一种基于邻域协同表达的分类方法 被引量：3

1

作者 徐苏平 杨习贝 +1 位作者 于化龙 於东军 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2017年第9期234-238,共5页

邻域粗糙集模型中,随着信息粒尺寸的增长,基于多数投票原则的邻域分类器(NC)容易对未知样本的类别产生误判。为了缓解该问题,在协同表达分类(CRC)思想的基础上,提出了一种基于邻域协同表达的分类方法,即邻域协同分类器(NCC)。NCC首先借... 邻域粗糙集模型中,随着信息粒尺寸的增长,基于多数投票原则的邻域分类器(NC)容易对未知样本的类别产生误判。为了缓解该问题,在协同表达分类(CRC)思想的基础上,提出了一种基于邻域协同表达的分类方法,即邻域协同分类器(NCC)。NCC首先借助邻域粗糙集模型对分类学习任务进行特征选择,然后找出被选特征下未知样本的邻域空间,最后在邻域空间内采用协同表达来代替多数投票原则,找出与未知样本具有最小重构误差的类别作为预测的类别标记。在4组UCI数据集上的实验结果表明:1)与NC相比,所提NCC在大尺寸信息粒下获得了较为满意的分类效果;2)与CRC相比,所提NCC在保持良好分类精度的同时,极大地降低了字典样本的规模,进而提高了分类的效率。 展开更多

关键词 分类 协同表达 特征选择 邻域 粗糙集

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L型氨基酸转运载体1及其配体在奶牛乳腺中的协同表达研究 被引量：2

2

作者 林叶 侯晓明 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期212-217,共6页

为探讨氨基酸转运与乳腺泌乳功能之间的关系,本研究采用激光扫描共聚焦显微技术对泌乳期和干奶期奶牛乳腺中LAT1和4F2hc的表达含量和表达方式进行研究。结果显示,LAT1和4F2hc的蛋白表达含量在泌乳期高乳蛋白率荷斯坦奶牛中显著高于泌乳... 为探讨氨基酸转运与乳腺泌乳功能之间的关系,本研究采用激光扫描共聚焦显微技术对泌乳期和干奶期奶牛乳腺中LAT1和4F2hc的表达含量和表达方式进行研究。结果显示,LAT1和4F2hc的蛋白表达含量在泌乳期高乳蛋白率荷斯坦奶牛中显著高于泌乳期低乳蛋白率的荷斯坦奶牛和干奶期的荷斯坦奶牛。泌乳期LAT1和4F2hc协同表达于腺泡上皮细胞基底侧的细胞膜上和围绕导管的肌上皮细胞;干奶期LAT1和4F2hc协同表达于乳导管上皮细胞质膜。相关性分析显示泌乳期和干奶期LAT1和4F2hc在乳腺中的表达高度正相关,相关系数0.810。结果表明,LAT1是奶牛乳腺中负责转运氨基酸的载体,LAT1/4F2hc协同表达与泌乳期乳蛋白生物合成以及干奶期乳腺组织重建紧密正相关。 展开更多

关键词 奶牛 乳腺 LAT1 4F2hc 协同表达 相关性

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核糖体蛋白基因协同表达的分子机制 被引量：2

3

作者 朱可可 易聪 周兴涛 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第35期17376-17379,共4页

从真核生物核糖体蛋白的基因结构和所涉及的信号传导途径入手,论述了核糖体蛋白基因协同表达的分子机制。

关键词 核糖体 协同表达 基因结构 信号传导

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基于分块加权LBP向量和解析字典的协同表达分类 被引量：2

4

作者 陈酉明 宋晓宁 於东军 《南京理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期170-176,共7页

传统协同表达分类(CRC)算法因直接使用原始样本构造非传统字典,容易受到样本维度、光照和姿态变化等因素的影响。该文在协同表达框架基础上,提出了一种新的利用分块加权局部二值特征(LBP)直方图向量构造解析字典的协同表达人脸分类方法... 传统协同表达分类(CRC)算法因直接使用原始样本构造非传统字典,容易受到样本维度、光照和姿态变化等因素的影响。该文在协同表达框架基础上,提出了一种新的利用分块加权局部二值特征(LBP)直方图向量构造解析字典的协同表达人脸分类方法。首先通过分块加权方法优化LBP算子提取的纹理特征,然后采用解析字典学习方法将样本数据投影到稀疏系数空间,并使用协同表达方法重构测试样本,完成样本分类。与已有算法相比,该文算法的实验结果较好。ORL和LFW数据库上的实验结果证明了该文方法的有效性。 展开更多

关键词 协同表达 字典学习 局部二值特征 人脸分类

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拟南芥Argonaute1/2/4/5序列分歧以及与特定miRNA的协同表达(英文) 被引量：1

5

作者 赵文文 韩颖颖 +1 位作者 刘宝林 王志翠 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期47-54,共8页

Argonaute(Ago)是RNA诱导的基因沉默复合体(RISC)中的一个重要组成部分,在RNA沉默通路中结合小RNA发挥着关键的作用.本文对12个物种的85个Ago/Ago-like基因序列进行了系统发育进化分析.结果表明,植物Ago可被分为3大分支,且基因在物种产... Argonaute(Ago)是RNA诱导的基因沉默复合体(RISC)中的一个重要组成部分,在RNA沉默通路中结合小RNA发挥着关键的作用.本文对12个物种的85个Ago/Ago-like基因序列进行了系统发育进化分析.结果表明,植物Ago可被分为3大分支,且基因在物种产生分歧之前就已经发生了重复.3个分支之间高同义和非同义突变频率揭示了Ago蛋白家族功能的高度保守性.采用实时荧光定量PCR对拟南芥Ago1/2/4/5在不同发育阶段和胁迫条件下的表达情况进行了分析.结果显示,Ago1在拟南芥幼苗和成熟组织中表达显著;与23℃(最适温度)相比,16℃(亚适温度)条件下,Ago1表达量显著下调,Ago5表达量则显著上调;在脱水胁迫下,Ago5表达量下调,Ago4表达量上调.另外,根据5'端碱基类型不同,188 954个幼苗miRNAs和2 047 843个成熟组织miRNAs被分类.结果显示,5'端为U的miRNAs在植物中的含量最多,这与Ago1表达量最高是协同的;16℃条件下,5'端为C的miRNAs和Ago5表达协同上调.这些结果都表明,Ago蛋白及其偏好的miRNAs是协同表达的. 展开更多

关键词 系统发育分析 ARGONAUTE miRNA的5'端碱基类型 亚适温度 脱水胁迫 协同表达

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苯丙氨酸生物合成关键酶基因pheA与aroF协同表达

6

作者 芦佳 黄坤央 +3 位作者 赵越 徐琪寿 郭军 黄英武 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期210-213,共4页

目的:优化L-苯丙氨酸生物合成通路上的关键酶基因pheA、aroF的蛋白表达,构建高产L-苯丙氨酸的工程菌株。方法:通过设计酶基因的间隔调控序列,分别构建重组质粒pZE12-RBS-AF和pZE12-AF,SDS-PAGE观察蛋白表达量,转入营养缺陷菌MGΔ中构建... 目的:优化L-苯丙氨酸生物合成通路上的关键酶基因pheA、aroF的蛋白表达,构建高产L-苯丙氨酸的工程菌株。方法:通过设计酶基因的间隔调控序列,分别构建重组质粒pZE12-RBS-AF和pZE12-AF,SDS-PAGE观察蛋白表达量,转入营养缺陷菌MGΔ中构建工程菌,并发酵培养。结果:工程菌MGΔpZE12-AF苯丙氨酸的产量比工程菌MGΔpZE12-RBS-AF高1倍,实现了L-苯丙氨酸生物合成关键酶基因pheA和aroF协同,匹配表达。结论:调整串联酶基因之间的间隔调控序列可实现苯丙氨酸合成酶基因的协同表达,提供了一种新的提高苯丙氨酸工程菌产量的方法。 展开更多

关键词 L-苯丙氨酸 间隔调控序列 协同表达

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双系统协同进化的基因表达式编程及其在函数发现中的应用 被引量：3

7

作者 王超学 吴书玲 张婧菁 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2016年第11期2314-2320,共7页

受人类进化过程的启发,提出了一种双系统协同进化的基因表达式编程算法DSCE-GEP。DSCE-GEP由自然进化系统和人工干预系统组成。人工干预系统包括个体干预和种群干预。个体干预是依据基因库对种群中的个体进行去劣和增优操作,旨在改善种... 受人类进化过程的启发,提出了一种双系统协同进化的基因表达式编程算法DSCE-GEP。DSCE-GEP由自然进化系统和人工干预系统组成。人工干预系统包括个体干预和种群干预。个体干预是依据基因库对种群中的个体进行去劣和增优操作,旨在改善种群中个体的质量;种群干预通过引入随机和镜像个体来提高种群的多样性和全局寻优能力。与权威文献中改进的GEP关于函数发现问题的大量对比实验表明,本文算法在收敛速度、求解质量方面优于对比算法,具有明显的竞争力。 展开更多

关键词 双系统协同进化基因表达式编程 基因库 人工干预系统 函数发现问题

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基于半耦合稀疏表达的极低分辨率人脸识别 被引量：2

8

作者 杨威 卢涛 汪浩 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2017年第22期169-175,共7页

现有基于学习的人脸超分辨率算法假设高低分辨率特征具有流形一致性(耦合字典学习),然而低分辨率图像的降质过程使得高低分辨率特征产生了"一对多"的映射关系偏差,减少了极低分辨率图像特征的判决信息,降低了超分辨率重建图... 现有基于学习的人脸超分辨率算法假设高低分辨率特征具有流形一致性(耦合字典学习),然而低分辨率图像的降质过程使得高低分辨率特征产生了"一对多"的映射关系偏差,减少了极低分辨率图像特征的判决信息,降低了超分辨率重建图像的识别率。针对这一问题,引入了半耦合稀疏字典学习模型,松弛高低分辨率流形一致性假设,同时学习稀疏表达字典和稀疏表达系数之间的映射函数,提升高低分辨率判决特征的一致性,在此基础上,引入协同分类模型,实现半耦合特征的高效分类。实验表明:相比于传统稀疏表达分类算法,算法不仅提高了识别率,并且还大幅度降低了时间开销,验证了半耦合稀疏学习字典在人脸识别中的有效性。 展开更多

关键词 稀疏表达 半耦合 协同表达分类 极低分辨率 人脸识别

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基于合成生物学设计的家蚕和昆虫细胞杆状病毒表达系统研究进展 被引量：2

9

作者 占鹏飞 李家磊 +3 位作者 易咏竹 刘兴健 李轶女 张志芳 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期170-177,共8页

杆状病毒表达系统主要宿主有昆虫细胞和家蚕两种类型,已广泛应用于结构生物学的研究和生物制剂尤其是疫苗的研发。近十余年来由于合成生物学的发展,该系统的发展目标已从单一基因操作转向于需多基因协同操作才能完成的任务。重点研究领... 杆状病毒表达系统主要宿主有昆虫细胞和家蚕两种类型,已广泛应用于结构生物学的研究和生物制剂尤其是疫苗的研发。近十余年来由于合成生物学的发展,该系统的发展目标已从单一基因操作转向于需多基因协同操作才能完成的任务。重点研究领域涵盖了难以表达蛋白如膜蛋白的表达量改善、多基因协调表达的兴起尤其是重组腺相关病毒(rAAV)的包装研究、杆状病毒作为哺乳动物基因呈递载体应用的优化、高质量完全人源化蛋白表达系统的建立和完善、通过研究杆状病毒和宿主的互作以改善表达产物的质和量等方面,这极大地拓展了该系统作为一个表达系统的研发应用范围。该系统优化的重点在于进行系统、集成式的改良以提高目的产品的质和量,尤其是应重视宿主侧的遗传背景改良以及病毒和宿主互作的研究。 展开更多

关键词 杆状病毒表达系统 合成生物学 多基因操作 协同表达 家蚕

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协同两类腈水合酶高效催化烟酰胺及丙烯酰胺生物合成 被引量：1

10

作者 赵凯阳 黄微煜 +5 位作者 蔡宋佳 陈员庆 吴超城 周丽 程中一 周哲敏 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2022年第18期48-52,共5页

腈水合酶(nitrile hydratase,NHase)可以将腈类物质通过水合作用转化生成更有利用价值的酰胺类化合物,在工业上被用于生产烟酰胺、丙烯酰胺等重要化学品。然而,尚无兼具对底物和产物耐受性高以及催化活性高的腈水合酶,导致底物不能被彻... 腈水合酶(nitrile hydratase,NHase)可以将腈类物质通过水合作用转化生成更有利用价值的酰胺类化合物,在工业上被用于生产烟酰胺、丙烯酰胺等重要化学品。然而,尚无兼具对底物和产物耐受性高以及催化活性高的腈水合酶,导致底物不能被彻底利用、酰胺产物的产量受限。该研究协同表达了高催化活性的低分子质量腈水合酶(L-NHase)和高耐受性的高分子质量腈水合酶(H-NHase),并优化两类酶在质粒上的排列位置。其中BAE-BAG菌株对底物、产物的耐受性与H-NHase菌株相仿;在以烟腈或者丙烯腈为底物进行全细胞催化时,该菌株的催化速率与L-NHase菌株相仿,最终烟酰胺产量可达到516 g/L,是目前报道的最高产量;丙烯酰胺产量比原始BAE或BAG菌株提高19.1%以上。该文成功协同两类腈水合酶,同时提高了合成烟酰胺和丙烯酰胺的催化反应速率及产量,对工业应用具有一定的指导意义。 展开更多

关键词 腈水合酶 协同表达 烟酰胺 丙烯酰胺 全细胞催化

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基于目标域局部近邻几何信息的域自适应图像分类方法 被引量：6

11

作者 唐宋 陈利娟 +1 位作者 陈志贤 叶茂 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2017年第4期1164-1168,共5页

在许多实际工程应用中,训练场景(源域)和测试场景(目标域)的分布并不相同,如果将源域中训练的分类器直接应用到目标域,性能往往会出现大幅度下降。目前大多数域自适应方法以概率推导为基础。从图像特征表达的角度出发,针对自适应图像分... 在许多实际工程应用中,训练场景(源域)和测试场景(目标域)的分布并不相同,如果将源域中训练的分类器直接应用到目标域,性能往往会出现大幅度下降。目前大多数域自适应方法以概率推导为基础。从图像特征表达的角度出发,针对自适应图像分类问题,提出一种新的基于协同特征的无监督方法。首先,所有源样本被作为字典;然后,距离目标样本最近的三个目标域样本被用来帮助鲁棒地表达局部近邻几何信息;最后,结合字典和局部近邻信息实现编码,并利用最近邻分类器完成分类。因为协同特征通过融合目标域局部近邻信息,获得了更强的鲁棒性和区分性,基于该特征编码的分类方法具有更好的分类性能。在域自适应数据集上的对比实验结果表明所提算法是有效的。 展开更多

关键词 域自适应 流形 目标域局部近邻关系 协同表达 图像分类

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基于主元分析和线性判别分析降维的稀疏表示分类 被引量：3

12

作者 那天 宋晓宁 於东军 《南京理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第3期286-291,共6页

为解决传统的稀疏表示分类(SRC)算法在小样本人脸识别过程中的过大时间开销问题,该文提出2种基于降维的SRC算法。扩展主元分析(EPCA)算法利用PCA算法构造约束优化稀疏模型,对测试样本进行线性表示,通过比较测试样本和每类训练样本的重构... 为解决传统的稀疏表示分类(SRC)算法在小样本人脸识别过程中的过大时间开销问题,该文提出2种基于降维的SRC算法。扩展主元分析(EPCA)算法利用PCA算法构造约束优化稀疏模型,对测试样本进行线性表示,通过比较测试样本和每类训练样本的重构PCA系数进行决策分类。EPCA+线性判别分析(EPCA+LDA)算法在EPCA算法的基础上增加LDA约束模型,提高重构样本的稀疏表示的鉴别性。将该文算法应用于AR和FERET人脸数据库,与扩展SRC(ESRC)、SRC、SRC_PCA、协同表达分类(CRC)算法相比,该文算法有较高的识别率和较低的时间复杂度。将EPCA算法和EPCA+LDA算法应用于FETET数据集,识别率分别为61.46%和59.17%,运行时间分别为383.02 s和220.62 s。 展开更多

关键词 主元分析 线性判别分析 降维 稀疏表示分类 人脸识别 协同表达分类

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分子植物卓越中心揭示玉米胚乳灌浆调控新机制

13

作者 无 《种业导刊》 2020年第1期41-41,共1页

日前,中国科学院分子植物科学卓越创新中心巫永睿研究组在 Plant Biotechnology Journal 杂志上在线发表题为Transactivation of Sus1 and Sus2 by Opaque2 is an essential supplement to sucrose synthase-mediated endosperm filling... 日前,中国科学院分子植物科学卓越创新中心巫永睿研究组在 Plant Biotechnology Journal 杂志上在线发表题为Transactivation of Sus1 and Sus2 by Opaque2 is an essential supplement to sucrose synthase-mediated endosperm filling in maize 的研究论文。该论文进一步拓展了Opaque2(O2)作为玉米胚乳灌浆调控网络核心转录因子的作用范围,揭示其可以调控胚乳储藏物质合成起始单元生成所需基因的协同表达。该研究得到国家自然科学基金、中国科技部和中科院等的资助。 展开更多

关键词 储藏物质 玉米胚乳 国家自然科学基金 中国科学院 协同表达

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中国农业科学院揭示基因组中保守非编码序列参与植物远程基因互作的新机制

14

《蔬菜》 2023年第3期20-20,共1页

中国农业科学院蔬菜花卉所王晓武团队研究发现,保守非编码序列(CNSs)参与基因之间的染色质远程互作,CNSs富集活性组蛋白修饰并且募集转录因子(TFs),进而导致基因的启动子区域与另一基因的下游区域发生远程互作,最后调控互作的基因产生... 中国农业科学院蔬菜花卉所王晓武团队研究发现,保守非编码序列(CNSs)参与基因之间的染色质远程互作,CNSs富集活性组蛋白修饰并且募集转录因子(TFs),进而导致基因的启动子区域与另一基因的下游区域发生远程互作,最后调控互作的基因产生协同表达。研究团队利用Hi-C试验技术,获得白菜和甘蓝的全基因组染色质互作数据,进一步结合拟南芥的Hi-C数据集分析,发现拟南芥、白菜和甘蓝中分布在不同染色体上的基因频繁发生远程空间互作。 展开更多

关键词 中国农业科学院 蔬菜花卉所 基因互作 非编码序列 团队研究 组蛋白修饰 协同表达 研究团队

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