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一种生物相关性优先的两步卵巢癌化疗疗效敏感基因选取方法
1
作者
韩斌
王清
+2 位作者
解瑞飞
厉力华
祝磊
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期572-581,共10页
作为卵巢癌主要诊疗手段之一的化疗,费用昂贵,副作用大,且患者反应的个体差异很大。本文提出一种首先依据诊断结果(卵巢癌化疗疗效)相关性进行特征选择,然后利用蒙特卡洛方法对特征基因排序,最终建立预测化疗反应模型的方法,克服了过度...
作为卵巢癌主要诊疗手段之一的化疗,费用昂贵,副作用大,且患者反应的个体差异很大。本文提出一种首先依据诊断结果(卵巢癌化疗疗效)相关性进行特征选择,然后利用蒙特卡洛方法对特征基因排序,最终建立预测化疗反应模型的方法,克服了过度依赖分类率的弊端。首先利用奇异值分解,基于散点图和Kolmogorov-Smirnovtest(K-S test)的定性和定量分析非生物因素对基因表达谱的影响,结合化疗反应样本的聚类图进行基因筛选;然后采用基于信息增益的随机森林方法精选基因,得到与化疗相关的敏感基因。实验结果表明,此方法与经典方法(SVMRFE、T-test)相比,所选取出的特征基因具有较好的分类能力且保持稳定;从生物学角度分析显示,此方法所得到的敏感基因与化疗疗效的联系更加紧密,50个基因中,有4个(NR2F2、CLDN3、PURA、C1ORF38)直接与卵巢癌相关;17个(USO1、TCF7L2、NR2F2等)与肿瘤或癌症直接相关,或与肿瘤密切相关的生物过程(例细胞生长与繁殖、新陈代谢、细胞循环、DNA修复等)相关。
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关键词
卵巢癌化疗
疗效
有监督奇异值分解(SSVD)
特征选取
随机森林
决策树
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职称材料
卵巢癌化疗的细胞动力学
2
作者
李小平
崔恒
《实用妇产科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期257-259,共3页
关键词
细胞动力学
恶性肿瘤
化疗
卵巢癌化疗
专题讨论
卵巢
肿瘤细胞
药物作用机制
治疗手段
联合用药
细胞群体
合理
化疗
力学知识
增殖过程
指导意义
化疗
方案
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职称材料
复发性卵巢癌的治疗现状和进展
被引量：
14
3
作者
贺彬彬
孙淑华
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2010年第8期1280-1281,共2页
卵巢癌是一种严重威胁妇女生命的常见妇科恶性肿瘤。近年来以肿瘤细胞减灭术为基础，辅以铂类／紫杉醇联合化疗,使大部分患者获得临床缓解．但最终70％的患者有复发，部分患者产生耐药,治疗效果很不理想。目前，化疗仍是复发性卵巢癌的...
卵巢癌是一种严重威胁妇女生命的常见妇科恶性肿瘤。近年来以肿瘤细胞减灭术为基础，辅以铂类／紫杉醇联合化疗,使大部分患者获得临床缓解．但最终70％的患者有复发，部分患者产生耐药,治疗效果很不理想。目前，化疗仍是复发性卵巢癌的主要治疗手段。本文就复发性卵巢癌化疗的现状和未来趋势进行综述。
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关键词
复发性
卵巢
癌
治疗效果
肿瘤细胞减灭术
妇科恶性肿瘤
联合
化疗
卵巢癌化疗
临床缓解
紫杉醇
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职称材料
题名
一种生物相关性优先的两步卵巢癌化疗疗效敏感基因选取方法
1
作者
韩斌
王清
解瑞飞
厉力华
祝磊
机构
杭州电子科技大学生命信息与仪器工程学院
杭州市肿瘤医院
出处
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期572-581,共10页
基金
国家自然科学基金(60801055
60801054)
浙江省自然科学基金(Z2090299)
文摘
作为卵巢癌主要诊疗手段之一的化疗,费用昂贵,副作用大,且患者反应的个体差异很大。本文提出一种首先依据诊断结果(卵巢癌化疗疗效)相关性进行特征选择,然后利用蒙特卡洛方法对特征基因排序,最终建立预测化疗反应模型的方法,克服了过度依赖分类率的弊端。首先利用奇异值分解,基于散点图和Kolmogorov-Smirnovtest(K-S test)的定性和定量分析非生物因素对基因表达谱的影响,结合化疗反应样本的聚类图进行基因筛选;然后采用基于信息增益的随机森林方法精选基因,得到与化疗相关的敏感基因。实验结果表明,此方法与经典方法(SVMRFE、T-test)相比,所选取出的特征基因具有较好的分类能力且保持稳定;从生物学角度分析显示,此方法所得到的敏感基因与化疗疗效的联系更加紧密,50个基因中,有4个(NR2F2、CLDN3、PURA、C1ORF38)直接与卵巢癌相关;17个(USO1、TCF7L2、NR2F2等)与肿瘤或癌症直接相关,或与肿瘤密切相关的生物过程(例细胞生长与繁殖、新陈代谢、细胞循环、DNA修复等)相关。
关键词
卵巢癌化疗
疗效
有监督奇异值分解(SSVD)
特征选取
随机森林
决策树
Keywords
ovarian cancer chemotherapy
supervised singular value decomposition
gene selection
random forests
decision tree
分类号
R318 [医药卫生—生物医学工程]
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职称材料
题名
卵巢癌化疗的细胞动力学
2
作者
李小平
崔恒
机构
北京大学人民医院妇科肿瘤中心
出处
《实用妇产科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期257-259,共3页
关键词
细胞动力学
恶性肿瘤
化疗
卵巢癌化疗
专题讨论
卵巢
肿瘤细胞
药物作用机制
治疗手段
联合用药
细胞群体
合理
化疗
力学知识
增殖过程
指导意义
化疗
方案
分类号
R735.37 [医药卫生—肿瘤]
R557.1 [医药卫生—血液循环系统疾病]
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职称材料
题名
复发性卵巢癌的治疗现状和进展
被引量：
14
3
作者
贺彬彬
孙淑华
机构
湖北省肿瘤医院妇科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2010年第8期1280-1281,共2页
文摘
卵巢癌是一种严重威胁妇女生命的常见妇科恶性肿瘤。近年来以肿瘤细胞减灭术为基础，辅以铂类／紫杉醇联合化疗,使大部分患者获得临床缓解．但最终70％的患者有复发，部分患者产生耐药,治疗效果很不理想。目前，化疗仍是复发性卵巢癌的主要治疗手段。本文就复发性卵巢癌化疗的现状和未来趋势进行综述。
关键词
复发性
卵巢
癌
治疗效果
肿瘤细胞减灭术
妇科恶性肿瘤
联合
化疗
卵巢癌化疗
临床缓解
紫杉醇
分类号
R737.31 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种生物相关性优先的两步卵巢癌化疗疗效敏感基因选取方法
韩斌
王清
解瑞飞
厉力华
祝磊
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
卵巢癌化疗的细胞动力学
李小平
崔恒
《实用妇产科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2005
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
复发性卵巢癌的治疗现状和进展
贺彬彬
孙淑华
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2010
14
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职称材料
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