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基于HRM技术开发水稻抗条纹叶枯病基因STV11功能标记
1
作者 王婵 吴莹莹 +4 位作者 李文奇 李霞 王芳权 周彤 杨杰 《作物学报》 北大核心 2025年第9期2547-2556,共10页
水稻条纹叶枯病是一种由灰飞虱传播的重要病害,对水稻(Oryza sativa L.)生产造成威胁,其病原为水稻条纹叶枯病毒(rice stripe virus,RSV)。为了加快水稻条纹叶枯病抗性品种选育进程,本研究旨在开发可以快速准确鉴定水稻条纹叶枯病抗性... 水稻条纹叶枯病是一种由灰飞虱传播的重要病害,对水稻(Oryza sativa L.)生产造成威胁,其病原为水稻条纹叶枯病毒(rice stripe virus,RSV)。为了加快水稻条纹叶枯病抗性品种选育进程,本研究旨在开发可以快速准确鉴定水稻条纹叶枯病抗性基因的功能标记,有助于提高水稻种质改良的效率。STV11是从籼稻Kasalath中鉴定的条纹叶枯病抗性基因。根据Kasalath型条纹叶枯病基因STV11KAS的6个碱基缺失的功能性多态性序列差异,通过NCBI查找克隆序列(登录号:LOC_Os11g30910),针对其第773~779位核苷酸在抗感品种上的差异序列,设计基于高分辨率熔解曲线(high-resolution melting curve,HRM)的功能性分子标记stvHRM-3。进一步,对所检测品种的目标片段的PCR产物进行测序分析以验证鉴定结果,并对部分江苏省试验品种进行抗条纹叶枯病表型和基因型的分析。通过HRM-PCR检测结合测序分析,筛选了STV11基因1个功能区域的功能标记stvHRM-3。利用stvHRM-3对包括江苏省晚粳组区试、迟熟中粳预试材料以及育种中间材料、部分品种资源等在内的520份粳稻材料的STV11基因型进行检测。结果发现,217份水稻材料为抗病基因型;294份材料为感病基因型;9份材料为抗感杂合基因型。基于功能标记鉴定为抗病基因型的材料均表现出高抗或抗病表型特征。基于HRM-PCR技术开发的基因功能标记stvHRM-3可以快速高通量鉴定水稻STV11不同基因型,具有潜在的育种应用价值。 展开更多
关键词 水稻 条纹叶枯病 STV11基因 功能标记 HRM-PCR技术
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兼容双平台的玉米糯质基因InDel功能标记开发与应用
2
作者 朱维佳 王蕊 +11 位作者 薛英杰 田红丽 范亚明 王璐 李松 徐丽 卢柏山 史亚兴 易红梅 陆大雷 杨扬 王凤格 《作物学报》 北大核心 2025年第9期2330-2340,共11页
为了实现糯玉米中糯质基因变异类型的快速鉴定、了解其在现代糯玉米育种中的应用情况,本研究针对wx-D7、wx-D10、wx-124、wx-hAT等4种常见的糯质基因InDel变异开发功能标记,以普通玉米、糯玉米、甜玉米和甜糯玉米为研究对象,通过多种分... 为了实现糯玉米中糯质基因变异类型的快速鉴定、了解其在现代糯玉米育种中的应用情况,本研究针对wx-D7、wx-D10、wx-124、wx-hAT等4种常见的糯质基因InDel变异开发功能标记,以普通玉米、糯玉米、甜玉米和甜糯玉米为研究对象,通过多种分子检测平台验证糯质功能标记的特异性和有效性。结果显示,4种Waxy功能标记在KASP平台和荧光毛细管电泳平台均能够实现特异性基因分型,且能够有效区分普通玉米与糯质玉米,并确定糯玉米中Waxy基因的变异类型。针对玉米自交系,当检出特异性糯质功能标记时,可依据4种糯质变异类型确定待测样品的糯质基因单倍型并判断其糯质表型,对于未检测到4种糯质变异的玉米种质则为非糯性或糯质稀有突变。当待测样本为玉米杂交种时,可能存在隐性纯合基因型、隐性等位糯性杂合基因型、糯/非糯杂合基因型及显性纯合基因型等4种情况,依据糯质单倍型结果判定。在检测出的糯玉米中85%以上为wx-D7变异类型,表明wx-D7为我国当前糯玉米育种中主要的应用类型。同时,在糯玉米杂交种中发现有D7/D10两种糯质变异类型同时存在的现象,但糯质自交系中仅存在单一的糯质变异类型,意味着在糯玉米杂交育种中可通过聚合不同类型的糯质变异实现遗传改良。本研究为糯质基因设计了一套适用于多种分子检测平台的功能标记组合,为鉴定、筛选玉米糯质性状提供了有效的方案。 展开更多
关键词 糯玉米 糯质基因 功能标记 INDEL KASP 荧光毛细管电泳
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水稻抽穗期调控基因Hd6功能标记的开发及应用
3
作者 陈智慧 陶亚军 +8 位作者 范方军 许扬 王芳权 李文奇 古丽娜尔·巴合提别克 蒋彦婕 朱建平 李霞 杨杰 《中国水稻科学》 北大核心 2025年第1期47-54,共8页
【目的】探究Hd6等位基因型在江苏粳稻和籼稻中的分布,提高Hd6等位基因型在水稻抽穗期遗传改良中的应用价值和选择效率。【方法】根据籼稻品种Kasalath中有功能的等位基因Hd6与粳稻品种日本晴中无功能的等位基因hd6在功能区域存在的单... 【目的】探究Hd6等位基因型在江苏粳稻和籼稻中的分布,提高Hd6等位基因型在水稻抽穗期遗传改良中的应用价值和选择效率。【方法】根据籼稻品种Kasalath中有功能的等位基因Hd6与粳稻品种日本晴中无功能的等位基因hd6在功能区域存在的单核苷酸差异,设计和筛选出Hd6基因功能标记K-Hd6-21F/Hd6-1R和N-Hd6-22F/Hd6-1R,并测序分析验证;利用K-Hd6-21F/Hd6-1R和N-Hd6-22F/Hd6-1R对江苏省不同生态类型的粳稻品种和不同来源的籼稻品种的Hd6基因型进行检测。【结果】该功能标记可准确鉴定出Hd6的不同基因型;48份中熟中粳水稻品种中,携带Hd6的水稻品种占42%;30份迟熟中粳水稻品种中携带Hd6的占50%;48份早熟晚粳水稻品种中,携带Hd6的占77.5%。Hd6的2种等位基因型在江苏省3个不同生态区域粳稻品种中均有分布,但有功能的Hd6等位基因型在3个区域粳稻品种中的分布随着抽穗期变长,基因型频率增加;而Hd6基因在籼稻中表现出高度保守性,检测的62个籼稻品种均携带有功能的Hd6等位基因型。【结论】本研究为Hd6基因的育种利用和分子标记辅助选择奠定了基础,也为籼稻早熟品种的选育提供新依据和有效途径。 展开更多
关键词 水稻 抽穗期 Hd6 功能标记 等位基因特异性PCR
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小麦株型相关基因TaOTUB1的克隆和功能标记开发
4
作者 谢妍 吴林楠 +2 位作者 张天星 李梦 马猛 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第3期279-286,共8页
为了开发小麦株型相关的功能标记,对小麦OTUBs家族成员进行鉴定,并克隆得到一个潜在株型相关基因TaOTUB1,并对其表达模式进行分析。结果表明,TaOTUB1基因在小麦各组织广泛表达,且在小麦OTUBs家族33个成员中表达丰度最高。利用748份小麦... 为了开发小麦株型相关的功能标记,对小麦OTUBs家族成员进行鉴定,并克隆得到一个潜在株型相关基因TaOTUB1,并对其表达模式进行分析。结果表明,TaOTUB1基因在小麦各组织广泛表达,且在小麦OTUBs家族33个成员中表达丰度最高。利用748份小麦基因组自然变异数据分析发现,TaOTUB1-A启动子区主要存在HapⅠ和HapⅡ两种单倍型。基于-761 bp位点的SNP开发dCAPS分子标记,利用该标记能够在313份小麦品种中有效鉴定HapⅠ和HapⅡ。通过关联分析,HapⅠ是有利于小麦株型改良和产量增加的优异单倍型。HapⅠ在国内外栽培小麦中属于优势单倍型。研究结果有助于小麦株型改良和分子标记辅助选择育种。 展开更多
关键词 小麦 株型 TaOTUB1 功能标记
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水稻镉离子转运基因OsCd1等位变异分析与功能标记开发
5
作者 刘芊 李小秀 +2 位作者 樊国建 袁定阳 段美娟 《作物研究》 2025年第3期260-267,288,共9页
OsCd1基因与镉的吸收、运输密切相关,其优异等位变异的利用对降低水稻籽粒镉含量具有重要意义。本研究利用393份水稻核心种质的第三代测序数据,系统分析了OsCd1基因的多态性、单倍型、蛋白质三级结构等。结果显示:OsCd1基因在核心种质... OsCd1基因与镉的吸收、运输密切相关,其优异等位变异的利用对降低水稻籽粒镉含量具有重要意义。本研究利用393份水稻核心种质的第三代测序数据,系统分析了OsCd1基因的多态性、单倍型、蛋白质三级结构等。结果显示:OsCd1基因在核心种质中均为单拷贝,保守性较其他基因高,但是在籼稻与粳稻之间存在明显分化;编码区共鉴定出8种单倍型,其中只有2种单倍型的氨基酸发生改变;启动子区变异比较丰富,但变异位点未落在关键的顺式作用元件上。最后,基于编码区的籼、粳稻分化重要位点SNP22开发并验证了OsCd1基因的功能分子标记。本研究为进一步挖掘与利用OsCd1优异等位变异与培育低镉水稻品种奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 OsCd1 镉 序列变异 功能标记
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水稻萌发耐淹性基因功能标记开发和种质资源筛选
6
作者 郑嘉汉 李忠金 +3 位作者 赵锦祥 黄奇 冯忠平 陈丽萍 《种子》 北大核心 2025年第7期71-79,共9页
筛选萌发耐淹水稻种质资源,对现有萌发耐淹基因的遗传效应验证,是选育适宜直播水稻新品种的基础。为评价种质资源的萌发耐淹性,对不同来源的288份水稻材料进行萌发耐淹性鉴定,共获得越24、R651、农香占、P469、P393、野T14878、甬粳108... 筛选萌发耐淹水稻种质资源,对现有萌发耐淹基因的遗传效应验证,是选育适宜直播水稻新品种的基础。为评价种质资源的萌发耐淹性,对不同来源的288份水稻材料进行萌发耐淹性鉴定,共获得越24、R651、农香占、P469、P393、野T14878、甬粳108、润香糯2号等21份萌发耐淹性强的水稻材料,其中14份为籼稻材料。通过与功能SNP位点强连锁的其他SNP位点开发OsUGT75A基因的功能标记(75AFM、75AFMB)和利用OsGF14h现有功能标记,对OsUGT75A和OsGF14h两个耐淹基因进行基因型鉴定,使用线性回归分析量化基因对表型的贡献。结果表明,OsUGT75A在不同的遗传背景下均显著提高耐淹表型,而OsGF14h同样提高耐淹表型,但差异不显著。通过耐淹表型鉴定和开发功能标记鉴定基因型,为萌发耐淹水稻新品种的选育提供了种质资源,并为OsUGT75A的育种实践应用提供了依据。 展开更多
关键词 水稻 萌发耐淹 耐淹基因 功能标记
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基于HRM技术开发水稻糊化温度基因ALK功能标记 被引量：3
7
作者 王军 周晶 +9 位作者 陶亚军 李文奇 朱建平 范方军 王芳权 许扬 陈智慧 蒋彦婕 李霞 杨杰 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期106-110,共5页
【目的】糊化温度是影响稻米蒸煮食味品质的重要指标,ALK是控制水稻糊化温度的主效基因,开发可快速高通量鉴定ALK基因型的功能标记有助于提高水稻品质改良的效率。【方法】根据ALK基因4198位、4329位和4330位存在的单碱基差异,设计基于... 【目的】糊化温度是影响稻米蒸煮食味品质的重要指标,ALK是控制水稻糊化温度的主效基因,开发可快速高通量鉴定ALK基因型的功能标记有助于提高水稻品质改良的效率。【方法】根据ALK基因4198位、4329位和4330位存在的单碱基差异,设计基于HRM技术检测的基因功能标记。【结果】通过PCR检测结合测序分析,筛选了ALK基因2个功能区域的功能标记ALKH4、ALKH5。利用ALKH4、ALKH5对81份籼稻品种、279份粳稻品种进行了ALK基因型检测,结果发现,16份粳稻和19份籼稻为G-GC基因型;51份粳稻为A-GC基因型;212份粳稻和62份籼稻为G-TT基因型。【结论】基于HRM技术开发的基因功能标记ALKH4、ALKH5可以快速高通量鉴定控制糊化温度ALK不同基因型,具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 水稻 糊化温度 ALK 功能标记 HRM技术
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小麦籽粒大小相关基因TaCYP78A17的功能标记开发
8
作者 张天星 李梦 +3 位作者 吴林楠 赵惠贤 胡胜武 马猛 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期3025-3034,共10页
籽粒大小是影响小麦产量的重要因素之一。为了开发小麦籽粒大小相关的功能标记,本研究克隆得到一个潜在籽粒大小相关基因TaCYP78A17,并对其进行了系统进化、表达模式、等位变异分析和功能标记开发。结果表明,TaCYP78A17基因是小麦细胞色... 籽粒大小是影响小麦产量的重要因素之一。为了开发小麦籽粒大小相关的功能标记,本研究克隆得到一个潜在籽粒大小相关基因TaCYP78A17,并对其进行了系统进化、表达模式、等位变异分析和功能标记开发。结果表明,TaCYP78A17基因是小麦细胞色素P450 CYP78A家族的一员,且在小麦幼穗和籽粒中高表达;在30份普通小麦品种中发现TaCYP78A17-Ap存在6个SNP和2个InDel;根据InDel 4和InDel 8开发功能标记InDel-A17,可将30份普通小麦品种分为TaCYP78A17-Ap-HapⅠ, TaCYP78A17-Ap-HapⅡ和TaCYP78A17-Ap-HapⅢ三种单倍型;利用该功能标记在323份普通小麦品种中进行验证,发现该功能标记可以有效区分上述3种单倍型;表型调查发现具有TaCYP78A17-Ap-HapI单倍型的小麦其千粒重和籽粒大小显著高于具有TaCYP78A17-Ap-HapⅡ或TaCYP78A17-Ap-HapⅢ单倍型的小麦。研究结果有望应用于小麦分子标记辅助选择育种。 展开更多
关键词 小麦 籽粒大小 TaCYP78A17 功能标记
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玉米籽粒功能标记研究进展
9
作者 孙联合 王斌功 《大麦与谷类科学》 2024年第1期1-8,共8页
功能标记是依据功能基因序列的多态性开发的一种准确、高效的分子标记,不同等位变异基因与表型直接相关。籽粒性状是由互相关联多基因调控的较复杂的重要性状之一,也是生化生理一系列过程的最终表现,已成为育种者在品种选育过程中的研... 功能标记是依据功能基因序列的多态性开发的一种准确、高效的分子标记,不同等位变异基因与表型直接相关。籽粒性状是由互相关联多基因调控的较复杂的重要性状之一,也是生化生理一系列过程的最终表现,已成为育种者在品种选育过程中的研究热点。对国内外玉米籽粒性状的分子标记、QTL定位、候选基因克隆、全基因组关联分析、转基因技术等应用的相关研究进行了综述,探讨了籽粒功能标记存在的问题,旨在为玉米籽粒分子生物学及现代生物技术在玉米育种中的应用提供参考。 展开更多
关键词 玉米 籽粒 功能标记 籽粒构型 籽粒品质 遗传连锁图谱
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一种水稻香味基因功能标记的开发 被引量：73
10
作者 王丰 李金华 +5 位作者 柳武革 廖亦龙 朱满山 刘振荣 黄慧君 黄德娟 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期347-352,共6页
为了提高水稻香味基因的分子标记辅助选择的准确性,根据水稻隐性香型品种与非香型品种的BAD2基因(即香味基因)序列之间存在8bp碱基缺失,设计出香味基因fgr的InDel功能标记GRFM04。利用该标记对粤丰B(香型)/振丰B(非香型)的F2分离群体和... 为了提高水稻香味基因的分子标记辅助选择的准确性,根据水稻隐性香型品种与非香型品种的BAD2基因(即香味基因)序列之间存在8bp碱基缺失,设计出香味基因fgr的InDel功能标记GRFM04。利用该标记对粤丰B(香型)/振丰B(非香型)的F2分离群体和其他16份香稻品种和6份非香稻品种进行检测验证。依据其PCR扩增产物电泳带型,可以准确地区分出香型纯合基因型、非香型纯合基因型和杂合基因型3种带型,且3种带型与其植株或品种相应的香味性状表现完全呈一一对应关系。 展开更多
关键词 水稻 香味基因 功能标记 分子标记辅助选择
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水稻抗咪唑啉酮类除草剂基因ALS功能标记的开发与应用 被引量：28
11
作者 王芳权 杨杰 +6 位作者 范方军 李文奇 王军 许扬 朱金燕 费云燕 仲维功 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期324-331,共8页
选育和利用抗除草剂水稻品种具有重要的生产实践意义。通过筛选水稻资源,发现了抗除草剂材料金粳818,其ALS基因编码区第1880位碱基存在一个由G到A的碱基变异,导致丝氨酸突变为天冬酰胺,从而具有除草剂抗性。本研究基于该位点的碱基变异... 选育和利用抗除草剂水稻品种具有重要的生产实践意义。通过筛选水稻资源,发现了抗除草剂材料金粳818,其ALS基因编码区第1880位碱基存在一个由G到A的碱基变异,导致丝氨酸突变为天冬酰胺,从而具有除草剂抗性。本研究基于该位点的碱基变异,设计了11条等位基因特异PCR(allelic-specific PCR,AS-PCR)引物,经过优化筛选,获得两个引物组合F1N(S1/S9)和F1M(S1/S10),将该标记命名为AS-ALS。利用F2群体及其亲本和杂交种,结合AS-ALS标记检测和除草剂抗性分析,结果表明感除草剂ALS-G等位基因型只能被F1N引物对有效扩增,抗除草剂ALS-A等位基因型只能被F1M引物对有效扩增,而杂合基因型能同时被两对引物F1N和F1M扩增,ALS-A纯合或杂合等位基因型都表现抗除草剂,ALS-G纯合基因型表现感除草剂。因此本研究开发的标记能有效区分除草剂抗性基因的3种基因型,基因型与表型完全对应。该标记用于回交育种,可以选择ALS-A杂合基因型单株,剔除ALS-G纯合等位基因型,在自交的F2保留ALS-A纯合基因型单株,连续自交,能快速获得除草剂抗性稳定的水稻材料。该除草剂抗性基因的功能标记还可用于咪唑啉酮类除草剂抗性资源筛选。 展开更多
关键词 水稻 除草剂 乙酰乳酸合成酶 ALS基因 功能标记
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稻瘟病抗病基因Pi-k^h功能标记的开发及江苏粳稻品种中Pi-k^h的变异 被引量：27
12
作者 王军 杨杰 +5 位作者 朱金燕 范方军 李文奇 王芳权 黄转运 仲维功 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期141-147,共7页
稻瘟病抗病基因Pi-kh是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。根据Pi-kh感病基因和抗病基因序列存在143bp插入的特征,设计了InDel标记FM143。Tetep具有抗病基因Pi-kh,分子标记FM143PCR扩增带型为非插入带型,而不携带Pi-kh的材料的带... 稻瘟病抗病基因Pi-kh是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。根据Pi-kh感病基因和抗病基因序列存在143bp插入的特征,设计了InDel标记FM143。Tetep具有抗病基因Pi-kh,分子标记FM143PCR扩增带型为非插入带型,而不携带Pi-kh的材料的带型为插入带型。利用该标记对Tetep与宁9108的F2群体进行分析,结果表明该标记能准确区分Pi-kh、Pi-kh纯合及杂合基因型,标记基因型符合1∶2∶1比例,没有发生偏分离现象。利用该标记对65份江苏省历年来大面积推广的粳稻品种和64份粳稻品系进行检测,筛选出具有非插入带型的粳稻品种19份、粳稻品系22份。进一步对江苏省粳稻品种中Pi-kh位点进行测序,发现江苏粳稻品种(系)Pi-kh基因座位与Tetep和已经登录的Pi-kh序列相比在102bp处存在一个单碱基的变异(由G突变为C),使得谷氨酸变异为天门冬氨酸,且该变异高度保守。将江苏省粳稻品种中发现的Pi-kh位点的等位基因暂定名为Pi-khJSJ。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 功能标记
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水稻广亲和基因S5-n的功能标记开发及其应用 被引量：34
13
作者 杨杰 王军 +2 位作者 曹卿 陈志德 仲维功 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期2000-2007,共8页
广亲和基因S5-n是能够恢复籼、粳杂种育性的基因,利用常规育种方法回交转育广亲和基因需要通过配组杂种F1,根据F1的育性判断和选择S5-n,选育周期长,方法繁琐。因此,在广亲和遗传改良和聚合育种中需要寻找一种快速、简便的广亲和基因检... 广亲和基因S5-n是能够恢复籼、粳杂种育性的基因,利用常规育种方法回交转育广亲和基因需要通过配组杂种F1,根据F1的育性判断和选择S5-n,选育周期长,方法繁琐。因此,在广亲和遗传改良和聚合育种中需要寻找一种快速、简便的广亲和基因检测方法。本研究根据水稻广亲和基因和籼粳S-5等位基因序列存在136bp缺失的特征,设计了InDel标记S5136。前人研究已经明确02428、Dualr、CPSLO17具有S5-n,分子标记S5136 PCR扩增这3个材料的带型为缺失带型,而不携带广亲和基因S5-n的材料的带型为非缺失带型。利用该标记对3037与02428的F2群体分析表明,该标记能准确区分S5-n、S5-i纯合及杂合基因型,标记基因型符合1∶2∶1比例,没有发生偏分离现象。利用该标记从554份水稻品种资源(O.sativa L.)和27份普通野生稻(O.rufipogen Griff.)以及24份江淮流域杂草稻资源中筛选出具有缺失带型的资源材料13份,并对其PCR产物测序证实为S5-n,对Kasalath的广亲和性进行了初步验证;从20份02428的高世代育种材料中,筛选到携带广亲和基因S5-n的恢复系2份。该标记可以用于S5-n基因资源筛选、分子标记辅助选择育种和培矮64S为母本的杂交种种子纯度鉴定。 展开更多
关键词 广亲和基因S5-n 功能标记 亚洲栽培稻 普通野生稻 杂草稻
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水稻稻瘟病抗性基因Bsr-d1功能标记的开发和利用 被引量：17
14
作者 王军 赵婕宇 +7 位作者 许扬 范方军 朱金燕 李文奇 王芳权 费云燕 仲维功 杨杰 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1612-1620,共9页
稻瘟病是危害水稻最严重的病害之一,选育抗病品种是防治该病害最有效的方法。Bsr-d1是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。为提高Bsr-d1基因在育种中的选择效率,根据Bsr-d1与其感病等位基因bsr-d1在功能区域存在的单核苷酸差异,设... 稻瘟病是危害水稻最严重的病害之一,选育抗病品种是防治该病害最有效的方法。Bsr-d1是对稻瘟病菌具有广谱抗性的一个重要基因。为提高Bsr-d1基因在育种中的选择效率,根据Bsr-d1与其感病等位基因bsr-d1在功能区域存在的单核苷酸差异,设计和筛选出Bsr-d1基因不同类型的基因功能标记CAPs5-1和3Bsr-d1/3bsr-d1,结合测序分析验证,可准确鉴定出Bsr-d1的不同基因型。利用3Bsr-d1/3bsr-d1对34份籼稻品种、江苏历年来主要推广的110份粳稻品种、其他省份的13份粳稻品种、148份太湖流域地方粳稻资源和19份太湖流域地方籼稻资源进行了Bsr-d1基因型检测,筛选到携带Bsr-d1基因的籼型资源11份,271份粳型资源中均不携带Bsr-d1基因,这也说明Bsr-d1主要分布在籼型水稻资源中,在粳型资源中几乎不存在。本研究为Bsr-d1基因的育种利用和分子标记辅助选择奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 Bsr-d1 功能标记 CAPS 等位基因特异PCR
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水稻千粒重基因TGW6功能标记的开发与利用 被引量：15
15
作者 王军 杨杰 +5 位作者 徐祥 朱金燕 范方军 李文奇 王芳权 仲维功 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期473-478,共6页
水稻粒重是影响产量及品质的重要性状之一,TGW6是能显著增加千粒重同时不影响稻米品质的粒重基因。为提高千粒重基因TGW6在育种中的选择效率,在前人克隆的基础上,根据TGW6与其等位基因tgw6在功能区域存在的单碱基缺失,设计和筛选出TGW6... 水稻粒重是影响产量及品质的重要性状之一,TGW6是能显著增加千粒重同时不影响稻米品质的粒重基因。为提高千粒重基因TGW6在育种中的选择效率,在前人克隆的基础上,根据TGW6与其等位基因tgw6在功能区域存在的单碱基缺失,设计和筛选出TGW6基因的功能标记CAPs6-1,对CAPs6-1扩增的PCR产物测序验证,说明CAPs6-1可以准确鉴定出TGW6的不同基因型。利用该标记对不同来源的43份籼稻资源、江苏2007-2013年审定的65份粳稻品种和太湖流域179份粳稻地方资源进行了TGW6基因型检测,筛选到携带TGW6基因的籼稻资源14份,244份粳型资源均不携带TGW6基因,这也说明TGW6主要分布在籼型水稻资源中,在粳型资源中几乎不存在。 展开更多
关键词 水稻 千粒重 TGW6 功能标记
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水稻冷胁迫响应基因OsSADMC功能标记的开发和利用 被引量：12
16
作者 胡晓晨 张婷 +4 位作者 杨圣 秦巧 石英尧 王文生 傅彬英 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期475-480,共6页
通过对95份水稻种质资源进行苗期耐冷性鉴定,筛选出10份苗期耐冷(存活率≥60%)和9份冷敏感的材料(存活率为零),并对水稻冷胁迫响应基因OsSADMC进行了表达分析,发现对照和冷胁迫处理条件下该基因在耐冷品种中的表达量都显著高于冷敏感品... 通过对95份水稻种质资源进行苗期耐冷性鉴定,筛选出10份苗期耐冷(存活率≥60%)和9份冷敏感的材料(存活率为零),并对水稻冷胁迫响应基因OsSADMC进行了表达分析,发现对照和冷胁迫处理条件下该基因在耐冷品种中的表达量都显著高于冷敏感品种。对耐冷材料丽江新团黑谷(LTH)和冷敏感材料IR29的基因编码区域进行了克隆和测序分析,在两个品种间鉴定了10个SNP位点,其中第749碱基处存在的一个碱基变异(C突变为T),从而使丝氨酸变为亮氨酸。根据其中一个SNP位点设计了OsSADMC的功能标记SADMC-CAPS1,该标记可以准确地鉴定出19份耐冷性不同水稻种质资源OsSADMC的基因型和耐冷性。 展开更多
关键词 水稻 耐冷性 功能标记 OsSADMC
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水稻多酚氧化酶基因功能标记的开发与应用 被引量：13
17
作者 杨杰 曹卿 +3 位作者 王军 范方军 张玉琼 仲维功 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期37-42,共6页
水稻酚反应是水稻分类的重要依据。控制水稻酚反应的多酚氧化酶基因(PPO)已经克隆,根据其等位基因的DNA序列差异设计了InDel功能标记FMppo-18和FMppo-29。利用这两个标记对45份材料进行了标记基因型分析和酚反应鉴定。结果发现3份普通... 水稻酚反应是水稻分类的重要依据。控制水稻酚反应的多酚氧化酶基因(PPO)已经克隆,根据其等位基因的DNA序列差异设计了InDel功能标记FMppo-18和FMppo-29。利用这两个标记对45份材料进行了标记基因型分析和酚反应鉴定。结果发现3份普通野生稻为非缺失带型;8份籼稻材料中6份为非缺失带型,而Dular为缺失29 bp带型,龙晴为缺失18bp带型,表明Dular和龙晴分别携带29 bp和18 bp缺失的PPO等位基因;11份粳稻材料中9份携带18 bp缺失的PPO等位基因,2份携带29 bp缺失的PPO等位基因。对23份杂草稻鉴定的结果表明,7份早年发现的杂草稻,即3份江苏省连云港穞稻和4份安徽省怀远、来安、全椒、肥东的塘稻为非缺失带型;而16份近年来发现的杂草稻中14份不缺失,2份表现为18 bp缺失的PPO等位基因,与江苏省大面积推广的栽培粳稻品种携带相同的PPO基因。酚反应结果表明带29 bp或18bp缺失的PPO等位基因的材料酚反应呈阴性,而不缺失的材料酚反应呈阳性。标记基因型与酚反应表现型完全对应。表明这两个功能标记可用于水稻种质资源鉴定、进化研究以及多酚氧化酶基因的分子标记辅助选择育种。 展开更多
关键词 多酚氧化酶 酚反应 功能标记 杂草稻 基因漂移
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功能标记的开发及在禾谷类作物中的应用 被引量：16
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作者 王昊龙 韩俊杰 +2 位作者 李淼淼 南富波 李卫华 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1963-1971,共9页
功能标记是根据与表型紧密相关的功能基因内部特定区域多态性基序开发出来的一种新型分子标记。由于功能标记直接来源于基因内部的功能性基序,因此,此类标记可以对不同遗传背景下目标等位基因的有无作直接、快速的判定。本文在3种DNA分... 功能标记是根据与表型紧密相关的功能基因内部特定区域多态性基序开发出来的一种新型分子标记。由于功能标记直接来源于基因内部的功能性基序,因此,此类标记可以对不同遗传背景下目标等位基因的有无作直接、快速的判定。本文在3种DNA分子标记基于植物中的开发、应用特点比较论述的基础上,重点介绍了功能标记的开发特点,最后探讨功能标记作为一种辅助育种手段在禾谷类作物常规育种中的应用及其开发前景。 展开更多
关键词 功能标记 禾谷类作物 开发 应用
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利用功能标记鉴定普通野生稻中的白叶枯病抗性基因 被引量：12
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作者 夏志辉 韩飞 +4 位作者 高利芬 袁潜华 翟文学 刘迪 罗越华 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期653-656,共4页
以9个菲律宾白叶枯病菌小种对供试的9份普通野生稻(Oryza rufipogonGriff.)及1份高感白叶枯病材料IR24进行抗性鉴定,发现IR24对所有的菌株都表现为高感,6份野生稻材料对9个菌株表现全抗,占参试野生稻总数的67%。取自广西玉林的1份材料只... 以9个菲律宾白叶枯病菌小种对供试的9份普通野生稻(Oryza rufipogonGriff.)及1份高感白叶枯病材料IR24进行抗性鉴定,发现IR24对所有的菌株都表现为高感,6份野生稻材料对9个菌株表现全抗,占参试野生稻总数的67%。取自广西玉林的1份材料只感PXO280(P8),海南万宁的1份材料感PXO71(P4),广州高州的1份材料对PXO79、PXO99和PXO339感病,而这几份材料对其余菌株都表现为抗病,说明每份材料至少含有1个抗性基因。利用已克隆的白叶枯病抗性基因xa5、xa13、Xa21和Xa27的功能标记检测,结果表明9份供试普通野生稻中都不含抗性基因xa5、Xa21;5份为显性Xa13纯合体,4份为隐性抗病xa13杂合体;5份为抗病显性Xa27纯合体,3份为隐性xa27纯合体,1份材料中xa27和Xa27都不存在。 展开更多
关键词 普通野生稻 白叶枯病 抗性基因 功能标记
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豫南香稻品种Badh2基因功能标记的检测及应用 被引量：12
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作者 彭波 孔冬艳 +10 位作者 庞瑞华 孙艳芳 宋晓华 李慧龙 王青林 韩爽 郭桂英 李金涛 周棋赢 段斌 宋世枝 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第8期1693-1699,共7页
【目的】香稻中香味的产生是由于水稻第8染色体上面Badh2基因的功能缺失而导致2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)前体物质的增多,进而2AP积累使稻米产生香气。【方法】本研究利用Badh2基因开发的7个功能标记,针对豫南地区16份香稻品种进行了检测与... 【目的】香稻中香味的产生是由于水稻第8染色体上面Badh2基因的功能缺失而导致2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)前体物质的增多,进而2AP积累使稻米产生香气。【方法】本研究利用Badh2基因开发的7个功能标记,针对豫南地区16份香稻品种进行了检测与分析。【结果】4份香稻品种属于第2外显子突变类型,2份香稻品种属于第4~5外显子突变类型,5份香稻品种属于第7外显子突变类型;并没有发现Badh2基因启动子区及第12~14外显子突变类型的香稻品种。【结论】通过Badh2基因功能标记的检测与分析,本研究鉴定了豫南香稻品种对应的突变类型,为利用分子标记辅助选择培育优质香稻新品种奠定基础。 展开更多
关键词 香稻 Badh2基因 功能标记 检测
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