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不同种群白纹伊蚊单倍型多态性、遗传分化及种系发育关系分析
被引量：
1
1
作者
李中波
侯强红
段德勇
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1452-1460,共9页
【目的】试验旨在探究湖南怀化地区不同种群白纹伊蚊单倍型多态性、遗传分化情况及种系发育关系。【方法】于湖南怀化地区采集30只白纹伊蚊样本,PCR扩增其核糖体18S rRNA及线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cox1)基因部分序列。利用Clustal...
【目的】试验旨在探究湖南怀化地区不同种群白纹伊蚊单倍型多态性、遗传分化情况及种系发育关系。【方法】于湖南怀化地区采集30只白纹伊蚊样本,PCR扩增其核糖体18S rRNA及线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cox1)基因部分序列。利用ClustalX软件对其变异位点进行分析;运用Dnasp 5.0、Network 4.6及Arlequin version 3.0软件进行单倍型多态性与遗传分化分析;利用PhyML 3.0及Mega 5.0软件对白纹伊蚊的种系发育关系进行分析。【结果】所获全部样本的18S rRNA和cox 1基因序列长度均为489和1004 bp。白纹伊蚊18S rRNA基因序列中共存在30个变异位点,17个单倍型(A1~A17,Hd=0.9149),其中单倍型A5为最古老的单倍型,白纹伊蚊18S rRNA的基因分化系数(Gst)、遗传分化系数(Fst)和基因流(Nm)分别为0.05614、0.24001和0.792;白纹伊蚊的cox 1基因序列中共存在2个变异位点,3个单倍型(B1~B3,Hd=0.1908),其中单倍型B1为最古老的单倍型,白纹伊蚊cox 1基因的Gst、Fst和Nm分别为0.05000、0.04762和4.999。系统发育树中,来源于怀化地区的30只白纹伊蚊均分别处于2个发育树的一个分支。【结论】来源于湖南怀化地区的白纹伊蚊个体和种群之间存在一定程度基因变异和单倍型多态性现象,但各单倍型及其个体之间具有较近的亲缘关系,且两种群白纹伊蚊个体间发生了较为频繁的基因交流,未出现遗传分化。
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关键词
白纹伊蚊
单倍型多态性
基因流
遗传分化
种系发育关系
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职称材料
不同地区长角血蜱的单倍型多样性、遗传分化及种群扩张研究
2
作者
李中波
程天印
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期5405-5415,共11页
【目的】探究浏阳、信阳两地区长角血蜱的单倍型多样性(Hd)、遗传分化及种群扩张状况,为后续长角血蜱的种群遗传结构研究提供数据支撑和理论依据。【方法】试验以采集于两地区的30只长角血蜱为样品,对其线粒体cox 1、nad 5基因进行PCR...
【目的】探究浏阳、信阳两地区长角血蜱的单倍型多样性(Hd)、遗传分化及种群扩张状况,为后续长角血蜱的种群遗传结构研究提供数据支撑和理论依据。【方法】试验以采集于两地区的30只长角血蜱为样品,对其线粒体cox 1、nad 5基因进行PCR扩增及测序,运用Clustal X、Dnasp 5.0和Network 4.6软件对两地区长角血蜱的单倍型多样性进行分析;运用Dnasp 5.0和Arlequin version 3.0软件探究两地区长角血蜱的遗传分化及种群扩张状况。【结果】长角血蜱cox 1基因序列(776 bp)中共存在4个碱基突变位点,含5个单倍型(A1~A5,Hd=0.3609),其基因分化系数(Gst)、遗传分化系数(Fst)、基因流(Nm)分别为―0.0154、―0.019和―26.82;长角血蜱nad 5基因序列(519 bp)中共存在33个碱基突变位点,含17个单倍型(B1~B17,Hd=0.9402),Gst、Fst、Nm分别为0.0316、0.0503和9.44;长角血蜱cox 1+nad 5基因序列(1295 bp)中共存在37个碱基突变位点,含20个单倍型(C1~C20,Hd=0.9563),Gst、Fst、Nm分别为0.0184、0.0451和10.59。表明两地区的长角血蜱之间尚未出现遗传分化。cox 1、nad 5及cox 1+nad 5基因的种群扩张分析结果显示,来自于浏阳、信阳两地区的长角血蜱均经历了多次种群扩张事件。【结论】来自于浏阳、信阳两地区的长角血蜱之间虽存在低水平的遗传变异和单倍型多样性,但它们之间却存在较高频率的基因交流,无明显的遗传分化,且浏阳、信阳两地区的长角血蜱经历了多次种群扩张事件。
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关键词
长角血蜱
单倍型多态性
遗传分化
基因流
种群扩张
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职称材料
题名
不同种群白纹伊蚊单倍型多态性、遗传分化及种系发育关系分析
被引量：
1
1
作者
李中波
侯强红
段德勇
机构
怀化职业技术学院
湖南农业大学动物医学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1452-1460,共9页
基金
国家自然科学基金青年项目(31902294)
湖南省自然科学基金青年项目(2020JJ5230)
+2 种基金
湖南省教育厅项目(21C1443)
湖南省自然科学基金项目(2022JJ50319)
湖南省怀化市科学技术局项目(2020R3107)。
文摘
【目的】试验旨在探究湖南怀化地区不同种群白纹伊蚊单倍型多态性、遗传分化情况及种系发育关系。【方法】于湖南怀化地区采集30只白纹伊蚊样本,PCR扩增其核糖体18S rRNA及线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cox1)基因部分序列。利用ClustalX软件对其变异位点进行分析;运用Dnasp 5.0、Network 4.6及Arlequin version 3.0软件进行单倍型多态性与遗传分化分析;利用PhyML 3.0及Mega 5.0软件对白纹伊蚊的种系发育关系进行分析。【结果】所获全部样本的18S rRNA和cox 1基因序列长度均为489和1004 bp。白纹伊蚊18S rRNA基因序列中共存在30个变异位点,17个单倍型(A1~A17,Hd=0.9149),其中单倍型A5为最古老的单倍型,白纹伊蚊18S rRNA的基因分化系数(Gst)、遗传分化系数(Fst)和基因流(Nm)分别为0.05614、0.24001和0.792;白纹伊蚊的cox 1基因序列中共存在2个变异位点,3个单倍型(B1~B3,Hd=0.1908),其中单倍型B1为最古老的单倍型,白纹伊蚊cox 1基因的Gst、Fst和Nm分别为0.05000、0.04762和4.999。系统发育树中,来源于怀化地区的30只白纹伊蚊均分别处于2个发育树的一个分支。【结论】来源于湖南怀化地区的白纹伊蚊个体和种群之间存在一定程度基因变异和单倍型多态性现象,但各单倍型及其个体之间具有较近的亲缘关系,且两种群白纹伊蚊个体间发生了较为频繁的基因交流,未出现遗传分化。
关键词
白纹伊蚊
单倍型多态性
基因流
遗传分化
种系发育关系
Keywords
Aedes albopictus
haplotypes diversity
gene flow
genetic differentiation
phylogenetic analysis
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
在线阅读
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职称材料
题名
不同地区长角血蜱的单倍型多样性、遗传分化及种群扩张研究
2
作者
李中波
程天印
机构
怀化职业技术学院
湖南农业大学动物医学院
龙岩学院生命科学学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期5405-5415,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31902294)
湖南省自然科学基金项目(2022JJ50319)
+2 种基金
湖南省教育厅优秀青年项目(23B1072)
动物源性人兽共患病防控福建省高校工程研究中心项目(2022K004)
怀化市科技局重点实验室项目(2023R2208)。
文摘
【目的】探究浏阳、信阳两地区长角血蜱的单倍型多样性(Hd)、遗传分化及种群扩张状况,为后续长角血蜱的种群遗传结构研究提供数据支撑和理论依据。【方法】试验以采集于两地区的30只长角血蜱为样品,对其线粒体cox 1、nad 5基因进行PCR扩增及测序,运用Clustal X、Dnasp 5.0和Network 4.6软件对两地区长角血蜱的单倍型多样性进行分析;运用Dnasp 5.0和Arlequin version 3.0软件探究两地区长角血蜱的遗传分化及种群扩张状况。【结果】长角血蜱cox 1基因序列(776 bp)中共存在4个碱基突变位点,含5个单倍型(A1~A5,Hd=0.3609),其基因分化系数(Gst)、遗传分化系数(Fst)、基因流(Nm)分别为―0.0154、―0.019和―26.82;长角血蜱nad 5基因序列(519 bp)中共存在33个碱基突变位点,含17个单倍型(B1~B17,Hd=0.9402),Gst、Fst、Nm分别为0.0316、0.0503和9.44;长角血蜱cox 1+nad 5基因序列(1295 bp)中共存在37个碱基突变位点,含20个单倍型(C1~C20,Hd=0.9563),Gst、Fst、Nm分别为0.0184、0.0451和10.59。表明两地区的长角血蜱之间尚未出现遗传分化。cox 1、nad 5及cox 1+nad 5基因的种群扩张分析结果显示,来自于浏阳、信阳两地区的长角血蜱均经历了多次种群扩张事件。【结论】来自于浏阳、信阳两地区的长角血蜱之间虽存在低水平的遗传变异和单倍型多样性,但它们之间却存在较高频率的基因交流,无明显的遗传分化,且浏阳、信阳两地区的长角血蜱经历了多次种群扩张事件。
关键词
长角血蜱
单倍型多态性
遗传分化
基因流
种群扩张
Keywords
Haemaphysalis longicornis
haplotype diversity
genetic differentiation
gene flow
population expansion
分类号
S852.746 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同种群白纹伊蚊单倍型多态性、遗传分化及种系发育关系分析
李中波
侯强红
段德勇
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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职称材料
2
不同地区长角血蜱的单倍型多样性、遗传分化及种群扩张研究
李中波
程天印
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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