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题名金属β-内酰胺酶GOB-54的发现与表征
被引量：1
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作者
章升霞
王绍琛
吕云斌
冯治洋
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机构
南京农业大学食品科技学院
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出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第24期44-50,共7页
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基金
国家自然科学基金项目(32370089)。
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文摘
该文旨在从土壤中挖掘新型β-内酰胺类抗生素耐药基因,分析耐药机制,做好临床预警,为开发新型β-内酰胺类药物提供信息。利用功能筛选策略,从土壤宏基因组文库中筛选获得阳性克隆,通过亚克隆构建和序列测定,得到耐药基因序列。利用序列比对、系统发育树分析、三维结构建模等生物信息学方法对耐药基因进行分析。使用微量肉汤稀释法评估β-内酰胺酶的耐药活性,利用生化实验分析酶水解抗生素的能力。鉴定出一个β-内酰胺抗生素耐药基因,与已知的β-内酰胺酶基因最高只有52.30%氨基酸序列一致性,命名为gob-54,编码β-内酰胺酶GOB-54。SWISS-MODEL三维建模发现GOB-54与临床来源的GOB-18具有高度相似的结构。动力学参数表明在所测试的β-内酰胺抗生素中,GOB-54对哌拉西林具有最高的亲和力和催化活性,动力学参数Km和Kcat/Km分别为121.82μmol/L和49.15 L/(mmol·s)。该研究利用功能宏基因组学方法挖掘出土壤来源的β-内酰胺抗生素耐药基因gob-54,编码广谱β-内酰胺酶GOB-54,为临床上监测和防控β-内酰胺类抗生素耐药基因的传播提供借鉴。
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关键词
Β-内酰胺酶
土壤微生物
功能宏基因组学
抗生素耐药基因
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Keywords
β-lactamase
soil microorganism
functional metagenomics
drug resistance genes
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分类号
R914
[医药卫生—药物化学]
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