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副猪嗜血杆菌血清4型和13型的分子血清分型研究
被引量:
5
1
作者
李忍
郭芳芳
+3 位作者
郭杰
崔一芳
曹晓亚
徐福洲
《动物医学进展》
北大核心
2021年第2期6-11,共6页
为在临床诊断中快速鉴定副猪嗜血杆菌(HPS)血清4型和13型等优势流行血清型,分子血清分型方法较常规的基于特异性抗血清的血清分型方法更加准确和高效。根据HPS血清4型脂多糖合成蛋白基因wcip 4和血清13型糖脂转移蛋白基因gltP序列设计...
为在临床诊断中快速鉴定副猪嗜血杆菌(HPS)血清4型和13型等优势流行血清型,分子血清分型方法较常规的基于特异性抗血清的血清分型方法更加准确和高效。根据HPS血清4型脂多糖合成蛋白基因wcip 4和血清13型糖脂转移蛋白基因gltP序列设计特异性引物,分别建立了简便快速鉴定HPS血清4型和13型的环介导等温扩增方法(LAMP)。特异性检测结果显示,HPS血清4型或13型参考菌株检测为阳性,而其他HPS血清型参考菌株及19种其他细菌检测均为阴性;敏感性检测结果显示,在25μL反应体系中,HPS血清4型和13型基因组DNA检测限分别为1 pg和2.5 pg。对已知血清型的22株HPS临床分离株检测结果显示,13株血清4型和5株血清13型分别检测均为阳性,而其他血清型分离株检测均为阴性。结果表明,建立的LAMP方法可用于HPS血清4型和13型的快速鉴定,有助于HPS优势流行血清型的快速调查及疫苗防控。
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关键词
副猪嗜血杆菌
分子血清分型
环介导等温扩增
特异性
敏感性
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职称材料
沙门氏菌传统血清凝集分型和分子血清分型试剂盒方法比较
被引量:
4
2
作者
周燕霞
任岩
+7 位作者
王青龙
曹悦
胡凤月
张熙雅
巩有博
张跃川
耿建强
蔡雪凤
《食品安全质量检测学报》
CAS
2019年第18期6068-6077,共10页
目的验证沙门氏菌血清分型试剂盒的适用性,考核本实验室传统沙门氏菌血清分型技术,扩充沙门氏菌的分型方法,寻找更有效、更快捷的沙门氏菌分型方法。方法保存的样品菌株库中随意挑选33株沙门氏菌和6株标准菌株,首先确证为沙门氏菌,然后...
目的验证沙门氏菌血清分型试剂盒的适用性,考核本实验室传统沙门氏菌血清分型技术,扩充沙门氏菌的分型方法,寻找更有效、更快捷的沙门氏菌分型方法。方法保存的样品菌株库中随意挑选33株沙门氏菌和6株标准菌株,首先确证为沙门氏菌,然后分别采用传统的玻片血清凝集方法和分子血清分型试剂盒对其进行分型,最后采用16S rRNA系统发育树对试验菌株进行聚类分析。结果2种分型手段的匹配率高达94.9%,其中YP 281 Salmonella havana和YP 639 Salmonella liverpool没有匹配到,这2株菌在试剂盒数据库中不存在,但本实验利用传统血清分型手段可以对这2株菌进行准确分型,其中YP 281是本实验室对GB 4789.4-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》表B.1外成功分型的沙门氏菌。结论本实验室传统血清凝集分型技术合格。沙门分子血清分型试剂盒具有较好的适用性,能更快速、更方便对沙门氏菌进行分型。
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关键词
沙门氏菌
血清
分型
传统玻片
血清
凝集
分型
沙门
分子血清分型
试剂盒
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职称材料
沙门菌属特异性检测靶点碱基差异位点的识别及其血清型决定力
被引量:
2
3
作者
石秀清
周秀娟
+2 位作者
施春雷
张芬
史贤明
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第24期47-52,共6页
以美国国家生物技术信息中心(NCBI)已公布的28株沙门菌(14个血清型)全基因组序列为研究对象,对前期研究获得的7个沙门菌属特异性检测靶点在不同血清型间的单核苷酸多态性进行比较分析,结果表明,S9和S69为碱基差异位点最多的两个靶点,具...
以美国国家生物技术信息中心(NCBI)已公布的28株沙门菌(14个血清型)全基因组序列为研究对象,对前期研究获得的7个沙门菌属特异性检测靶点在不同血清型间的单核苷酸多态性进行比较分析,结果表明,S9和S69为碱基差异位点最多的两个靶点,具有沙门菌分子血清分型的潜在能力。随后,通过分析S9和S69在沙门菌不同血清型菌株中的差异位点,分别绘制两个血清分型靶点的差异位点表,从而获得了这两个靶点同时用于14个沙门菌血清型的快速分子血清分型的差异位点组合。在这些组合中,同一血清型具有相同的差异位点,不同血清型可以通过差异位点得以区分。最后,采集食品样品192份,用国标方法获得疑似沙门菌21株;利用血清分子分型靶点S9和S69进行快速分型,并同时用传统玻片凝集反应鉴定方法进行验证,两种方法鉴定结果的符合率为100%。鉴定结果为:21株沙门菌共包括4个不同血清型,其中肠炎沙门菌10株、鼠伤寒沙门菌7株、鸡沙门菌2株、纽波特沙门菌2株。基因组序列分析结果和分离株分型结果均表明,沙门菌特异分子检测靶点S9和S69相结合具备沙门菌的分子血清分型能力,以差异位点表为基础建立的血清分型方法有望替代传统的玻片凝集血清分型这一繁杂步骤,从而降低沙门菌血清鉴定的时间与成本,为聚合酶链式反应技术应用于沙门菌分子血清分型提供新思路。
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关键词
沙门菌
分子血清分型
特异性检测靶点
食品样品
血清
鉴定
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职称材料
题名
副猪嗜血杆菌血清4型和13型的分子血清分型研究
被引量:
5
1
作者
李忍
郭芳芳
郭杰
崔一芳
曹晓亚
徐福洲
机构
北京市农林科学院畜牧兽医研究所/畜禽疫病防控技术北京市重点实验室
出处
《动物医学进展》
北大核心
2021年第2期6-11,共6页
基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0500706)
国家自然科学基金项目(31572527)
北京市农林科学院科技创新能力建设专项项目(KJCX201914)。
文摘
为在临床诊断中快速鉴定副猪嗜血杆菌(HPS)血清4型和13型等优势流行血清型,分子血清分型方法较常规的基于特异性抗血清的血清分型方法更加准确和高效。根据HPS血清4型脂多糖合成蛋白基因wcip 4和血清13型糖脂转移蛋白基因gltP序列设计特异性引物,分别建立了简便快速鉴定HPS血清4型和13型的环介导等温扩增方法(LAMP)。特异性检测结果显示,HPS血清4型或13型参考菌株检测为阳性,而其他HPS血清型参考菌株及19种其他细菌检测均为阴性;敏感性检测结果显示,在25μL反应体系中,HPS血清4型和13型基因组DNA检测限分别为1 pg和2.5 pg。对已知血清型的22株HPS临床分离株检测结果显示,13株血清4型和5株血清13型分别检测均为阳性,而其他血清型分离株检测均为阴性。结果表明,建立的LAMP方法可用于HPS血清4型和13型的快速鉴定,有助于HPS优势流行血清型的快速调查及疫苗防控。
关键词
副猪嗜血杆菌
分子血清分型
环介导等温扩增
特异性
敏感性
Keywords
Haemophilus parasuis
molecular serotyping
loop-mediated isothermal amplification
specifi-city
sensitivity
分类号
S852.612 [农业科学—基础兽医学]
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
沙门氏菌传统血清凝集分型和分子血清分型试剂盒方法比较
被引量:
4
2
作者
周燕霞
任岩
王青龙
曹悦
胡凤月
张熙雅
巩有博
张跃川
耿建强
蔡雪凤
机构
北京市食品安全监控和风险评估中心(北京市食品检验所)
出处
《食品安全质量检测学报》
CAS
2019年第18期6068-6077,共10页
文摘
目的验证沙门氏菌血清分型试剂盒的适用性,考核本实验室传统沙门氏菌血清分型技术,扩充沙门氏菌的分型方法,寻找更有效、更快捷的沙门氏菌分型方法。方法保存的样品菌株库中随意挑选33株沙门氏菌和6株标准菌株,首先确证为沙门氏菌,然后分别采用传统的玻片血清凝集方法和分子血清分型试剂盒对其进行分型,最后采用16S rRNA系统发育树对试验菌株进行聚类分析。结果2种分型手段的匹配率高达94.9%,其中YP 281 Salmonella havana和YP 639 Salmonella liverpool没有匹配到,这2株菌在试剂盒数据库中不存在,但本实验利用传统血清分型手段可以对这2株菌进行准确分型,其中YP 281是本实验室对GB 4789.4-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》表B.1外成功分型的沙门氏菌。结论本实验室传统血清凝集分型技术合格。沙门分子血清分型试剂盒具有较好的适用性,能更快速、更方便对沙门氏菌进行分型。
关键词
沙门氏菌
血清
分型
传统玻片
血清
凝集
分型
沙门
分子血清分型
试剂盒
Keywords
Salmonella
serotype
traditional slide serum agglutination
Salmonella molecular serum kit
分类号
TS207.4 [轻工技术与工程—食品科学]
R155.5 [医药卫生—营养与食品卫生学]
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职称材料
题名
沙门菌属特异性检测靶点碱基差异位点的识别及其血清型决定力
被引量:
2
3
作者
石秀清
周秀娟
施春雷
张芬
史贤明
机构
上海交通大学农业与生物学院
出处
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017年第24期47-52,共6页
基金
政府间国际科技创新合作重点专项(2016YFE0106100).
文摘
以美国国家生物技术信息中心(NCBI)已公布的28株沙门菌(14个血清型)全基因组序列为研究对象,对前期研究获得的7个沙门菌属特异性检测靶点在不同血清型间的单核苷酸多态性进行比较分析,结果表明,S9和S69为碱基差异位点最多的两个靶点,具有沙门菌分子血清分型的潜在能力。随后,通过分析S9和S69在沙门菌不同血清型菌株中的差异位点,分别绘制两个血清分型靶点的差异位点表,从而获得了这两个靶点同时用于14个沙门菌血清型的快速分子血清分型的差异位点组合。在这些组合中,同一血清型具有相同的差异位点,不同血清型可以通过差异位点得以区分。最后,采集食品样品192份,用国标方法获得疑似沙门菌21株;利用血清分子分型靶点S9和S69进行快速分型,并同时用传统玻片凝集反应鉴定方法进行验证,两种方法鉴定结果的符合率为100%。鉴定结果为:21株沙门菌共包括4个不同血清型,其中肠炎沙门菌10株、鼠伤寒沙门菌7株、鸡沙门菌2株、纽波特沙门菌2株。基因组序列分析结果和分离株分型结果均表明,沙门菌特异分子检测靶点S9和S69相结合具备沙门菌的分子血清分型能力,以差异位点表为基础建立的血清分型方法有望替代传统的玻片凝集血清分型这一繁杂步骤,从而降低沙门菌血清鉴定的时间与成本,为聚合酶链式反应技术应用于沙门菌分子血清分型提供新思路。
关键词
沙门菌
分子血清分型
特异性检测靶点
食品样品
血清
鉴定
Keywords
Salmonella
molecular serotyping
Salmonella-specific targets
food samples
serum identification
分类号
Q781 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
副猪嗜血杆菌血清4型和13型的分子血清分型研究
李忍
郭芳芳
郭杰
崔一芳
曹晓亚
徐福洲
《动物医学进展》
北大核心
2021
5
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职称材料
2
沙门氏菌传统血清凝集分型和分子血清分型试剂盒方法比较
周燕霞
任岩
王青龙
曹悦
胡凤月
张熙雅
巩有博
张跃川
耿建强
蔡雪凤
《食品安全质量检测学报》
CAS
2019
4
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下载PDF
职称材料
3
沙门菌属特异性检测靶点碱基差异位点的识别及其血清型决定力
石秀清
周秀娟
施春雷
张芬
史贤明
《食品科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
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