-
题名fGn模型在结肠癌基因表达数据集去噪中的应用
- 1
-
-
作者
艾玲梅
李科
马苗
-
机构
陕西师范大学计算机科学学院
-
出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期303-307,共5页
-
基金
陕西省重点实验室开放共享基金资助项目(SAIIP201202)
陕西师范大学学习科学交叉学科培育计划基金资助项目
-
文摘
基因表达数据集获取过程中容易掺杂噪声成分,噪声会干扰数据的正确表达从而影响其后期的分析与研究。基于中值计算法估计噪声标准差的经验模态分解(EMD)去噪存在一定的不足,从而影响去噪效果。分数阶高斯噪声(fGn)模型可提供EMD下较为准确的噪声标准差估计方法,在该模型下去噪可减少白色及有色噪声,进而增强去噪效果。因此在中值计算EMD去噪基础上,提出一种基于fGn模型的去噪方案,并对结肠癌基因表达数据集做去噪分析。实验结果表明,相比中值计算EMD去噪方法,改进方法的信噪比、噪声抑制比、t检验等值具有一定的优势,可作为基因表达数据集去噪的一种参考方案。
-
关键词
基因表达数据集
经验模态分解去噪
噪声标准差
分数阶高斯噪声
结肠癌
-
Keywords
gene expression dataset
Empirical Mode Decomposition （EMD） denoising
noise standard deviations
fractional Gaussian noise（fGn）
colon cancer
-
分类号
TP391
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
-
