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Nanopore靶向测序在呼吸道样本中检测非结核分枝杆菌的诊断价值研究
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作者 应广智 蔡青山 +2 位作者 马晓卿 陈凌燕 陈园园 《中国防痨杂志》 北大核心 2025年第5期589-596,共8页
目的:探讨Nanopore靶向测序在呼吸道样本中检测非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)的诊断价值。方法:回顾性收集2021年12月至2022年9月在浙江省杭州市红十字会医院结核病诊疗中心行呼吸道样本Nanopore靶向测序的455例患... 目的:探讨Nanopore靶向测序在呼吸道样本中检测非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)的诊断价值。方法:回顾性收集2021年12月至2022年9月在浙江省杭州市红十字会医院结核病诊疗中心行呼吸道样本Nanopore靶向测序的455例患者的资料。根据诊断标准,455例患者最终诊断为NTM-PD患者(NTM-PD组)65例,诊断为非NTM-PD患者(非NTM-PD组)390例,455例患者的肺泡灌洗液或痰液同时进行Nanopore靶向测序、BACTEC MGIT 960液体培养(简称“液体培养”)和(或)PCR荧光探针检测,比较各种方法诊断NTM-PD的效能。结果:以临床诊断结果为标准,Nanopore靶向测序、液体培养、PCR荧光探针检测呼吸道样本NTM的敏感度分别为92.3%(60/65)、83.1%(54/65)和57.1%(36/63),特异度分别为96.2%(375/390)、98.7%(385/390)和99.5%(380/382),阳性预测值分别为80.0%(60/75)、91.5%(54/59)和94.7%(36/38),阴性预测值分别为98.7%(375/380)、97.2%(385/396)和93.4%(380/407);Nanopore靶向测序、液体培养和PCR荧光探针的Kappa值分别为0.831、0.851和0.679。以液体培养为标准,Nanopore靶向测序和PCR荧光探针检测的敏感度分别为86.4%(51/59)和73.5%(36/49),特异度分别为98.0%(388/396)和94.4%(374/396),阳性预测值分别为86.4%(51/59)和62.1%(36/58),阴性预测值分别为98.0%(388/396)和96.6%(374/387);Nanopore靶向测序和PCR荧光探针的Kappa值分别为0.844和0.629。在65例临床诊断为NTM-PD组的患者中,Nanopore靶向测序和液体培养+基因芯片均为阳性的样本为50例,菌种鉴定的一致性为96.0%(48/50)。结论:Nanopore靶向测序在诊断NTM-PD中表现出较高的敏感度和特异度,与常规鉴定方法的一致性良好。在菌种鉴定方面,Nanopore靶向测序与液体培养结合基因芯片的检测结果具有高度一致性。Nanopore靶向测序能够对疑似NTM-PD患者的临床呼吸道样本进行快速检测,并获取菌种鉴定结果,为后续抗NTM治疗方案的制定提供指导。 展开更多
关键词 典型性细菌 分枝杆菌感染 NANOPORES 诊断技术和方法 敏感性与特异性
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129株非结核分枝杆菌采用两种分子检测技术行菌种鉴定的结果分析 被引量:10
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作者 刘佳文 吕红艳 +1 位作者 丁北川 张治国 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2019年第9期999-1004,共6页
目的分析北京地区3个单位非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株采用芯片杂交法(简称“芯片法”)和16SrRNA基因测序(简称“基因测序”)进行菌种鉴定的结果,为临床分枝杆菌病的快速准确诊断提供科学依据。方法用芯片法和基因测序进行北京地区3... 目的分析北京地区3个单位非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株采用芯片杂交法(简称“芯片法”)和16SrRNA基因测序(简称“基因测序”)进行菌种鉴定的结果,为临床分枝杆菌病的快速准确诊断提供科学依据。方法用芯片法和基因测序进行北京地区3个单位129株NTM临床分离株的菌种鉴定,实验操作者之间采用双盲法,对两种鉴定方法的结果进行比较和评价。结果129株NTM菌株中,有107株进行分枝杆菌基因测序,其中59株为胞内分枝杆菌(55.1%);29株为堪萨斯分枝杆菌(27.1%);5株为龟分枝杆菌/脓肿分枝杆菌(4.7%);3株为鸟分枝杆菌(2.8%);2株为偶发分枝杆菌(1.9%);2株为戈登分枝杆菌(1.9%);1株为蟾蜍分枝杆菌(0.9%);1株为草分枝杆菌(0.9%);1株为瘰疬分枝杆菌(0.9%);4株为其他NTM(3.7%)。有116株进行芯片法分枝杆菌菌种鉴定,且有96株同时进行芯片法和基因测序法检测,两种方法进行菌种鉴定的符合率为88.5%(85/96)。基因测序发现有3株外来菌株,分别为明尼苏达分枝杆菌、熊本分枝杆菌、提门分枝杆菌(M.temen)。结论北京3家机构NTM菌种以胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和龟分枝杆菌/脓肿分枝杆菌为主。用芯片法和基因测序对NTM临床分离株进行菌种鉴定的一致率较高。 展开更多
关键词 分枝杆菌 典型性 生物学鉴定法 芯片分析技术 分子探针技术 寡核苷酸序列分析 结果与过程评价(卫生保健)
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非结核分枝杆菌病的实验室诊断技术进展 被引量:16
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作者 黄明翔 《中国防痨杂志》 CAS 2013年第7期538-541,共4页
目前,非结核分枝杆菌(NTM)病的发病率在全球逐年提高,NTM与结核分枝杆菌均可引起肺部以及其他部位病变,而且临床症状相似,鉴别诊断困难,所以分枝杆菌菌种鉴定对于疾病的诊断、治疗及预后意义重大。传统生化鉴定方法费力耗时,不能很好地... 目前,非结核分枝杆菌(NTM)病的发病率在全球逐年提高,NTM与结核分枝杆菌均可引起肺部以及其他部位病变,而且临床症状相似,鉴别诊断困难,所以分枝杆菌菌种鉴定对于疾病的诊断、治疗及预后意义重大。传统生化鉴定方法费力耗时,不能很好地满足临床需要。近年来,以免疫层析技术为基础的MPB64抗原胶体金法、以色谱技术为基础的气相及高效液相色谱法、以基因探针、限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)及PCR-基因测序方法为代表的分子生物学技术等各种新技术的引入,为NTM的菌种鉴定提供了更为科学的方法。作者就上述3种技术为基础开展的菌种鉴定方法,综合国内外近年来的文献,介绍了各种方法的原理、应用情况、性能指标等,同时对方法的优点及局限性进行初步评价。相信随着新技术不断完善,能够逐步形成快速可靠、成本低廉的标准化NTM菌种鉴定体系。 展开更多
关键词 分枝杆菌感染 典型性 实验室技术和方法
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基于BACTEC MGIT 960培养的结核分枝杆菌与非结核分枝杆菌混合感染检测方法的研究 被引量:1
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作者 陈振华 郭婧玮 +4 位作者 王珏 胡培磊 易松林 刘怡 谭云洪 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1243-1249,共7页
目的:探讨结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)和非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM)混合感染的检测方法,为临床诊治混合感染提供参考依据。方法:使用脓肿分枝杆菌、鸟分枝杆菌、胞内分枝杆菌3... 目的:探讨结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)和非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM)混合感染的检测方法,为临床诊治混合感染提供参考依据。方法:使用脓肿分枝杆菌、鸟分枝杆菌、胞内分枝杆菌3种NTM和MTBC标准菌株(H37Rv)各制备3种不同初始浓度(10^(-2)mg/ml、10^(-4)mg/ml和10^(-6)mg/ml)的菌液,将每个浓度的NTM与MTBC采用9种不同比例(NTM标准菌株与H37Rv按照1∶99、5∶95、10∶90、20∶80、50∶50、80∶20、90∶10、95∶5和99∶1)混合制成81种混合感染标本。3种感染模型分别为脓肿分枝杆菌和H37Rv、鸟分枝杆菌和H37Rv、胞内分枝杆菌和H37Rv。经BACTEC MGIT 960培养,采用MPB64抗原检测、对硝基苯甲酸(PNB)生长试验、荧光PCR熔解曲线法和恒温扩增实时荧光法4种方法对培养液进行检测。结果:3种混合感染模型的81份标本均在34 d内报告阳性。其中,MPB64抗原检测阳性3份(3.7%,3/81);PNB生长试验阳性78份(96.3%,78/81);荧光PCR熔解曲线法仅检出相应的NTM 64份(79.0%,64/81),仅检出MTBC 3份(3.7%,3/81),同时检出相应的NTM和MTBC 14份(17.3%,14/81);恒温扩增实时荧光法检出MTBC 67份(82.7%,67/81)。结论:临床标本经BACTEC MGIT 960培养,仪器报告阳性后,用MPB64抗原检测和PNB生长试验初判,若有NTM生长,建议采用分子生物学方法鉴定NTM,同时用单一检测MTBC核酸的方法对培养液进行检测,以免MTBC漏检。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 典型性细菌 重叠感染 培养技术 研究技术
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宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌肺病的诊断价值 被引量:18
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作者 孔娇 陈园园 +2 位作者 蔡青山 赵亚芳 喻义杭 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2022年第11期1135-1140,共6页
目的:探讨宏基因二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在非结核分枝杆菌肺病(nontuberculous mycobacterial pulmonary disease,NTM-PD)中的诊断价值。方法:回顾性搜集2020年1月至2022年2月浙江大学医学院附属杭... 目的:探讨宏基因二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在非结核分枝杆菌肺病(nontuberculous mycobacterial pulmonary disease,NTM-PD)中的诊断价值。方法:回顾性搜集2020年1月至2022年2月浙江大学医学院附属杭州市胸科医院结核病诊疗中心收治的123例疑似NTM-PD患者的资料。根据诊断标准,123例疑似NTM-PD患者最终诊断为NTM-PD患者(NTM-PD组;74例)和非NTM-PD患者(非NTM-PD组;49例)。123例患者肺泡灌洗液、痰液、肺组织同时进行mNGS、PCR荧光探针法、BACTEC MGIT 960分枝杆菌全自动快速液体培养(简称“液体培养”),比较3种方法的诊断效能。结果:以最终临床诊断结果为标准,mNGS、液体培养及PCR荧光探针法检测NTM-PD的敏感度分别为83.8%(62/74)、78.4%(58/74)、67.6%(50/74),特异度分别为65.3%(32/49)、91.8%(45/49)、87.8%(43/49),诊断一致率分别为76.4%(94/123)、83.7%(103/123)、75.6%(93/123),Kappa值分别为0.524、0.647、0.521。以液体培养结果为标准,mNGS和PCR荧光探针法检测NTM-PD的敏感度分别为87.1%(54/62)和75.8%(47/62),特异度分别为59.0%(36/61)和85.2%(52/61),诊断一致率分别为73.2%(90/123)和80.5%(99/123),Kappa值分别为0.462和0.587。对74例NTM-PD患者菌株进行mNGS及基因芯片法菌种鉴定,以基因芯片法为菌种鉴定标准,mNGS检测的准确率为63.8%(37/58)。结论:在NTM-PD的诊断中,mNGS检测的敏感度较高,可直接鉴定至菌种水平,但特异度较低,应重点提高检测特异度,以更好地服务于临床工作。 展开更多
关键词 基因组学 分枝杆菌 典型性 诊断技术和方法 对比研究
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福建省261株非结核分枝杆菌的菌种鉴定分析 被引量:9
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作者 林建 赵永 +2 位作者 戴志松 魏淑贞 林淑芳 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第6期590-595,共6页
目的通过对福建省261株非结核分枝杆菌(NTM)进行菌种鉴定,分析福建省NTM的菌种分布情况,为福建省NTM病的临床诊疗和流行病学研究提供科学依据。方法从福建省9个省级结核病耐药监测点和9个地市级疾病预防控制中心结核病实验室2016年6月至... 目的通过对福建省261株非结核分枝杆菌(NTM)进行菌种鉴定,分析福建省NTM的菌种分布情况,为福建省NTM病的临床诊疗和流行病学研究提供科学依据。方法从福建省9个省级结核病耐药监测点和9个地市级疾病预防控制中心结核病实验室2016年6月至2019年12月开展常规培养的菌株中,收集到分枝杆菌菌株3355株,经对硝基苯甲酸(PNB)生长试验初步鉴定出261株NTM菌株,采用GenoType Mycobacterium CM试剂盒进行分枝杆菌的菌种鉴定,DNA测序或MeltPro Myco试剂盒进一步鉴定无法确定菌种的菌株。结果从261株被初步鉴定为NTM的菌株中,鉴定出213株(81.61%)NTM,NTM的分离率为6.35%(213/3355),其中,位列前三的NTM菌种分别是胞内分枝杆菌(65.73%,140/213)、脓肿分枝杆菌(17.37%,37/213)和堪萨斯分枝杆菌(4.22%,9/213);同时,发现了6种罕见的NTM,分别为M.arupense、M.peregrinum、M.phocaicum、M.sinense、M.vanbaalenii和M.dioxanotrophicus;还鉴定出了9株混合感染菌株,其中,8株为结核分枝杆菌复合群(MTBC)和胞内分枝杆菌的混合感染,1株为MTBC和鸟分枝杆菌的混合感染。结论三种NTM鉴定方法的联合使用,揭示了福建省最常见的3种NTM分别是为胞内分枝杆菌、脓肿分枝杆菌和堪萨斯分枝杆菌,还发现了6种罕见的NTM和9株混合感染菌株。 展开更多
关键词 分枝杆菌 典型性 细菌分型技术 聚合酶链反应 流行病学研究
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广州市非结核分枝杆菌临床分离株菌种鉴定及药物敏感性试验结果分析 被引量:28
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作者 刘东鑫 郑惠文 +6 位作者 贺文从 宋怡蒙 何萍 赵冰 欧喜超 刘春法 赵雁林 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2019年第5期534-540,共7页
目的对广州市非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株进行菌种鉴定与药物敏感性试验(简称“药敏试验”).为临床诊断和治疗NTM病提供依据。方法从2016年广州市胸科医院行分枝杆菌分离培养的1250份标本中搜集培养阳性的717株临床分离株.采用水溶... 目的对广州市非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株进行菌种鉴定与药物敏感性试验(简称“药敏试验”).为临床诊断和治疗NTM病提供依据。方法从2016年广州市胸科医院行分枝杆菌分离培养的1250份标本中搜集培养阳性的717株临床分离株.采用水溶性对硝基苯甲酸(PNB)和嗟吩-2-竣酸W(TCH)对其进行培养.以鉴别MTB与NTM.通过多靶位基因聚合酶链反应(PCR)测序.对PNB和TC'H培养确定为NTM的菌株进一步行菌种鉴定.并采用最低抑菌浓度法(MIC)检测98株NTM对18种抗结核药物的耐药性。结果717株分枝杆菌中,检出106株NTM菌株,检出率为14.4%;其中103株传代成功.传代率为97. 2%(103/106)。经NTM菌种鉴定?按照构成比高低依次为脓肿分枝杆菌[34.0%(35/103)]、胞内分枝杆菌[25. 2%(26/103)]、马赛分枝杆菌[20. 4%(21/103)]、鸟分枝杆菌[9. 7%(10/103)]、堪萨斯分枝杆菌[5. 8%(6/103)],偶发分枝杆菌[1.9%(2/103)],以及1株缓黄分枝杆菌、1株猪分枝杆菌和1株阿加普尔分枝杆菌[均占0.9%(1/103)]。98株NTM菌株的药敏试验结果显示,敏感者前3位依次为阿米卡星[93. 9%(92/98)]、克拉霉素[91. 8%(90/98)]和阿奇霉素[71. 4%(70/98)].耐药者前3位依次为利福平[89. 8%(88/98刀、左氧氟沙星[83. 7%(82/98)]和亚胺培南[77. 6%(76/98)]。并且NTM不同菌种对部分药物的耐药性存在种间差异。结论广州市NTM的检出率高于我国其他地区.流行的菌种以脓肿分枝杆菌和胞内分枝杆菌为主;克拉霉素和阿米卡星是临床治疗NTM患者的优选抗生素?应重视对利福平和左氧氟沙星的耐药性。 展开更多
关键词 分枝杆菌.非典型性:细菌学技术 微生物敏感性试验 抗药性.细菌 结果评价(卫生保健)
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339株非结核分枝杆菌临床分离株菌种鉴定及耐药性分析 被引量:20
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作者 秦中华 景晔 +2 位作者 杜岩青 宋晓梅 张丽霞 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2020年第6期630-633,共4页
回顾性分析2014年3月至2019年3月天津市海河医院经罗氏培养和"DNA微阵列芯片技术"确定的339株非结核分枝杆菌(NTM),并对其药物敏感性试验(简称"药敏试验")结果进行分析。339株NTM临床分离株中,排在前3位者分别为胞... 回顾性分析2014年3月至2019年3月天津市海河医院经罗氏培养和"DNA微阵列芯片技术"确定的339株非结核分枝杆菌(NTM),并对其药物敏感性试验(简称"药敏试验")结果进行分析。339株NTM临床分离株中,排在前3位者分别为胞内分枝杆菌38.6%(131/339)、龟-脓肿分枝杆菌21.2%(72/339)、堪萨斯分枝杆菌18.3%(62/339)。体外药敏试验显示胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和龟-脓肿分枝杆菌对8种抗结核药品(异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇、对氨基水杨酸、卡那霉素、卷曲霉素、氧氟沙星)耐药率情况为:胞内分枝杆菌的耐药率分别为95.6%(108/113)、82.3%(93/113)、94.7%(107/113)、54.0%(61/113)、92.0%(69/75)、81.3%(61/75)、85.3%(64/75)、87.5%(49/56);堪萨斯分枝杆菌的耐药率分别为100.0%(54/54)、3.7%(2/54)、98.1%(53/54)、11.1%(6/54)、95.0%(38/40)、90.0%(36/40)、27.5%(11/40)、13.8%(4/29);龟-脓肿分枝杆菌的耐药率分别为96.9%(62/64)、93.8%(60/64)、95.3%(61/64)、92.2%(59/64)、88.4%(38/43)、86.0%(37/43)、88.4%(38/43)、87.1%(27/31)。临床分离NTM菌种以胞内分枝杆菌、龟-脓肿分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌为主,其中胞内分枝杆菌、龟-脓肿分枝杆菌对常用一线、二线抗结核药品具有较高的耐药性,堪萨斯分枝杆菌对利福平、乙胺丁醇、氧氟沙星、卷曲霉素的耐药率低。 展开更多
关键词 分枝杆菌 典型性 生物学鉴定法 细菌分型技术 微生物敏感试验 数据说明 统计
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安徽省非结核分枝杆菌临床分离率及人群分布和耐药性分析 被引量:16
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作者 包训迪 江跃 +6 位作者 梁锁 程红燕 夏广秀 王超 叶倩 王舒 王庆 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2020年第7期718-724,共7页
目的分析安徽省非结核分枝杆菌(NTM)临床分离率和人群分布及耐药性情况,为NTM的防治提供科学依据。方法按照分层整群抽样方法从全省86个结核病门诊抽取42个调查点,连续纳入2015年9月15日至2016年8月31日的涂阳疑似肺结核患者3047例,对... 目的分析安徽省非结核分枝杆菌(NTM)临床分离率和人群分布及耐药性情况,为NTM的防治提供科学依据。方法按照分层整群抽样方法从全省86个结核病门诊抽取42个调查点,连续纳入2015年9月15日至2016年8月31日的涂阳疑似肺结核患者3047例,对痰标本酸性罗氏培养阳性的2652株菌株行菌种鉴定[对硝基苯甲酸(PNB)培养和早期分泌蛋白(MPB64)胶体金法]和基因测序(16S rRNA和hsp65 DNA测序),再对其中的NTM临床分离株在不同人群中的分布特征和耐药性检测(微孔板法)进行研究和分析。结果2652株培养阳性菌株经初步菌种鉴定获得122株NTM菌株,进一步经基因测序获得NTM临床分离株107株[符合率为87.70%(107/122),分离率为4.03%(107/2652)]、结核分枝杆菌12株、诺卡菌1株、污染菌2株;其中107株NTM共计分离出6种优势菌种,以胞内分枝杆菌[65.42%(70/107)]和脓肿分枝杆菌[25.23%(27/107)]为主。NTM菌株在复治[9.26%(41/443)]、女性[6.32%(39/617)]、≥40岁[5.11%(100/1956)]、退休[8.82%(12/136)]和农民[4.38%(86/1965)]、初中及以下学历([4.43%(97/2189)]、家庭年收入<2万元[4.98%(75/1506)]人群中的分离率均明显高于初治[2.99%(66/2209)]、男性[3.34%(68/2035)]、<40岁[1.01%(7/696)]、工人[0.96%(1/104)]、高中及以上[2.16%(10/463)]、家庭年收入≥2万元[2.83%(27/955)]者[χ^2值分别为37.434、10.854、36.387、17.021、18.995、8.748,P值分别为0.000、0.001、0.000、0.002、0.001、0.033]。104株(排除1株复苏失败的胞内分枝杆菌、1株草分枝杆菌和1株马赛分枝杆菌)菌株的药物敏感性试验结果显示,不同NTM对阿米卡星、利福布汀、克拉霉素和利福平的敏感度较高[分别为87.50%(91/104)、86.54%(90/104)、83.65%(87/104)、75.00%(78/104)],对亚胺培南/西司他丁、头孢西丁、米诺环素、多西环素等的耐药率较高[分别为100.00%(104/104)、95.19%(99/104)、94.23%(98/104)、93.27%(97/104)]。结论安徽省NTM的分离率较低,以复治、女性、40岁及以上、农民、低学历、低收入人群为主,且耐药率较高,应提升实验室鉴别和监测NTM的水平。 展开更多
关键词 分枝杆菌 典型性 细菌学技术 微生物敏感性试验 抗药性 细菌 流行病学研究 结果评价(卫生保健) 小地区分析
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大力加强非结核分枝杆菌病的实验室诊断研究 被引量:5
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作者 郑惠文 赵雁林 《中国防痨杂志》 CAS 2016年第9期697-700,共4页
【摘要】非结核分枝杆菌(NTM)病的发病率在全球逐年增加,但由于NTM病与结核病相比有相似的临床症状,且致病菌种繁多,鉴别诊断困难,增加了治疗的难度,所以对分枝杆菌进行菌种鉴定将在疾病的诊断、治疗及预后上具有重要意义。现代... 【摘要】非结核分枝杆菌(NTM)病的发病率在全球逐年增加,但由于NTM病与结核病相比有相似的临床症状,且致病菌种繁多,鉴别诊断困难,增加了治疗的难度,所以对分枝杆菌进行菌种鉴定将在疾病的诊断、治疗及预后上具有重要意义。现代细菌学方法的快速鉴别诊断,以及随着免疫技术和分子生物技术的发展,为NTM的鉴定提供了更快速、准确的诊断方法。 展开更多
关键词 分枝杆菌 典型性 实验室技术和方法 诊断 鉴别
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恒温微流控系统检测及鉴定结核分枝杆菌复合群与非结核分枝杆菌的应用价值 被引量:2
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作者 王泉 马瑞瑛 +4 位作者 杨婷 张亚丽 许苗 撒玉玲 陈清波 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第8期817-820,共4页
目的评价恒温微流控系统检测分枝杆菌并鉴定结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)与非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM)的应用价值。方法收集新疆医科大学第八附属医院2018年9月至2019年12月间... 目的评价恒温微流控系统检测分枝杆菌并鉴定结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)与非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM)的应用价值。方法收集新疆医科大学第八附属医院2018年9月至2019年12月间经抗酸染色镜检阳性的痰液标本,共624份。分别应用罗氏固体培养,对硝基苯甲酸(PNB)和噻吩-2-羧酸肼(TCH)生长试验,以及恒温微流控系统进行分枝杆菌检测和菌种鉴定;以罗氏固体培养和PNB/TCH生长试验菌种鉴定结果为参照,评价恒温微流控系统检测分枝杆菌和鉴定菌种的效能。结果624份痰标本中,经罗氏固体培养法检测阳性612份(98.1%),恒温微流控系统检测阳性607份(97.3%),差异无统计学意义(χ^(2)=0.021,P=0.950)。以罗氏固体培养法检测结果作为参照标准,恒温微流控系统检测抗酸染色镜检阳性的痰液标本中分枝杆菌的敏感度和特异度分别为99.2%(607/612)和100.0%(12/12),Kappa值为0.82。以PNB/TCH生长试验结果作为参照标准,恒温微流控系统检测痰液标本中MTBC的敏感度和特异度分别为99.6%(513/515)和100.0%(97/97),Kappa值为0.99;恒温微流控系统检测痰液标本中NTM的敏感度和特异度分别为96.9%(94/97)和100.0%(515/515),Kappa值为0.98。结论恒温微流控系统在以抗酸染色镜检阳性为诊断基础时,鉴定痰液标本中MTBC与NTM具有较好的性能。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 分枝杆菌 典型性 核酸扩增技术 诊断 鉴别 评价研究
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山东地区439株非结核分枝杆菌临床分离株菌种鉴定及耐药情况 被引量:8
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作者 封彬彬 金锋 +5 位作者 景辉 王俊玲 林美英 乔秀丽 李铭 邱丽华 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第5期516-520,共5页
为分析山东地区非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacterium,NTM)临床分离株菌种分布及耐药情况,笔者选取2015年1月至2019年12月山东省胸科医院收治的354例NTM肺病患者的临床分离株进行菌种鉴定,并分析菌株对异烟肼、利福平、乙胺丁... 为分析山东地区非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacterium,NTM)临床分离株菌种分布及耐药情况,笔者选取2015年1月至2019年12月山东省胸科医院收治的354例NTM肺病患者的临床分离株进行菌种鉴定,并分析菌株对异烟肼、利福平、乙胺丁醇等25种药品的耐药情况(2018年前采用绝对浓度法检测,2018年及以后采用微孔板法检测)。结果显示,354株NTM临床分离株共鉴定出12种菌种,主要以胞内分枝杆菌(69.77%,247/354)、堪萨斯分枝杆菌(12.71%,45/354)及脓肿分枝杆菌(7.63%,27/354)为主。男性和≥45岁患者构成比[分别为64.97%(230/354)和84.75%(300/354)]明显高于女性和<45岁患者[分别为35.03%(124/354)和15.25%(54/354)],差异均有统计学意义(χ^(2)值分别为18.639和42.363,P值均<0.01)。183株(51.69%)NTM分离株行药物敏感性试验,其中,50株采用绝对浓度法,结果显示:除对乙胺丁醇的耐药率为52.00%(26/50)外,对其余9种药品(异烟肼、利福平、链霉素、卷曲霉素、左氧氟沙星、对氨基水杨酸、阿米卡星、卡那霉素、氧氟沙星)的耐药率均≥86.00%;133株采用微孔板法,结果显示:对莫西沙星、阿米卡星及克拉霉素的耐药率均较低[分别为0.00%(0/133)、3.76%(5/133)、6.02%(8/133)],对亚胺培南/西司他丁、多西环素、米诺环素、复方磺胺甲噁唑的耐药率均较高[分别为98.50%(131/133)、91.73%(122/133)、90.23%(120/133)、90.23%(120/133)];且不同NTM菌种对部分药品的耐药性存在种间差异。 展开更多
关键词 分枝杆菌 典型性 细菌分型技术 微生物敏感性试验 数据说明 统计
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2017年绍兴地区106株非结核分枝杆菌菌种鉴定结果分析 被引量:4
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作者 金法祥 陶学芳 +2 位作者 王华钧 许文芳 陈雪芳 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2019年第11期1179-1183,共5页
目的分析绍兴地区非结核分枝杆菌(NTM)的流行情况,为NTM诊疗提供科学依据。方法对绍兴地区2017年临床分离的972株分枝杆菌,采用结核分枝杆菌抗原检测胶体金法进行结核分枝杆菌复合群和NTM的初步菌种鉴定,结果106株为NTM,占分枝杆菌培养... 目的分析绍兴地区非结核分枝杆菌(NTM)的流行情况,为NTM诊疗提供科学依据。方法对绍兴地区2017年临床分离的972株分枝杆菌,采用结核分枝杆菌抗原检测胶体金法进行结核分枝杆菌复合群和NTM的初步菌种鉴定,结果106株为NTM,占分枝杆菌培养阳性菌株的10.91%(106/972),对初步鉴定为NTM的菌株应用DNA微阵列芯片法进行NTM菌种鉴定。结果106株NTM菌株经DNA微阵列芯片法鉴定,共有14个菌种,其中菌株数量前3位的菌种为:胞内分枝杆菌[55株(51.89%)]、鸟分枝杆菌[19株(17.92%)]、堪萨斯分枝杆菌[13株(12.26%)]。其余分别为:龟-脓肿分枝杆菌[4株(3.77%)]、瘰疬分枝杆菌[3株(2.83%)]、戈登分枝杆菌[3株(2.83%)]、土分枝杆菌[2株(1.89%)]、其他[7株(6.60%)]。结论2017年绍兴地区NTM临床分离率占分枝杆菌培养阳性菌株的10.91%;NTM种类多,以胞内分枝杆菌、鸟分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌为主要流行菌种。 展开更多
关键词 分枝杆菌 典型性 细菌分型技术 芯片分析技术 小地区分析
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传统培养法与PCR-荧光探针法鉴定分枝杆菌的对比研究 被引量:17
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作者 张洁 邢青 +4 位作者 王甦民 易俊莉 杨新宇 丁北川 苏建荣 《中国防痨杂志》 CAS 2015年第3期291-294,共4页
目的比较传统培养法和PCR荧光探针法在分枝杆菌的鉴定中有无差异。方法对1552株分枝杆菌临床分离株同时用传统培养法对硝基苯甲酸(PNB)、噻吩二羧酸肼(TCH)培养基生长试验及PCR-荧光探针法进行鉴定,结果有差别的菌株用16SrRNA基因... 目的比较传统培养法和PCR荧光探针法在分枝杆菌的鉴定中有无差异。方法对1552株分枝杆菌临床分离株同时用传统培养法对硝基苯甲酸(PNB)、噻吩二羧酸肼(TCH)培养基生长试验及PCR-荧光探针法进行鉴定,结果有差别的菌株用16SrRNA基因测序的方法进行确认。结果两种方法非结核分枝杆菌的符合率为75.4%(46/61),结核分枝杆菌复合群的符合率为99.0%(1491/1506),总体符合率为99.0%(1537/1552)。两种方法检测结果不同的15株样本经16SrRNA基因测序进行鉴定,PCR-探针法与16SrRNA结果一致的有14株,另外1株经传代分离纯化后测序结果为结核分枝杆菌和戈登分枝杆菌的混合菌。非结核分枝杆菌对PNB培养基的敏感度为21.7%(13/60),有0.1%(1/1492)的结核分枝杆菌复合群对PNB表现耐受性。对PNB敏感的13株非结核分枝杆菌中,有76.9%(10/13)为堪萨斯分枝杆菌。结论部分非结核分枝杆菌使用PNBTCH生长试验进行鉴定时会出现误判,而PCD荧光探针法鉴定结核分枝杆菌复合群和非结核分枝杆菌的准确性较高。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 结核分枝杆菌 细菌学技术 聚合酶链反应 对比研究
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胶体金法结合涂片形态学特征快速鉴别结核分枝杆菌复合群的应用评价 被引量:5
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作者 黄明翔 张丽水 +1 位作者 陈新朝 毛文捷 《中国防痨杂志》 CAS 2012年第12期830-834,共5页
目的探讨结核分枝杆菌抗原胶体金法结合涂片形态学特征鉴别结核分枝杆菌复合群的应用价值。方法采用涂片形态学特征和结核分枝杆菌抗原胶体金法对853株分枝杆菌临床分离株进行鉴别并与传统菌种鉴定结果进行比较。结果涂片法鉴别结核分... 目的探讨结核分枝杆菌抗原胶体金法结合涂片形态学特征鉴别结核分枝杆菌复合群的应用价值。方法采用涂片形态学特征和结核分枝杆菌抗原胶体金法对853株分枝杆菌临床分离株进行鉴别并与传统菌种鉴定结果进行比较。结果涂片法鉴别结核分枝杆菌的敏感度为98.4%(750/762),特异度为96.7%(88/91);胶体金试验鉴别结核分枝杆菌的敏感度为99.0%(754/762),特异度为98.9%(90/91);两种方法均为阳性,可报告菌株中含有结核分枝杆菌复合群(MTC),其阳性预测值为100.0%(741/741);两种方法均为阴性,可报告非结核分枝杆菌(NTM),其阴性预测值为100.0%(87/87)。结论结合涂片形态和结核分枝杆菌抗原胶体金两种方法鉴别结核分枝杆菌可以提高检测的准确性,是一种快速、简便,适于各级实验室使用的方法。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 分枝杆菌 典型性 胶体金 细菌学技术 敏感性与特异性
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胞内分枝杆菌临床分离株亚种组成及体外耐药性分析 被引量:6
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作者 李远春 张越 +4 位作者 曾祥洁 贺文从 邱倩 赵雁林 李燕明 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第2期147-152,共6页
目的分析深圳地区胞内分枝杆菌临床分离株的亚种组成及其耐药谱,为治疗胞内分枝杆菌肺病提供科学依据。方法选取中国疾病预防控制中心国家结核病参比实验室保存且初步鉴定为胞内分枝杆菌的临床分离株,共计97株。菌株均分离自深圳市第三... 目的分析深圳地区胞内分枝杆菌临床分离株的亚种组成及其耐药谱,为治疗胞内分枝杆菌肺病提供科学依据。方法选取中国疾病预防控制中心国家结核病参比实验室保存且初步鉴定为胞内分枝杆菌的临床分离株,共计97株。菌株均分离自深圳市第三人民医院2018年收集的疑似肺结核和非结核分枝杆菌(NTM)肺病患者的呼吸道标本。采用PCR及基因测序鉴定胞内分枝杆菌临床分离株亚种,使用Sensititre?SLOWMYCO药敏板测定菌株对13种药品(克拉霉素、阿米卡星、莫西沙星、利奈唑胺、利福平、利福布汀、乙胺丁醇、链霉素、多西环素、环丙沙星、异烟肼、乙硫异烟胺及复方磺胺甲噁唑)的药物敏感性情况。结果97株胞内分枝杆菌临床分离株以亚种胞内分枝杆菌最多[63.92%(62/97)],其次为奇美拉分枝杆菌[18.56%(18/97)]和副胞内分枝杆菌[17.53%(17/97)]。药物敏感性试验显示,胞内分枝杆菌的MIC50和MIC_(90)值最低的是利福布汀(0.5和8μg/ml),最高的是链霉素(32和64μg/ml);亚种胞内分枝杆菌和副胞内分枝杆菌的MIC_(90)均为2μg/ml,而奇美拉分枝杆菌则高达64μg/ml。胞内分枝杆菌临床分离株对克拉霉素、乙胺丁醇、利福平、利福布汀、链霉素、阿米卡星、利奈唑胺和莫西沙星总的耐药率分别为9.28%(9/97)、44.33%(43/97)、42.27%(41/97)、15.46%(15/97)、36.08%(35/97)、11.34%(11/97)、38.14%(37/97)和46.39%(45/97);奇美拉分枝杆菌对克拉霉素的耐药率[27.78%(5/18)]明显高于亚种胞内分枝杆菌[4.84%(3/62)],差异有统计学意义(χ^(2)=8.156,P=0.012)。结论深圳地区胞内分枝杆菌以亚种胞内分枝杆菌为主,对各药品的敏感性有差异,且各亚种对同一药品的敏感性也不同,建议临床治疗前应鉴定至亚种并行药物敏感性试验,以实现个性化治疗。 展开更多
关键词 分枝杆菌 典型性 分枝杆菌感染 细菌分型技术 微生物敏感性试验 抗药性 细菌
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脓肿分枝杆菌致患者多系统播散性感染一例的诊治过程分析 被引量:2
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作者 张开义 吕正煊 +3 位作者 刘永莉 张乐 朱江春 喻明丽 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2021年第1期66-71,共6页
目的探讨脓肿分枝杆菌致病特点,提高临床医生对该病的认识及诊治水平。方法回顾性分析昆明市第三人民医院2018年6月9日收治的1例脓肿分枝杆菌致患者多系统播散性感染的临床资料、诊治经过及随访、转归情况,并进行经验总结。结果本例患者... 目的探讨脓肿分枝杆菌致病特点,提高临床医生对该病的认识及诊治水平。方法回顾性分析昆明市第三人民医院2018年6月9日收治的1例脓肿分枝杆菌致患者多系统播散性感染的临床资料、诊治经过及随访、转归情况,并进行经验总结。结果本例患者于2017年7月因"发热、咳嗽1月余"就诊于澜沧县人民医院,以肺部感染治疗2周无效后转至普洱县人民医院,再以"肺结核"诊断性抗结核药品治疗至2017年12月,咳嗽及发热症状较前有缓解。但12月20日患者因发热、咳嗽突然加重并伴胸闷而入住普洱市人民医院,以肺结核并发肺部感染继续行抗结核和抗感染治疗。1个月后因效果不佳而转诊至昆明医科大学某附属医院,诊治后的病情仍无改善,于2018年2月14日回原住地,在当地医院门诊间断进行抗感染及对症治疗。5月8日患者因病情再次加重且伴右侧颈部淋巴结肿大,就诊于云南省某肿瘤医院,淋巴结手术标本病理检查未检出恶性细胞,考虑"耐药性肺结核可能",于6月9日转至我院。经我院血培养、淋巴结脓液培养、肺泡灌洗液分枝杆菌22项分子诊断检测鉴定为"脓肿分枝杆菌",给予"利奈唑胺、莫西沙星、氯法齐明、阿米卡星、克拉霉素"联合治疗40d好转出院,且随访预后良好。结论当疑似结核病患者反复抗酸杆菌检测阻性且诊断性抗结核治疗效果差,除考虑耐药结核病外,还应积极行新型分子生物学检测排除NTM病,以提高疾病诊断率和治愈率。 展开更多
关键词 分枝杆菌感染 典型性 分枝杆菌 龟亚科 疾病特征 诊断技术和方法 药物疗法 联合 结果与过程评价(卫生保健)
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CDG-3荧光探针检测结核分枝杆菌的初步研究 被引量:1
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作者 武剑楠 孔成成 +1 位作者 霍凤敏 孙照刚 《中国防痨杂志》 CAS 2018年第4期378-383,共6页
目的探讨CDG-3荧光探针[β-内酰胺酶(BlaC)特异性绿色荧光探针]用于结核病诊断的潜在可能性。方法为明确CDG-3荧光探针的特异性,选取结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)标准株H37Rv,牛和非洲分枝杆菌标准株,35种临... 目的探讨CDG-3荧光探针[β-内酰胺酶(BlaC)特异性绿色荧光探针]用于结核病诊断的潜在可能性。方法为明确CDG-3荧光探针的特异性,选取结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)标准株H37Rv,牛和非洲分枝杆菌标准株,35种临床相对常见的不同非结核分枝杆菌(nontuberculousm ycobacteria,NTM)标准株和6种呼吸道感染病原菌标准株,与CDG-3荧光探针反应后进行检测;为初步了解CDG-3荧光探针临床应用效果,收集2016年1月至9月于北京胸科医院门诊就诊的200例疑似肺结核患者的痰标本分别进行金胺O荧光染色法、培养法(罗氏固体培养联合MGIT960液体培养,二者只要有一种结果为阳性即认为培养阳性)和CDG-3荧光探针检测,并对检测结果进行分析。结果以H37Rv为标准,CDG-3荧光探针检测牛和非洲分枝杆菌标准株结果均为阳性。试验的35种NTM标准株中,CDG-3荧光探针检测结果阳性的菌株仅有3株,分别是堪萨斯分枝杆菌、玛尔摩分枝杆菌和草分枝杆菌;其余32株的检测结果为阴性。6种呼吸道感染病原菌中,5种检测结果为阴性,1种(诺卡菌)为阳性。在临床痰标本实验中,CDG-3荧光探针对痰MTB的阳性检出率为53.0%(106/200),高于金胺O荧光染色法(29.5%,59/200)与培养法(35.0%,70/200)的阳性率,差异有统计学意义(x^2值分别为33.587、21.121,P值均为0.000)。以培养法结果为标准,CDG-3荧光探针检测的敏感度为84.3%(59/70),高于金胺O荧光染色法(70.0%,49/70);特异度为63.8%(83/130),低于金胺O荧光染色法(92.3%,120/130);以临床诊断为标准,CDG-3荧光探针检测的敏感度为64.4%(96/149),高于金胺O荧光染色法(39.6%,59/149)和培养法(44.3%,66/149);特异度为95%(19/20),低于金胺O荧光染色法(100%,20/20),高于培养法(90%,18/20)。结论CDG-3荧光探针对MTB的选择性较好,受NTM干扰较小,与呼吸道感染病原菌的反应还需进一步研究;CDG-3荧光探针技术具有快速、简便、检出效率高等优势,但特异度有待进一步提高。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 分枝杆菌 典型性 实验室技术和方法 临床对照试验 CDG-3荧光 探针
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实时荧光核酸恒温扩增检测技术在疑似肺结核早期诊断中的临床意义 被引量:5
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作者 江万航 卫安娜 +1 位作者 庞慧敏 谭守勇 《中国防痨杂志》 CAS 2017年第12期1309-1312,共4页
目的探讨实时荧光核酸恒温扩增检测技术(simultaneous amplification and testing,SAT)用于疑似肺结核早期诊断的临床意义。方法分析2015年7-12月广州市胸科医院收治的呼吸道疾病患者338例,其中疑似肺结核患者242例(疑似肺结核组... 目的探讨实时荧光核酸恒温扩增检测技术(simultaneous amplification and testing,SAT)用于疑似肺结核早期诊断的临床意义。方法分析2015年7-12月广州市胸科医院收治的呼吸道疾病患者338例,其中疑似肺结核患者242例(疑似肺结核组),临床已排除肺结核的肺部其他疾病患者96例(对照组)。所有患者同时进行了痰SAT检测、抗酸杆菌涂片、分枝杆菌培养和菌种鉴定等检查;统计疑似肺结核患者菌种鉴定结果,对SAT检测与结核分枝杆菌(MTB)培养及菌种鉴定结果的符合率、SAT检测诊断疑似肺结核的敏感度和特异度进行分析。结果疑似肺结核组242例患者中痰培养阳性233例,菌种鉴定为MTB感染者222例,非结核分枝杆菌(NTM)感染者11例;痰培养结果为阴性的患者9例。对照组患者痰培养结果均为阴性。菌种鉴定为MTB感染者SAT检测阳性192例,SAT检测与菌种鉴定符合率为86.5%(192/222);菌种鉴定为NTM感染者SAT检测阳性0例(0/11),与菌种鉴定符合率为100.0%(11/11);对照组SAT检测阳性者2例(2.1%,2/96),与分枝杆菌培养符合率为97.9%(94/96)。SAT在疑似肺结核患者诊断中的敏感度为86.5%(192/222),特异度为97.9%(94/96)。结论在疑似肺结核患者中开展SAT检测对肺结核早期诊断具有重要临床意义。 展开更多
关键词 结核 核酸扩增技术 早期诊断 分枝杆菌感染 典型性 呼吸道疾病
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一种新型L型细菌培养基的研制 被引量:1
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作者 唐银 文斌 《湖南医科大学学报》 CSCD 1992年第4期390-392,共3页
关键词 典型性细菌 培养基 细菌学技术
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