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黑龙江地区人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因及单体型多态性研究 被引量:14
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作者 李鑫 丁镌 +3 位作者 王鑫 侯玲 刘颖 刘杰 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期83-89,共7页
目的:研究中国造血干细胞捐献者资料库黑龙江分库无关捐献者HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因和单体型频率分布特征。方法:采用PCR-测序分型技术(SBT)对13 670名随机、无血缘关系、健康的中华骨髓库黑龙江分库造血干细胞捐献者进行HLA-A、B... 目的:研究中国造血干细胞捐献者资料库黑龙江分库无关捐献者HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因和单体型频率分布特征。方法:采用PCR-测序分型技术(SBT)对13 670名随机、无血缘关系、健康的中华骨髓库黑龙江分库造血干细胞捐献者进行HLA-A、B、DRB1高分辨基因分型,利用计数法和最大似然性原理方法分别计算HLA-A、B、DRB1等位基因及单体型频率。结果:共观察到286个HLA等位基因,其中频率>0.1的A、B、DRB1座位特异性分别为A*02∶01、A*24∶02、A*11∶01、DR*07∶01、DR*09∶01、DR*15∶01。1 087条A-B单体型中,22条单体型的频率高于0.01,267条单体型呈现显著的正连锁不平衡(ALD>0,HF≥1.09×10-4,χ2>3.84),12条表现为强连锁不平衡(RLD>0.80);1 329条B-DRB1单体型中,19条单体型的频率高于0.01,357条单体型呈现显著的正连锁不平衡,18条表现为强连锁不平衡(RLD>0.80);4 428条A-BDRB1单体型中,1 348条单体型有意义(频率≥1.09×10-4),17条单体型频率高于0.005。结论:获得黑龙江地区人群HLAA、B、DRB1高分辨等位基因频率和单体型分布数据及相关遗传参数,等位基因和单体型的分布特征接近北方汉族人群,但具有其自身分布特征。 展开更多
关键词 HLA-A/B/DRB1 高分辨基因分型 基因/单体型频率
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转化生长因子β_1基因标签单核苷酸多态性与新疆汉族原发性高血压相关性研究
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作者 何芳 邓峰美 +5 位作者 钟华 杨建峰 石晓鹏 王刚 王振焕 陈雄英 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第A10期1976-1976,共1页
关键词 原发性高血压 转化生长因子 采集血样 单体型频率 核苷酸 流行病学调查 患病风险
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中国北京汉族人群ABCA4基因的SNPs研究 被引量:1
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作者 张小龙 王红 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期53-56,共4页
目的:研究北京汉族人群中ABCA4基因单核苷酸多态性,为病因学研究提供依据。方法:选取国际人类基因组单体型图计划(Hap Map)公布的北京汉族人群(Han Chinese in Beijing,China,CHB)ABCA4基因SNPs基因型数据,利用Haploview4.2软件... 目的:研究北京汉族人群中ABCA4基因单核苷酸多态性,为病因学研究提供依据。方法:选取国际人类基因组单体型图计划(Hap Map)公布的北京汉族人群(Han Chinese in Beijing,China,CHB)ABCA4基因SNPs基因型数据,利用Haploview4.2软件对其进行分析。结果:Hapmap提供的343个ABCA4基因的SNPs中,有129个(37.6%)纯合基因型SNPs和214个(62.39%)合格SNPs。本研究共确定95个标签SNPs,构建了3个单体域,各单体域均以前2种单体型为主,累计频率在91.1%-94.0%之间。结论:通过分析北京汉族人群ABCA4基因SNPs数据,得到了标签SNPs、单体域和主要单体型,为进一步的病因学研究打下了基础。 展开更多
关键词 核苷酸多态性(SNPs) ABCA4基因 HAP Map Haploview 最小等位基因频率(MAF) 单体型频率 Hardy-Weinberg平衡
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