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题名猪圆环病毒2型三株贵州流行株全基因序列分析
被引量：4
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作者
李涛
王开功
程振涛
周碧君
文明
崔亚兰
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机构
贵州省农业委员会
贵州省生猪质量安全工程技术研究中心
贵州大学动物科学学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期165-170,共6页
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基金
贵州省生猪质量安全工程技术研究中心建设项目[黔科合农C字(2011)4022号]
贵州省农业委员会科技计划项(2013-06号)
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文摘
为掌握贵州省猪圆环病毒2型(PCV2)流行株的分子生物学资料,对已分离的3株PCV2贵州流行株(GZ-LZ1株、GZ-KY1株和GZ-PX1株)进行全基因克隆与测序,应用生物信息学软件将贵州PCV2流行株与参考株进行核苷酸同源性与系统进化树分析。结果显示,3株PCV2贵州流行株贵州全基因组大小均为1 767 bp,同源性为97.0%-98.3%,与国内外24株参考株同源性为77.5%-99.9%,与国产疫苗株同源性为95.5%-98.2%;系统进化树结果显示,3株PCV2贵州流行株归属PCV2d分支,其中GZ-LZ1株和GZ-PX1株与国内PCV2疫苗YM-SH株的进化关系较远,而GZ-KY1与四川SC-10株、浙江ZJ-38株和黑龙江HLJ-10株的进化关系较近。
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关键词
猪圆环病毒
2
型
全基因序列
分离株的遗传分析
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Keywords
PCV2
Complete gene sequencing
Genetic analysis of isolates
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分类号
S852.65
[农业科学—基础兽医学]
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