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柳杉CAPS遗传标记反应体系的优化 被引量:2
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作者 杨萍 郑前剑 +1 位作者 赵明水 汤定钦 《浙江林学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期52-55,共4页
建立柳杉Cryptomeria fortuneiCAPS反应优化体系是进行柳杉遗传多样性研究的前提。通过对影响柳杉CAPS遗传标记反应体系结果主要因子的研究,确定了最佳的柳杉CAPS扩增反应体系:含有2.0μL 10×Buffer,0.08 mmol.L-1dNTPs,200 mg.L-... 建立柳杉Cryptomeria fortuneiCAPS反应优化体系是进行柳杉遗传多样性研究的前提。通过对影响柳杉CAPS遗传标记反应体系结果主要因子的研究,确定了最佳的柳杉CAPS扩增反应体系:含有2.0μL 10×Buffer,0.08 mmol.L-1dNTPs,200 mg.L-1铸型DNA,1.5 mmol.L-1MgCl2,0.1μmol.L-1引物和41.675 nkatTaqDNA聚合酶的20μL反应液。扩增程序是94℃预变性5 min,然后94℃变性40 s,58℃退火40 s,72℃延伸80 s,共35个循环,然后在72℃延伸5 min。PCR产物10.0μL,加入2.0μL 10×Buffer,83.350 nkat内切酶,7.5μL双蒸水构成20μL酶切反应体系。 展开更多
关键词 植物学 柳杉 切割的产物多态性序列(caps) DNA标记 反应体系 优化
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分群分析法获得与多花黑麦草抗叶班病基因连锁的EST-CAPS标记 被引量:6
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作者 丁成龙 沈益新 +1 位作者 顾共如 三浦优一 《草地学报》 CAS CSCD 2006年第1期9-13,23,共6页
利用多花黑麦草叶斑病抗性和敏感个体杂交构建F 1分离群体,采用分群分析法(bu lked segregan t ana lys is,BSA),通过多花黑麦草表达序列标签(expressed sequence tag,EST)的PCR扩增和扩增产物的限制性内切酶酶切多态性(cleaved am p li... 利用多花黑麦草叶斑病抗性和敏感个体杂交构建F 1分离群体,采用分群分析法(bu lked segregan t ana lys is,BSA),通过多花黑麦草表达序列标签(expressed sequence tag,EST)的PCR扩增和扩增产物的限制性内切酶酶切多态性(cleaved am p lified po lym orph ic sequence,CAPS)筛选,获得一个同多花黑麦草草抗叶斑病紧密连锁的EST-CAPS标记p56。对照多花黑麦草细胞质雄性不育(CM S)群体构建的遗传连锁图,该EST-CAPS标记位于多花黑麦草的第5遗传连锁群(LG 5)。对cDNA文库中对应于标记位点p56的EST序列片段分析和基因库搜索结果表明,该EST所编码的氨基酸序列同大麦天冬酰胺合成酶基因H vAS 1和H vAS 2的部分氨基酸序列片段同源性很高,推测位点p56所处的基因为编码多花黑麦草天冬酰胺合成酶基因。该分子标记可用于多花黑麦草分子标记辅助育种。 展开更多
关键词 多花黑麦草 叶班病 分子标记 表达序列标签(EST) 酶切片段多态性序列(caps)
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同源四倍体和二倍体水稻Wx基因与淀粉品质的遗传关系 被引量:3
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作者 刘玉花 栾丽 +4 位作者 龙文波 王兴 孔繁伦 何涛 涂升斌 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期143-149,共7页
用Wx基因的(CT)n微卫星标记和切割的扩增产物多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)分子标记PCR-AccⅠ对40份同源四倍体和14份二倍体水稻Wx基因型进行研究。利用484/485引物检测,Wx基因呈Wx1、Wx2和Wx33种多态性;而... 用Wx基因的(CT)n微卫星标记和切割的扩增产物多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)分子标记PCR-AccⅠ对40份同源四倍体和14份二倍体水稻Wx基因型进行研究。利用484/485引物检测,Wx基因呈Wx1、Wx2和Wx33种多态性;而用PCR-AccⅠ检测,Wx基因表现为G-型和T-型。同时,在测定稻米直链淀粉含量(AC)、胶稠度(GC)和糊化温度(GT)的基础上探讨它们与Wx基因的关系,结果表明AC、GC与Wx基因密切相关,GT与Wx基因相关不显著。综合分析表明,同源四倍体水稻中,92.0%的Wx1基因型材料为G-型,而Wx2基因型村料和80.0%的Wx3基因型材料为T-型。统计分析表明,Wx基因(CT)n微卫星标记检测与PCR-AccⅠ分子标记检测的相关系数为0.842,呈极显著正相关。 展开更多
关键词 同源四倍体 水稻 蜡质基因 直链淀粉含量 胶稠度 糊化温度 遗传关系 微卫星标记 切割的产物多态性序列
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