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杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备
1
作者
倪坚
张艳华
+3 位作者
汤访评
孙立夫
裴克全
薛煜
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期115-119,共5页
454焦磷酸测序已成为真菌群落结构研究的常用手段,文中对454焦磷酸测序的Barcoded PCR扩增中的模板质量浓度、Mg2+和引物浓度等反应条件进行了优化,并对扩增所得产物的特异性进行了鉴定;同时就不同Taq酶对测序结果的影响进行了讨论。结...
454焦磷酸测序已成为真菌群落结构研究的常用手段,文中对454焦磷酸测序的Barcoded PCR扩增中的模板质量浓度、Mg2+和引物浓度等反应条件进行了优化,并对扩增所得产物的特异性进行了鉴定;同时就不同Taq酶对测序结果的影响进行了讨论。结果表明:DNA模板经适度稀释能显著提高反应效率;Mg2+及引物浓度对扩增反应效率有影响,建议上下游引物浓度均为0.1μmol·L-1,Mg2+浓度可不做调整;使用特异性好、活性较强的Taq酶对保证扩增产物的真菌特异性至关重要,建议选用热启动Taq酶。
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关键词
杜鹃花菌根真菌
454焦磷酸测序
样品制备
加接头的聚合链式反应
优化
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职称材料
题名
杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备
1
作者
倪坚
张艳华
汤访评
孙立夫
裴克全
薛煜
机构
绍兴文理学院
中国科学院植物研究所
东北林业大学
出处
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第5期115-119,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31170469)
文摘
454焦磷酸测序已成为真菌群落结构研究的常用手段,文中对454焦磷酸测序的Barcoded PCR扩增中的模板质量浓度、Mg2+和引物浓度等反应条件进行了优化,并对扩增所得产物的特异性进行了鉴定;同时就不同Taq酶对测序结果的影响进行了讨论。结果表明:DNA模板经适度稀释能显著提高反应效率;Mg2+及引物浓度对扩增反应效率有影响,建议上下游引物浓度均为0.1μmol·L-1,Mg2+浓度可不做调整;使用特异性好、活性较强的Taq酶对保证扩增产物的真菌特异性至关重要,建议选用热启动Taq酶。
关键词
杜鹃花菌根真菌
454焦磷酸测序
样品制备
加接头的聚合链式反应
优化
Keywords
Ericoid mycorrhizal fungi
454 pyrosequencing
Sample preparation
Barcoded PCR
Optimization
分类号
Q939.5 [生物学—微生物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杜鹃花菌根真菌454焦磷酸测序的样品制备
倪坚
张艳华
汤访评
孙立夫
裴克全
薛煜
《东北林业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
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