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基于单细胞质谱分析的膀胱癌细胞分型研究
被引量：
1
1
作者
孙佳琪
陈安琪
+5 位作者
闫明月
傅广候
李刚强
金百冶
陈腊
闻路红
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期621-627,共7页
单细胞质谱分析能够获得单个细胞的代谢图谱,揭示细胞之间的异质性,在肿瘤学研究中具有重要价值。该文采用单细胞质谱和机器学习技术,建立了膀胱癌细胞亚型的鉴别方法。基于所采集的单细胞代谢数据,分别使用线性判别分析、随机森林、支...
单细胞质谱分析能够获得单个细胞的代谢图谱,揭示细胞之间的异质性,在肿瘤学研究中具有重要价值。该文采用单细胞质谱和机器学习技术,建立了膀胱癌细胞亚型的鉴别方法。基于所采集的单细胞代谢数据,分别使用线性判别分析、随机森林、支持向量机、逻辑回归建立了机器学习分类模型,并进行了模型的性能评估。结果表明,各机器学习模型均具有良好的膀胱癌细胞分型能力,分类准确率≥94.9%,灵敏度≥88.6%,特异度≥93.3%。其中,随机森林算法的分类准确率达100%,模型的受试者工作特征曲线下面积达1。该方法实现了膀胱癌单细胞的代谢物检测及细胞亚型区分,也为更广泛的单细胞代谢组学研究提供了参考。
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关键词
单细胞质谱分析
膀胱癌
代谢物检测
细胞
分型
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职称材料
题名
基于单细胞质谱分析的膀胱癌细胞分型研究
被引量：
1
1
作者
孙佳琪
陈安琪
闫明月
傅广候
李刚强
金百冶
陈腊
闻路红
机构
宁波大学高等技术研究院
宁波华仪宁创智能科技有限公司
广州市华粤行仪器有限公司
浙江大学医学院附属第一医院
出处
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期621-627,共7页
基金
国家重点研发计划资助项目(2022YFF0705002)
国家自然科学基金资助项目(81902604)
+4 种基金
浙江省重点研发计划项目(2020C03026,2020C02023)
宁波市3315创新团队项目(2017A-17-C)
宁波市重点研发计划项目(2022Z130)
广州市番禺区创新创业领军团队资助项目(2017-R01-5)
宁波大学王宽诚幸福基金项目。
文摘
单细胞质谱分析能够获得单个细胞的代谢图谱,揭示细胞之间的异质性,在肿瘤学研究中具有重要价值。该文采用单细胞质谱和机器学习技术,建立了膀胱癌细胞亚型的鉴别方法。基于所采集的单细胞代谢数据,分别使用线性判别分析、随机森林、支持向量机、逻辑回归建立了机器学习分类模型,并进行了模型的性能评估。结果表明,各机器学习模型均具有良好的膀胱癌细胞分型能力,分类准确率≥94.9%,灵敏度≥88.6%,特异度≥93.3%。其中,随机森林算法的分类准确率达100%,模型的受试者工作特征曲线下面积达1。该方法实现了膀胱癌单细胞的代谢物检测及细胞亚型区分,也为更广泛的单细胞代谢组学研究提供了参考。
关键词
单细胞质谱分析
膀胱癌
代谢物检测
细胞
分型
Keywords
single-cell mass spectrometry
bladder cancer
metabolite detection
cell typing
分类号
O657.63 [理学—分析化学]
Q251 [生物学—细胞生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于单细胞质谱分析的膀胱癌细胞分型研究
孙佳琪
陈安琪
闫明月
傅广候
李刚强
金百冶
陈腊
闻路红
《分析测试学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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