期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
2
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
苏姜猪mtDNA D-loop序列的遗传多样性分析
被引量：
2
1
作者
韩大勇
周春宝
+2 位作者
倪黎纲
陈章言
赵锦明
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1472-1479,共8页
【目的】通过对苏姜猪线粒体DNA(mtDNA)D-loop高变区Ⅰ的序列扩增测序,探究苏姜猪种群的种质资源特性和遗传多样性。【方法】采集苏姜猪核心群100头经产母猪耳组织,提取DNA后扩增苏姜猪核心群母猪mtDNA D-loop高变区Ⅰ的基因片段并测序...
【目的】通过对苏姜猪线粒体DNA(mtDNA)D-loop高变区Ⅰ的序列扩增测序,探究苏姜猪种群的种质资源特性和遗传多样性。【方法】采集苏姜猪核心群100头经产母猪耳组织,提取DNA后扩增苏姜猪核心群母猪mtDNA D-loop高变区Ⅰ的基因片段并测序,运用NCBI在线BLAST对测序序列与参考序列进行比对、校正并寻找同源序列,确定mtDNA D-loop高变区Ⅰ序列的长度和位置;使用DnaSP v.5.10.1软件统计获得群体中核苷酸多态位点和变异位点数量,分析单倍型多样度(Hd)、核苷酸多样性(Pi)、平均核苷酸差异度(K)等参数;使用Mega 7.0软件对不同单倍型进行基于Kimura’s 2-prarmetermodel的遗传距离计算,采用邻接法(Neighbor-Joining,NJ)对苏姜猪的4个单倍型、17个中国地方猪种、欧洲家猪(登录号:AF034253.1)的mtDNA D-loop高变区Ⅰ序列构建系统发育树。【结果】对100头苏姜猪的mtDNA D-loop序列高变区Ⅰ进行扩增测序,获得长度为429 bp的有效序列,获得的序列中,AT含量为63.1%,GC含量为36.9%;中性检验Tajima’s D值为-1.80517(P<0.05),证实苏姜猪种群显著性偏离中性检验;被测序列中检测到19个变异位点,定义了4个单倍型,单倍型多样度为0.578,核苷酸多样性为0.0032;种群内4个单倍型之间的平均遗传距离在0.004~0.031之间。系统发育树结果显示,群体分为国内和国外2个类群,苏姜猪4个单倍型都聚集在国内分支上,其中单倍型H2和二花脸猪聚为一类,单倍型H4和姜曲海、皖南花猪等聚为一类。【结论】苏姜猪种群mtDNA D-loop高变区Ⅰ多态位点比例高,单倍型多样度高,核苷酸多样性低;苏姜猪群体内优势单倍型的遗传距离较近,占比较高,反映出苏姜猪群体母系来源较少。
展开更多
关键词
苏姜猪
线粒体DNA
D-loop区
遗传变异
单倍型多样度
核苷酸
多样
性
在线阅读
下载PDF
职称材料
基于线粒体控制区的中华绒螯蟹群体遗传多样性分析
被引量：
9
2
作者
闫龙
宋娜
+2 位作者
王俊
鹿志创
高天翔
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期615-620,共6页
中华绒螯蟹（Eriocheir sinensis H.Milne Edwards）隶属于十足目（Decapoda）、方蟹科（Grapsidae）、绒螯蟹属（Eriocheir）,广泛分布于我国沿海各大水系[1]。中华绒螯蟹肉味鲜美、营养价值高,是我国重要的水产经济物种。目前,中华绒...
中华绒螯蟹（Eriocheir sinensis H.Milne Edwards）隶属于十足目（Decapoda）、方蟹科（Grapsidae）、绒螯蟹属（Eriocheir）,广泛分布于我国沿海各大水系[1]。中华绒螯蟹肉味鲜美、营养价值高,是我国重要的水产经济物种。目前,中华绒螯蟹的增殖放流和水产养殖等生产活动的开展已造成不同水系种质资源严重混杂[2,3]。因此,为深入了解不同水系中华绒螯蟹的遗传特征和种质差异,有效管理利用和保护中华绒螯蟹资源,对不同水系中华绒螫蟹的遗传多样性和群体遗传结构研究势在必行。
展开更多
关键词
中华绒螯蟹
线粒体控制区
单倍型多样度
核苷酸
多样
度
遗传结构
遗传
多样
性
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
苏姜猪mtDNA D-loop序列的遗传多样性分析
被引量：
2
1
作者
韩大勇
周春宝
倪黎纲
陈章言
赵锦明
机构
江苏农牧科技职业学院
江苏姜曲海种猪场
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1472-1479,共8页
基金
江苏现代农业(生猪)产业技术体系资源保护与利用创新团队(JATS[2022]390)。
文摘
【目的】通过对苏姜猪线粒体DNA(mtDNA)D-loop高变区Ⅰ的序列扩增测序,探究苏姜猪种群的种质资源特性和遗传多样性。【方法】采集苏姜猪核心群100头经产母猪耳组织,提取DNA后扩增苏姜猪核心群母猪mtDNA D-loop高变区Ⅰ的基因片段并测序,运用NCBI在线BLAST对测序序列与参考序列进行比对、校正并寻找同源序列,确定mtDNA D-loop高变区Ⅰ序列的长度和位置;使用DnaSP v.5.10.1软件统计获得群体中核苷酸多态位点和变异位点数量,分析单倍型多样度(Hd)、核苷酸多样性(Pi)、平均核苷酸差异度(K)等参数;使用Mega 7.0软件对不同单倍型进行基于Kimura’s 2-prarmetermodel的遗传距离计算,采用邻接法(Neighbor-Joining,NJ)对苏姜猪的4个单倍型、17个中国地方猪种、欧洲家猪(登录号:AF034253.1)的mtDNA D-loop高变区Ⅰ序列构建系统发育树。【结果】对100头苏姜猪的mtDNA D-loop序列高变区Ⅰ进行扩增测序,获得长度为429 bp的有效序列,获得的序列中,AT含量为63.1%,GC含量为36.9%;中性检验Tajima’s D值为-1.80517(P<0.05),证实苏姜猪种群显著性偏离中性检验;被测序列中检测到19个变异位点,定义了4个单倍型,单倍型多样度为0.578,核苷酸多样性为0.0032;种群内4个单倍型之间的平均遗传距离在0.004~0.031之间。系统发育树结果显示,群体分为国内和国外2个类群,苏姜猪4个单倍型都聚集在国内分支上,其中单倍型H2和二花脸猪聚为一类,单倍型H4和姜曲海、皖南花猪等聚为一类。【结论】苏姜猪种群mtDNA D-loop高变区Ⅰ多态位点比例高,单倍型多样度高,核苷酸多样性低;苏姜猪群体内优势单倍型的遗传距离较近,占比较高,反映出苏姜猪群体母系来源较少。
关键词
苏姜猪
线粒体DNA
D-loop区
遗传变异
单倍型多样度
核苷酸
多样
性
Keywords
Sujiang pig
mtDNA D-loop
genetic variation
haplotype diversity
nucleotide diversity
分类号
S828 [农业科学—畜牧学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
基于线粒体控制区的中华绒螯蟹群体遗传多样性分析
被引量：
9
2
作者
闫龙
宋娜
王俊
鹿志创
高天翔
机构
中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所
中国水产科学研究院黄海水产研究所
辽宁省海洋水产科学研究院
浙江海洋学院水产学院
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期615-620,共6页
基金
国家公益性行业(农业)科研专项(201303050)资助
文摘
中华绒螯蟹（Eriocheir sinensis H.Milne Edwards）隶属于十足目（Decapoda）、方蟹科（Grapsidae）、绒螯蟹属（Eriocheir）,广泛分布于我国沿海各大水系[1]。中华绒螯蟹肉味鲜美、营养价值高,是我国重要的水产经济物种。目前,中华绒螯蟹的增殖放流和水产养殖等生产活动的开展已造成不同水系种质资源严重混杂[2,3]。因此,为深入了解不同水系中华绒螯蟹的遗传特征和种质差异,有效管理利用和保护中华绒螯蟹资源,对不同水系中华绒螫蟹的遗传多样性和群体遗传结构研究势在必行。
关键词
中华绒螯蟹
线粒体控制区
单倍型多样度
核苷酸
多样
度
遗传结构
遗传
多样
性
Keywords
Chinese mitten crab
mtDNA control region
Haplotype diversity
Nucleotide diversity
Genetic structure
Genetic diversity
分类号
Q349.1 [生物学—遗传学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苏姜猪mtDNA D-loop序列的遗传多样性分析
韩大勇
周春宝
倪黎纲
陈章言
赵锦明
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于线粒体控制区的中华绒螯蟹群体遗传多样性分析
闫龙
宋娜
王俊
鹿志创
高天翔
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
9
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
