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一种确定反应中间态几何特征和能量的综合性方法(英文)
1
作者
郑铮
刘振明
张亮仁
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期1439-1442,共4页
通过综合使用传统的过渡态优化算法、数学统计工具以及人工神经网络算法(ANN)找到一种不依赖于反应物起始构象而得到化学反应中过渡态结构和能量的方法.在两个反应物互相接近的过程中,每一步的几何构象都对应着一个系统能量值.本研究的...
通过综合使用传统的过渡态优化算法、数学统计工具以及人工神经网络算法(ANN)找到一种不依赖于反应物起始构象而得到化学反应中过渡态结构和能量的方法.在两个反应物互相接近的过程中,每一步的几何构象都对应着一个系统能量值.本研究的目的是尽可能地收集处在反应能量面上的这种能量点值.通过采用几何参数作为自变量对势能面进行模拟研究,得到了势能面上对应过渡态结构的一阶鞍点.采用乙醛负离子和甲醛作为反应物,对经典的醛醇缩合反应中的亲核进攻步骤进行了研究.对内禀反应坐标(IRC)路径的计算是从反应物的三组不同起始构象出发,最终获得了反应势能面上的96个点.本研究中的势能面采用人工神经网络算法进行模拟研究,并利用交叉验证方法评估得到的结果,避免了采用人工神经网络算法时过度拟合情况的发生.
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关键词
反应
过渡态
反应物几何构象
人工神经网络
反应
势能面
一阶鞍点
交叉验证
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职称材料
题名
一种确定反应中间态几何特征和能量的综合性方法(英文)
1
作者
郑铮
刘振明
张亮仁
机构
北京大学药学院药物化学系
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期1439-1442,共4页
基金
supported by the National High-Tech Research and Development Program of China (863) (2006AA02Z337).~~
文摘
通过综合使用传统的过渡态优化算法、数学统计工具以及人工神经网络算法(ANN)找到一种不依赖于反应物起始构象而得到化学反应中过渡态结构和能量的方法.在两个反应物互相接近的过程中,每一步的几何构象都对应着一个系统能量值.本研究的目的是尽可能地收集处在反应能量面上的这种能量点值.通过采用几何参数作为自变量对势能面进行模拟研究,得到了势能面上对应过渡态结构的一阶鞍点.采用乙醛负离子和甲醛作为反应物,对经典的醛醇缩合反应中的亲核进攻步骤进行了研究.对内禀反应坐标(IRC)路径的计算是从反应物的三组不同起始构象出发,最终获得了反应势能面上的96个点.本研究中的势能面采用人工神经网络算法进行模拟研究,并利用交叉验证方法评估得到的结果,避免了采用人工神经网络算法时过度拟合情况的发生.
关键词
反应
过渡态
反应物几何构象
人工神经网络
反应
势能面
一阶鞍点
交叉验证
Keywords
Reaction transition state
Geometry of reactant
Artificial neural network
Reaction energysurface
First order saddle point
Cross-validation
分类号
O643.1 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
一种确定反应中间态几何特征和能量的综合性方法(英文)
郑铮
刘振明
张亮仁
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009
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