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异构机群系统上并行计算双序列的最长公共子序列
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作者 许莉莉 魏鹰 +1 位作者 罗海鹏 张林才 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2010年第5期1669-1671,1682,共4页
针对处理机节点具有不同计算速度、不同通信能力的情况,考虑计算和通信启动开销,给定处理机分配顺序,基于可分负载理论,提出一种存储受限异构机群系统的序列串最优分配线性规划模型,给出相应的序列串最优分配方法。实验结果表明,基于最... 针对处理机节点具有不同计算速度、不同通信能力的情况,考虑计算和通信启动开销,给定处理机分配顺序,基于可分负载理论,提出一种存储受限异构机群系统的序列串最优分配线性规划模型,给出相应的序列串最优分配方法。实验结果表明,基于最优序列串分配方法的双序列最长公共子序列并行算法优于平均分配序列串算法,获得了较好的加速,并具有良好的可扩展性。 展开更多
关键词 双序列的最长公共子序列 并行算法 异构机群系统 可分负载 分配策略
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一种最长扩展公共子序列新算法
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作者 王前东 《电讯技术》 北大核心 2024年第8期1307-1314,共8页
在最长填充公共子序列问题中提出一种新问题:假设有一个完整序列C和一个不完整序列Q,长度分别为m和n,Q中丢失的元素为相邻的相同元素,要求寻找一个丢失前的序列Q,使得C和Q具有最长的公共子序列。针对此问题,首先将Q中每个元素复制m-1个... 在最长填充公共子序列问题中提出一种新问题:假设有一个完整序列C和一个不完整序列Q,长度分别为m和n,Q中丢失的元素为相邻的相同元素,要求寻找一个丢失前的序列Q,使得C和Q具有最长的公共子序列。针对此问题,首先将Q中每个元素复制m-1个并插入Q中原来的位置,生成长度为mn的扩展序列Q^(*),然后证明了C和Q的最长扩展公共子序列是两序列C和Q^(*)的最长公共子序列,最后提出一种时空复杂度为O(mn)的最长扩展公共子序列求解新算法,并用轨迹实验证明了该算法对强噪声干扰和轨迹点丢失的同时有效性。 展开更多
关键词 最长公共序列(LCS) 最长填充公共序列(LFCS) 扩展公共序列(ECS) 最长扩展公共序列(LECS)
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跨学科视角下白云湖湿地土地利用长时间序列变化研究
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作者 王先霞 宫玉涛 《农业与技术》 2025年第12期87-93,共7页
合理进行湿地土地开发与利用是促进湿地可持续发展的重要保证。本文以山东省济南市白云湖湿地为研究区,通过跨学科方法探究其土地开发与利用的长时间序列变化特征和驱动因素。搜集大量地方志、文献资料和新闻报道等材料,定性阐释白云湖... 合理进行湿地土地开发与利用是促进湿地可持续发展的重要保证。本文以山东省济南市白云湖湿地为研究区,通过跨学科方法探究其土地开发与利用的长时间序列变化特征和驱动因素。搜集大量地方志、文献资料和新闻报道等材料,定性阐释白云湖湿地的历史演变;利用1983—2019年5期Landsat 8遥感影像数据对研究区土地利用变化进行定量研究;本文建立了遥感影像和调查数据所描述的土地利用变化之间的相关性,以探讨白云湖湿地土地利用变化的驱动因素。结果显示,研究区湿地土地利用景观格局发生了多次大规模转变,表明公共政策对湿地尤其是较小范围内的土地利用可能会产生决定性影响。 展开更多
关键词 土地利用 时间序列变化 公共政策 跨学科 白云湖湿地
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结合Hausdorff距离和最长公共子序列的轨迹分类 被引量:26
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作者 魏龙翔 何小海 +1 位作者 滕奇志 高明亮 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2013年第4期784-790,共7页
为了提高运动目标轨迹分类的准确性,该文综合考虑了轨迹的位置信息和方向信息,提出了一种结合Hausdorff距离和最长公共子序列(Longest Common SubSequence,LCSS)的轨迹分类算法。该算法首先采用改进的Hausdorff距离对轨迹的位置信息进... 为了提高运动目标轨迹分类的准确性,该文综合考虑了轨迹的位置信息和方向信息,提出了一种结合Hausdorff距离和最长公共子序列(Longest Common SubSequence,LCSS)的轨迹分类算法。该算法首先采用改进的Hausdorff距离对轨迹的位置信息进行相似性测量,然后采用改进的LCSS算法对轨迹的方向信息进行相似性测量。与其他轨迹聚类算法不同,该算法融合了Hausdorff距离和LCSS两种算法的优点,提高了轨迹分类的准确性。此外,为了进一步降低计算复杂度,该文还实现了一种基于插值的保距变换算法和一种LCSS快速算法。实验结果表明,该轨迹分类算法可以明显提高轨迹的聚类准确率,聚类准确率可达到96%;基于插值的保距变换算法和LCSS快速算法可以很大程度上降低算法的计算复杂度,下降幅度最大可达到80%。该方法可以同时满足轨迹分类对精确度、实时性和鲁棒性的要求。 展开更多
关键词 图像处理 轨迹分类 HAUSDORFF距离 最长公共序列(LCSS) 保距变换 LCSS快速算法
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带约束最长公共子序列快速算法 被引量:7
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作者 业宁 朱大铭 +1 位作者 张倩倩 沈丽容 《南京大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期576-584,共9页
带约束最长公共子序列(CLCS)问题有很深的生物学应用背景,常被用来表示同源基因序列相似性的度量,但计算CLCS时间代价很高,最早的CLCS算法的时间复杂度为O(rn4),目前,最快的CLCS算法的时间复杂性为O(rn2).运用对偶原理将带约束最长公共... 带约束最长公共子序列(CLCS)问题有很深的生物学应用背景,常被用来表示同源基因序列相似性的度量,但计算CLCS时间代价很高,最早的CLCS算法的时间复杂度为O(rn4),目前,最快的CLCS算法的时间复杂性为O(rn2).运用对偶原理将带约束最长公共子序列问题转换为带约束最小覆盖集问题,并建立带权的ref树结构,构造包含约束序列的约束覆盖子集,约简带约束覆盖子集并从中搜索关键路径,再通过关键路径构造CLCS,该算法将算法时间复杂度提升到O(nlogn+(q+r)L),r是约束序列的长度,q是两序列序偶的个数,L是两序列的最长公共子序列(LCS)长度. 展开更多
关键词 带约束最长公共序列 快速算法 对偶算法
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基于滑动窗口最长公共子序列Wi-Fi指纹定位算法 被引量:4
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作者 张明洋 陈剑 +1 位作者 闻英友 赵宏 《东北大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1390-1394,共5页
针对基于Wi-Fi瞬时指纹定位算法中由于RSS信号的时变特性引起的Wi-Fi定位精度差问题,提出了一种基于滑动窗口最长公共子序列指纹定位算法.该算法将时间序列的RSS信号指纹转化为基于滑动窗口的数据模型,增加了指纹特征信息,提高比对准确... 针对基于Wi-Fi瞬时指纹定位算法中由于RSS信号的时变特性引起的Wi-Fi定位精度差问题,提出了一种基于滑动窗口最长公共子序列指纹定位算法.该算法将时间序列的RSS信号指纹转化为基于滑动窗口的数据模型,增加了指纹特征信息,提高比对准确性.通过计算请求定位数据与样本的最长公共子序列来获得样本点的相似性,解决由于窗口伸缩或滑动窗口中个别采样点无信号引起的比对不准确问题,从而提高了定位的精确性和鲁棒性.实验结果表明,所提定位算法的结果明显优于瞬时指纹定位算法. 展开更多
关键词 室内定位 指纹 滑动窗口 时间序列 最长公共序列
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基于最长公共子序列的人体运动序列检索 被引量:2
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作者 冯林 李璞 +1 位作者 孙焘 郑虎 《系统仿真学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第22期7164-7167,共4页
在计算机仿真领域,运用重新组合等相关技术,可以对已经捕捉的人体运动数据实现重用,以较低的成本产生新的运动。但是,由于运动库的数据庞大,对其实施有效检索成为一个重要问题。以倒排表数据结构为基础,设计出一套针对人体运动的检索算... 在计算机仿真领域,运用重新组合等相关技术,可以对已经捕捉的人体运动数据实现重用,以较低的成本产生新的运动。但是,由于运动库的数据庞大,对其实施有效检索成为一个重要问题。以倒排表数据结构为基础,设计出一套针对人体运动的检索算法。不同于传统的最长公共子序列(Longest Common Subsequence,LCSS)的度量算法,提出了一种限制最小匹配率ρmin的有限最长公共子序列(Limited-LCSS)算法,并在此基础上针对倒排表的数据结构特点对算法进行了优化,显著的提高了算法的效率。实验表明提出的检索方法具有较好的速度和准确性。 展开更多
关键词 运动捕捉 检索 最长公共序列 倒排表
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基于最长公共子序列的非同步相似轨迹判断 被引量:11
8
作者 刘宇 王前东 《电讯技术》 北大核心 2017年第10期1165-1170,共6页
针对非同步相似轨迹判断问题,提出了一种基于最长公共子序列理论的相似轨迹判断新算法。首先,求出查询轨迹线段与候选轨迹线段之间的距离;其次,利用最长公共子序列算法,计算两轨迹的最长公共子轨迹长度;最后,根据相似度门限,判断轨迹是... 针对非同步相似轨迹判断问题,提出了一种基于最长公共子序列理论的相似轨迹判断新算法。首先,求出查询轨迹线段与候选轨迹线段之间的距离;其次,利用最长公共子序列算法,计算两轨迹的最长公共子轨迹长度;最后,根据相似度门限,判断轨迹是否相似。数值实例验证了所提算法能够提高非同步轨迹的相似度。 展开更多
关键词 侦察监视 最长公共序列 非同步相似轨迹 最长公共轨迹
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一种带匹配路径约束的最长公共子序列长度算法 被引量:9
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作者 王前东 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2017年第11期2615-2619,共5页
在带约束的最长公共子序列问题中提出一种特殊的新问题:假设有两序列Q和C,Q中指定的匹配位置序列I,计算两序列Q和C的最长公共子序列,且这个最长公共子序列的匹配路径必须经过位置序列I。针对此问题,该文提出一种带匹配路径约束的最长公... 在带约束的最长公共子序列问题中提出一种特殊的新问题:假设有两序列Q和C,Q中指定的匹配位置序列I,计算两序列Q和C的最长公共子序列,且这个最长公共子序列的匹配路径必须经过位置序列I。针对此问题,该文提出一种带匹配路径约束的最长公共子序列算法。首先定义带匹配路径约束的最长公共子序列模型,其次推出该序列的性质,最后求出带匹配路径约束的最长公共子序列长度的基础算法和快速算法。基础算法和快速算法时间复杂度分别为O(mnt)和O(mn),m,n,t分别为序列Q,C,I的长度。 展开更多
关键词 最长公共序列 匹配路径约束 带约束的最长公共序列 带匹配路径约束的最长公共序列
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基于格代数的最长公共子序列近似求解 被引量:2
10
作者 孙焘 朱晓明 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2017年第2期270-274,共5页
多条序列的最长公共子序列可以代表多条序列的公共信息,其在诸多领域里有着重要的应用,如信息检索、基因序列匹配等。求解多条序列的最长公共子序列是著名的NP难问题,本质为多解问题。一些近似算法虽然时间复杂度较低,但只能求出单解,... 多条序列的最长公共子序列可以代表多条序列的公共信息,其在诸多领域里有着重要的应用,如信息检索、基因序列匹配等。求解多条序列的最长公共子序列是著名的NP难问题,本质为多解问题。一些近似算法虽然时间复杂度较低,但只能求出单解,对于有多解的序列集合,求得的结果信息量损失较大。因此提出一个新的近似算法来解决最长公共子序列问题。算法引入了代数结构"格",通过动态规划求解出两条序列的公共格,并递归求解当前格与当前序列的公共格。公共格中的路径保存了多条公共子序列使得最终求解出的最长公共子序列为多个。对算法的相关定理给出了理论证明,并通过实验验证了算法的正确性。 展开更多
关键词 最长公共序列 近似算法 贪心算法
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基于最长公共子序列的随机路径选择算法设计 被引量:2
11
作者 王防修 周康 《计算机工程与设计》 CSCD 北大核心 2014年第6期2170-2173,共4页
针对传统算法只能求出一个最长公共子序列而无法求出多个最长公共子序列,设计了一种可求多个最长公共子序列的算法。简述了最长公共子序列的算法原理,描述了求最长公共子序列长度的动态规划算法,在此基础上求出一个最长公共子序列,通过... 针对传统算法只能求出一个最长公共子序列而无法求出多个最长公共子序列,设计了一种可求多个最长公共子序列的算法。简述了最长公共子序列的算法原理,描述了求最长公共子序列长度的动态规划算法,在此基础上求出一个最长公共子序列,通过对算法改进得到可求多个最长公共子序列的随机路径选择算法。该算法具有计算速度快、占用内存小、计算机易于实现等优点。其核心是寻优路径的选择,提出了寻找最优解的路径选择问题,讨论并给出了搜索多个可行解的快速算法,该算法充分利用了动态规划算法计算过程中提供的寻优方向信息得到最优路径的随机选择算法,与传统算法相比可求多个最长公共子序列。 展开更多
关键词 最长公共序列 最优结构 动态规划 随机路径选择 最优解
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基于公共子序列的OPSM双聚类算法 被引量:1
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作者 薛云 傅俊橦 +4 位作者 李杰进 王杜齐 邝秋华 张美珍 肖化 《华南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2015年第4期165-171,共7页
OPSM作为一种基于模式的双聚类方法,被广泛应用于基因数据矩阵的分析上.在一个OPSM聚类中,形成聚类的若干基因在特定的条件子集下具有一致的表达模式,其中隐含着基因的关联调控信息,对基因数据矩阵进行双聚类分析具有生物学意义.其中,De... OPSM作为一种基于模式的双聚类方法,被广泛应用于基因数据矩阵的分析上.在一个OPSM聚类中,形成聚类的若干基因在特定的条件子集下具有一致的表达模式,其中隐含着基因的关联调控信息,对基因数据矩阵进行双聚类分析具有生物学意义.其中,Deep OPSM是OPSM聚类中行数少列数多的特殊聚类.根据OPSM模型,该文提出了一种快速有效的精确性算法,用于挖掘分散在基因数据矩阵中的OPSM聚类.首先寻找基因数据矩阵中任意两行的公共子序列,然后利用STL map对找到的公共子序列进行支持度统计,并将符合支持度阈值的OPSM聚类输出,且通过阈值的设置即可输出Deep OPSMs.结果证明该算法能够快速地找到符合条件的Deep OPSMs.通过P-value值分析,验证了找到的Deep OPSM具有明显的生物学意义. 展开更多
关键词 OPSM 公共序列 DEEP OPSM 聚类 STL MAP
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最长公共子序列问题的改进快速算法 被引量:9
13
作者 李欣 舒风笛 《计算机应用研究》 CSCD 2000年第2期28-30,共3页
现在几个最常用的解决最长公共子序列(LCS)问题的算法的时间复杂度分别是O(pn),O(n(m-p)).这里m、n两个待比较字符串的长度,p是最长公共子串的长度.给出一种时间复杂度为O(p(m-p));空间复杂度为O(... 现在几个最常用的解决最长公共子序列(LCS)问题的算法的时间复杂度分别是O(pn),O(n(m-p)).这里m、n两个待比较字符串的长度,p是最长公共子串的长度.给出一种时间复杂度为O(p(m-p));空间复杂度为O(m+n)的算法.与以前的算法相比;不管在p<<m的情况下,还是在p接近m时,这种算法都有更快的速度. 展开更多
关键词 最长公共序列 算法 差分压缩算法 字符串
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最长公共子序列的量子算法 被引量:3
14
作者 徐文旭 廖明宏 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第B12期99-103,共5页
本文给出了求给定两个序列最长公共子序列(Longest Common Subsequence,LCS)问题的量子算法,能在O(n)时间内求解两个长为n字符序列的最长公共子序列.算法在分析传统动态规划填表过程潜在并行性的基础上,对填表过程进行量子化,... 本文给出了求给定两个序列最长公共子序列(Longest Common Subsequence,LCS)问题的量子算法,能在O(n)时间内求解两个长为n字符序列的最长公共子序列.算法在分析传统动态规划填表过程潜在并行性的基础上,对填表过程进行量子化,并通过带有量子存储器的量子Oracle,完成量子并行填表的计算.算法最后对前面计算获得的所有局部LCS的均匀叠加态应用Grover搜索,找出最终解,相对于经典动态规划实现了二次加速. 展开更多
关键词 算法 最长公共序列 Oracle
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求解最长循环公共子序列问题的两个算法 被引量:3
15
作者 郑子君 王洪 余成 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2020年第11期3334-3337,3358,共5页
最长循环公共子序列(LCCS)是两个字符串在所有可能的循环移位操作下能得到的最长公共子序列(LCS)。针对穷举移位量求解LCCS效率过低的问题,设法对候选移位量进行筛选。通过证明循环移位操作对两字符串间LCS长度增量影响的上下限,得到最... 最长循环公共子序列(LCCS)是两个字符串在所有可能的循环移位操作下能得到的最长公共子序列(LCS)。针对穷举移位量求解LCCS效率过低的问题,设法对候选移位量进行筛选。通过证明循环移位操作对两字符串间LCS长度增量影响的上下限,得到最优移位量的必要条件,从而减小了求解LCCS的枚举量;在此基础上,建立了求解LCCS的迭代方法,只经过少数几次迭代便可消除绝大部分无效候选移位量;此外,还提出一个可在O(mn)时间复杂度下快速估算LCCS长度的近似算法。大量随机模拟表明,当两字符串间的相似度明显高于随机字符串的相似度时,提出的两种算法表现良好。 展开更多
关键词 最长公共序列 循环字符串 文本相似度 动态规划
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求最长公共子序列长度的一个新方法 被引量:1
16
作者 林清波 吴锤红 《福建农业大学学报》 CSCD 1998年第4期505-509,共5页
提出了一个求序列X最长单调子序列的方法,若X的长度为n,则此方法所需时间为O(nlogn),空间占用为O(n).利用该方法可有效地求出X,Y两序列最长公共子序列的长度.如果X的长度为m,Y的长度为n,此时空间占用为O... 提出了一个求序列X最长单调子序列的方法,若X的长度为n,则此方法所需时间为O(nlogn),空间占用为O(n).利用该方法可有效地求出X,Y两序列最长公共子序列的长度.如果X的长度为m,Y的长度为n,此时空间占用为O(m+n);若Y中的各个元素在X中平均重复出现至多常数次,则所需时间为O(m+nlogn).作为应用之一,该方法可以用于文本的比较、等级考试录入文本的评测等. 展开更多
关键词 最长单调序列 最长公共序列 动态选择树
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基于复杂网络和最优子序列双射的形状描述与匹配 被引量:8
17
作者 汤进 陈展展 +1 位作者 罗斌 孙登第 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1757-1765,共9页
本文结合复杂网络理论分析形状特性,对形状建模成基于形状内部距离的小世界复杂网络,分析复杂网络节点的度特征和聚类系数特征,通过复杂网络的动态演化,构造多尺度的关于节点分布的直方图来描述形状;用轮廓点多尺度的度特征、聚类系数... 本文结合复杂网络理论分析形状特性,对形状建模成基于形状内部距离的小世界复杂网络,分析复杂网络节点的度特征和聚类系数特征,通过复杂网络的动态演化,构造多尺度的关于节点分布的直方图来描述形状;用轮廓点多尺度的度特征、聚类系数特征和内部距离形状上下文特征来描述轮廓点,结合改进的最优子序列双射算法实现形状匹配.实验中分析了复杂网络理论中各特征在形状分析中的描述能力,实验结果表明提出的形状匹配算法能实现一些非刚性变换下的物体形状匹配和较高精度的形状检索. 展开更多
关键词 形状描述 复杂网络 最优序列 形状匹配
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k-长DNA子序列计数算法研究 被引量:2
18
作者 王树林 王戟 +1 位作者 陈火旺 张鼎兴 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期40-42,共3页
基因组的结构与功能存在密切联系,其功能主要通过DNA子序列来表达,因此研究DNA序列结构对于生物信息学来说具有重要的意义。该文研究了k-长DNA子序列在DNA全序列中出现频数的计数问题,设计并实现了k-长DNA子序列内部计数算法和外部计数... 基因组的结构与功能存在密切联系,其功能主要通过DNA子序列来表达,因此研究DNA序列结构对于生物信息学来说具有重要的意义。该文研究了k-长DNA子序列在DNA全序列中出现频数的计数问题,设计并实现了k-长DNA子序列内部计数算法和外部计数算法。该算法通过一个哈希函数把k-长DNA子序列映射为整数关键字从而把k-长DNA子序列出现频数的计数问题转化为整数关键字的重复计数问题,使得能够利用经典B树算法来解决k-长DNA子序列的出现频数计数问题。针对所要解决的问题提出3种改进措施以进一步提高算法的性能。 展开更多
关键词 k-DNA序列 DNA序列 B树 全基因组
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基于高效精确的最大公共子序列的视频片段匹配 被引量:1
19
作者 张玉荣 谢慧 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2010年第22期206-209,共4页
为视频序列匹配提出一个高效精确的最大公共子序列(Efficient and Effective Longest Common Subsequence,EELCS)算法。首先,利用矢量量化(Vector Quantization,VQ)将多维最大公共子序列算法(Multi-dimensionalLCS,MLCS)中元素对匹配过... 为视频序列匹配提出一个高效精确的最大公共子序列(Efficient and Effective Longest Common Subsequence,EELCS)算法。首先,利用矢量量化(Vector Quantization,VQ)将多维最大公共子序列算法(Multi-dimensionalLCS,MLCS)中元素对匹配过程中的实际距离的计算简化成比较操作,较原始的最大公共子序列匹配算法(Original LCS,OLCS),该处理不仅可以继承MLCS的可应用到实际多维时序匹配问题中的优点,同时大大降低了匹配的复杂度;然后进一步区分待匹配序列中由于匹配子序列和未匹配子序列在时间轴上连续性而产生的差异;最后将该算法应用到视频片段的匹配中。实验结果表明,与具有代表性的基于时间规扭曲的最大公共子序列(Time-Warped LCS,T-WLCS)和连续最大公共子序列(Continuous LCS,CLCS)相比,该算法能较好地应用于视频序列的匹配。 展开更多
关键词 视频检索 序列匹配 矢量量化 最大公共序列
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同时最优化时间表长与总完工时间的双代理单机序列分批排序问题 被引量:1
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作者 何程 韩鑫鑫 《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2020年第4期487-494,共8页
本文研究在一台序列分批处理机上同时最优化A代理的时间表长和B代理的总完工时间的双代理排序问题.在序列分批的背景下,工件被分批加工(但不同代理的工件不能在同一批中加工,且每个代理都希望最小化仅依赖于各自工件完工时间的费用函数... 本文研究在一台序列分批处理机上同时最优化A代理的时间表长和B代理的总完工时间的双代理排序问题.在序列分批的背景下,工件被分批加工(但不同代理的工件不能在同一批中加工,且每个代理都希望最小化仅依赖于各自工件完工时间的费用函数)且一批的加工时间等于这一批中所有工件的加工时间和.而且在一个新批开始加工前,机器有一个常数的安装时间.此外,根据批容量,序列分批模型又被分成有界模型和无界模型.在本文中,我们对所研究问题的有界模型和无界模型分别给出了一个多项式时间算法. 展开更多
关键词 代理排序 序列分批 计算复杂性 时间表 总完工时间
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