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6株H9N2亚型禽流感病毒厦门分离株全基因序列测定与分析
被引量:
6
1
作者
蔡振鸿
赵冉
+4 位作者
陈琼
杨涛
张丹英
陈永锋
何扬州
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2019年第6期54-71,共18页
为了解分离自厦门市养殖场、活禽交易市场和活禽屠宰场的H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza viruse,AIV)的遗传变异特征,本研究对分离到的6株H9N2亚型AIV进行全基因组序列测定、遗传进化分析和特殊位点的氨基酸分析。结果显示:6株分...
为了解分离自厦门市养殖场、活禽交易市场和活禽屠宰场的H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza viruse,AIV)的遗传变异特征,本研究对分离到的6株H9N2亚型AIV进行全基因组序列测定、遗传进化分析和特殊位点的氨基酸分析。结果显示:6株分离株的HA裂解位点均符合低致病性禽流感病毒特征,HA受体结合位点尤其是234位氨基酸突变为L,表现出人流感病毒受体结合特性;NA存在颈部9个核苷酸缺失的高致病性分子特征;内部基因NS1基因发生P42S突变,M1基因发生N30D、T215A突变,M2基因发生S31N的突变,PB1-F2基因发生N66S突变,提示当前分离株已出现耐药性、致病性增强的变化。8个基因片段均属于欧亚谱系,内部基因与H7N9、H10N8、H10N6、H5N6亚型亲缘关系密切。本研究结果为本地区禽流感生物学特性研究和防控提供科学依据。
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关键词
禽流感病毒
H9N2亚型
基因
分析
分子遗传进化分析
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职称材料
H6亚型禽流感病毒厦门分离株全基因序列分析
被引量:
1
2
作者
赵冉
蔡振鸿
+3 位作者
陈琼
张丹英
杨涛
连玉华
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期85-88,共4页
为了解2017年分离自厦门市某活禽屠宰场的H6N6亚型禽流感病毒(AIV)的遗传变异特征,本研究对分离到的4株H6N6亚型AIV进行全基因组序列测定、遗传进化分析和特殊位点的氨基酸分析。结果显示:4株分离株的HA裂解位点和受体结合位点均符合低...
为了解2017年分离自厦门市某活禽屠宰场的H6N6亚型禽流感病毒(AIV)的遗传变异特征,本研究对分离到的4株H6N6亚型AIV进行全基因组序列测定、遗传进化分析和特殊位点的氨基酸分析。结果显示:4株分离株的HA裂解位点和受体结合位点均符合低致病性AIV特征,但其中1株分离株NA存在颈部11个氨基酸的缺失。NS1发生P42S突变、M1发生N30D、T215A突变、M2发生V27I的突变。8个基因节段均属于欧亚谱系,内部基因与H5N1、H5N6、H6N1及H6N2 AIV亲缘关系密切。本研究结果表明,4株H6N6分离株均表现为低致病性AIV特征,但也存在与耐药性、毒力增强等相关的突变,基因来源呈现多样性。本研究结果为本地区AIV生物学特性研究及其疾病防控提供科学依据。
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关键词
H6N6亚型
基因
分析
分子遗传进化分析
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职称材料
福建省厦门市野鸟H2N6亚型禽流感病毒分离与序列分析
3
作者
蔡振鸿
《中国动物检疫》
CAS
2018年第11期56-61,共6页
为初步了解福建省野生水鸟的禽流感病毒携带情况及其潜在危害,对厦门市滨海水鸟进行禽流感病毒检测,从新鲜粪便中分离到1株H2N6亚型禽流感病毒,并对其进行全基因组序列测定、进化分析及致病性分析。序列分析显示:该分离株的HA裂解位点...
为初步了解福建省野生水鸟的禽流感病毒携带情况及其潜在危害,对厦门市滨海水鸟进行禽流感病毒检测,从新鲜粪便中分离到1株H2N6亚型禽流感病毒,并对其进行全基因组序列测定、进化分析及致病性分析。序列分析显示:该分离株的HA裂解位点序列为PQIEPKGL↓,不存在多个连续碱性氨基酸,HA受体结合位点左侧缘第236位氨基酸为Q,未发生L突变,仍为嗜禽源性分子生物特征;NA颈部无Aa缺失,符合低致病性禽流感病毒氨基酸序列特征;与毒力相关的内部基因M1存在N30D、T215A突变,NS1存在P42S突变,PB2存在Q591H突变,与当前在家禽中流行的H9N2、H6N6等亚型毒株突变趋势相似;与耐药性相关的M2特定位点均未发生耐药性突变。遗传进化分析显示,该野鸟H2N6分离株的HA和NA基因属于欧亚谱系,6个内部基因与本地健康家禽分离株H9N2、H6N6、H11N3、H3N3亲缘关系较远(70%~93%),位于不同亚分支。分析结果表明,该毒株虽为低致病性禽流感病毒,但与致病性相关的突变位点存在部分基因突变,具有潜在的毒力增强趋势,需持续监测。
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关键词
H2N6亚型禽流感
基因
分析
分子遗传进化分析
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职称材料
题名
6株H9N2亚型禽流感病毒厦门分离株全基因序列测定与分析
被引量:
6
1
作者
蔡振鸿
赵冉
陈琼
杨涛
张丹英
陈永锋
何扬州
机构
厦门市思明区市政管理中心
厦门市动物疫病预防控制中心
出处
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2019年第6期54-71,共18页
基金
厦门市科技计划项目(3502Z20174050)
文摘
为了解分离自厦门市养殖场、活禽交易市场和活禽屠宰场的H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza viruse,AIV)的遗传变异特征,本研究对分离到的6株H9N2亚型AIV进行全基因组序列测定、遗传进化分析和特殊位点的氨基酸分析。结果显示:6株分离株的HA裂解位点均符合低致病性禽流感病毒特征,HA受体结合位点尤其是234位氨基酸突变为L,表现出人流感病毒受体结合特性;NA存在颈部9个核苷酸缺失的高致病性分子特征;内部基因NS1基因发生P42S突变,M1基因发生N30D、T215A突变,M2基因发生S31N的突变,PB1-F2基因发生N66S突变,提示当前分离株已出现耐药性、致病性增强的变化。8个基因片段均属于欧亚谱系,内部基因与H7N9、H10N8、H10N6、H5N6亚型亲缘关系密切。本研究结果为本地区禽流感生物学特性研究和防控提供科学依据。
关键词
禽流感病毒
H9N2亚型
基因
分析
分子遗传进化分析
Keywords
Avian influenza virus
H9N2 subtype AIV
gene analysis
phylogenic analysis
分类号
S852.659.5 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
H6亚型禽流感病毒厦门分离株全基因序列分析
被引量:
1
2
作者
赵冉
蔡振鸿
陈琼
张丹英
杨涛
连玉华
机构
厦门市动物疫病预防控制中心
厦门市思明区市政管理中心
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期85-88,共4页
基金
厦门市科技计划项目(3502Z20174050)
文摘
为了解2017年分离自厦门市某活禽屠宰场的H6N6亚型禽流感病毒(AIV)的遗传变异特征,本研究对分离到的4株H6N6亚型AIV进行全基因组序列测定、遗传进化分析和特殊位点的氨基酸分析。结果显示:4株分离株的HA裂解位点和受体结合位点均符合低致病性AIV特征,但其中1株分离株NA存在颈部11个氨基酸的缺失。NS1发生P42S突变、M1发生N30D、T215A突变、M2发生V27I的突变。8个基因节段均属于欧亚谱系,内部基因与H5N1、H5N6、H6N1及H6N2 AIV亲缘关系密切。本研究结果表明,4株H6N6分离株均表现为低致病性AIV特征,但也存在与耐药性、毒力增强等相关的突变,基因来源呈现多样性。本研究结果为本地区AIV生物学特性研究及其疾病防控提供科学依据。
关键词
H6N6亚型
基因
分析
分子遗传进化分析
Keywords
subtype H6N6
gene analysis
phylogenic analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
福建省厦门市野鸟H2N6亚型禽流感病毒分离与序列分析
3
作者
蔡振鸿
机构
厦门市思明区市政管理中心
出处
《中国动物检疫》
CAS
2018年第11期56-61,共6页
基金
厦门市科技计划项目(3502Z20174050)
文摘
为初步了解福建省野生水鸟的禽流感病毒携带情况及其潜在危害,对厦门市滨海水鸟进行禽流感病毒检测,从新鲜粪便中分离到1株H2N6亚型禽流感病毒,并对其进行全基因组序列测定、进化分析及致病性分析。序列分析显示:该分离株的HA裂解位点序列为PQIEPKGL↓,不存在多个连续碱性氨基酸,HA受体结合位点左侧缘第236位氨基酸为Q,未发生L突变,仍为嗜禽源性分子生物特征;NA颈部无Aa缺失,符合低致病性禽流感病毒氨基酸序列特征;与毒力相关的内部基因M1存在N30D、T215A突变,NS1存在P42S突变,PB2存在Q591H突变,与当前在家禽中流行的H9N2、H6N6等亚型毒株突变趋势相似;与耐药性相关的M2特定位点均未发生耐药性突变。遗传进化分析显示,该野鸟H2N6分离株的HA和NA基因属于欧亚谱系,6个内部基因与本地健康家禽分离株H9N2、H6N6、H11N3、H3N3亲缘关系较远(70%~93%),位于不同亚分支。分析结果表明,该毒株虽为低致病性禽流感病毒,但与致病性相关的突变位点存在部分基因突变,具有潜在的毒力增强趋势,需持续监测。
关键词
H2N6亚型禽流感
基因
分析
分子遗传进化分析
Keywords
H2N6 subtype AIV
gene analysis
phylogenic analysis
分类号
S851.3 [农业科学—预防兽医学]
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被引量
操作
1
6株H9N2亚型禽流感病毒厦门分离株全基因序列测定与分析
蔡振鸿
赵冉
陈琼
杨涛
张丹英
陈永锋
何扬州
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2019
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
H6亚型禽流感病毒厦门分离株全基因序列分析
赵冉
蔡振鸿
陈琼
张丹英
杨涛
连玉华
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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下载PDF
职称材料
3
福建省厦门市野鸟H2N6亚型禽流感病毒分离与序列分析
蔡振鸿
《中国动物检疫》
CAS
2018
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