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海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析
被引量：
1
1
作者
常凯军
谭德冠
+2 位作者
李定琴
孙雪飘
张家明
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009年第27期12965-12967,共3页
[目的]对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。[方法]对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA序列进行分析,对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个I类内含子二级结构模型的构建。...
[目的]对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。[方法]对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA序列进行分析,对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个I类内含子二级结构模型的构建。[结果]橡胶藻16S rRNA在639位点(E.coli序列编号)有一个46 bp的插入片段,该片段能形成一个完美的双发夹结构,对16SrRNA的正常折叠不会产生影响。[结论]这一双发夹结构在其他物种的叶绿体rDNA中还未见报道过。
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关键词
18S核编码核糖体RNA
16S叶绿体编码核糖体RNA
I类内含子
双发夹结构
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职称材料
绿藻Heterochlorella luteoviridis SAG211-2a叶绿体16S rRNA基因研究
2
作者
陈强
马帅
+2 位作者
谭德冠
孙雪飘
张家明
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期142-145,共4页
为了研究绿藻Heterochlorella luteoviridis SAG211-2a叶绿体16S rRNA基因中内含子和双发夹结构在rRNA成熟过程中是否被切除,以来自德国歌德堡大学藻种库的绿藻藻株SAG 211-2a为材料,提取其基因组DNA作为模板,PCR扩增并测序叶绿体16S r...
为了研究绿藻Heterochlorella luteoviridis SAG211-2a叶绿体16S rRNA基因中内含子和双发夹结构在rRNA成熟过程中是否被切除,以来自德国歌德堡大学藻种库的绿藻藻株SAG 211-2a为材料,提取其基因组DNA作为模板,PCR扩增并测序叶绿体16S rRNA基因,与同源物种的16S rRNA基因进行比对;并提取SAG211-2a的总RNA,用一管法RT-PCR法扩增16S rDNA基因成熟转录子后,克隆至pMD19-T表达载体上,转化大肠杆菌DH5α,提取质粒并测序。结果表明,绿藻SAG211-2a叶绿体16S rRNA基因中存在1个长度为46 bp的双发夹结构(DHE)和1个长度为537 bp的Ⅰ类内含子,内含子在rRNA成熟过程中被切除,而双发夹结构却保留在rRNA中,从而验证了双发夹结构在rRNA成熟过程中没有被切除。
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关键词
Ⅰ类内含子
双发夹结构
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职称材料
题名
海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析
被引量：
1
1
作者
常凯军
谭德冠
李定琴
孙雪飘
张家明
机构
中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点开放实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009年第27期12965-12967,共3页
文摘
[目的]对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。[方法]对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA序列进行分析,对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个I类内含子二级结构模型的构建。[结果]橡胶藻16S rRNA在639位点(E.coli序列编号)有一个46 bp的插入片段,该片段能形成一个完美的双发夹结构,对16SrRNA的正常折叠不会产生影响。[结论]这一双发夹结构在其他物种的叶绿体rDNA中还未见报道过。
关键词
18S核编码核糖体RNA
16S叶绿体编码核糖体RNA
I类内含子
双发夹结构
Keywords
18S rDNA
16S rDNA
Group I intron
Double hairpin structure
分类号
S335.4 [农业科学—作物遗传育种]
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职称材料
题名
绿藻Heterochlorella luteoviridis SAG211-2a叶绿体16S rRNA基因研究
2
作者
陈强
马帅
谭德冠
孙雪飘
张家明
机构
海南大学农学院
中国热带农业科学院热带生物技术研究所/海南省热带生物质能源研究中心
出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期142-145,共4页
文摘
为了研究绿藻Heterochlorella luteoviridis SAG211-2a叶绿体16S rRNA基因中内含子和双发夹结构在rRNA成熟过程中是否被切除,以来自德国歌德堡大学藻种库的绿藻藻株SAG 211-2a为材料,提取其基因组DNA作为模板,PCR扩增并测序叶绿体16S rRNA基因,与同源物种的16S rRNA基因进行比对;并提取SAG211-2a的总RNA,用一管法RT-PCR法扩增16S rDNA基因成熟转录子后,克隆至pMD19-T表达载体上,转化大肠杆菌DH5α,提取质粒并测序。结果表明,绿藻SAG211-2a叶绿体16S rRNA基因中存在1个长度为46 bp的双发夹结构(DHE)和1个长度为537 bp的Ⅰ类内含子,内含子在rRNA成熟过程中被切除,而双发夹结构却保留在rRNA中,从而验证了双发夹结构在rRNA成熟过程中没有被切除。
关键词
Ⅰ类内含子
双发夹结构
Keywords
16S rRNA
16S rDNA
Group I intron
double-haipin structure
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析
常凯军
谭德冠
李定琴
孙雪飘
张家明
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2009
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
绿藻Heterochlorella luteoviridis SAG211-2a叶绿体16S rRNA基因研究
陈强
马帅
谭德冠
孙雪飘
张家明
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
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职称材料
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