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一种面向功能基因挖掘的动物多组学数据集: 1; 作者刘洪窦婧文 +5 位作者王越廖勇刘小磊李新云赵书红付玉华《农业大数据学报》 2025年第1期96-106,共11页; 单一的组学数据难以全面揭示基因调控性状的复杂分子机制,整合不同类型和层次的生物组学数据对于理解生物体内复杂的分子网络具有重要的意义。本数据集提供了包含21个动物物种的61191个个体水平组学数据(WGS、RNA-Seq、ChIP-Seq和ATAC-S... 展开更多; 关键词多组学数据跨物种功能基因挖掘个体水平深度学习; 在线阅读下载PDF 职称材料

转录组测序及其在甜菜功能基因挖掘中的应用被引量：2: 2; 作者张自强白晨 +7 位作者张惠忠李晓东付增娟赵尚敏鄂圆圆张辉王良张必周《北方农业学报》 2018年第5期39-43,共5页; 由于转录组测序技术具有检测费用低、检测通量高、不受遗传背景影响等优势,使其成为当前挖掘基因的主要手段之一。文章首先介绍了转录组测序技术的基本情况,接着阐述了该技术在甜菜功能基因研究方面的进展,文章最后展望转录组测序技术... 展开更多; 关键词转录组测序甜菜功能基因挖掘; 在线阅读下载PDF 职称材料

盐单胞属新种Halomonas binhaiensis Y2R2的基因组分析与功能挖掘: 3; 作者张亚茹张钶 +3 位作者韩旭陈帅君李晓雁黄海东《天津农学院学报》 2025年第4期9-17,共9页; Halomonas binhaiensis Y2R2是从天津滨海盐碱地中分离得到的具有溶磷功能的盐单胞菌属(Halomonas)新种,为发掘菌株Y2R2的菌种信息,采取基因组功能注释与比较基因组学分析的方法,对其可能的次级代谢产物合成基因簇进行预测,探究该菌株... 展开更多; 关键词盐单胞菌溶磷菌功能注释基因功能挖掘次级代谢产物; 在线阅读下载PDF 职称材料

基于宏基因组和宏转录组的发酵食品微生物研究进展被引量：27: 4; 作者雷忠华陈聪聪陈谷《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第3期330-337,共8页; 揭示传统发酵食品中微生物群落结构特征、演替变化规律和功能基因是多年来科学研究和工业生产共同关注的焦点。近年来,高通量测序技术以其高效和相对廉价的优势,成为传统发酵食品微生物研究的重要工具。本文从高通量测序技术的基因组和... 展开更多; 关键词发酵食品宏基因组学宏转录组学微生物群落结构演替变化规律功能基因挖掘; 在线阅读下载PDF 职称材料

药用植物蛋白质组学的研究进展被引量：4: 5; 作者付强赵杰宏 +1 位作者刘育辰邹颉《贵州农业科学》 CAS 2018年第10期16-19,共4页; 药用植物蛋白质组学是药用植物功能基因挖掘、功能化合物代谢通路及功能机制等研究的有效工具。为药用植物功能基因组的深入研究提供参考,从药用植物活性物质代谢通路及治疗作用机制研究2方面对药用植物蛋白质组学的研究进展进行综述,... 展开更多; 关键词蛋白质组学药用植物功能基因挖掘药物靶标蛋白; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一种面向功能基因挖掘的动物多组学数据集: 1; 作者刘洪窦婧文王越廖勇刘小磊李新云赵书红付玉华; 机构农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室湖北洪山实验室; 出处《农业大数据学报》 2025年第1期96-106,共11页; 基金国家自然科学基金面上项目(32272841) 湖北国际科技合作项目(2022EHB055)。; 文摘单一的组学数据难以全面揭示基因调控性状的复杂分子机制,整合不同类型和层次的生物组学数据对于理解生物体内复杂的分子网络具有重要的意义。本数据集提供了包含21个动物物种的61191个个体水平组学数据(WGS、RNA-Seq、ChIP-Seq和ATAC-Seq)和基因组注释信息,有效数据规模为2.8 TB。此外,本数据集还收录了基于深度学习算法得到的基因与表型实体识别数据。总的来说,该多组学数据集可用于农业重要性状的基因发掘和功能验证,能够为跨物种比较研究提供有价值的资源,也可更好地服务于动物经济性状关键基因识别模型构建以及算法研究。; 关键词多组学数据跨物种功能基因挖掘个体水平深度学习; Keywords multi-omics data cross-species functional gene mining individual level deep learning; 分类号 TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程] Q811.4 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名转录组测序及其在甜菜功能基因挖掘中的应用被引量：2: 2; 作者张自强白晨张惠忠李晓东付增娟赵尚敏鄂圆圆张辉王良张必周; 机构内蒙古农牧业科学院特色作物研究所; 出处《北方农业学报》 2018年第5期39-43,共5页; 基金内蒙古自治区自然科学基金项目[2016BS(LH)0305] 农业部糖料产业技术体系项目(CARS-170104); 文摘由于转录组测序技术具有检测费用低、检测通量高、不受遗传背景影响等优势,使其成为当前挖掘基因的主要手段之一。文章首先介绍了转录组测序技术的基本情况,接着阐述了该技术在甜菜功能基因研究方面的进展,文章最后展望转录组测序技术在甜菜基因挖掘中的应用前景。通过转录组测序可以构建甜菜丰富的基因表达数据库,尤其是挖掘与甜菜产量、含糖量调控、抗逆性相关的基因资源,为后续基因克隆、分子标记辅助育种以及转基因育种等提供理论支持与基因资源。; 关键词转录组测序甜菜功能基因挖掘; Keywords RNA-Seq Sugarbeet Functional gene excavation; 分类号 S566.3 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名盐单胞属新种Halomonas binhaiensis Y2R2的基因组分析与功能挖掘: 3; 作者张亚茹张钶韩旭陈帅君李晓雁黄海东; 机构天津农学院农学与资源环境学院天津农学院食品科学与生物工程学院; 出处《天津农学院学报》 2025年第4期9-17,共9页; 基金国家级大学生创新创业训练计划项目(202210061003)。; 文摘 Halomonas binhaiensis Y2R2是从天津滨海盐碱地中分离得到的具有溶磷功能的盐单胞菌属(Halomonas)新种,为发掘菌株Y2R2的菌种信息,采取基因组功能注释与比较基因组学分析的方法,对其可能的次级代谢产物合成基因簇进行预测,探究该菌株的潜在功能。菌株Y2R2的GO、COG和KEGG等数据库功能注释结果表明,菌株Y2R2参与碳水化合物代谢和氨基酸代谢的相关基因较多,分别有341个和336个。通过与3个近缘模式菌株的比较基因组分析,发现有3623个共有的基因家族基因,663个特有基因。其中,Y2R2与黄河盐单胞菌(Halomonas huangheensis)NTU-107的同源性最高;预测得到多个菌株Y2R2次级代谢产物合成基因簇,包括四氢嘧啶(Ectoine)和细菌萜类化合物Sodorifen的合成基因簇。其中,四氢嘧啶合成基因簇与地中海甲壳虫(Methylophaga thalassica)的四氢嘧啶合成基因簇相似度高达75%。通过生物信息学分析,探究菌株Y2R2适应高渗透压环境和溶磷的机理,挖掘菌株在盐碱地植物促生方面的潜在功能,为盐单胞菌属新种菌株Y2R2在滨海盐碱地改良领域的应用提供技术支持。; 关键词盐单胞菌溶磷菌功能注释基因功能挖掘次级代谢产物; Keywords Halomonas phosphate-solubilizing bacteria functional annotation gene function mining secondary metabolites; 分类号 Q939.112 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于宏基因组和宏转录组的发酵食品微生物研究进展被引量：27: 4; 作者雷忠华陈聪聪陈谷; 机构华南理工大学食品科学与工程学院; 出处《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第3期330-337,共8页; 基金广东省公益研究与能力建设专项资金项目(2015A020209029); 文摘揭示传统发酵食品中微生物群落结构特征、演替变化规律和功能基因是多年来科学研究和工业生产共同关注的焦点。近年来,高通量测序技术以其高效和相对廉价的优势,成为传统发酵食品微生物研究的重要工具。本文从高通量测序技术的基因组和转录组层面的研究出发,综述了近8年来宏基因组学与宏转录组学在研究发酵食品微生物群落结构、相互作用及挖掘功能基因等方面的进展,并分析讨论其面临的主要问题和发展趋势,为未来发酵食品的科学研究和工业生产提供一定参考。; 关键词发酵食品宏基因组学宏转录组学微生物群落结构演替变化规律功能基因挖掘; Keywords fermented foods metagenomics metatranscriptomics microbial community structure microbial succession discovery of functional genes; 分类号 TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名药用植物蛋白质组学的研究进展被引量：4: 5; 作者付强赵杰宏刘育辰邹颉; 机构贵阳中医学院药学院; 出处《贵州农业科学》 CAS 2018年第10期16-19,共4页; 基金贵阳中医学院2018年度学术新苗培养及创新探索专项"基于二代三代测序技术的黑骨藤转录组分析及强心苷关键合成基因克隆"[黔科合平台人才(2017)5735号-21] 国家自然科学基金项目"基于双分子标记的甘草属药用亲缘关系研究"(81473308); 文摘药用植物蛋白质组学是药用植物功能基因挖掘、功能化合物代谢通路及功能机制等研究的有效工具。为药用植物功能基因组的深入研究提供参考,从药用植物活性物质代谢通路及治疗作用机制研究2方面对药用植物蛋白质组学的研究进展进行综述,并对其未来发展趋势进行展望。; 关键词蛋白质组学药用植物功能基因挖掘药物靶标蛋白; Keywords proteome medicinal plant functional gene mining drug target protein; 分类号 S567 [农业科学—中草药栽培]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	一种面向功能基因挖掘的动物多组学数据集	刘洪窦婧文王越廖勇刘小磊李新云赵书红付玉华	《农业大数据学报》	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	转录组测序及其在甜菜功能基因挖掘中的应用	张自强白晨张惠忠李晓东付增娟赵尚敏鄂圆圆张辉王良张必周	《北方农业学报》	2018	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	盐单胞属新种Halomonas binhaiensis Y2R2的基因组分析与功能挖掘	张亚茹张钶韩旭陈帅君李晓雁黄海东	《天津农学院学报》	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	基于宏基因组和宏转录组的发酵食品微生物研究进展	雷忠华陈聪聪陈谷	《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心	2018	27	在线阅读下载PDF 职称材料
5	药用植物蛋白质组学的研究进展	付强赵杰宏刘育辰邹颉	《贵州农业科学》 CAS	2018	4	在线阅读下载PDF 职称材料