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印第安纳沙门菌环介导等温扩增检测方法的建立 被引量:3
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作者 龚建森 徐敬潇 +4 位作者 付立霞 张笛 董永毅 徐步 窦新红 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期560-564,共5页
旨在解决印第安纳沙门菌传统检测方法的缺陷,建立快速、特异、灵敏的分子检测方法。通过比较基因组学方法获取印第安纳沙门菌特异性检测靶标,进一步设计用于环介导等温扩增的引物组。通过对反应条件优化,建立针对印第安纳沙门菌的特异... 旨在解决印第安纳沙门菌传统检测方法的缺陷,建立快速、特异、灵敏的分子检测方法。通过比较基因组学方法获取印第安纳沙门菌特异性检测靶标,进一步设计用于环介导等温扩增的引物组。通过对反应条件优化,建立针对印第安纳沙门菌的特异性分子检测方法。结果显示,该检测方法特异性强、耗时短,检测下限为59拷贝·反应-1。应用该方法对临床分离菌株进行检测,结果不仅与国家标准(GB4789.4—2016)检测结果一致,还可用于自凝菌株检测。本研究建立的方法能实现印第安纳沙门菌的快速检测,将在临床诊断中发挥重要作用。 展开更多
关键词 印第安纳沙门菌 环介导等温扩增技术 比较基因组学 检测
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利用温控双表达载体制备印第安纳沙门菌菌蜕 被引量:1
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作者 龚建森 徐敬潇 +4 位作者 付立霞 韩先干 张笛 董永毅 徐步 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期246-251,264,共7页
为制备安全高效的印第安纳沙门菌菌蜕,本研究以温控质粒pTCV为载体,分别构建出只含噬菌体PhiX174裂解基因E的pTCK01质粒、同时含裂解基因E和金黄色葡萄球菌核酸酶A(SNA)的pTCK02质粒及对裂解基因E和SNA密码子优化后的p TCK03质粒,分别... 为制备安全高效的印第安纳沙门菌菌蜕,本研究以温控质粒pTCV为载体,分别构建出只含噬菌体PhiX174裂解基因E的pTCK01质粒、同时含裂解基因E和金黄色葡萄球菌核酸酶A(SNA)的pTCK02质粒及对裂解基因E和SNA密码子优化后的p TCK03质粒,分别转化印第安纳沙门菌S1105后经42℃诱导表达,并对各重组菌开展溶菌动力学监测、重组菌的基因组电泳检测和菌蜕电镜观察。PCR鉴定结果表明,重组质粒pTCK01、pTCK02和pTCK03均正确构建。溶菌动力学显示,含质粒pTCK03的重组菌S1105(pTCK03/S1105)的OD600nm值在诱导后120 min达到最低,且低于重组菌p TCK01/S1105和重组菌pTCK02/S1105,之后一直稳定在最低水平;其溶菌率也显著高于pTCK01/S1105和p TCK02/S1105(p<0.05)。基因组电泳检测结果显示,pTCK03/S1105基因组在诱导1 h后即被降解且降解得最彻底。扫描和透射电镜观察结果显示,pTCK03/S1105菌蜕表面形态明显皱缩,胞质内容物完全释放。上述结果表明,通过优化裂解基因E和SNA密码子可提高印第安纳沙门菌菌蜕的裂解效率,并彻底降解了其遗传物质,本研究为印第安纳沙门菌菌蜕疫苗的研发提供新思路和参考。 展开更多
关键词 印第安纳沙门菌 双表达载体 裂解基因E 金黄色葡萄球核酸酶A
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2007-2017年我国部分地区人源及动物源印第安纳沙门菌耐药特征分析 被引量:6
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作者 王鲁彦 陈家良 +3 位作者 陈丹妮 李杰 刁保卫 闫梅英 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期309-317,共9页
目的回顾性分析2007-2017年我国人来源和动物来源印第安纳沙门菌的耐药表型及遗传特征,为耐药性产生来源提供线索。方法对2007-2017年分离的100株印第安纳沙门菌,采用微量肉汤稀释法测定所有菌株对23种抗菌药物的耐药表型。对全部菌株... 目的回顾性分析2007-2017年我国人来源和动物来源印第安纳沙门菌的耐药表型及遗传特征,为耐药性产生来源提供线索。方法对2007-2017年分离的100株印第安纳沙门菌,采用微量肉汤稀释法测定所有菌株对23种抗菌药物的耐药表型。对全部菌株进行基因组测序,利用ResFinder和PlasmidFinder数据库进行耐药基因和质粒型别鉴定,并构建基于核心基因组SNPs的系统发育树进行菌株间遗传进化关系分析。结果100株印第安纳沙门菌对多种药物都呈现高水平耐药,且对阿米卡星、头孢他啶、头孢噻肟、头孢吡肟、左氧氟沙星、吉米沙星的耐药率均呈现逐年上升趋势。阿莫西林-克拉维酸钾和阿奇霉素动物分离株耐药率高于人源株。IncH家族为印第安纳沙门菌携带质粒主要型别,菌株耐药表型与耐药基因携带一致率在95%以上。基于核心基因组SNPs的系统进化树表明印第安纳沙门菌分布呈现一定的时空聚集性,动物分离株与人分离株交叉分布,部分动物株与人源株聚集在一起。结论我国人源及动物源印第安纳沙门菌的多重耐药现象均较严重。随着时间的推移,菌株对多数药物耐药水平呈上升趋势,人与动物之间存在潜在的交互传播,提示我们应密切关注并加强沙门菌在人间及动物间耐药性变迁的监测,以便及时发现耐药克隆播散。 展开更多
关键词 印第安纳沙门菌 耐药 基因组序列 进化分析
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广东省部分地区禽产品中印第安纳沙门菌的耐药性和耐药基因分子特征研究 被引量:3
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作者 刘海霞 黄雪欢 +5 位作者 邬雨倩 王存敏 詹泽强 高凤磊 廖明 张建民 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2020年第6期96-101,共6页
为了解广东省部分地区禽产品中印第安纳沙门菌的耐药情况和耐药基因分子特征,本研究对2018年分离于广州市及佛山市禽样品中36株印第安纳沙门菌,利用琼脂稀释法检测其耐药性和采用PCR检测其耐药基因,并用脉冲场凝胶电泳对菌株进行分子分... 为了解广东省部分地区禽产品中印第安纳沙门菌的耐药情况和耐药基因分子特征,本研究对2018年分离于广州市及佛山市禽样品中36株印第安纳沙门菌,利用琼脂稀释法检测其耐药性和采用PCR检测其耐药基因,并用脉冲场凝胶电泳对菌株进行分子分型。结果显示:对四环素的耐药性达100%,环丙沙星为55.6%,头孢噻肟为30.6%,97.2%(35/36)株表现出多重耐药性;β-内酰胺酶的质粒blaOXA-1、blaTEM、blaCTX-M-55检出率分别为47.2%、13.9%和2.8%,喹诺酮耐药决定区基因parC和gyrA突变率分别为86.1%和61.1%,在质粒中aac(6’)-Ib-cr、qnrS和qnrB检出率分别为58.3%、36.1%和11.1%;36株印第安纳沙门菌共有32种PFGE基因指纹图谱,且基因型差异较大。本研究结果表明,广东省禽产品中印第安纳沙门菌的感染源较为复杂。 展开更多
关键词 印第安纳沙门菌 耐药性 耐药基因 脉冲场凝胶电泳
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一株印第安纳沙门菌单相变异体的分离鉴定与特征分析
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作者 许姝 王伟 +2 位作者 王学鑫 王月明 许海燕 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期347-350,共4页
目的分析鸡肉源印第安纳沙门菌单相变异体菌株特征。方法2020年从山东济南和江苏扬州超市采集123份鸡肉样品并进行沙门菌分离,利用针对沙门菌肠毒素基因stn的PCR鉴定方法对疑似菌落进行鉴定并使用经典载玻片凝集试验鉴定沙门菌的血清型... 目的分析鸡肉源印第安纳沙门菌单相变异体菌株特征。方法2020年从山东济南和江苏扬州超市采集123份鸡肉样品并进行沙门菌分离,利用针对沙门菌肠毒素基因stn的PCR鉴定方法对疑似菌落进行鉴定并使用经典载玻片凝集试验鉴定沙门菌的血清型,采用微量稀释法测定其对常见15种药物的敏感性,对于无法鉴定出血清型的菌株,最后通过全基因组测序对菌株进行基因组特征分析。结果共分离得到14株沙门菌,并通过全基因组测序和生物信息学分析发现一株ST17的印第安纳沙门菌单相变异体。药敏结果显示该菌株为多重耐药菌株,对氨苄西林、头孢唑林、头孢噻肟、庆大霉素、链霉素、四环素、氯霉素、氟苯尼考、萘啶酸、环丙沙星和复方新诺明耐药。耐药基因分析结果显示该分离株携带7类15种耐药基因,还在喹诺酮耐药决定区存在4个相关的点突变。结论本研究首次报道了一株多重耐药的印第安纳沙门菌单相变异体,并利用全基因组测序技术对其基因组特征进行分析,为沙门菌血清型的鉴定提供了新思路。 展开更多
关键词 印第安纳沙门菌单相变异体 ST17 多重耐药
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山东地区禽源沙门菌的耐药基因流行性调查及分析 被引量:3
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作者 李雪 孙坚 +3 位作者 廖晓萍 黄婷 方亮星 刘雅红 《中国家禽》 北大核心 2015年第18期63-65,共3页
本研究旨在了解山东地区鸡场的禽源沙门菌在2008年和2012年的血清型、耐药基因流行性变化,为耐药沙门菌的流行提供防控依据。收集山东地区13个鸡场的94株沙门菌(2008年51株,2012年43株)进行血清型分析和PCR扩增,并对不同年份的PCR扩增... 本研究旨在了解山东地区鸡场的禽源沙门菌在2008年和2012年的血清型、耐药基因流行性变化,为耐药沙门菌的流行提供防控依据。收集山东地区13个鸡场的94株沙门菌(2008年51株,2012年43株)进行血清型分析和PCR扩增,并对不同年份的PCR扩增结果用R软件进行相关性分析。结果显示,分离自山东地区养鸡场的沙门菌全部是印第安纳血清型;PCR结果显示,从2008年开始,携带blaCTX-M、aac(6′)-Ib-cr、oqx AB基因的沙门菌就已经在山东地区的鸡场内流行,4年后的2012年,这些多重耐药菌不但没有减少反而有增加的趋势,尤其是blaCTX-M-9G基因的检出率显著高于2008年。研究表明山东地区的禽源印第安纳沙门菌已成为该地区的优势流行菌群,并且同时携带能够介导人医和兽医临床耐药的多个耐药基因等方向发展,给临床有效治疗带来了巨大的挑战。 展开更多
关键词 禽源 印第安纳沙门菌 ESBLS
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