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玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析
被引量：
6
1
作者
谭贤杰
宋燕春
+4 位作者
石云素
程伟东
吴子恺
王天宇
黎裕
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期58-66,共9页
Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95...
Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95份自交系的ZmRCA1进行测序,获得长约1 680 bp的基因组序列。多态分析表明,在1 680 bp的区间内共发现22个SNP和8个InDel,其中5个SNP和1个InDel变异产生氨基酸序列改变;频率在0.1以上的13个多态性位点共形成27种单倍型,利用6个多态性位点就可以分辨约90%的单倍型。ZmRCA1基因具有高度序列保守性,基因DNA序列相似性为97.9%,而氨基酸序列的相似性则达99.8%;中性检验表明,ZmRCA1基因符合中性进化模型假设,没有发生纯化选择。
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关键词
Rubisco活化酶(RCA)
单
核苷酸多态性(SNP)
InDe1
连锁不平衡(LD)
单倍犁
单倍犁
标签SNP
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职称材料
题名
玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析
被引量：
6
1
作者
谭贤杰
宋燕春
石云素
程伟东
吴子恺
王天宇
黎裕
机构
广西大学农学院
广西农业科学院玉米研究所
中国农业科学院作物科学研究所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期58-66,共9页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2011CB100100
2009CB118401)
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10Z188)资助
文摘
Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95份自交系的ZmRCA1进行测序,获得长约1 680 bp的基因组序列。多态分析表明,在1 680 bp的区间内共发现22个SNP和8个InDel,其中5个SNP和1个InDel变异产生氨基酸序列改变;频率在0.1以上的13个多态性位点共形成27种单倍型,利用6个多态性位点就可以分辨约90%的单倍型。ZmRCA1基因具有高度序列保守性,基因DNA序列相似性为97.9%,而氨基酸序列的相似性则达99.8%;中性检验表明,ZmRCA1基因符合中性进化模型假设,没有发生纯化选择。
关键词
Rubisco活化酶(RCA)
单
核苷酸多态性(SNP)
InDe1
连锁不平衡(LD)
单倍犁
单倍犁
标签SNP
Keywords
Rubisco activase（RCA）
SNP
InDel
LD
Haplotype
htSNP
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析
谭贤杰
宋燕春
石云素
程伟东
吴子恺
王天宇
黎裕
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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