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双链置换探针实时PCR用于DNA池的等位基因频率测定
1
作者
程金平
梁基选
李庆阁
《厦门大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第B08期113-118,共6页
结合荧光双链置换探针的特异性和实时PCR的准确定量能力,建立了一种新颖、准确、价廉且高通量的测定DNA池等位基因频率的方法.该方法采用不同荧光标记的双链置换探针1次PCR反应即可测定出等位基因频率.实验以β 地中海贫血CDs41 42( TC...
结合荧光双链置换探针的特异性和实时PCR的准确定量能力,建立了一种新颖、准确、价廉且高通量的测定DNA池等位基因频率的方法.该方法采用不同荧光标记的双链置换探针1次PCR反应即可测定出等位基因频率.实验以β 地中海贫血CDs41 42( TCTT)突变为对象,分别用荧光染料FAM和ROX标记野生型和突变型探针,由实时PCR检测建立的等位基因浓度与循环阈值的响应曲线计算DNA池的等位基因频率.结果表明,建立的系列等位基因浓度与循环阈值呈线性关系,线性相关系数分别为0.9977(野生型等位基因)和0.9938(突变型等位基因),可检测的最低等位基因频率达1%,等位基因频率在1%～90%范围内测定误差小于4%.该方法可广泛用于流行病学调查、遗传连锁分析以及全基因组连锁不平衡扫描等领域.
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关键词
双链置换探针
实时PCR
DNA池
等位基因
频率测定
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职称材料
题名
双链置换探针实时PCR用于DNA池的等位基因频率测定
1
作者
程金平
梁基选
李庆阁
机构
厦门大学生命科学学院细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室
厦门大学医学院抗癌研究中心
出处
《厦门大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第B08期113-118,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30170834)
福建省自然科学基金重点项目(C0220001)资助.
文摘
结合荧光双链置换探针的特异性和实时PCR的准确定量能力,建立了一种新颖、准确、价廉且高通量的测定DNA池等位基因频率的方法.该方法采用不同荧光标记的双链置换探针1次PCR反应即可测定出等位基因频率.实验以β 地中海贫血CDs41 42( TCTT)突变为对象,分别用荧光染料FAM和ROX标记野生型和突变型探针,由实时PCR检测建立的等位基因浓度与循环阈值的响应曲线计算DNA池的等位基因频率.结果表明,建立的系列等位基因浓度与循环阈值呈线性关系,线性相关系数分别为0.9977(野生型等位基因)和0.9938(突变型等位基因),可检测的最低等位基因频率达1%,等位基因频率在1%～90%范围内测定误差小于4%.该方法可广泛用于流行病学调查、遗传连锁分析以及全基因组连锁不平衡扫描等领域.
关键词
双链置换探针
实时PCR
DNA池
等位基因
频率测定
Keywords
double-stranded displacing probe
real-time PCR
DNA pooling
allele frequency
分类号
Q343.1 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
双链置换探针实时PCR用于DNA池的等位基因频率测定
程金平
梁基选
李庆阁
《厦门大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2004
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