多倍体植物中单核苷酸多态性(SNPs)的开发 被引量：6

1

作者 贺道华 邢宏宜 +3 位作者 赵俊兴 赵艳宁 齐程 王艳婷 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期485-492,共8页

单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上由单核苷酸的变异所引起的一种DNA序列多态性.在人、拟南芥、水稻等二倍体生物中,已经开发出大量的SNP标记并被用于群体结构分析、关联作图等研究,而在棉花、油菜、小麦等多倍体植物中,SNP的开发... 单核苷酸多态性(SNP)是指在基因组水平上由单核苷酸的变异所引起的一种DNA序列多态性.在人、拟南芥、水稻等二倍体生物中,已经开发出大量的SNP标记并被用于群体结构分析、关联作图等研究,而在棉花、油菜、小麦等多倍体植物中,SNP的开发与应用却进展迟缓.为促进多倍体植物中SNP的开发,本文对多倍体植物中SNP标记开发所遇到的难题进行了阐述,并对多倍体中SNP标记开发方法进行了梳理,包括位点特异性引物的PCR片段直接测序,利用多倍体的近缘二倍体区分SNPs和部分同源序列间的差异(homoeologous sequence variants,HSVs),利用2代测序技术大规模发掘SNPs,基于公共数据库的序列通过生物信息学分析获取候选SNPs,通过遗传(分离)模式的研究验证SNPs等.利用上述方法可实现多倍体植物中SNP标记的大规模开发. 展开更多

关键词 多倍体 单核苷酸多态性 标记开发 部分同源性

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单核苷酸多态性(SNP)分子标记在小麦遗传育种中的研究进展 被引量：13

2

作者 吴澎 刘娟 田纪春 《农学学报》 2019年第1期54-58,共5页

为了了解单核苷酸多态性(SNP)标记在小麦遗传育种中的研究进展并为下一步在面粉制品中的应用奠定基础,本研究归纳了SNP分子标记所具有的特点以及应用比较普遍的检测方法,包括DNA构象法、高分辨溶解曲线法及直接测序法等检测方法;总结了... 为了了解单核苷酸多态性(SNP)标记在小麦遗传育种中的研究进展并为下一步在面粉制品中的应用奠定基础,本研究归纳了SNP分子标记所具有的特点以及应用比较普遍的检测方法,包括DNA构象法、高分辨溶解曲线法及直接测序法等检测方法;总结了近几年SNP标记在小麦遗传图谱的构建、作物育种、全基因组关联分析、遗传多样性和物种进化等方面的研究进展;最后提出可开发不同作物的高通量SNP芯片使SNP的研究向高通量化、全基因组发展,以及培育具有良好面制品感官特性的小麦新品种。 展开更多

关键词 单核苷酸多态性标记 遗传图谱 全基因组关联分析 作物育种 小麦

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单核苷酸多态性作为新一代分子标记的优越性 被引量：9

3

作者 王淑新 连林生 《中国畜牧兽医》 CAS 2008年第4期31-33,共3页

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上,为数众多且分布广泛,遗传稳定,现已成为新一代的分子标记,其相关研究方兴未艾。遂作者将SNP的优越性做了一个多方面的阐述... 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上,为数众多且分布广泛,遗传稳定,现已成为新一代的分子标记,其相关研究方兴未艾。遂作者将SNP的优越性做了一个多方面的阐述,以期对SNP的认识及以后的深入研究有所帮助。 展开更多

关键词 分子标记 单核苷酸多态性 优越性

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‘永泰’杨梅亲本鉴定及其单核苷酸多态性遗传变异分析 被引量：3

4

作者 陈方永 胡丹 +2 位作者 颜帮国 倪海枝 王引 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期708-717,共10页

采用基因组重测序和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)系统进化树构建等方法,研究‘永泰’和9个相关品种的亲缘关系,并开发了4025个SNP核心标记用于遗传和育种研究。根据SNP位点的变异性计算遗传相似系数(genetic sim... 采用基因组重测序和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)系统进化树构建等方法,研究‘永泰’和9个相关品种的亲缘关系,并开发了4025个SNP核心标记用于遗传和育种研究。根据SNP位点的变异性计算遗传相似系数(genetic similarity,GS),得出‘永泰’与亲本‘硬丝’的GS为0.99783。系统进化树构建结果表明,10个品种分为2组,其中:‘黑晶’‘东岙早梅’‘乌紫’‘荸荠’‘木叶’5个品种聚为一组;‘早大梅’‘早佳’‘软丝’‘永泰’‘硬丝’5个品种聚为一组,且‘硬丝’与变异品种‘永泰’聚为一小支。同时,‘永泰’在叶片大小、叶缘、叶脉等形态学性状和果实口感上与亲本存在显著差异。通过‘永泰’与参考基因组对比注释,共得到4660个单核苷酸变异位点。根据研究结果推断,‘永泰’叶片和果实产生显著形态变异的原因可能是SNP位点产生了转换和颠换以及核苷酸序列发生了突变。由此可见,‘永泰’既有亲本‘硬丝’的基本特征,也有与其形态学和果实口感上存在的典型差异。 展开更多

关键词 杨梅 亲缘关系 单核苷酸多态性标记开发 变异

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馒头质构性状与单核苷酸多态性标记关联分析

5

作者 刘娟 陈广凤 +5 位作者 田纪春 吴澎 赵子彤 杨艺 李向阳 唐晓珍 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期269-276,共8页

质构是影响馒头品质的一个重要因素,研究馒头质构相关性状的基因位点对改良其品质具有指导意义。以205份小麦品种为实验材料,利用分布于小麦21条染色体的24 355个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记对其制成的馒... 质构是影响馒头品质的一个重要因素,研究馒头质构相关性状的基因位点对改良其品质具有指导意义。以205份小麦品种为实验材料,利用分布于小麦21条染色体的24 355个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记对其制成的馒头质构性状进行全基因组关联分析。共检测到与馒头质构性状显著关联的位点313个。其中,31个极显著(p<0.000 1)关联位点,11个位点至少在两个环境中表达,46个高遗传贡献率位点(R^2>10%),分布在小麦21条染色体中的15条。同时,还得到5个主效关联位点,如控制黏着性的极显著位点Kukri_c13329_800,在两个环境中表达且遗传贡献率>10%。得到的控制馒头质构相关性状的位点为在分子水平上研究馒头品质相关性状提供了一定参考。 展开更多

关键词 小麦 馒头质构 全基因组关联分析 单核苷酸多态性标记

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单核苷酸多态性在多倍体作物油菜中的研究进展 被引量：8

6

作者 王会 刘佳 +1 位作者 付丽 梅德圣 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期422-429,436,共9页

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是新型分子标记,广泛存在于生物基因组中,在人类及动物的许多研究领域得到了应用,但是在油菜等一些重要的多倍体植物中应用较少。本文以油菜为例,对作物中常用的SNP开发及检测方法... 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是新型分子标记,广泛存在于生物基因组中,在人类及动物的许多研究领域得到了应用,但是在油菜等一些重要的多倍体植物中应用较少。本文以油菜为例,对作物中常用的SNP开发及检测方法作了概述,其中包括第二代测序方法和SNP芯片等快速发展的新技术;综述了SNP在油菜基因定位、遗传多样性研究、全基因组关联分析等研究中的应用进展;讨论了作物SNP研究的发展趋势;以期为SNP在油菜等重要多倍体作物中广泛应用提供参考。 展开更多

关键词 多倍体作物 单核苷酸多态性 分子标记 油菜

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单核苷酸多态性的发掘、鉴定及其在果树上应用的研究进展 被引量：1

7

作者 魏召新 张凌云 +2 位作者 曾培 李翀 钟广炎 《中国南方果树》 北大核心 2010年第3期86-90,共5页

单核苷酸多态性(SNP)作为第三代遗传标记,已在主要模式植物和作物中大规模开发研究。在果树中,SNP研究起步相对较晚,但进展不小。对以果树为主的SNP鉴定、开发状况,SNP在遗传多样性分析、系统进化分析、分子标记与遗传作图、基因定位及... 单核苷酸多态性(SNP)作为第三代遗传标记,已在主要模式植物和作物中大规模开发研究。在果树中,SNP研究起步相对较晚,但进展不小。对以果树为主的SNP鉴定、开发状况,SNP在遗传多样性分析、系统进化分析、分子标记与遗传作图、基因定位及功能研究中的最新进展进行了综述。展望了SNP研究在果树上的利用前景。 展开更多

关键词 单核苷酸多态性 分子标记 果树 遗传育种

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单核苷酸多态性及其在羊育种中的应用 被引量：1

8

作者 王红娜 张英杰 +2 位作者 刘月琴 任立坤 杨少华 《中国草食动物科学》 CAS 2012年第S1期71-75,共5页

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）最早于1994年出现在人类分子遗传杂志上,随后美国麻省理工学院学者Lander^[1]在Science上第1次正式提出SNPs为新一代分子标记。它是继限制性片段长度多... 单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）最早于1994年出现在人类分子遗传杂志上,随后美国麻省理工学院学者Lander^[1]在Science上第1次正式提出SNPs为新一代分子标记。它是继限制性片段长度多态性（RFLP）、微卫星标记（SSR）之后的第3代分子标记。SNP作为一种遗传学研究策略可以满足当前研究的各种要求。随着SNP研究和开发的迅速发展,SNP已经成为羊基因组分析的一个重要的研究工具,已经应用于经济性状QTL位点的定位以及优良性状的选育。 展开更多

关键词 基因组分析 单核苷酸多态性 微卫星标记 子标记 排卵数 编码区 SNPS 群体遗传多样性 萨福克羊

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单核苷酸多态性及其在海洋动物遗传研究中的应用 被引量：1

9

作者 李军 喻子牛 《南方水产》 2010年第3期74-80,共7页

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是基因组水平上单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性,是继限制性片段长度多态性、微卫星标记之后的第三代分子标记。最初SNPs主要应用在人类重要疾病的关联性研究中,随着检测技... 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是基因组水平上单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性,是继限制性片段长度多态性、微卫星标记之后的第三代分子标记。最初SNPs主要应用在人类重要疾病的关联性研究中,随着检测技术不断提高以及各种生物SNP数据库的不断完善,其逐渐被应用于遗传图谱的构建、群体遗传学、亲缘关系、关联分析和基因功能分析等方面。文章主要介绍了SNPs的发生、特点及常用检测方法,综述了SNPs在海洋生物遗传学中的研究进展,以期将SNPs更好地应用到海洋经济动物遗传育种中。 展开更多

关键词 单核苷酸多态性 分子标记 海洋生物 遗传研究与应用

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单核苷酸多态性(SNP)分型的主要方法及研究进展 被引量：4

10

作者 刘健 宋倩倩 +1 位作者 翁巧琴 张金枝 《浙江畜牧兽医》 2016年第3期12-14,共3页

近年来,随着现代分子生物学的发展,遗传标记也在不断的发展与进步。目前,基因的单核苷酸多态性（SNP）已成为继RFLP,SSR之后的第三代分子遗传标记。SNP是指在基因组水平上单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性,包括单碱基转换、颠换、插... 近年来,随着现代分子生物学的发展,遗传标记也在不断的发展与进步。目前,基因的单核苷酸多态性（SNP）已成为继RFLP,SSR之后的第三代分子遗传标记。SNP是指在基因组水平上单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性,包括单碱基转换、颠换、插入及缺失等形式,具有数量丰富,分辨率高,覆盖基因组范围大,遗传稳定等主要优点。因此,SNP可广泛应用于农学、医学及生物进化等相关领域,作为稳定的分子遗传标记从而开展相关研究。 展开更多

关键词 遗传标记 单核苷酸多态性 基因组水平 SNP 序列多态性 颠换 DNA 生物进化 单碱基 等位基因特异性

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单核苷酸多态性在大豆育种中的应用 被引量：6

11

作者 许阳 李东潮 +3 位作者 李晓丽 王飞雪 徐青 张明辉 《安徽农业科学》 CAS 2004年第5期1000-1002,共3页

单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism ,SNP)是指DNA序列上的单个碱基变异 ,它具有分布广、多态信息量大、易于检测和统计分析等优点 ,被称为继RFLP和微卫星标记后的第三代基因遗传标记。单核苷酸多态性是等位基因间序列差异... 单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism ,SNP)是指DNA序列上的单个碱基变异 ,它具有分布广、多态信息量大、易于检测和统计分析等优点 ,被称为继RFLP和微卫星标记后的第三代基因遗传标记。单核苷酸多态性是等位基因间序列差异最为普遍的类型 ,可作为一种高通量的遗传标记。已建立PCR扩增目标序列及其产物测序和电子SNP(eSNP)等多种发现和检测SNP的方法。大豆等作物也已开展了SNP分析。 展开更多

关键词 单核苷酸多态性(SNPs) 分子标记 大豆 连锁不平衡

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单核苷酸突变的检测及其在畜牧业中的应用前景 被引量：13

12

作者 屈彦纯 邓昌彦 刘桂兰 《国外畜牧科技》 2001年第4期39-42,共4页

单核苷酸多态性 ( SNP)是最新发展起来的第 3代分子标记 ,具有密度高、双等位基因、易实现自动化检测的特点。本文重点介绍了 SNP检测的方法和原理及其在畜牧业研究生产中的广泛利用前景。并提出

关键词 SNP 分子标记 等位基因 单核苷酸多态性 单核苷酸突变 检测 畜牧业 应用前景

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影响猪生长和肉质性状的显著SNP在大约克和长白群体内的多态性分析 被引量：2

13

作者 王彦平 王怀中 +2 位作者 姜运良 郭建凤 王继英 《山东农业科学》 2016年第8期128-133,共6页

通过文献搜索,收集整理了影响猪生长和肉质性状的显著单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,基于飞行时间质谱技术对大约克(n=400)和长白(n=399)样本进行SNP快速分型,并分析了这些位点在大约克和长白群体内的基因型... 通过文献搜索,收集整理了影响猪生长和肉质性状的显著单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,基于飞行时间质谱技术对大约克(n=400)和长白(n=399)样本进行SNP快速分型,并分析了这些位点在大约克和长白群体内的基因型、等位基因频率、哈代-温伯格平衡状态等遗传学特征。结果表明:利用飞行时间质谱技术可对17个影响猪肉质和生长性状的显著SNP位点进行同时快速基因分型,平均个体检出率为96.35%;17个被检SNP位点中9个为多态位点,其它8个为只有一种基因型的单态位点;多态SNP位点中有6个处于哈代-温伯格平衡状态,其它3个严重偏离哈代-温伯格平衡。本研究收集了对猪生长和肉质性状具有显著效应的SNP位点,探讨了利用飞行质谱技术进行多位点SNP快速分型的可行性,为今后建立猪生长和肉质性状标记辅助选择、加快猪的遗传研究进展奠定基础。 展开更多

关键词 猪 飞行时间质谱技术 单核苷酸多态性(SNP) 等位基因频率 标记辅助选择

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大白菜EST-SSR标记开发中非SSR标记的鉴别 被引量：1

14

作者 周新成 刘立峰 +1 位作者 李化银 高建伟 《山东农业科学》 2010年第4期1-3,7,共4页

EST-SSR标记开发过程中经常会遇到一些问题,例如引物重复设计等。本试验对从大白菜EST序列中开发的30个多态性SSR标记产生的多态性条带进行测序,结果发现有一些标记的多态性并不是由于其所含有的简单重复序列重复次数的改变引起的,这类... EST-SSR标记开发过程中经常会遇到一些问题,例如引物重复设计等。本试验对从大白菜EST序列中开发的30个多态性SSR标记产生的多态性条带进行测序,结果发现有一些标记的多态性并不是由于其所含有的简单重复序列重复次数的改变引起的,这类标记约占鉴定标记总数的13%。这些标记实际上属于EST-SCAR标记。在进行SSR变异对基因表达及功能影响方面的研究时,这类非SSR标记应该被排除。 展开更多

关键词 EST—SSR 标记开发 多态性 测序 大白菜

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策勒黑羊、和田羊和卡拉库尔羊血液蛋白多态性研究 被引量：2

15

作者 祁成年 雷红 姜锋韬 《中国草食动物》 2010年第4期35-36,共2页

关键词 血液蛋白多态性 卡拉库尔羊 策勒黑羊 和田羊 遗传多样性分析 遗传标记 种质资源保护 开发利用

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基于石榴全基因组序列的SSR标记开发及鉴定 被引量：15

16

作者 洪文娟 郝兆祥 +5 位作者 刘康佳 罗华 毕润霞 苑兆和 宗世祥 王君 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期38-47,共10页

【目的】利用cDNA文库筛选的石榴SSR多态性标记数量有限,为进一步推动石榴遗传多样性分析、遗传图谱构建、品种鉴定等研究,有必要系统开发高效稳定的分子标记位点。【方法】本研究根据已发表的石榴基因组测序数据利用MISA软件对1~6核苷... 【目的】利用cDNA文库筛选的石榴SSR多态性标记数量有限,为进一步推动石榴遗传多样性分析、遗传图谱构建、品种鉴定等研究,有必要系统开发高效稳定的分子标记位点。【方法】本研究根据已发表的石榴基因组测序数据利用MISA软件对1~6核苷酸重复的SSR位点进行了查找,分析了不同类型SSR位点的序列特征,进而设计引物并检测了引物的有效性和多态性。【结果】(1)石榴基因组中共检测到146 445个SSR位点,其中以单核苷酸重复型SSR最多(占51.95%),六核苷酸重复型最少(仅占0.38%);SSR序列以A/T碱基占主导,具有偏向性。(2)石榴基因组SSR序列长度变化范围为10~252 bp,平均长度15.48 bp。不同长度重复单元类型的SSR序列长度存在丰富变异,呈现随着重复次数增多,SSR序列丰度减少的趋势。(3)根据不同类型SSR位点设计并合成引物140对,其中119对在12份石榴种质中可扩增出有效条带,41对可产生多态性条带,PIC值在0.007~0.566之间;从中筛选出多态性较高、稳定性好的引物15对,共检测到等位基因44个,平均每个SSR位点检测到2.933 3个等位基因。【结论】利用石榴全基因组序列可实现SSR标记的大规模开发,并可鉴定出大量适用于石榴遗传多样性分析、遗传图谱构建、品种鉴定等研究的SSR引物。相关研究为石榴的遗传育种研究提供了丰富的SSR序列信息和标记资源。 展开更多

关键词 石榴 基因组 SSR 标记开发 多态性

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基于转录组分析的甘薯贮藏根淀粉含量相关SNPs开发

17

作者 秦桢 王庆美 +7 位作者 李爱贤 周媛媛 解备涛 段文学 张海燕 李广华 董顺旭 侯夫云 《山东农业科学》 北大核心 2024年第12期10-15,共6页

甘薯是重要的粮食和经济作物,贮藏根淀粉含量是甘薯的重要农艺性状,开发与淀粉含量相关的分子标记对于加快育种进程具有重要意义。但甘薯具有自交不亲和特性,基因组是高度杂合的六倍体,增加了开发分子标记的难度。本试验以高淀粉品种漯... 甘薯是重要的粮食和经济作物,贮藏根淀粉含量是甘薯的重要农艺性状,开发与淀粉含量相关的分子标记对于加快育种进程具有重要意义。但甘薯具有自交不亲和特性,基因组是高度杂合的六倍体,增加了开发分子标记的难度。本试验以高淀粉品种漯徐薯8号和低淀粉品种郑薯20及其杂交F1代中6个高淀粉株系和6个低淀粉株系为材料,基于转录组测序分析并结合表型分析,发现44个高淀粉特异的SNPs位点,从中选取9个进行PCR单克隆分析,筛选到3个与高淀粉含量显著相关的位点,分别为chr9.27120209、chr9.27120256和chr9.13675504,用上述12个株系和F_(1)群体中的另外16个株系进行验证,最终得到3个与贮藏根淀粉含量相关的单核苷酸多态性(SNPs)位点。本试验丰富了甘薯分子标记开发的途径,为甘薯贮藏根淀粉含量相关育种提供了可选择的标记。 展开更多

关键词 甘薯 贮藏根 淀粉含量 单核苷酸多态性标记 转录组分析

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基于稀疏表示的精神分裂症生物标记物筛选方法 被引量：2

18

作者 武杰 魏凤仙 付令 《中国生物医学工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期692-696,共5页

精神分裂症是以思维、情感与行为的分裂为主要特征的一类复杂精神疾病,国内外大量研究发现遗传因素是该疾病发生的重要原因。为了能够从大量影像学和遗传学数据中找出精神分裂症相关的生物标记物,受稀疏表示的启发,提出一种基于稀疏表... 精神分裂症是以思维、情感与行为的分裂为主要特征的一类复杂精神疾病,国内外大量研究发现遗传因素是该疾病发生的重要原因。为了能够从大量影像学和遗传学数据中找出精神分裂症相关的生物标记物,受稀疏表示的启发,提出一种基于稀疏表示的影像遗传学数据整合分析方法,并应用于对精神分裂症相关生物标记物的筛选。针对从208个样本中提取到的41 236组f MRI和722 177组SNP数据,通过对传统稀疏表示模型施加广义惩罚限制,然后对两类数据施加不同的权重因子α1、α2,并且使用不同的Lp(p=0、0.5、1)范数对模型分别求解,研究不同条件下两类数据的显著关联特征规律。结果发现,基因DAOA和HTR2A在下列多重情况下均被筛选出:一是f MRI数据的权重α1取0.35~0.8之间多个不同权重时,二是SNP数据的权重α2仅为0.2时,三是在L0、L0.5、L1等3种不同范数下。此外,在影像学数据方面,发现顶下缘角回脑区也与精神分裂症相关,此发现与先前精神分裂症的影像学研究结果一致。研究结果表明,将基于稀疏表示的影像遗传学数据整合分析方法应用于精神分裂症的生物标记物筛选是一个可行的方法,这为今后精神分裂症的影像遗传学研究提供了一种新的研究思路。 展开更多

关键词 精神分裂症 稀疏表示 单核苷酸多态性 生物标记物

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馒头主要品质性状SNP标记全基因组关联分析

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作者 吴澎 刘娟 +5 位作者 陈广凤 李向阳 赵子彤 杨艺 唐晓珍 田纪春 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期159-164,共6页

为从分子水平研究控制馒头主要品质性状的基因位点,以205份不同小麦品种为实验材料,利用分布于小麦全基因组的24 355个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记对馒头比容、色泽与质构性状进行关联分析。检测到8个比容... 为从分子水平研究控制馒头主要品质性状的基因位点,以205份不同小麦品种为实验材料,利用分布于小麦全基因组的24 355个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记对馒头比容、色泽与质构性状进行关联分析。检测到8个比容性状极显著关联位点(P<0.000 1),同时也是高遗传变异贡献率位点(R^2>10%),2个位点至少在2个环境中稳定表达;23个馒头色泽性状极显著关联位点,30个高遗传变异贡献率位点,9个位点在两个以上环境中检测到;31个馒头质构性状极显著关联位点,46个高遗传变异贡献率位点,11个位点在两个以上环境中检测到。同时,发掘了5个质构性状主效关联位点,如5D染色体上胶着性位点BS00000020_51。本研究所得到的这些位点为结合分子育种技术改良馒头用小麦粉品质提供了有价值的参考。 展开更多

关键词 馒头 品质性状 单核苷酸多态性标记 关联分析 极显著关联位点

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全基因组关联分析馒头比容与质构SNP标记

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作者 刘娟 陈广凤 +5 位作者 田纪春 吴澎 赵子彤 杨艺 李向阳 唐晓珍 《中国粮油学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第5期106-111,127,共7页

为从分子水平研究控制馒头比容与质构性状的基因位点,以205份不同小麦品种为实验材料,利用分布于小麦全基因组的24 355个单核苷酸多态性(SNP)标记对馒头比容与质构性状进行关联分析。共检测到42个比容性状显著关联位点,其中8个极显著关... 为从分子水平研究控制馒头比容与质构性状的基因位点,以205份不同小麦品种为实验材料,利用分布于小麦全基因组的24 355个单核苷酸多态性(SNP)标记对馒头比容与质构性状进行关联分析。共检测到42个比容性状显著关联位点,其中8个极显著关联位点(P<0.000 1),同时也是高遗传贡献率位点(R^2>10%),2个位点至少在2个环境中稳定表达;检测到313个质构性状显著关联位点,其中31个极显著关联位点,46个高遗传贡献率位点,11个位点至少在2个环境中稳定表达。同时,发掘了5个质构性状主效关联位点,如3B染色体上黏聚性关联位点Kukri_c13329_800等。本研究所得到的这些标记为在分子水平上研究馒头品质性状提供了有价值的参考。 展开更多

关键词 馒头比容 馒头质构 单核苷酸多态性标记 全基因组关联分析 显著关联位点

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