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阿维链霉菌双组分信号系统的生物信息学分析 被引量:2
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作者 程钢 喻子牛 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期630-635,共6页
应用多种生物信息学方法,如序列比对、多序列比对、系统进化树分析、二级结构预测等,对阿维链霉菌中双组分信号系统蛋白进行鉴定分析。结果表明:阿维链霉菌中存在61个组氨酸蛋白激酶,其中30个组氨酸蛋白激酶包含了全部的保守传递器结构... 应用多种生物信息学方法,如序列比对、多序列比对、系统进化树分析、二级结构预测等,对阿维链霉菌中双组分信号系统蛋白进行鉴定分析。结果表明:阿维链霉菌中存在61个组氨酸蛋白激酶,其中30个组氨酸蛋白激酶包含了全部的保守传递器结构域。阿维链霉菌中也存在69个应答调控蛋白,主要分布在3种主要的应答调控蛋白家族中。与天蓝色链霉菌和其他微生物中双组分信号系统进行比较和对功能结构域进行分析,表明:在这些蛋白所组成48个双组分信号系统中,多个双信号调控系统与阿维链霉菌中环境刺激反应和调控相关。 展开更多
关键词 阿维链霉菌 双组分信号系统 组氨酸蛋白激酶 应答调控蛋白 生物信息学
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欧美杨细菌性溃疡病菌双组分信号转导系统LqHK1基因的功能 被引量:1
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作者 魏强 李爱宁 贺伟 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第4期105-112,共8页
【目的】明确欧美杨细菌性溃疡病病原菌中双组分信号转导系统LqHK1基因的生物学功能,以阐明该病原菌的致病机制。【方法】采用生物信息学方法鉴定双组分系统LqHK1,利用同源重组方法获得该基因缺失突变体菌株△LqHK1,分析突变体及其互补... 【目的】明确欧美杨细菌性溃疡病病原菌中双组分信号转导系统LqHK1基因的生物学功能,以阐明该病原菌的致病机制。【方法】采用生物信息学方法鉴定双组分系统LqHK1,利用同源重组方法获得该基因缺失突变体菌株△LqHK1,分析突变体及其互补菌株的生长速率、游动性、生物膜形成、致病性等生物学特性。同时,采用qRT-PCR检测与病原菌游动性相关的基因flgB、flgC、flgE的表达水平,并定量分析接种病原菌后在接种点部位杨树组织内病原菌的DNA含量。【结果】鉴定出病原细菌的双组分系统基因LqHK1,通过同源重组获得缺失突变体△LqHK1。表型分析显示:△LqHK1在1年生107杨茎干上的致病力显著下降;突变体在寄主体内定殖的菌量明显少于野生型菌株;突变体菌株的游动能力比野生型显著降低,游动性相关基因flgB、flgC、flgE在突变体中的表达量显著下降;LqHK1突变体生物膜的形成能力显著降低,生长速率与野生型无显著差异。【结论】LqHK1基因缺失突变体在107杨上的致病能力显著下降,欧美杨细菌性溃疡病病原菌双组分信号转导系统LqHK1基因与病原菌的致病性密切相关。 展开更多
关键词 欧美杨细菌性溃疡病病原菌 双组分信号系统 致病性
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水稻双组分系统基因干旱胁迫表达谱分析 被引量:3
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作者 潘雅姣 王迪 +2 位作者 朱苓华 傅彬英 黎志康 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1628-1636,共9页
利用全基因组表达芯片,系统分析干旱胁迫条件下水稻双组分信号系统(two componentsystem,TCS)相关基因在其不同发育阶段、不同组织以及抗旱能力不同的株系中的表达谱变化特征。结果表明,双组分信号系统基因在干旱胁迫环境下的表达具明... 利用全基因组表达芯片,系统分析干旱胁迫条件下水稻双组分信号系统(two componentsystem,TCS)相关基因在其不同发育阶段、不同组织以及抗旱能力不同的株系中的表达谱变化特征。结果表明,双组分信号系统基因在干旱胁迫环境下的表达具明显的时空特异性,表现为不同组织的TCS基因干旱胁迫表达谱差异较大,而同一组织内表达谱相似,其中生殖生长期(幼穗分化期和孕穗期)两个叶片材料中TCS基因表达谱最为接近;与细胞分裂素信号传导负向调控相关的A型应答调控器在旱胁迫下表达下调,而与CK信号传导正向调控相关的B型应答调控器呈现明显上调趋势,推测与干旱胁迫下CK信号传导增强有关,同时乙烯受体基因在干旱胁迫环境下的表达下调,从激素间相互关系的角度更好地印证了上述推测;与拟南芥细胞分裂素受体基因(AHK2、AHK3和AHK5)序列相似的磷酸感应激酶基因HK5和HK3在干旱胁迫下表达上调,与拟南芥中不依赖细胞分裂素的AHK5序列接近的HK6则表达下调,进一步验证上述推测;干旱胁迫下抗旱能力不同的水稻株系其TCS基因表达谱没有明显差异,推测TCS基因差异表达可能源于对干旱胁迫反应,而其表达对抗旱能力的增强还有待进一步研究。 展开更多
关键词 双组分信号系统 干旱胁迫 表达谱 水稻
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甘薯组氨酸激酶蛋白IbHK5响应干旱和盐胁迫的功能分析 被引量:1
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作者 霍如雪 葛祥菡 +4 位作者 石嘉 李雪蕊 戴圣杰 刘振宁 李宗芸 《作物学报》 北大核心 2025年第3期650-666,共17页
组氨酸激酶是植物双组分信号系统中的一类重要元件,参与了植物生长发育、逆境响应等多种生物学功能。本研究在甘薯中鉴定到一个与拟南芥AHK5同源的基因Ib HK5。亚细胞定位研究表明,Ib HK5蛋白主要定位于细胞质和细胞核中。利用拟南芥异... 组氨酸激酶是植物双组分信号系统中的一类重要元件,参与了植物生长发育、逆境响应等多种生物学功能。本研究在甘薯中鉴定到一个与拟南芥AHK5同源的基因Ib HK5。亚细胞定位研究表明,Ib HK5蛋白主要定位于细胞质和细胞核中。利用拟南芥异源超表达和甘薯发状根遗传转化技术研究了Ib HK5参与干旱胁迫和盐胁迫的生物学功能。结果表明,Ib HK5在拟南芥中的异源超表达能够增强拟南芥的耐旱性和耐盐性,超表达株系中表现出较高的POD、SOD和CAT酶活,较少的H_(2)O_(2)和O^(2-)的积累,以及相对表达量较高的POD、SOD、CAT和GPX等ROS清除系统相关基因。同样,Ib HK5在甘薯中的超表达也能增强甘薯的耐旱性和耐盐性,甘薯发状根也表现出较高的POD、SOD和CAT酶活,较少的H_(2)O_(2)和O^(2-)的积累。酵母双杂交试验表明,Ib HK5能与拟南芥AHP1、AHP2、AHP3和AHP5蛋白互作。上述结果证实Ib HK5是参与干旱胁迫和盐胁迫的一个正调控因子。研究结果有助于解析甘薯抵御干旱胁迫和盐胁迫的生理机制与分子机制,也能够为耐干旱、耐盐的甘薯定向改良和品种选育提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 甘薯 双组分信号系统 组氨酸激酶 IbHK5 干旱胁迫 盐胁迫
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文心兰OnRR9基因克隆及表达 被引量:3
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作者 闫冰玉 巩笑笑 +4 位作者 谭玉荣 王鹏 李双江 潘英文 刘进平 《热带生物学报》 2018年第4期393-400,共8页
利用RACE技术从文心兰花瓣中克隆到RR基因,将其命名为OnRR9(登录号:MH758789)。OnRR9基因全长为627 bp,编码208个氨基酸。对其进行蛋白质2级结构分析,构建进化树,并进行实时荧光定量分析。结果表明:OnRR9蛋白为亲水性的分泌蛋白,定位于... 利用RACE技术从文心兰花瓣中克隆到RR基因,将其命名为OnRR9(登录号:MH758789)。OnRR9基因全长为627 bp,编码208个氨基酸。对其进行蛋白质2级结构分析,构建进化树,并进行实时荧光定量分析。结果表明:OnRR9蛋白为亲水性的分泌蛋白,定位于细胞核中。同源序列比对显示,OnRR9基因属于Yes N/Ara C家族,氨基酸序列中含有保守的REC结构域,可能参与双组分信号转导途径。构建进化树表明,OnRR9蛋白与拟南芥中A型ARRs亲缘关系接近,OnRR9基因可能作为细胞分裂素信号传导的成分。实时荧光定量分析结果表明,OnRR9基因在盛开期前后表达模式发生逆转,表明它可能参与文心兰花瓣衰老启动过程。 展开更多
关键词 文心兰 OnRR9基因 花衰老 双组分信号系统 基因表达
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