目的:探讨肥胖相关指标与DNA甲基化时钟及其加速指标之间的关系,并分析两者在时间上的先后顺序。方法:研究数据来源于中国双生子登记系统在2013年和2017—2018年开展的两次专题调查。通过Illumina Infinium人类甲基化450K芯片和EPIC芯...目的:探讨肥胖相关指标与DNA甲基化时钟及其加速指标之间的关系,并分析两者在时间上的先后顺序。方法:研究数据来源于中国双生子登记系统在2013年和2017—2018年开展的两次专题调查。通过Illumina Infinium人类甲基化450K芯片和EPIC芯片测定外周血DNA甲基化数据,并采用DNA甲基化年龄计算器(https://dnamage.genetics.ucla.edu/)或研究者提供的R代码计算DNA甲基化时钟指标GrimAA、PCGrimAA和DunedinPACE。肥胖指标包括体重、体重指数(body mass index,BMI)、腰围、腰臀比、腰高比。横断面分析纳入1070名双生子,对内分析同卵双生子378对,异卵双生子155对,采用混合效应模型分析肥胖指标与DNA甲基化时钟及其加速指标的相关性。纵向分析纳入314名双生子,对内分析同卵双生子95对,异卵双生子62对,采用交叉滞后模型进一步探索肥胖与DNA甲基化时钟指标间的时间顺序关联。上述分析均分别在全部双生子和同卵、异卵双生子对内进行。结果:横断面分析人群中同卵双生子占71.0%,男性占68.0%,平均实足年龄为(49.9±12.1)岁;纵向分析人群中同卵双生子占60.5%,男性占60.8%;基线平均实足年龄为(50.4±10.2)岁,平均随访时间(4.6±0.6)年。除随访时腰臀比均值高于基线外,其他肥胖指标基线与随访均值差异无统计学意义。相关性分析显示,在全部双生子中,体重、BMI、腰围、腰臀比、腰高比均与DunedinPACE时钟呈正相关,其中腰高比与DunedinPACE时钟的关联最为显著(β=0.21,95%CI:0.11~0.31);体重和BMI均与GrimAA呈负相关(β=-0.03,95%CI:-0.05~-0.01;β=-0.07,95%CI:-0.12~-0.02),体重与PCGrimAA呈负相关(β=-0.02,95%CI:-0.03~0.00);但双生子对内分析中的相关性未达到统计学显著水平。交叉滞后分析显示,基线体重升高可能引起随访时GrimAA增加,基线体重、BMI和腰围升高可能引起随访时PCGrimAA增加,基线腰臀比升高可能引起随访时DunedinPACE升高。结论:肥胖指标与DNA甲基化时钟指标存在相关,基线肥胖指标对随访时部分DNA甲基化时钟指标的变化具有影响,肥胖可能通过加速DNA甲基化时钟和衰老进程对个体健康产生长期影响,但二者间的关联受双生子共享的遗传或环境因素影响。展开更多
目的:在成年双生子人群中探索与血压指标(收缩压、舒张压、平均动脉压、脉压)存在相关性的DNA甲基化位点。方法:研究人群来自中国双生子登记系统,共476名双生子,问卷调查包括一般人口学特征、生活方式及疾病状况等信息,体格检查包括血...目的:在成年双生子人群中探索与血压指标(收缩压、舒张压、平均动脉压、脉压)存在相关性的DNA甲基化位点。方法:研究人群来自中国双生子登记系统,共476名双生子,问卷调查包括一般人口学特征、生活方式及疾病状况等信息,体格检查包括血压、身高、体重等信息,使用Infinium Human Methylation450 Bead Chip芯片对外周全血进行全基因组DNA甲基化检测。在调整潜在混杂因素的基础上,通过构建混合效应模型在全基因组范围寻找与血压指标存在相关性的DNA甲基化位点,显著性水平为错误发现阳性位点率<0.05。结果:经过数据质量控制最终纳入465名双生子(122对同卵双生子,104对异卵双生子,13对双生子的其中之一),年龄(44.8±13.2)岁,男性多于女性,同卵略多于异卵,目前吸烟和目前规律饮酒者所占比例均大于30%。所有双生子个体均行全基因组DNA甲基化与血压指标相关分析,经多重校正后未发现显著的甲基化位点,但位于10号染色体的cg07761116在3个血压指标(收缩压、舒张压、平均动脉压)相关分析中的P值相对较小,提示其可能是一个与血压相关的位点。还有7个位点在两个血压指标相关分析中的P值较小,所在基因与神经发育、蛋白质稳态、炎症反应等功能相关。结论:没有明确证据支持与血压水平存在相关性的甲基化位点,可能由于样本量不足等原因,可以为后续开展类似的双生子研究提供参考,后续研究可以关注10号染色体上的cg07761116及其他P值较小的位点。展开更多
文摘目的:探讨肥胖相关指标与DNA甲基化时钟及其加速指标之间的关系,并分析两者在时间上的先后顺序。方法:研究数据来源于中国双生子登记系统在2013年和2017—2018年开展的两次专题调查。通过Illumina Infinium人类甲基化450K芯片和EPIC芯片测定外周血DNA甲基化数据,并采用DNA甲基化年龄计算器(https://dnamage.genetics.ucla.edu/)或研究者提供的R代码计算DNA甲基化时钟指标GrimAA、PCGrimAA和DunedinPACE。肥胖指标包括体重、体重指数(body mass index,BMI)、腰围、腰臀比、腰高比。横断面分析纳入1070名双生子,对内分析同卵双生子378对,异卵双生子155对,采用混合效应模型分析肥胖指标与DNA甲基化时钟及其加速指标的相关性。纵向分析纳入314名双生子,对内分析同卵双生子95对,异卵双生子62对,采用交叉滞后模型进一步探索肥胖与DNA甲基化时钟指标间的时间顺序关联。上述分析均分别在全部双生子和同卵、异卵双生子对内进行。结果:横断面分析人群中同卵双生子占71.0%,男性占68.0%,平均实足年龄为(49.9±12.1)岁;纵向分析人群中同卵双生子占60.5%,男性占60.8%;基线平均实足年龄为(50.4±10.2)岁,平均随访时间(4.6±0.6)年。除随访时腰臀比均值高于基线外,其他肥胖指标基线与随访均值差异无统计学意义。相关性分析显示,在全部双生子中,体重、BMI、腰围、腰臀比、腰高比均与DunedinPACE时钟呈正相关,其中腰高比与DunedinPACE时钟的关联最为显著(β=0.21,95%CI:0.11~0.31);体重和BMI均与GrimAA呈负相关(β=-0.03,95%CI:-0.05~-0.01;β=-0.07,95%CI:-0.12~-0.02),体重与PCGrimAA呈负相关(β=-0.02,95%CI:-0.03~0.00);但双生子对内分析中的相关性未达到统计学显著水平。交叉滞后分析显示,基线体重升高可能引起随访时GrimAA增加,基线体重、BMI和腰围升高可能引起随访时PCGrimAA增加,基线腰臀比升高可能引起随访时DunedinPACE升高。结论:肥胖指标与DNA甲基化时钟指标存在相关,基线肥胖指标对随访时部分DNA甲基化时钟指标的变化具有影响,肥胖可能通过加速DNA甲基化时钟和衰老进程对个体健康产生长期影响,但二者间的关联受双生子共享的遗传或环境因素影响。
文摘目的:在成年双生子人群中探索与血压指标(收缩压、舒张压、平均动脉压、脉压)存在相关性的DNA甲基化位点。方法:研究人群来自中国双生子登记系统,共476名双生子,问卷调查包括一般人口学特征、生活方式及疾病状况等信息,体格检查包括血压、身高、体重等信息,使用Infinium Human Methylation450 Bead Chip芯片对外周全血进行全基因组DNA甲基化检测。在调整潜在混杂因素的基础上,通过构建混合效应模型在全基因组范围寻找与血压指标存在相关性的DNA甲基化位点,显著性水平为错误发现阳性位点率<0.05。结果:经过数据质量控制最终纳入465名双生子(122对同卵双生子,104对异卵双生子,13对双生子的其中之一),年龄(44.8±13.2)岁,男性多于女性,同卵略多于异卵,目前吸烟和目前规律饮酒者所占比例均大于30%。所有双生子个体均行全基因组DNA甲基化与血压指标相关分析,经多重校正后未发现显著的甲基化位点,但位于10号染色体的cg07761116在3个血压指标(收缩压、舒张压、平均动脉压)相关分析中的P值相对较小,提示其可能是一个与血压相关的位点。还有7个位点在两个血压指标相关分析中的P值较小,所在基因与神经发育、蛋白质稳态、炎症反应等功能相关。结论:没有明确证据支持与血压水平存在相关性的甲基化位点,可能由于样本量不足等原因,可以为后续开展类似的双生子研究提供参考,后续研究可以关注10号染色体上的cg07761116及其他P值较小的位点。
