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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌全基因组测序及黏菌素耐药分析
1
作者
储雯雯
刘周
+4 位作者
李昕
叶乃芳
龚真
曾晓娇
周强
《中国感染控制杂志》
北大核心
2025年第1期37-44,共8页
目的通过全基因组测序分析临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及黏菌素耐药基因,为临床诊疗提供参考。方法收集2021—2023年安徽省某三级甲等综合医院住院患者临床标本分离的57株CRKP,对所有菌株进行药敏试验。采用全基...
目的通过全基因组测序分析临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及黏菌素耐药基因,为临床诊疗提供参考。方法收集2021—2023年安徽省某三级甲等综合医院住院患者临床标本分离的57株CRKP,对所有菌株进行药敏试验。采用全基因测序技术分析CRKP菌株多位点序列分型、荚膜血清型、耐药基因和毒力基因,并对所有菌株序列进行单核苷酸多态性分析,采用聚合酶链式反应(PCR)方法扩增与黏菌素耐药相关基因。结果57株CRKP对除替加环素外的14种抗菌药物均为耐药。测序结果显示,93.0%(53/57)的CRKP携带bla KPC-2,ST11型CRKP菌株检出率最高(51/57,89.5%)。单核苷酸多态性聚类分析表明,57株CRKP分为11个克隆群,其中有4个克隆群均为ST11-KL64型CRKP。40株(70.2%)CRKP携带多种毒力基因。5株黏菌素耐药CRKP,其耐药机制是在mgr B基因70位点处插入一个ISKpn26元件。结论CRKP菌株以产KPC-2 ST11-KL64型为主要流行型,在重症监护病房有播散性流行。ISKpn26元件插入引起mgr B基因突变与该地区CRKP黏菌素耐药有关。
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关键词
耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌
全基因组测序
单核苷酸多态性分析
黏菌素
耐药
ISKpn26
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职称材料
急性髓系白血病预后相关因素研究进展
被引量:
5
2
作者
武玉慧
涂三芳
+1 位作者
郭坤元
李玉华
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2011年第22期4159-4161,共3页
急性髓系白血病(AML)是一种具有显著异质性的血液系统恶性克隆性疾病。细胞遗传学改变很大程度上影响了患者的治疗和预后。随着生物学和计算机技术的不断发展,越来越多的预后相关因素被确认:如KIT、FLT3、NPMl和CEBPA等基因突变:...
急性髓系白血病(AML)是一种具有显著异质性的血液系统恶性克隆性疾病。细胞遗传学改变很大程度上影响了患者的治疗和预后。随着生物学和计算机技术的不断发展,越来越多的预后相关因素被确认:如KIT、FLT3、NPMl和CEBPA等基因突变:微阵列技术也确认了一些与预后相关的独特的基因表达特征;microRNA的表达、单核苷酸多态性分析和DNA甲基化特征也发现了一些重要的AML预后亚型。
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关键词
预后相关因素
急性髓系白血病
单核苷酸多态性分析
microRNA
恶性克隆性疾病
DNA甲基化
遗传学改变
计算机技术
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职称材料
药用植物研究中的分子标记技术应用进展
被引量:
8
3
作者
陈红波
余金芮
+1 位作者
杨春先
钱刚
《湖北农业科学》
2017年第13期2401-2405,共5页
通过对近年来常用分子标记技术的原理、技术特点及其在药用植物研究领域中应用现状的总结,以期为药用植物资源开发与评价提供参考,也进一步为药用植物功能基因的筛选和验证提供思路。
关键词
分子标记
药用植物
简单序列重复(SSR)
扩增片段长度
多态性
(AFLP)
单核苷酸多态性分析
技术(SNPs)
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职称材料
一种植物基因组DNA快速提取方法的建立与评估
被引量:
7
4
作者
李琳
罗淋淋
+2 位作者
罗光宇
莫蓓莘
刘琳
《深圳大学学报(理工版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期1-8,共8页
植物基因组脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)的提取是植物分子实验的基础,但随着样本数量的增加,基因组DNA的提取成为植株基因型鉴定以及单核苷酸多态性检测等分子实验的限速环节.为解决现有技术中提取植物基因组DNA过程繁琐、...
植物基因组脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)的提取是植物分子实验的基础,但随着样本数量的增加,基因组DNA的提取成为植株基因型鉴定以及单核苷酸多态性检测等分子实验的限速环节.为解决现有技术中提取植物基因组DNA过程繁琐、耗时耗力的问题,从提取液配方和提取条件等方面改良常规快速植物基因组DNA提取法,缩短了样本制备时间并简化了提取步骤,改良后每个样本DNA制备需时不到90 s,同时采用96孔板和配套设施显著提高了实验通量.该方法对植物样本的状态要求低、扩增效率高、成本低,适用于拟南芥、水稻和玉米等多种植物基因组DNA的提取与聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增实验,尤其适用于大样本量的规模化基因型鉴定.
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关键词
分子生物学
基因组脱氧核糖核酸
快速提取
聚合酶链式反应
水稻
拟南芥
基因型鉴定
单核苷酸多态性分析
简单重复序列标记
分析
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职称材料
题名
耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌全基因组测序及黏菌素耐药分析
1
作者
储雯雯
刘周
李昕
叶乃芳
龚真
曾晓娇
周强
机构
安徽医科大学第二附属医院检验科
出处
《中国感染控制杂志》
北大核心
2025年第1期37-44,共8页
基金
安徽医科大学第二附属医院临床研究培良计划项目(2021LCYB04)
安徽省高校自然科学研究项目(2023AH053175)
+1 种基金
安徽省转化医学研究院科研基金项目(2023zhyx-C78)
安徽省转化医学研究院科研基金项目(2021zhyx-C47)。
文摘
目的通过全基因组测序分析临床耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及黏菌素耐药基因,为临床诊疗提供参考。方法收集2021—2023年安徽省某三级甲等综合医院住院患者临床标本分离的57株CRKP,对所有菌株进行药敏试验。采用全基因测序技术分析CRKP菌株多位点序列分型、荚膜血清型、耐药基因和毒力基因,并对所有菌株序列进行单核苷酸多态性分析,采用聚合酶链式反应(PCR)方法扩增与黏菌素耐药相关基因。结果57株CRKP对除替加环素外的14种抗菌药物均为耐药。测序结果显示,93.0%(53/57)的CRKP携带bla KPC-2,ST11型CRKP菌株检出率最高(51/57,89.5%)。单核苷酸多态性聚类分析表明,57株CRKP分为11个克隆群,其中有4个克隆群均为ST11-KL64型CRKP。40株(70.2%)CRKP携带多种毒力基因。5株黏菌素耐药CRKP,其耐药机制是在mgr B基因70位点处插入一个ISKpn26元件。结论CRKP菌株以产KPC-2 ST11-KL64型为主要流行型,在重症监护病房有播散性流行。ISKpn26元件插入引起mgr B基因突变与该地区CRKP黏菌素耐药有关。
关键词
耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌
全基因组测序
单核苷酸多态性分析
黏菌素
耐药
ISKpn26
Keywords
carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae
whole-genome sequencing
single nucleotide polymorphism analysis
colistin
antimicrobial resistance
ISKpn26
分类号
R181.32 [医药卫生—流行病学]
R378.996 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
急性髓系白血病预后相关因素研究进展
被引量:
5
2
作者
武玉慧
涂三芳
郭坤元
李玉华
机构
南方医科大学珠江医院血液科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2011年第22期4159-4161,共3页
基金
国家自然科学基金资助(编号:30500607)
教育部新世纪优秀人才支持计划资助(编号:NCET-09-0087)
广东省自然科学基金重点项目资助(编号:9251051501000007)
文摘
急性髓系白血病(AML)是一种具有显著异质性的血液系统恶性克隆性疾病。细胞遗传学改变很大程度上影响了患者的治疗和预后。随着生物学和计算机技术的不断发展,越来越多的预后相关因素被确认:如KIT、FLT3、NPMl和CEBPA等基因突变:微阵列技术也确认了一些与预后相关的独特的基因表达特征;microRNA的表达、单核苷酸多态性分析和DNA甲基化特征也发现了一些重要的AML预后亚型。
关键词
预后相关因素
急性髓系白血病
单核苷酸多态性分析
microRNA
恶性克隆性疾病
DNA甲基化
遗传学改变
计算机技术
分类号
R733.71 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
药用植物研究中的分子标记技术应用进展
被引量:
8
3
作者
陈红波
余金芮
杨春先
钱刚
机构
遵义医学院细胞生物学教研室
遵义医学院口腔学院
出处
《湖北农业科学》
2017年第13期2401-2405,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31560087)
文摘
通过对近年来常用分子标记技术的原理、技术特点及其在药用植物研究领域中应用现状的总结,以期为药用植物资源开发与评价提供参考,也进一步为药用植物功能基因的筛选和验证提供思路。
关键词
分子标记
药用植物
简单序列重复(SSR)
扩增片段长度
多态性
(AFLP)
单核苷酸多态性分析
技术(SNPs)
Keywords
molecular marker
medicinal plants
simple sequence repeat(SSR)
amplified fragment length polymorphisms(AFLP)
single nucleotide polymorphisms(SNPs)
分类号
S567 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
一种植物基因组DNA快速提取方法的建立与评估
被引量:
7
4
作者
李琳
罗淋淋
罗光宇
莫蓓莘
刘琳
机构
深圳大学生命与海洋科学学院
深圳大学龙华生物产业创新研究院
深圳大学物理与光电工程学院
出处
《深圳大学学报(理工版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期1-8,共8页
基金
国家重点研发计划资助项目(2016YFD0101803)
国家自然科学基金资助项目(31600982)
+2 种基金
广东省创新创业团队资助项目(2014ZT05S078)
深圳市高端人才科研基金资助项目(827/000256)
深圳大学科研基金资助项目(2016095).
文摘
植物基因组脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)的提取是植物分子实验的基础,但随着样本数量的增加,基因组DNA的提取成为植株基因型鉴定以及单核苷酸多态性检测等分子实验的限速环节.为解决现有技术中提取植物基因组DNA过程繁琐、耗时耗力的问题,从提取液配方和提取条件等方面改良常规快速植物基因组DNA提取法,缩短了样本制备时间并简化了提取步骤,改良后每个样本DNA制备需时不到90 s,同时采用96孔板和配套设施显著提高了实验通量.该方法对植物样本的状态要求低、扩增效率高、成本低,适用于拟南芥、水稻和玉米等多种植物基因组DNA的提取与聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增实验,尤其适用于大样本量的规模化基因型鉴定.
关键词
分子生物学
基因组脱氧核糖核酸
快速提取
聚合酶链式反应
水稻
拟南芥
基因型鉴定
单核苷酸多态性分析
简单重复序列标记
分析
Keywords
molecular biology
genomic deoxyribonucleic acid
rapid extraction
polymerase chain reaction
Oryza sativa L.
Arabidopsis thaliana
genotyping
single nucleotide polymorphisms analysis
simple sequence repeat analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌全基因组测序及黏菌素耐药分析
储雯雯
刘周
李昕
叶乃芳
龚真
曾晓娇
周强
《中国感染控制杂志》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
急性髓系白血病预后相关因素研究进展
武玉慧
涂三芳
郭坤元
李玉华
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2011
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
药用植物研究中的分子标记技术应用进展
陈红波
余金芮
杨春先
钱刚
《湖北农业科学》
2017
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
一种植物基因组DNA快速提取方法的建立与评估
李琳
罗淋淋
罗光宇
莫蓓莘
刘琳
《深圳大学学报(理工版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020
7
在线阅读
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职称材料
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