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基于Cox半参数模型检测生存性状的印记数量性状位点
被引量：
1
1
作者
周晓晶
方铭
《黑龙江八一农垦大学学报》
2012年第5期80-84,共5页
在生存分析中,Cox比例风险模型和加速失效模型是研究控制数量性状位点(QTL)的生存时间的常用的方法。本文首先借助于Cox比例风险模型给出了半参数的区间定位方法去表征生存性状的印记数量性状位点(iQTL)。此方法的明显优势是无需估计复...
在生存分析中,Cox比例风险模型和加速失效模型是研究控制数量性状位点(QTL)的生存时间的常用的方法。本文首先借助于Cox比例风险模型给出了半参数的区间定位方法去表征生存性状的印记数量性状位点(iQTL)。此方法的明显优势是无需估计复杂的"讨厌"的基线风险函数。然后构造偏似然函数并根据其推断出iQTL的参数估计。采用期望最大化算法求解iQTL位置和遗传效应的极大似然估计值。所给统计推断方法保证了整个基因组范围内的显著iQTL的估计和检验,在一系列的零假设下,给出了所检测到的iQTL的印记模式。最后,此方法应用于分析一个公开发表的小鼠模型系统数据集。
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关键词
生存
性状
Cox半参数模型
印记数量性状位点
区间定位
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职称材料
题名
基于Cox半参数模型检测生存性状的印记数量性状位点
被引量：
1
1
作者
周晓晶
方铭
机构
黑龙江八一农垦大学理学院数学系
黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院
出处
《黑龙江八一农垦大学学报》
2012年第5期80-84,共5页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(31001001)
文摘
在生存分析中,Cox比例风险模型和加速失效模型是研究控制数量性状位点(QTL)的生存时间的常用的方法。本文首先借助于Cox比例风险模型给出了半参数的区间定位方法去表征生存性状的印记数量性状位点(iQTL)。此方法的明显优势是无需估计复杂的"讨厌"的基线风险函数。然后构造偏似然函数并根据其推断出iQTL的参数估计。采用期望最大化算法求解iQTL位置和遗传效应的极大似然估计值。所给统计推断方法保证了整个基因组范围内的显著iQTL的估计和检验,在一系列的零假设下,给出了所检测到的iQTL的印记模式。最后,此方法应用于分析一个公开发表的小鼠模型系统数据集。
关键词
生存
性状
Cox半参数模型
印记数量性状位点
区间定位
Keywords
survival traits
cox semi-parametric model
imprinted quantitative trait loci
interval mapping
分类号
Q348 [生物学—遗传学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
基于Cox半参数模型检测生存性状的印记数量性状位点
周晓晶
方铭
《黑龙江八一农垦大学学报》
2012
1
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