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凉山黑绵羊球虫病分子流行病学调查
1
作者 陈忠敏 吉色曲伍 +6 位作者 徐存燕 周可磊 李维 扎西祝玛 陈弟诗 陶思宇 李英林 《中国动物检疫》 2025年第8期18-24,共7页
为了解凉山黑绵羊的球虫感染状况,明确感染种类及其遗传特征,采集400份来自不同养殖场的疑似球虫感染的黑绵羊新鲜粪便样品,利用冻融裂解结合蛋白酶K消化法提取DNA,采用PCR技术,使用特异性引物扩增阳性样品ITS1基因,并通过Clustal W方... 为了解凉山黑绵羊的球虫感染状况,明确感染种类及其遗传特征,采集400份来自不同养殖场的疑似球虫感染的黑绵羊新鲜粪便样品,利用冻融裂解结合蛋白酶K消化法提取DNA,采用PCR技术,使用特异性引物扩增阳性样品ITS1基因,并通过Clustal W方法计算分析获得的ITS1基因核苷酸序列同源性,应用MEGA11中的Neighbor-Joining法构建系统进化树。结果显示:凉山黑绵羊球虫总体感染率为29.5%(118/400),其中散养羊群感染率(36.0%)高于规模养殖场(26.6%);鉴定出E.ahsata(阿撒他)、E.weybridgensis(温布里吉)及E.faurei(浮氏)3种艾美耳球虫。ITS1基因遗传进化分析发现,本地球虫流行株与墨西哥同种球虫株同源性较高,提示存在虫种跨区域传播。结果表明,凉山黑绵羊球虫感染较为普遍,且流行虫种存在遗传多样性,散养羊群是球虫病重点防控对象,需加强羊球虫病监测。本调查为凉山州黑绵羊球虫病综合防治提供了依据。 展开更多
关键词 凉山黑绵羊 球虫 分子流行病学调查 ITS1基因 遗传进化
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猪源十二指肠贾第虫分子流行病学研究进展
2
作者 王臣荣 许瑞勤 郝乐瑶 《家畜生态学报》 北大核心 2025年第5期115-119,共5页
十二指肠贾第虫(Giardia duodenalis)是一种重要的肠道寄生原虫,能感染多种宿主,包括人类和猪,可引起宿主腹泻、营养不良和体重减轻等症状,不仅给畜牧业造成经济损失,而且会危害公众健康。分子生物学技术在十二指肠贾第虫的检测、基因... 十二指肠贾第虫(Giardia duodenalis)是一种重要的肠道寄生原虫,能感染多种宿主,包括人类和猪,可引起宿主腹泻、营养不良和体重减轻等症状,不仅给畜牧业造成经济损失,而且会危害公众健康。分子生物学技术在十二指肠贾第虫的检测、基因分型及溯源等方面发挥着重要作用。文章对我国猪源十二指肠贾第虫分子流行病学研究进展进行综述,为其有效防控提供参考。 展开更多
关键词 十二指肠贾第虫 猪 分子流行病学 人兽共患病
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某综合性医院血液病患者艰难梭菌感染分子流行病学回顾性研究
3
作者 郑丽思 赵帆 +1 位作者 朱嘉梁 吕涛 《中国抗生素杂志》 北大核心 2025年第2期121-128,共8页
目的回顾性调查4年期间某综合性医院血液病患者艰难梭菌感染发生情况及临床特征,用核糖体分型技术分析艰难梭菌的分子流行病学及院内传播的风险。方法2019年7月—2023年7月,从血液病房患者腹泻粪便样本中分离出艰难梭菌;用聚合酶链式反... 目的回顾性调查4年期间某综合性医院血液病患者艰难梭菌感染发生情况及临床特征,用核糖体分型技术分析艰难梭菌的分子流行病学及院内传播的风险。方法2019年7月—2023年7月,从血液病房患者腹泻粪便样本中分离出艰难梭菌;用聚合酶链式反应(PCR)检测毒素基因tcdA、tcdB和二元毒素基因(cdtA、cdtB);毛细管凝胶电泳核糖体分型技术对产毒菌株进行分型研究。结果共分离得到130株产毒艰难梭菌,其中毒素A和B均阳性(A+B+)菌株116株(116/130,89.2%);毒素A阴性而毒素B阳性(A-B+)菌株14株(14/130,10.8%);130株产毒菌株中二元毒素阳性菌株7株(A+B+CDT+)(7/130,5.4%)。PCR核糖体分型将130株产毒艰难梭菌分为9个克隆群,同源性分析发现产毒素艰难梭菌在不同楼层病房之间以及同一病房不同时间有一定的流行。结论针对免疫功能低下患者,如血液恶性疾病患者,应提高临床医生对艰难梭菌感染的诊疗意识;同时可应用相应的分子流行病学分析监测聚集性病例菌株,对污染的医疗环境进行严格消毒,医护人员严格执行手卫生,实施有效的感染控制,从而减少艰难梭菌院内暴发流行。 展开更多
关键词 艰难梭菌感染 血液病 PCR核糖体分型 分子流行病学
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2024年湖南省猪繁殖与呼吸综合征病毒分子流行病学调查及谱系分析
4
作者 吴江涛 邹建曾 +1 位作者 袁莎莎 周宇骏 《湖南畜牧兽医》 2025年第4期18-21,共4页
为调查湖南省部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的分子流行特征,于2024年1—11月从湖南省部分地区640个疑似暴发PRRS的猪场收集组织或血液样品共2085份,采用RT-qPCR法检测组织样品PRRSV核酸阳性率,采用PCR法扩增部分阳性样本的ORF... 为调查湖南省部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的分子流行特征,于2024年1—11月从湖南省部分地区640个疑似暴发PRRS的猪场收集组织或血液样品共2085份,采用RT-qPCR法检测组织样品PRRSV核酸阳性率,采用PCR法扩增部分阳性样本的ORF5基因,分析PRRSV谱系和分布特征。结果发现,PRRSV核酸场阳性率和样品阳性率分别为28.91%(185/640)和23.79%(496/2085),不同地区的场阳性率和样本阳性率分别为12.50%~42.42%和2.77%~56.17%;不同季节的场阳性率和样品阳性率分别为20.0%~40.42%和13.32%~40.16%。进一步对13份PRRSV阳性样品进行谱系分析,发现共存在3种PRRSV谱系,分别为类NADC30、类HP-PRRSV和类经典型,所占比例分别为53.85%、38.46%和7.69%。结果表明,PRRSV广泛流行于湖南省不同地区,且至少流行3种谱系,其中类NADC30和类HP-PRRSV为优势流行谱系。 展开更多
关键词 湖南省 PRRSV 分子流行病学 RT-QPCR ORF5 谱系
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动物源肺炎克雷伯菌的耐药性危机——以分子流行病学、耐药机制与防控策略新视角为例
5
作者 高梅凤 黄华国 +1 位作者 阮晨梅 夏招彬 《农业与技术》 2025年第20期103-105,共3页
肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)是一种常见的条件致病菌,广泛分布于自然环境中,能引起多种感染。近年来其耐药程度持续升高,已对公共卫生形成显著威胁。本文系统梳理了动物源肺炎克雷伯菌的分子流行病学特征、耐药机制及防控策略... 肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)是一种常见的条件致病菌,广泛分布于自然环境中,能引起多种感染。近年来其耐药程度持续升高,已对公共卫生形成显著威胁。本文系统梳理了动物源肺炎克雷伯菌的分子流行病学特征、耐药机制及防控策略的最新进展,为该领域研究者提供参考,以期推动对该病原体的深入认知与有效遏制。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 动物感染 分子流行病学 耐药机制 防控策略
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2020年江苏地区鸭圆环病毒分子流行病学调查及分离方法的初步研究
6
作者 李子晗 林梦舟 +5 位作者 吴双 杨静静 谢军 吴植 王海燕 朱善元 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第3期134-140,共7页
为了解2020年江苏地区鸭圆环病毒(DuCV)的流行情况、分子特性及探索其分离方法,通过采集江苏部分地区疑似患鸭圆环病的病、死鸭脏器组织,研磨后提取DNA,运用PCR技术扩增该病毒全基因组并测序,分析其分子流行病学特征,确定遗传谱系。将PC... 为了解2020年江苏地区鸭圆环病毒(DuCV)的流行情况、分子特性及探索其分离方法,通过采集江苏部分地区疑似患鸭圆环病的病、死鸭脏器组织,研磨后提取DNA,运用PCR技术扩增该病毒全基因组并测序,分析其分子流行病学特征,确定遗传谱系。将PCR检测阳性的组织病料上清经绒毛尿囊膜接种9日龄SPF鸭胚,分别收集鸭胚绒毛尿囊膜和尿囊液,以相同的方法将PCR检测阳性的尿囊膜/尿囊液进行鸭胚传代,尝试探索分离DuCV的方法。采集的23份样品中共检测出阳性样本10份。病毒基因组序列分析结果表明10株分离株均属于DuCV 1型的分支,传代结果表明多数样本在第1代绒毛尿囊膜和尿囊液样品中可检出DuCV,仅有部分样本在第2、3代的绒毛尿囊膜PCR检测结果呈阳性,传至第4代次时就检测不到病毒核酸。检测的结果一定程度上也表明绒毛尿囊膜检出率高于尿囊液。该结果为江苏地区该病的防控提供了一定的参考价值。 展开更多
关键词 鸭圆环病毒 PCR 分子流行病学 SPF鸭胚
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2020-2021年我国规模化猪场猪圆环病毒2型和3型的分子流行病学调查分析 被引量：7
7
作者 陈翔鸿 曹琪 +5 位作者 谌磊 邓文芳 袁意 孔丹妮 宋文博 汤细彪 《动物医学进展》 北大核心 2024年第3期88-96,共9页
采集13个省市自治区的491个规模化猪场的1447份疑似猪圆环病毒感染样本,通过荧光定量PCR方法进行猪圆环病毒2型(PCV2)和猪圆环病毒3型(PCV3)的检测。分别随机选取50份PCV2和PCV3阳性样品,对其ORF2基因进行测序并分别进行核苷酸同源性比... 采集13个省市自治区的491个规模化猪场的1447份疑似猪圆环病毒感染样本,通过荧光定量PCR方法进行猪圆环病毒2型(PCV2)和猪圆环病毒3型(PCV3)的检测。分别随机选取50份PCV2和PCV3阳性样品,对其ORF2基因进行测序并分别进行核苷酸同源性比对和遗传进化分析。结果显示,样本中PCV2和PCV3检出率分别为29.16%(422/1447)和18.93%(274/1447)。规模化猪场中PCV2和PCV3检出率分别为47.05%(231/491)和15.68%(77/491),PCV2和PCV3混合感染率为23.81%,混合感染高于单一感染,与猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、伪狂犬病病毒(PRV)、猪肺炎支原体(MhP)等病原体以多种组合的混合感染形式出现。50个PCV2序列与16个参考毒株序列的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为75.6%~100%和83.1%~99.1%,PCV3对应同源性分别为95.9%~100%和96.3%~100%。分子遗传进化分析显示PCV2d占80%(40/50),PCV2a占4%(2/50),PCV2b占16%(8/50),未检测到PCV2c和PCV2e。PCV3a、PCV3b和PCV3c分别占28%(14/50)、22%(11/50)和50%(25/50)。表明2020-2021年我国规模化猪场PCV2的主要流行基因型是PCV2d,其次为PCV2a和PCV2b。PCV3c为我国规模化猪场中的主要流行基因型,而PCV3a和PCV3b流行率也依然较高。论文对我国猪圆环病毒的分子流行病学进行了数据补充,对临床防控起到了预警作用,也为猪圆环病毒疫苗的研发提供参考。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 猪圆环病毒3型 混合感染 分子流行病学
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ICU碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的毒力基因分布及分子流行病学特征 被引量：1
8
作者 黄雅轩 蔡依含 +2 位作者 何婉霞 张莉滟 赵越 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期730-736,共7页
目的:碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)携带的耐药基因会限制临床用药选择,其毒力基因也会严重影响患者预后。本研究旨在探讨重症监护室(intensive care unit,ICU)CRKP的毒力基因分布、荚膜... 目的:碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)携带的耐药基因会限制临床用药选择,其毒力基因也会严重影响患者预后。本研究旨在探讨重症监护室(intensive care unit,ICU)CRKP的毒力基因分布、荚膜血清型及分子流行病学特征,了解ICU中CRKP的感染特点,为ICU有效监测和防控CRKP感染提供科学依据。方法:收集2021年1月至2022年12月广东省人民医院ICU所分离并已确定为CRKP的非重复菌株共40株。采用全基因组测序方法,分析待测菌株耐药基因、毒力基因、荚膜血清型的分布,同时将CRKP基因组7个管家基因序列上传至肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KPN)多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)数据库进行分析,以明确菌株的序列型(sequence typing,ST)。结果:40例ICU CRKP感染患者年龄为(69.03±17.82)岁,且伴有多种基础疾病,临床结局好转和死亡各20例。所分离菌株主要来源于中段尿、肺泡灌洗液等标本。全基因组测序结果显示其主要携带blaKPC-1(29株,72.5%)和blaNDM-1(6株,15.0%),另有5株同时携带blaKPC-1和blaNDM-1。所携带的毒力基因有多种,其中entA、entB、entE、entS、fepA、fepC、fepG、yag/ecp、ompA等基因的携带率达100%,entD、fimB、iroB、iroD、fes、pla等基因携带率较低。ICU所分离的CRKP以ST11型(27例,67.5%)为主,荚膜血清型以KL64型(29例,72.5%)为主。共检出23例ST11-KL64型CRKP,占57.5%。结论:ICU CRKP主要为ST11-KL64型,并携带多种毒力基因,其中以铁吸收类毒力基因为主;且blaKPC已由blaKPC-2转为blaKPC-1。因此,需密切监测CRKP的分子流行病学变化,同时制订严格的防控措施,有效遏制CRKP感染的发生。 展开更多
关键词 重症监护室 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌 全基因组测序 毒力基因 荚膜血清型 多位点序列分型 分子流行病学
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猪繁殖与呼吸综合征的分子流行病学调查及防控研究 被引量：2
9
作者 李斌茹 《农业开发与装备》 2024年第9期211-213,共3页
对猪繁殖与呼吸综合征分子流行病学调查和防控方面的研究进行了综述。首先,对流行病学调查的内容进行了介绍,包括调查范围、采样方法和数据收集方法,以便更好地了解病原的分布和变化规律。其次,对病原的分布特征、变化趋势、传播路径及... 对猪繁殖与呼吸综合征分子流行病学调查和防控方面的研究进行了综述。首先,对流行病学调查的内容进行了介绍,包括调查范围、采样方法和数据收集方法,以便更好地了解病原的分布和变化规律。其次,对病原的分布特征、变化趋势、传播路径及影响因素进行深入分析,为制定有效的防控策略提供科学依据。在防控方面,从疫苗研制、生物安全管理和养殖管理等方面进行了论述,以提高防控措施的有效性与可行性。在此基础上,总结猪繁殖与呼吸综合征分子流行病学调查在疾病防控中的重要作用,并分析其有效性、可行性。为猪繁殖与呼吸综合征的防控提供理论依据,对推动我国养殖业的健康发展具有重要意义。 展开更多
关键词 猪繁殖 呼吸综合征 分子流行病学调查 防控
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猪链球菌病的分子流行病学及其防控策略 被引量：2
10
作者 岑鑫 《农村科学实验》 2024年第6期157-159,共3页
猪链球菌病是威胁猪群健康的重要传染病之一。该文对猪链球菌病的分子流行病学特征进行了深入分析,并探讨了有效的防控策略。利用基因分型和分子标记技术,揭示了猪链球菌的分子特性及其在不同地区的流行特征,研究了猪链球菌病的主要传... 猪链球菌病是威胁猪群健康的重要传染病之一。该文对猪链球菌病的分子流行病学特征进行了深入分析,并探讨了有效的防控策略。利用基因分型和分子标记技术,揭示了猪链球菌的分子特性及其在不同地区的流行特征,研究了猪链球菌病的主要传播途径和影响其流行的风险因素。在此基础上,该文从免疫策略与疫苗研发、生物安全与环境管理措施、抗菌药物的合理使用与抗药性管理等方面入手,提出了一系列有针对性的防控措施,旨在为相关工作者提供一些有益建议。 展开更多
关键词 猪链球菌病 分子流行病学 防控策略 生物安全
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副猪嗜血杆菌的多重耐药性及氨基糖苷类耐药基因分子流行病学分析
11
作者 吴瑗 董婉玉 +8 位作者 王馨雨 刘雅琦 周莹珊 杜静 于浩然 仲伟 宋厚辉 张聚民 王晓杜 《中国动物传染病学报》 北大核心 2024年第6期145-151,共7页
为了解规模化猪场副猪嗜血杆菌(HPS)的耐药基因流行情况,对来自国内52株HPS分离株开展了耐药基因检测、药敏试验、氨基糖苷类耐药基因Aph(3')-Ia和StrB氨基酸序列的比对及分析。结果表明:HPS分离株含有多重耐药基因(β-内酰胺类,氨... 为了解规模化猪场副猪嗜血杆菌(HPS)的耐药基因流行情况,对来自国内52株HPS分离株开展了耐药基因检测、药敏试验、氨基糖苷类耐药基因Aph(3')-Ia和StrB氨基酸序列的比对及分析。结果表明:HPS分离株含有多重耐药基因(β-内酰胺类,氨基糖苷类,磺胺类药和Ⅰ类整合子),其中bla-_(TEM)、Aph(3')-Ia、3'CS和Int1基因检出率为100%;HPS分离菌株对硫酸链霉素的耐药率高达75%。HPS分离菌株Aph(3')-Ia编码的部分氨基酸与除了已知HPS之外的6种细菌的氨基酸序列相同;HPS分离株JX-6 StrB基因编码的氨基酸序列与其他细菌差别较大,该菌株第18号位点StrB基因的ATP结合位点也发生了突变。本研究表明规模化养猪场HPS氨基糖苷类耐药基因Aph(3')-Ia和StrB携带率高,细菌耐药性的差异和耐药基因的改变可能是由一些特定的位点突变所导致。本研究为规模化养殖场HPS耐药基因变化规律研究和相关疾病的防控奠定了基础。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 耐药基因 氨基糖苷类耐药性 分子流行病学
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龙江和牛十二指肠贾第虫分子流行病学调查及基因型分析
12
作者 高满慧 陈剑冰 《浙江畜牧兽医》 2024年第5期23-25,共3页
十二指肠贾第虫是贾第虫属目前唯一的人畜共患寄生虫,经粪-口传播,能够引起大多数哺乳动物自限性的临床疾病。这种由十二指肠贾第虫引起的疾病被称为贾第虫病。贾第虫病的特征在于水样腹泻、腹部痉挛、减重和吸收不良。我国每年都能从... 十二指肠贾第虫是贾第虫属目前唯一的人畜共患寄生虫,经粪-口传播,能够引起大多数哺乳动物自限性的临床疾病。这种由十二指肠贾第虫引起的疾病被称为贾第虫病。贾第虫病的特征在于水样腹泻、腹部痉挛、减重和吸收不良。我国每年都能从人群中检出约2850万贾第虫病例,但这个数字仍可能是被低估的。 展开更多
关键词 人畜共患寄生虫 贾第虫病 十二指肠贾第虫 水样腹泻 吸收不良 基因型分析 分子流行病学调查 临床疾病
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我国部分地区NDV的分子流行病学研究 被引量：101
13
作者 曹殿军 郭鑫 +4 位作者 梁荣 闫丽辉 刘培欣 闵平 陈杰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期29-32,共4页
本研究根据新城疫病毒 (NDV)F基因编码区 1_374位核苷酸序列计算其遗传距离并绘制了NDV的系统发育进化树 ,将 6 8株NDV分为 9个基因型 (30株为国内分离株 ) ,其中Ⅰ～Ⅵ是早已存在的老基因型 ,Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ为新发现的基因型 ,特别是Ⅸ为... 本研究根据新城疫病毒 (NDV)F基因编码区 1_374位核苷酸序列计算其遗传距离并绘制了NDV的系统发育进化树 ,将 6 8株NDV分为 9个基因型 (30株为国内分离株 ) ,其中Ⅰ～Ⅵ是早已存在的老基因型 ,Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ为新发现的基因型 ,特别是Ⅸ为我国特有的基因型 (F48E9、M3、HLJ_3、HeB_1P和NM_5 )。 1997～ 1999年在我国云南、广西、甘肃、陕西、新疆等地分离的YN_1P、GX_3、H1、H2、P1、GX_1、GX_2、GS_2、GS_3、SHX_2、SHX_3、SHX_6、SHX_7、XJ_2和 1991年分离的HuB_1均属于Ⅶ基因型 ,该基因型的病毒是 90年代以来引起新城疫发生的主要病原。根据遗传距离和分离年代可将此基因型进一步划分为 5个基因亚型 ,分别是Ⅶa、Ⅶb、Ⅶc、Ⅶd和Ⅶe。此外HuN_1/ 98、HLJ_4/ 95和HeH_1P属一个老的基因Ⅵ ,1979～ 1985年分离自青海的QH_1、QH_2、QH_4属于一个新的基因型—Ⅷ型。可见在我国新城疫的流行是极其复杂的 ,既有老基因型的危险 (Ⅰ～Ⅵ ) ,又有新基因型 (Ⅶ )的流行 ,更有我国独特Ⅷ和Ⅸ基因型潜伏。 展开更多
关键词 新城疫病毒 F基因 系统发育进化树 分子流行病学 中国
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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及其分子流行病学分析 被引量：394
14
作者 童光志 周艳君 +4 位作者 郝晓芳 田志军 仇华吉 彭金美 安同庆 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期323-327,共5页
为了弄清2006年在我国南方一些猪场暴发的一种以高热、高发病率和高死亡率为特征的传染病的病因,我们从12个省市48个发病猪场采集临床样品进行了猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的... 为了弄清2006年在我国南方一些猪场暴发的一种以高热、高发病率和高死亡率为特征的传染病的病因,我们从12个省市48个发病猪场采集临床样品进行了猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的分离鉴定和分子流行病学分析。结果显示从48个猪场样品中均检测出了PRRSV,通过完整的ORF5和部分Nsp2基因序列比较分析发现来自12个省市不同猪场的PRRSV高度同源,而且在Nsp2基因上都有两个相同位点的缺失;从分离的15株PRRSV中选择湖南分离株HuN4人工感染5头60日龄的健康猪,结果5头猪分别在7 d～21 d内全部死亡,感染猪的临床症状和现地所见十分相似。本次试验结果表明新出现的以Nsp2基因部分缺失为特征的PRRSV对猪是高致病性的,可能是2006年大部分猪场暴发"高热综合症"的主要病因。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 高热综合症 分子流行病学
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2009年我国部分地区禽白血病分子流行病学调查 被引量：72
15
作者 高玉龙 邵华斌 +7 位作者 罗青平 潘伟 秦立廷 孙芬芬 刘超男 高宏雷 祁小乐 王笑梅 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期32-35,43,共5页
为了解自2009年年初以来国内一些地区禽白血病流行情况及流行毒株的分子特征,我们从湖北、黑龙江、山东、辽宁、吉林、广东、宁夏、安徽8个省区39个鸡场采集疑似禽白血病病料样品178份,用ALV-A、ALV-B和ALV-J特异性引物,通过PCR方法进... 为了解自2009年年初以来国内一些地区禽白血病流行情况及流行毒株的分子特征,我们从湖北、黑龙江、山东、辽宁、吉林、广东、宁夏、安徽8个省区39个鸡场采集疑似禽白血病病料样品178份,用ALV-A、ALV-B和ALV-J特异性引物,通过PCR方法进行检测。结果表明,8个省的35个鸡场的124份病料中检出了ALV-J(69.7%);25份病料中检出了ALV-A(13.9%);7份病料中检出了ALV-B(3.9%)。14个分离毒株env基因氨基酸同源性为84.3%～99%;与J亚群原型毒株HPRS-103的氨基酸序列同源性为87.3%～98.2%;与其它J亚群env基因氨基酸序列同源性为83%～97.4%。遗传进化分析表明,14个ALV-J分离株分别分属于不同的分支。其中,LJL09DH02分离株与其它分离株及参考毒株的的亲缘关系最远,与HPRS-103的氨基酸同源性仅为87.3%。另外4个分离株的env基因与HPRS-103的氨基酸同源性低于93%,其余9株与HPRS-103的同源性较高(96.6%以上)。该调查结果表明,我国目前ALV的感染主要以J亚群为主,ALV-A和B同时存在。 展开更多
关键词 禽白血病 J亚群白血病 血管瘤 ENV基因 分子流行病学
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2005年中国新城疫病毒分子流行病学研究 被引量：32
16
作者 刘华雷 王志亮 +5 位作者 吴延功 郑东霞 孙承英 宋翠平 左媛媛 王伟华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期1340-1344,共5页
采用2005年从国内不同地区、不同宿主分离到的NDV分离株，选取其中具有代表性的83株，用RT-PCR技术扩增其F基因重要的功能区片段，进一步进行序列测定。序列分析表明所扩增的目的片段长度为535bp，序列测定结果已经登陆到GenBank，登陆... 采用2005年从国内不同地区、不同宿主分离到的NDV分离株，选取其中具有代表性的83株，用RT-PCR技术扩增其F基因重要的功能区片段，进一步进行序列测定。序列分析表明所扩增的目的片段长度为535bp，序列测定结果已经登陆到GenBank，登陆号为DQ439866-DQ439948。参照国内外已发表的部分毒株的F基因序列，构建了NDV的遗传进化树，分析毒株间的遗传进化关系。通过遗传进化分析表明83株NDV分离株中有65株属于基因Ⅶ型，9株属于基因Ⅱ型，5株属于基因Ⅰ型，3株属于基因Ⅵ型，1株属于基因Ⅲ型。表明我国目前ND的流行情况比较复杂，其中基因Ⅶ型新城疫病毒所引起的新城疫在国内呈流行趋势，同时也存在其它基因型的散发，从而为我国目前新城疫的防治提供了科学的参考依据。 展开更多
关键词 新城疫病毒 分子流行病学 基因型
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我国部分省区鸡传染性法氏囊病病毒的分子流行病学研究 被引量：27
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作者 阳秀英 韦平 +6 位作者 黄志永 磨美兰 韦天超 李康然 韦住奉 赖家宏 朱学勤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期581-588,共8页
应用RT-PCR技术,对2000-2006年间收集于广西、江苏、浙江、安徽、海南的临床疑似传染性法氏囊病病鸡的法氏囊、脾脏和骨髓样品进行检测,对检测呈阳性的病料采用9～11日龄的鸡胚通过绒毛尿囊膜或鸡胚成纤维细胞接种的方法进行鸡传染性法... 应用RT-PCR技术,对2000-2006年间收集于广西、江苏、浙江、安徽、海南的临床疑似传染性法氏囊病病鸡的法氏囊、脾脏和骨髓样品进行检测,对检测呈阳性的病料采用9～11日龄的鸡胚通过绒毛尿囊膜或鸡胚成纤维细胞接种的方法进行鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)的分离和传代,结果成功分离到23株IBDV;设计针对IB-DVVP2基因高变区(用vVP2表示)的引物对这些分离株及5株常用的中等毒力商品疫苗株进行RT-PCR扩增并对其进行酶切分析和核苷酸序列测定,分析比较23个分离株与参考毒株的vVP2的序列并绘制遗传系谱树。结果表明BH09、BH11、JS1、JS7、YY1、YY6、YL051、050222、TSC-2(9)、TZ(3)、HN0602共11个分离株属于超强毒株,与已发表的vvIBDV其它中国分离株、日本分离株OKYM、欧洲分离株DV86和UK661的亲源关系均较近;040124、YL052、020180、YLZF2、040131、BH15、YY2、050045、050057、050258、TSC-1(3)、A038共12株属于经典毒株,其中040124、YL052 2株属于中等偏强毒力疫苗株,其余10株则属于弱毒疫苗株。本研究的结果表明,近6年来在我国5个省区养鸡业中流行的IBDV主要为vvIBDV毒株,而且所有分离株VP2基因高变区均缺乏明显的时间和地域的遗传特征。 展开更多
关键词 RT-PCR 限制性内切酶分析技术 超强毒株 经典毒株 变异株 VP2基因高变区 分子流行病学
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福建省2011年病毒性脑炎暴发病原Echo30分子流行病学分析 被引量：22
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作者 杨秀惠 严延生 +6 位作者 翁育伟 何爱华 张红榕 陈炜 许江阳 林其财 周勇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期265-269,共5页
目的了解福建省2011年病毒性脑炎暴发的病原特点及福建省近10年Echo30分子流行病学特征。方法应用细胞培养法获得病毒株,微量血清中和试验或RT-PCR序列分析鉴定Echo30血清型,提取病毒RNA核酸,逆转录为cD-NA,分段扩增VP1基因序列全长,测... 目的了解福建省2011年病毒性脑炎暴发的病原特点及福建省近10年Echo30分子流行病学特征。方法应用细胞培养法获得病毒株,微量血清中和试验或RT-PCR序列分析鉴定Echo30血清型,提取病毒RNA核酸,逆转录为cD-NA,分段扩增VP1基因序列全长,测定并分析扩增产物的序列。结果 2011年4月1日-6月2日,从福建省4个县(市)区病毒性脑炎病例标本中分离的病毒经鉴定均为Echo30;VP1基因序列分析显示,泉州市安溪和德化两地流行株高度同源(核苷酸与氨基酸序列同源性分别为99.0%和99.6%),同福安和厦门流行株(核苷酸与氨基酸序列同源性分别为98.5%和100%)核苷酸差异约9%,3个位点氨基酸出现了变异。近10年福建省Echo30分子流行病学分析显示,2011年泉州流行株并非由2005年当地流行株进化而来,而与2008年河南省分离株(HQ625646-Henan/04/2008)同源性最高;近10年福建省Echo30存在多基因型、多谱系的同时传播,并在2006年发现了两株第III新基因型病毒。结论造成2011年福建省病毒性脑炎暴发的病原为Echo30,且至少存在两条不同传播链病毒同时流行。Echo30福建株呈多基因型、多谱系分布流行特点。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 ECHO30 VP1基因 分子流行病学
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1997-2005年中国水禽新城疫分子流行病学特点分析 被引量：22
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作者 刘华雷 郑东霞 +4 位作者 孙承英 徐天刚 王永坤 吴延功 王志亮 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期145-148,共4页
对1997-2005年从国内分离到的10株水禽源新城疫病毒(NDV)进行了生物学特性和遗传特性研究。致病指数MDT和ICPI测定结果表明10株分离株均属于强毒株。采用RT-PCR扩增了各分离株F基因主要功能区片段(535 bp)并进行了序列分析。10株分离株... 对1997-2005年从国内分离到的10株水禽源新城疫病毒(NDV)进行了生物学特性和遗传特性研究。致病指数MDT和ICPI测定结果表明10株分离株均属于强毒株。采用RT-PCR扩增了各分离株F基因主要功能区片段(535 bp)并进行了序列分析。10株分离株F蛋白裂解位点的氨基酸组成均为112RRQKRF117,具有典型的强毒特征,与致病指数测定结果一致。参照国内外已发表的部分毒株的F基因序列,构建NDV的遗传进化树,分析毒株间的遗传进化关系。遗传进化树分析表明10株NDV分离株中有8株属于基因Ⅶd型,1株属于基因Ⅶc型,1株属于基因Ⅸ型。表明基因Ⅶ型NDV是造成中国水禽近年来发生新城疫的主要原因,与同期中国鸡群发生新城疫感染的流行特点一致。 展开更多
关键词 新城疫病毒 水禽 分子流行病学
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四川地区腹泻仔猪群猪圆环病毒Ⅱ型分子流行病学调查 被引量：20
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作者 赵军 周桐枫 +4 位作者 刘鹏娟 黄剑波 姜子义 朱玲 徐志文 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期546-549,共4页
为了解四川地区腹泻仔猪群中猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)的感染情况,本实验采用PCR方法对病料样品进行PCV2检测,并对分离的病毒DNA进行测序及生物信息学分析。结果显示PCV2感染率为71.6%(312/436),阳性结果中肠系膜淋巴结检出率为100%(312/312... 为了解四川地区腹泻仔猪群中猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)的感染情况,本实验采用PCR方法对病料样品进行PCV2检测,并对分离的病毒DNA进行测序及生物信息学分析。结果显示PCV2感染率为71.6%(312/436),阳性结果中肠系膜淋巴结检出率为100%(312/312)。将扩增并测序的19条PCV2序列与Gene Bank中23株参考序列比较分析,构建了系统进化树,结果表明四川省腹泻仔猪群感染PCV2基因型主要为PCV2b、PCV2d基因型。针对PCV2高频突变ORF2基因编码的Cap蛋白氨基酸序列进行生物信息学分析,结果显示主要抗原表位氨基酸位点存在替换,进而引起抗原漂移,这可能促使PCV2免疫原性发生改变。本研究为四川地区PCV2的防制奠定了基础。 展开更多
关键词 腹泻仔猪 圆环病毒Ⅱ型 CAP蛋白 分子流行病学
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