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基于COI序列的翡翠股贻贝Perna viridis线粒体遗传特性分析及其近缘种间的系统关系探讨
被引量:
7
1
作者
位正鹏
孔晓瑜
+1 位作者
吴相云
喻子牛
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期72-78,共7页
应用通用引物COIL 1490和COIH 2198对翡翠股贻贝Perna viridis的性腺和体细胞线粒体DNA进行PCR扩增,获得661bp长度的COI基因片段,经过比对性腺与体细胞的COI片段,发现雄性性腺与体细胞COI基因均为一个单倍型,即体内只有一种线粒体DNA类...
应用通用引物COIL 1490和COIH 2198对翡翠股贻贝Perna viridis的性腺和体细胞线粒体DNA进行PCR扩增,获得661bp长度的COI基因片段,经过比对性腺与体细胞的COI片段,发现雄性性腺与体细胞COI基因均为一个单倍型,即体内只有一种线粒体DNA类型,没有发现双单性遗传现象,雌、雄性腺的COI基因片段变异率很低(0.31%)。应用PAUP构建NJ树、MP树以及贝叶斯法构建了贝叶斯树,对股贻贝属3种间的系统关系进行了分析,结果表明,翡翠股贻贝P.viridis、P.canaliculus和P.perna之间的分化与分歧年代的估算是相吻合的。
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关键词
线粒体DNA(mt
DNA)
细胞色素氧化酶Ⅰ亚基基因(COI)
翡翠股贻贝Perna
VIRIDIS
双
单性
遗传
(
dui
)
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职称材料
题名
基于COI序列的翡翠股贻贝Perna viridis线粒体遗传特性分析及其近缘种间的系统关系探讨
被引量:
7
1
作者
位正鹏
孔晓瑜
吴相云
喻子牛
机构
中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室
中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室
出处
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期72-78,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30570242)
国家"863"计划项目(2006AA10A409)
文摘
应用通用引物COIL 1490和COIH 2198对翡翠股贻贝Perna viridis的性腺和体细胞线粒体DNA进行PCR扩增,获得661bp长度的COI基因片段,经过比对性腺与体细胞的COI片段,发现雄性性腺与体细胞COI基因均为一个单倍型,即体内只有一种线粒体DNA类型,没有发现双单性遗传现象,雌、雄性腺的COI基因片段变异率很低(0.31%)。应用PAUP构建NJ树、MP树以及贝叶斯法构建了贝叶斯树,对股贻贝属3种间的系统关系进行了分析,结果表明,翡翠股贻贝P.viridis、P.canaliculus和P.perna之间的分化与分歧年代的估算是相吻合的。
关键词
线粒体DNA(mt
DNA)
细胞色素氧化酶Ⅰ亚基基因(COI)
翡翠股贻贝Perna
VIRIDIS
双
单性
遗传
(
dui
)
Keywords
mitochondrial DNA, COI gene, Perna viridis, doubly uniparental inheritance (
dui
)
分类号
Q343.35 [生物学—遗传学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于COI序列的翡翠股贻贝Perna viridis线粒体遗传特性分析及其近缘种间的系统关系探讨
位正鹏
孔晓瑜
吴相云
喻子牛
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
7
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