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模拟含双锌核的甲烷单加氧酶催化甲烷和乙烷羟基化理论研究
1
作者
徐建
高超
+2 位作者
杨华清
秦松
胡常伟
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期877-882,共6页
采用密度泛函B3LYP方法,研究含双锌核的甲烷单加氧酶催化底物CH3X(X=H,CH3)羟基化的反应机理。用cis-(HCOO)(C3N2H4)Zn2(μ-O)2(COOH)(C3N2H4)(其中C3N2H4=咪唑)模拟双锌核甲烷单加氧酶中的关键化合物Q。研究表明,反应通过自由基回弹机...
采用密度泛函B3LYP方法,研究含双锌核的甲烷单加氧酶催化底物CH3X(X=H,CH3)羟基化的反应机理。用cis-(HCOO)(C3N2H4)Zn2(μ-O)2(COOH)(C3N2H4)(其中C3N2H4=咪唑)模拟双锌核甲烷单加氧酶中的关键化合物Q。研究表明,反应通过自由基回弹机理发生。首先,底物CH3X(X=H,CH3)与Q中的一个桥形氧发生相互作用生成分子复合物QCH3X。然后,Q中的一个桥形氧进一步夺取底物中的氢原子,生成QH和XCH2双自由基。这两种双自由基很容易结合生成醇类分子复合物PXCH2OH,其中P=cis-(HCOO)(C3N2H4)Zn(μ-O)Zn(COOH)(C3N2H4)。最后,分子复合物PXCH2OH脱去羟基化合物XCH2OH生成P。在298.15K和1atm的条件下,含双锌核甲烷单加氧酶Q催化CH4和CH3CH3羟基化反应在蛋白质溶液中的速率常数分别为6.414×10-19和1.542×10-6dm3.mol-1.s-1。
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关键词
密度泛函方法
双锌核甲烷单加氧酶
自由基机理
羟基化合物
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职称材料
题名
模拟含双锌核的甲烷单加氧酶催化甲烷和乙烷羟基化理论研究
1
作者
徐建
高超
杨华清
秦松
胡常伟
机构
四川大学化工学院
四川大学化学学院
出处
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期877-882,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(20503017)
文摘
采用密度泛函B3LYP方法,研究含双锌核的甲烷单加氧酶催化底物CH3X(X=H,CH3)羟基化的反应机理。用cis-(HCOO)(C3N2H4)Zn2(μ-O)2(COOH)(C3N2H4)(其中C3N2H4=咪唑)模拟双锌核甲烷单加氧酶中的关键化合物Q。研究表明,反应通过自由基回弹机理发生。首先,底物CH3X(X=H,CH3)与Q中的一个桥形氧发生相互作用生成分子复合物QCH3X。然后,Q中的一个桥形氧进一步夺取底物中的氢原子,生成QH和XCH2双自由基。这两种双自由基很容易结合生成醇类分子复合物PXCH2OH,其中P=cis-(HCOO)(C3N2H4)Zn(μ-O)Zn(COOH)(C3N2H4)。最后,分子复合物PXCH2OH脱去羟基化合物XCH2OH生成P。在298.15K和1atm的条件下,含双锌核甲烷单加氧酶Q催化CH4和CH3CH3羟基化反应在蛋白质溶液中的速率常数分别为6.414×10-19和1.542×10-6dm3.mol-1.s-1。
关键词
密度泛函方法
双锌核甲烷单加氧酶
自由基机理
羟基化合物
Keywords
density functional method
dizinc core methane monooxygenase
bound-radical mechanism
hydroxyl compound
分类号
O641.121 [理学—物理化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
模拟含双锌核的甲烷单加氧酶催化甲烷和乙烷羟基化理论研究
徐建
高超
杨华清
秦松
胡常伟
《化学研究与应用》
CAS
CSCD
北大核心
2009
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