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H6N6亚型禽流感病毒广东分离株分子遗传演化分析
被引量：
5
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作者
张烁
林宏文
+9 位作者
袁润余
宋亚芬
崔进
龚浪
瞿孝云
韩翡
吴晓薇
徐成刚
廖明
焦培荣
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期989-996,共8页
2010年至2011年在中国广东地区活禽交易市场进行流行病学调查时,在鸭咽和泄殖腔拭子中分离到2株H6N6亚型禽流感病毒,分别命名为A/Duck/Guangdong/C45/2010(H6N6)、A/Duck/Guangdong/C120/2011(H6N6)。应用RT-PCR分别对2株毒株的8个基因...
2010年至2011年在中国广东地区活禽交易市场进行流行病学调查时,在鸭咽和泄殖腔拭子中分离到2株H6N6亚型禽流感病毒,分别命名为A/Duck/Guangdong/C45/2010(H6N6)、A/Duck/Guangdong/C120/2011(H6N6)。应用RT-PCR分别对2株毒株的8个基因片段进行了克隆、测序与分析,结果表明:2毒株的HA裂解位点附近的氨基酸序列为P-Q-I-E-T-R-G,只有1个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒HA裂解位点附近的氨基酸序列特征;与2毒株HA基因相似性最高的毒株为A/Duck/Guangxi/GXd-5/2010(H6N1),与NA基因相似性最高的毒株分别为A/Duck/Fujian/3242/2007(H6N6)和A/Duck/Fujian/6159/2007(H6N6)。全基因组分子遗传演化分析表明,2毒株的8个基因片段均属于欧亚谱系的禽源演化分支;但HA基因属于ST2853-like分支,NP基因属于HN573-like分支,PB2、PB1、PA、M和NS基因属于ST339-like分支,说明本研究中的2株病毒为不同基因群间基因交换的重组病毒。因此,有必要加强H6亚型禽流感病毒流行病学调查以便及时关注其遗传变异与致病性进化,为中国禽流感的预防与控制提供数据支持和理论指导。
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关键词
禽流感病毒
H6N6
分子遗传演化分析
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题名
H6N6亚型禽流感病毒广东分离株分子遗传演化分析
被引量：
5
1
作者
张烁
林宏文
袁润余
宋亚芬
崔进
龚浪
瞿孝云
韩翡
吴晓薇
徐成刚
廖明
焦培荣
机构
华南农业大学兽医学院人兽共患病防控制剂国家地方联合工程实验室农业部兽用疫苗创制重点实验室广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室
内蒙古自治区通辽市扎鲁特旗农牧业局
广东省检验检疫局
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期989-996,共8页
基金
国家肉鸡产业技术体系项目(nycytx-42-G3-03)
广东省自然科学基金项目(10251064201000004
+5 种基金
10151064201000021)
广东省科技计划项目(2010B020307005
2012B020306003)
广东检验检疫局科技计划项目(2011GDK46)
广州市科技计划项目(2013J4500030
201300000037)
文摘
2010年至2011年在中国广东地区活禽交易市场进行流行病学调查时,在鸭咽和泄殖腔拭子中分离到2株H6N6亚型禽流感病毒,分别命名为A/Duck/Guangdong/C45/2010(H6N6)、A/Duck/Guangdong/C120/2011(H6N6)。应用RT-PCR分别对2株毒株的8个基因片段进行了克隆、测序与分析,结果表明:2毒株的HA裂解位点附近的氨基酸序列为P-Q-I-E-T-R-G,只有1个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒HA裂解位点附近的氨基酸序列特征;与2毒株HA基因相似性最高的毒株为A/Duck/Guangxi/GXd-5/2010(H6N1),与NA基因相似性最高的毒株分别为A/Duck/Fujian/3242/2007(H6N6)和A/Duck/Fujian/6159/2007(H6N6)。全基因组分子遗传演化分析表明,2毒株的8个基因片段均属于欧亚谱系的禽源演化分支;但HA基因属于ST2853-like分支,NP基因属于HN573-like分支,PB2、PB1、PA、M和NS基因属于ST339-like分支,说明本研究中的2株病毒为不同基因群间基因交换的重组病毒。因此,有必要加强H6亚型禽流感病毒流行病学调查以便及时关注其遗传变异与致病性进化,为中国禽流感的预防与控制提供数据支持和理论指导。
关键词
禽流感病毒
H6N6
分子遗传演化分析
Keywords
avian influenza virus
H6N6
phylogenic analysis
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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作者
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1
H6N6亚型禽流感病毒广东分离株分子遗传演化分析
张烁
林宏文
袁润余
宋亚芬
崔进
龚浪
瞿孝云
韩翡
吴晓薇
徐成刚
廖明
焦培荣
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
5
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