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单管双向等位基因专一性扩增方法在近交系小鼠遗传检测中的应用 被引量:11
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作者 胡培丽 范昌发 +1 位作者 岳秉飞 邢瑞昌 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2006年第4期246-250,共5页
目的将新近建立的单管双向等位基因专一性扩增(single-tube bi-directional allele specific amplification,SB-ASA)方法用于分析近交系小鼠基因组中的单核苷酸多态性(SNP)。方法以5个近交系小鼠为研究对象,采用SB-ASA方法对其16个SNP... 目的将新近建立的单管双向等位基因专一性扩增(single-tube bi-directional allele specific amplification,SB-ASA)方法用于分析近交系小鼠基因组中的单核苷酸多态性(SNP)。方法以5个近交系小鼠为研究对象,采用SB-ASA方法对其16个SNP位点进行检测,并通过双盲实验和测序验证该方法的可靠性;且考察了该方法中PCR反应各成分及扩增条件对结果的影响。结果16个SNP位点,SB-ASA都成功地对5个品系小鼠进行了分型,与测序结果完全一致;双盲实验结果显示通过3个SNP位点即可鉴别5个品系。结论SB-ASA方法可用于近交系小鼠SNP的遗传检测,可望作为一种新的分子生物学遗传检测方法推广应用。 展开更多
关键词 多态性 单核苷酸 单管双向等位基因专一性扩增 小鼠 近交系 遗传检测
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单管等位基因特异性扩增法同时测定多重单核苷酸多态性
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作者 汪维鹏 李融 王森 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期576-581,共6页
目的:建立了一种单管等位基因特异性扩增法同时测定多重单核苷酸多态性(SNP)。方法:以TYR基因外显子1上的3个SNP位点(71G>A、425A>T和758G>A)为例,首先采用PCR预扩增得一段含所有待测SNP位点的长片段;然后用限制性内切酶将其... 目的:建立了一种单管等位基因特异性扩增法同时测定多重单核苷酸多态性(SNP)。方法:以TYR基因外显子1上的3个SNP位点(71G>A、425A>T和758G>A)为例,首先采用PCR预扩增得一段含所有待测SNP位点的长片段;然后用限制性内切酶将其消化成短片段,在连接酶的作用下与设计的DNA适配器相连;以此连接产物为模板,在单个PCR管中加入一种适配器特异性通用引物和所有等位基因特异性引物进行PCR扩增;最后用琼脂糖凝胶电泳法分离检测PCR扩增产物,并根据扩增片段的大小判断SNP的类型。结果:采用该法成功测定了30名健康中国人的TYR基因中的3个SNP位点,与限制性片段长度多态性法(RFLP)测定结果完全一致。结论:该方法特异性高、结果准确、检测成本低,可用于同时测定多个SNP位点。 展开更多
关键词 等位基因特异性 单核苷酸多态性 单管 多重PCR TYR
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一种快速的leptin^(ob)和leptinr^(db)等位基因SNP分型方法 被引量:3
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作者 胡培丽 王金恒 岳秉飞 《中国比较医学杂志》 CAS 2010年第2期54-57,61,共5页
目的建立leptinob和leptinrdb等位基因的SNP分型方法-单管双向等位基因专一性扩增(single-tubebi-directional allele specific amplification,SB-ASA),同时与传统的PCR-酶切法进行比较分析。方法用PCR-酶切法和SB-ASA方法同时对ob/+杂... 目的建立leptinob和leptinrdb等位基因的SNP分型方法-单管双向等位基因专一性扩增(single-tubebi-directional allele specific amplification,SB-ASA),同时与传统的PCR-酶切法进行比较分析。方法用PCR-酶切法和SB-ASA方法同时对ob/+杂合小鼠的7只后代小鼠和db/m的9只后代小鼠进行了检测分型。结果两种方法都成功地对ob、db小鼠进行了分型,且结果完全一致。结论成功建立了一种快速的leptinob和leptinrdb等位基因的SNP分型方法-SB-ASA,促进了ob、db小鼠的繁殖育种工作。 展开更多
关键词 ob DB SNP 单管双向等位基因专一性扩增 小鼠
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鳜胰蛋白酶基因外显子3上SNP G169A位点鉴定和四种不同检测方法的比较 被引量:1
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作者 于海静 梁旭方 +2 位作者 方荣 彭敏燕 朱滔 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2011年第6期9-14,共6页
采用PCR产物直接测序法(DS)对鳜(Siniperca chuatsi)胰蛋白酶基因(TRY)进行单核苷酸多态性(SNPs)分析,发现外显子3上的G169A多态性。对312个样品进行分析,共发现三种基因型GG、GA、AA,其基因型频率分别为0.26、0.54、0.20,两个等位基因G... 采用PCR产物直接测序法(DS)对鳜(Siniperca chuatsi)胰蛋白酶基因(TRY)进行单核苷酸多态性(SNPs)分析,发现外显子3上的G169A多态性。对312个样品进行分析,共发现三种基因型GG、GA、AA,其基因型频率分别为0.26、0.54、0.20,两个等位基因G和A的基因频率分别为0.53和0.47。用创造限制性酶切位点法PCR(CRS-PCR)、单管双向等位基因专一性扩增(SB-ASA)和单链构象多态性分析(PCR-SSCP)对该SNP位点进行验证。结果表明,CRS-PCR法不能对该SNP位点分型,PCR-SSCP和SB-ASA法可以且准确度分别为100%和96.67%。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 直接测序法 单链构象多态性分析 单管双向等位基因专一性扩增 创造限制酶切位点法
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瓢鸡3个防御素基因(AvBD4、AvBD5、AvBD14)的Bi-PASA分子标记与沙门菌易感性的相关性研究 被引量:1
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作者 黄梦阳 李杨 +5 位作者 张林云 陈多珍 富国文 杨向东 罗袁山 史宪伟 《中国家禽》 北大核心 2019年第19期10-15,共6页
研究以3个防御素基因(AvBD4、AvBD5、AvBD14)为鸡沙门菌易感性候选基因,以瓢鸡成年鸡沙门菌阳性群体与阴性对照群体为研究对象,采用序列测定和双向PCR扩增特异等位基因标记(Bi-PASA)技术,分析了3个防御素基因变异与沙门菌易感性的相关... 研究以3个防御素基因(AvBD4、AvBD5、AvBD14)为鸡沙门菌易感性候选基因,以瓢鸡成年鸡沙门菌阳性群体与阴性对照群体为研究对象,采用序列测定和双向PCR扩增特异等位基因标记(Bi-PASA)技术,分析了3个防御素基因变异与沙门菌易感性的相关性。结果显示:在瓢鸡每个防御素基因编码区均检测到一个引起氨基酸变异的多态位点,分别建立了3个防御素基因的Bi-PASA分子标记;AvBD5基因A799G位点与瓢鸡沙门菌易感性的相关性达到极显著水平(P=0.0039),AvBD14基因的A2096T位点达到显著水平(P=0.017),而AvBD4相关性不显著(P=0.599);根据比值比(OR)与95%CI确定了每个防御素基因的保护基因型与易感基因型。研究结果对阐明防御素基因与沙门菌易感性的关系以及建立沙门菌抵抗力鸡群具有重要意义。 展开更多
关键词 瓢鸡 沙门菌 防御素基因 双向特异等位基因PCR 相关性
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4个近交系小鼠SNP位点的测定 被引量:12
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作者 胡培丽 范昌发 +1 位作者 岳秉飞 邢瑞昌 《中国比较医学杂志》 CAS 2006年第5期278-280,共3页
目的将新近建立的单管双向等位基因专一性扩增(single_tube bi_directional allele specific amplification,SB_ASA)方法用于分析国内近交系小鼠基因组中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)。方法以国内4个近交系小... 目的将新近建立的单管双向等位基因专一性扩增(single_tube bi_directional allele specific amplification,SB_ASA)方法用于分析国内近交系小鼠基因组中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)。方法以国内4个近交系小鼠为研究对象,采用SB_ASA方法对其16个SNP位点进行检测,并通过测序进行验证。结果16个SNP位点,SB_ASA都成功地对4个品系小鼠进行了分型,与测序结果完全一致。结论SB_ASA方法可以准确地检测国内近交系小鼠SNP位点等位基因型。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 单管双向等位基因专一性扩增 小鼠 近交系 遗传检测
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