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楤木属FAD2基因家族的鉴定及生物信息学分析
1
作者
燕敬利
王孟豪
+3 位作者
刘艳艳
杨莹
王旭飞
曹亚男
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期488-498,共11页
聚炔类化合物(PAs)是一类主要由桔梗类植物产生、具生物活性的植物特异性防御物质。其上游合成步骤由脂肪酸去饱和酶2(FAD2)催化。本文以PA的主要来源植物之一,桔梗类的五加科楤木属(Aralia)为研究对象,对楤木(A.elata(Miq.)Seem.)和龙...
聚炔类化合物(PAs)是一类主要由桔梗类植物产生、具生物活性的植物特异性防御物质。其上游合成步骤由脂肪酸去饱和酶2(FAD2)催化。本文以PA的主要来源植物之一,桔梗类的五加科楤木属(Aralia)为研究对象,对楤木(A.elata(Miq.)Seem.)和龙眼独活(A.fargesii Franch.)的FAD2基因家族进行鉴定,并对其保守基序、结构域、染色体分布、基因共线性、进化关系、分子演化速率以及表达情况进行分析。结果显示,楤木属的FAD2基因家族经历了广泛扩张,这可能是通过全基因组加倍/片段重复实现的;不同功能的FAD2保守基序完全一致,但楤木属不同生活型(草本vs.木本)代表物种FAD2的保守基序却产生了分化;楤木中可能有4个不同功能的FAD2基因,其在不同组织中的表达情况不同。本研究可为后续楤木属的物种鉴定、聚炔类物质合成新基因的挖掘以及桔梗类植物具高度多样化PAs分子机制的揭示提供参考。
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关键词
聚炔类化合物
脂肪酸去饱和酶2
楤木属
分子演化速率
功能基因
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题名
楤木属FAD2基因家族的鉴定及生物信息学分析
1
作者
燕敬利
王孟豪
刘艳艳
杨莹
王旭飞
曹亚男
机构
河南农业大学植物保护学院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期488-498,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31800179)。
文摘
聚炔类化合物(PAs)是一类主要由桔梗类植物产生、具生物活性的植物特异性防御物质。其上游合成步骤由脂肪酸去饱和酶2(FAD2)催化。本文以PA的主要来源植物之一,桔梗类的五加科楤木属(Aralia)为研究对象,对楤木(A.elata(Miq.)Seem.)和龙眼独活(A.fargesii Franch.)的FAD2基因家族进行鉴定,并对其保守基序、结构域、染色体分布、基因共线性、进化关系、分子演化速率以及表达情况进行分析。结果显示,楤木属的FAD2基因家族经历了广泛扩张,这可能是通过全基因组加倍/片段重复实现的;不同功能的FAD2保守基序完全一致,但楤木属不同生活型(草本vs.木本)代表物种FAD2的保守基序却产生了分化;楤木中可能有4个不同功能的FAD2基因,其在不同组织中的表达情况不同。本研究可为后续楤木属的物种鉴定、聚炔类物质合成新基因的挖掘以及桔梗类植物具高度多样化PAs分子机制的揭示提供参考。
关键词
聚炔类化合物
脂肪酸去饱和酶2
楤木属
分子演化速率
功能基因
Keywords
Polyacetylenes(PAs)
Fatty acid desaturase 2(FAD2)
Aralia
Molecular evolution rate
Functional genes
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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作者
出处
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被引量
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1
楤木属FAD2基因家族的鉴定及生物信息学分析
燕敬利
王孟豪
刘艳艳
杨莹
王旭飞
曹亚男
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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