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绵羊和人主要组织相容性复合体DRB1基因外显子2多态性及生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
陈月娥
李建华
+3 位作者
苟亚峰
王文文
朱军保
高剑峰
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第4期66-70,共5页
本试验旨在研究绵羊和人的主要组织相容性复合体(MHC)DRB1基因外显子2(exon2)单核苷酸多态性(SNPs)和单氨基酸多态性(SAPs),并进行生物信息学分析。运用生物基因组学数据库,利用生物信息学及比较基因组学方法对人与绵羊MHC-DRB1基因exon...
本试验旨在研究绵羊和人的主要组织相容性复合体(MHC)DRB1基因外显子2(exon2)单核苷酸多态性(SNPs)和单氨基酸多态性(SAPs),并进行生物信息学分析。运用生物基因组学数据库,利用生物信息学及比较基因组学方法对人与绵羊MHC-DRB1基因exon2序列多态性进行分析,采用生物信息学软件对绵羊MHC-DRB1的蛋白质结构及生物学功能进行预测和分析。结果显示,人主要组织相容性复合体(HLA)和绵羊主要组织相容性复合体(OLA)的DRB1exon2均存在丰富的SNPs位点和SAPs位点,单一多态位点和简约多态位点数不尽相同,二者相比仅有14个SNPs位点相同,其余位点均不同。序列分析结果表明,二者MHC-DRB1exon2序列具有高度相似性。进一步生物信息学分析结果显示序列变异引起的单氨基酸变化引发了蛋白质二级结构和三级结构的改变,可能因此会引起基因功能的异常,从而引发抗病性和疾病易感性的变异。
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关键词
绵羊主要组织相容性复合体DRB1
人主要组织相容性复合体DRB1
单
核苷酸
多态性
单氨基酸多态性
生物信
息学
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职称材料
题名
绵羊和人主要组织相容性复合体DRB1基因外显子2多态性及生物信息学分析
被引量：
3
1
作者
陈月娥
李建华
苟亚峰
王文文
朱军保
高剑峰
机构
石河子大学生命科学学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第4期66-70,共5页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)(2010CB530200)
文摘
本试验旨在研究绵羊和人的主要组织相容性复合体(MHC)DRB1基因外显子2(exon2)单核苷酸多态性(SNPs)和单氨基酸多态性(SAPs),并进行生物信息学分析。运用生物基因组学数据库,利用生物信息学及比较基因组学方法对人与绵羊MHC-DRB1基因exon2序列多态性进行分析,采用生物信息学软件对绵羊MHC-DRB1的蛋白质结构及生物学功能进行预测和分析。结果显示,人主要组织相容性复合体(HLA)和绵羊主要组织相容性复合体(OLA)的DRB1exon2均存在丰富的SNPs位点和SAPs位点,单一多态位点和简约多态位点数不尽相同,二者相比仅有14个SNPs位点相同,其余位点均不同。序列分析结果表明,二者MHC-DRB1exon2序列具有高度相似性。进一步生物信息学分析结果显示序列变异引起的单氨基酸变化引发了蛋白质二级结构和三级结构的改变,可能因此会引起基因功能的异常,从而引发抗病性和疾病易感性的变异。
关键词
绵羊主要组织相容性复合体DRB1
人主要组织相容性复合体DRB1
单
核苷酸
多态性
单氨基酸多态性
生物信
息学
Keywords
Ovis aries MHC-DRBI
Homo sapiens MHC-DRB1
single nucleotide polymorphisms
single amino acid polymorphisms
bio-informatics
分类号
S858.26 [农业科学—临床兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
绵羊和人主要组织相容性复合体DRB1基因外显子2多态性及生物信息学分析
陈月娥
李建华
苟亚峰
王文文
朱军保
高剑峰
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014
3
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