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鸡解偶联蛋白(UCP)基因内含子的克隆与系统发生树的构建
被引量：
6
1
作者
赵建国
李辉
+2 位作者
王启贵
王宇祥
唐志权
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期50-54,共5页
解偶联蛋白基因是新近发现的能够增加能量的消耗,与脂肪代谢和能量调控密切相关的一组基因。本研究根据小鼠UCP2基因的剪切方式,设计4对引物成功克隆测序了鸡UCP基因的全部5个内含子,发现都是GT AG类型的内含子,鸡UCP基因的结构和小鼠的...
解偶联蛋白基因是新近发现的能够增加能量的消耗,与脂肪代谢和能量调控密切相关的一组基因。本研究根据小鼠UCP2基因的剪切方式,设计4对引物成功克隆测序了鸡UCP基因的全部5个内含子,发现都是GT AG类型的内含子,鸡UCP基因的结构和小鼠的UCP2基因结构一致。以不同物种UCP基因的cds区域序列和内含子2、内含子3序列进行系统发生树的构建,结果表明:以UCP基因cds区域序列构建的系统发生树与物种树是一致的,UCP基因可以作为研究动物群体系统演化研究的有效基因;但以内含子2与内含子3序列构建的系统发生树的结构则完全不是这样,与物种树的差别比较大。
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关键词
鸡
解偶联蛋白基因
分子系统发生树
内含子
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职称材料
刺鳅属(Mastacembelus)鱼类和中华刺鳅的线粒体COI基因序列比较
2
作者
吴斌
王海华
+2 位作者
曾庆祥
徐先栋
马本贺
《江西农业学报》
CAS
2021年第10期119-124,共6页
应用生物信息学方法对27种刺鳅属鱼类和中华刺鳅的线粒体COI基因序列片段进行了比较分析,结果表明:COI基因碱基组成偏倚明显,27种刺鳅属鱼类COI基因中,A+T含量(53.6%)明显高于G+C含量(46.4%);在中华刺鳅COI基因中,A+T含量(57.8%)也明显...
应用生物信息学方法对27种刺鳅属鱼类和中华刺鳅的线粒体COI基因序列片段进行了比较分析,结果表明:COI基因碱基组成偏倚明显,27种刺鳅属鱼类COI基因中,A+T含量(53.6%)明显高于G+C含量(46.4%);在中华刺鳅COI基因中,A+T含量(57.8%)也明显高于G+C含量(42.2%),这与大部分鱼类的COI基因序列研究结果一致。中华刺鳅与大多数刺鳅属鱼类均保持中等遗传距离(0.162~0.217),但与非洲坦噶尼喀湖特有的Mastacembelus albomaculatus的遗传距离较远,达到0.268,计算了27种和26种(剔除Mastacembelus albomaculatus)刺鳅属鱼类的平均遗传距离,分别为0.134和0.123。基于COI基因构建的系统发育树分析,27种刺鳅属(Mastacembelus)鱼类和中华刺鳅可以明显区分为3个类群,即以大刺鳅等大多数刺鳅属鱼类、中华刺鳅、Mastacembelus albomaculatus。研究结果支持中华刺鳅属于刺鳅科,同时建议重新整理刺鳅属。由NJ和MP法构建的系统发生树均提示,非洲坦噶尼喀湖特有的Mastacembelus albomaculatus是相对较古老的类群,刺鳅属鱼类可能起源于非洲,但这需要进一步更加全面的分子生物学分析。同时,大刺鳅和中华刺鳅保持相对较近的遗传距离,通过种间杂交,培育耐低温且营养高的新品种具有较大的可行性。
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关键词
刺鳅属
中华刺鳅
COI基因
遗传距离
分子系统发生树
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职称材料
题名
鸡解偶联蛋白(UCP)基因内含子的克隆与系统发生树的构建
被引量：
6
1
作者
赵建国
李辉
王启贵
王宇祥
唐志权
机构
东北农业大学动物科技学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第1期50-54,共5页
基金
国家自然科学基金(项目编号 3 0 2 70 950 )
黑龙江省杰出青年基金项目~~
文摘
解偶联蛋白基因是新近发现的能够增加能量的消耗,与脂肪代谢和能量调控密切相关的一组基因。本研究根据小鼠UCP2基因的剪切方式,设计4对引物成功克隆测序了鸡UCP基因的全部5个内含子,发现都是GT AG类型的内含子,鸡UCP基因的结构和小鼠的UCP2基因结构一致。以不同物种UCP基因的cds区域序列和内含子2、内含子3序列进行系统发生树的构建,结果表明:以UCP基因cds区域序列构建的系统发生树与物种树是一致的,UCP基因可以作为研究动物群体系统演化研究的有效基因;但以内含子2与内含子3序列构建的系统发生树的结构则完全不是这样,与物种树的差别比较大。
关键词
鸡
解偶联蛋白基因
分子系统发生树
内含子
Keywords
chicken
UCP gene
molecular phylogenetic tree
分类号
Q951 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
刺鳅属(Mastacembelus)鱼类和中华刺鳅的线粒体COI基因序列比较
2
作者
吴斌
王海华
曾庆祥
徐先栋
马本贺
机构
江西省水产科学研究所
赣州市水产科学研究所
出处
《江西农业学报》
CAS
2021年第10期119-124,共6页
基金
江西省重点研发计划项目(20171ACF60012)
江西省现代农业产业技术体系建设专项资金(JXARS-10)。
文摘
应用生物信息学方法对27种刺鳅属鱼类和中华刺鳅的线粒体COI基因序列片段进行了比较分析,结果表明:COI基因碱基组成偏倚明显,27种刺鳅属鱼类COI基因中,A+T含量(53.6%)明显高于G+C含量(46.4%);在中华刺鳅COI基因中,A+T含量(57.8%)也明显高于G+C含量(42.2%),这与大部分鱼类的COI基因序列研究结果一致。中华刺鳅与大多数刺鳅属鱼类均保持中等遗传距离(0.162~0.217),但与非洲坦噶尼喀湖特有的Mastacembelus albomaculatus的遗传距离较远,达到0.268,计算了27种和26种(剔除Mastacembelus albomaculatus)刺鳅属鱼类的平均遗传距离,分别为0.134和0.123。基于COI基因构建的系统发育树分析,27种刺鳅属(Mastacembelus)鱼类和中华刺鳅可以明显区分为3个类群,即以大刺鳅等大多数刺鳅属鱼类、中华刺鳅、Mastacembelus albomaculatus。研究结果支持中华刺鳅属于刺鳅科,同时建议重新整理刺鳅属。由NJ和MP法构建的系统发生树均提示,非洲坦噶尼喀湖特有的Mastacembelus albomaculatus是相对较古老的类群,刺鳅属鱼类可能起源于非洲,但这需要进一步更加全面的分子生物学分析。同时,大刺鳅和中华刺鳅保持相对较近的遗传距离,通过种间杂交,培育耐低温且营养高的新品种具有较大的可行性。
关键词
刺鳅属
中华刺鳅
COI基因
遗传距离
分子系统发生树
Keywords
Mastacembelus
Sinobdella sinensis
COI gene
Genetic distance
Molecular phylogenetic tree
分类号
Q959.483 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸡解偶联蛋白(UCP)基因内含子的克隆与系统发生树的构建
赵建国
李辉
王启贵
王宇祥
唐志权
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2004
6
在线阅读
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职称材料
2
刺鳅属(Mastacembelus)鱼类和中华刺鳅的线粒体COI基因序列比较
吴斌
王海华
曾庆祥
徐先栋
马本贺
《江西农业学报》
CAS
2021
0
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职称材料
已选择
0
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引证文献
统计分析
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