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DNA分子计算模型 被引量:3
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作者 李燕 王秀峰 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2003年第8期21-23,共3页
The field of practical DNA computing opened in 1994 with Adleman's paper,in which a laboratory experi-ment involving DNA molecules was used to solve a small instance of the Hamiltonian Path problem. The characteri... The field of practical DNA computing opened in 1994 with Adleman's paper,in which a laboratory experi-ment involving DNA molecules was used to solve a small instance of the Hamiltonian Path problem. The characteris-tic of this computation is its powerful ability in parallelism, its huge storage and high energy efficiency. This papermainly introduces the principles of DNA computing and the sticker computing model. 展开更多
关键词 DNA 分子计算模型 脱氧核糖核酸 粘接模型
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一种广义分子计算模型及其在NP问题中的应用 被引量:1
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作者 李艳梅 余文 宁建国 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2014年第11期3353-3356,共4页
目前各种分子计算模型多基于生物技术,求解一个问题的分子计算机算法很难不作修改地应用于其他类似的问题,尚不似传统计算机般通用。为此,提出一种基于图灵机的广义分子计算模型,其由一台单带图灵机、一条单向只写带和一条工作带组成,... 目前各种分子计算模型多基于生物技术,求解一个问题的分子计算机算法很难不作修改地应用于其他类似的问题,尚不似传统计算机般通用。为此,提出一种基于图灵机的广义分子计算模型,其由一台单带图灵机、一条单向只写带和一条工作带组成,通过只写带与工作带之间特殊的映射函数实现并行的同时读、写操作。实验说明了该模型能够在多项式时间求解NP完全的满足性问题(SAT),比现有分子计算模型在计算准确性和通用性上存在明显优势。 展开更多
关键词 广义分子计算模型 图灵机 SAT问题
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力场/溶剂水模型对EGFRvⅢ抗原-MR1(scFv)抗体复合物的MM-PBSA计算精度的影响与实验验证
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作者 任家毅 杨志伟 +8 位作者 郑念珏 李军旗 杨春龙 林淑健 杨冰 黄俊卿 廖化新 袁晓辉 欧仕益 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2017年第11期2070-2076,共7页
以表皮生长因子Ⅲ型突变体(EGFRvⅢ)抗原多肽与其抗体(MR1)及其人源化突变体的复合物结构为出发点,采用分子动力学中的6种常用力场及3种常用溶剂水模型,分别对上述抗原-抗体复合物进行100ns的分子动力学模拟与分子力学和连续介质模型计... 以表皮生长因子Ⅲ型突变体(EGFRvⅢ)抗原多肽与其抗体(MR1)及其人源化突变体的复合物结构为出发点,采用分子动力学中的6种常用力场及3种常用溶剂水模型,分别对上述抗原-抗体复合物进行100ns的分子动力学模拟与分子力学和连续介质模型计算自由能(MM-PBSA),并在实验上利用等温滴定量热(ITC)仪测定了抗原和抗体相互作用的热力学参数.通过在结构变化、能量变化及野生型与突变体比较等几个方面进行综合分析,给出了最佳的计算模型.对不同力场及水模型计算精度等相关问题进行了探讨. 展开更多
关键词 单链抗体 分子动力学模拟 分子力学和连续介质模型的自由能计算 等温滴定量热 均方根偏差
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