目的:利用全基因组表达谱芯片筛查与卵巢浆液性囊腺癌发生相关的基因,对在卵巢浆液性囊腺癌发生过程中可能参与的基因间的信号转导通路进行分析。方法:选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中卵巢浆液性囊腺癌的Affymetrix Gene Chip Human E...目的:利用全基因组表达谱芯片筛查与卵巢浆液性囊腺癌发生相关的基因,对在卵巢浆液性囊腺癌发生过程中可能参与的基因间的信号转导通路进行分析。方法:选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中卵巢浆液性囊腺癌的Affymetrix Gene Chip Human Exon 1.0 ST Array数据共16张,分别为卵巢浆液性囊腺癌组8张和正常组8张,筛选出差异表达基因,并进行基因本体(gene ontology,GO)分析和信号通路分析,构建卵巢浆液性囊腺癌相关基因间的信号转导通路,分析网络中具有重要作用的基因。结果:共筛选出1 144个在卵巢癌中差异表达的基因,其中表达上调的基因有747个,表达下调的基因有397个。GO分析得到上调差异基因的显著性功能分析结果362项,下调差异基因的显著性功能分析结果 160项(P<0.05)。其中包括与肿瘤发生相关的基因功能有细胞周期、DNA复制、细胞增殖、细胞凋亡、细胞黏附等。信号通路分析得到45个显著上调信号通路和14个显著下调信号通路(P<0.05)。其中参与肿瘤发生相关的信号通路主要有细胞周期、P53信号通路、DNA复制、肿瘤中的信号通路、PI3K-Akt信号通路、ECM-receptor信号通路、细胞黏附因子、细胞凋亡等。挑选显著性基因功能和信号通路分析的交集基因229个,构建显著性GO与信号通路基因间信号转导网络。分析发现CDK1、PLK1、MCM3和PGK1这4个基因在卵巢癌的基因调控网络中具有重要作用。结论:卵巢浆液性囊腺癌中有大量差异表达基因,差异表达的基因在多个与肿瘤发生密切相关的信号通路中发挥重要的调控作用。展开更多
