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余甘子转录组与SSR信息分析及分子标记开发
1
作者 王建超 张小艳 +2 位作者 谢丽雪 张立杰 李韬 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第3期35-45,共11页
【目的】明确余甘子转录组SSR位点的分布特征,开发余甘子SSR分子标记技术,为余甘子的亲缘关系鉴定、遗传育种和创新利用提供理论依据。【方法】以6份表型差异较大的余甘子叶片为材料,通过高通量测序技术获得余甘子叶非参转录组数据,分... 【目的】明确余甘子转录组SSR位点的分布特征,开发余甘子SSR分子标记技术,为余甘子的亲缘关系鉴定、遗传育种和创新利用提供理论依据。【方法】以6份表型差异较大的余甘子叶片为材料,通过高通量测序技术获得余甘子叶非参转录组数据,分析其转录组和SSR位点分布特征,设计SSR引物并进行有效性和多态性筛选,最终开发余甘子SSR分子标记技术。【结果】余甘子叶转录组测序共获得65074条基因,平均长度为1064 bp,71.77%的基因成功获得功能注释;所有基因中共获得18245个SSR位点,发生频率为21.68%,含有192种重复基元,其中A/T重复基元数目最多;多态性SSR位点共2714个,占比为14.88%,表明SSR位点可用于遗传多样性分析的潜力较大。对18245个含有SSR位点的基因进行SSR引物设计,共设计出12488对SSR引物,成功率为73.88%,其中7602对引物的重复基元为单核苷酸,占比为60.87%。随机挑选154对引物进行SSR位点有效性和多态性分析,筛选出10对扩增条带清晰且多态性较好的SSR引物,这10对SSR引物重复基元分别为二核苷酸7个,三核苷酸1个和五核苷酸2个,扩增产物大小为127~270 bp,平均为220.5 bp。【结论】多态性SSR位点用于余甘子遗传多样性分析的潜力较大,筛选出10对扩增条带清晰且多态性较好的SSR引物。 展开更多
关键词 余甘子 转录组 SSR 引物筛选 分子标记
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种子休眠基因Sdr4的生物信息学分析与分子标记开发和应用
2
作者 黄奇娜 姜鸿瑞 +3 位作者 杨婕 于坤宇 杨长登 梁燕 《中国水稻科学》 北大核心 2026年第1期61-71,共11页
【目的】水稻收获前穗发芽严重制约产量与品质形成,该性状主要受种子休眠基因调控。解析种子休眠分子机制对改良水稻穗萌抗性具有重要理论价值与育种意义。【方法】综合运用生物信息学分析、分子标记开发及标记辅助选择技术,系统解析种... 【目的】水稻收获前穗发芽严重制约产量与品质形成,该性状主要受种子休眠基因调控。解析种子休眠分子机制对改良水稻穗萌抗性具有重要理论价值与育种意义。【方法】综合运用生物信息学分析、分子标记开发及标记辅助选择技术,系统解析种子休眠基因Sdr4(Seed dormancy 4)的生物学功能,探究其分子标记在多基因型种质改良中的应用潜力。【结果】Sdr4启动子区含TATA-box等核心元件及ABA响应元件等多种顺式作用元件,其编码蛋白为低稳定性疏水蛋白(101~150氨基酸区段磷酸化修饰占比25.93%),三级结构以α-螺旋(15.50%)、β-折叠(15.50%)和无规则卷曲(66.37%)为主。3K单倍型数据库与AlphaFold分析表明Sdr4基因具有6种功能性突变的单倍型,且在强休眠种质Kasalath与弱休眠种质日本晴(Nipponbare)的Sdr4氨基酸序列存在多个位点差异。系统发育分析显示Sdr4在非洲栽培稻(Oryza glaberrima)与沼生菰(Zizania palustris)中具有高度保守性。通过Kasalath与日本晴的Sdr4等位变异,开发了Sdr4-KF/KR与Sdr4-PF/PR两对功能标记,可精准区分种子休眠强度。基于25个水稻品种的分子检测筛选出休眠性显著差异的种质,并利用上述标记成功创制了强休眠型中组18改良系。【结论】Sdr4通过调控种子休眠深度影响水稻穗萌抗性。分子标记筛选表明20个主栽品种均呈种子弱休眠表型,利用Sdr4特异性标记选育的K17与K88新品系具有显著穗萌抗性。本研究为Sdr4功能解析及水稻抗穗萌分子育种提供了理论支撑与技术储备。 展开更多
关键词 穗发芽 Sdr4 水稻 生物信息学 分子标记辅助选择
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应用ISSR分子标记鉴定天麻杂交后代研究
3
作者 崔丽丽 冯志伟 +5 位作者 郭鸿莹 陈曦 金美伶 王继阳 常彤 宋超 《特产研究》 2026年第1期91-96,共6页
杂交后代纯度是天麻种质创新的关键,纯度鉴定技术作为1杂交种鉴定评价的工具至关重要。为鉴定天麻杂交种的遗传纯度,本文利用ISSR分子标记技术对天麻杂交种及其亲本进行分析,从20条有效引物中筛选出5条特异性引物(编号为807,834,835,841... 杂交后代纯度是天麻种质创新的关键,纯度鉴定技术作为1杂交种鉴定评价的工具至关重要。为鉴定天麻杂交种的遗传纯度,本文利用ISSR分子标记技术对天麻杂交种及其亲本进行分析,从20条有效引物中筛选出5条特异性引物(编号为807,834,835,841,873)。结果表明,5条引物可快速有效地辨别杂交种,对供试杂交天麻后代的鉴定率为100%。聚类分析显示,WH01和WH02杂交F1代均与亲本红天麻的遗传关系最近,而WH03杂交后代与亲本遗传关系都较远。ISSR分子标记技术可准确、快速鉴定天麻杂交后代真实性,F1代和亲本之间、F1代之间都存在丰富的遗传变异。 展开更多
关键词 天麻 杂交 ISSR分子标记技术 种子纯度 鉴定
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水稻恢复系广亲和基因和恢复基因分子标记鉴定及农艺性状分析
4
作者 张金霞 黄金华 +7 位作者 李畅 孙建权 胡秀明 殷春渊 王和乐 张倩倩 张玉红 刘贺梅 《江苏农业科学》 北大核心 2026年第2期79-85,共7页
为了培育花粉量大、恢复力强、配合力高、农艺性状优异的杂交粳稻恢复系,并为建立高产优质抗逆杂交粳稻育种体系提供核心亲本资源,利用“籼粳架桥”方法,筛选遗传背景差异较大的种质材料进行杂交,从而导入籼稻遗传成分,对不同亚种以及... 为了培育花粉量大、恢复力强、配合力高、农艺性状优异的杂交粳稻恢复系,并为建立高产优质抗逆杂交粳稻育种体系提供核心亲本资源,利用“籼粳架桥”方法,筛选遗传背景差异较大的种质材料进行杂交,从而导入籼稻遗传成分,对不同亚种以及不同生态型中的有利基因进行重组,利用广亲和基因(S5-n)和育性恢复基因(Rf1a)分子标记对200份水稻恢复系材料进行PCR扩增检测,同时结合表型性状进行综合评价,系统考察播始历期、株高、单株有效穗数、穗长、每穗着粒数、每穗实粒数、千粒重、每穗着粒密度以及结实率等关键农艺性状。结果表明,在200份材料中,有80份同时含有广亲和基因(S5-n)和育性恢复基因(Rf1a),综合农艺性状分析,最终筛选出产量高(单株实粒重>46g)、结实率高(>80.0%)以及含有目标基因的新恢复系材料7份,可作为杂交组合的父本资源。通过建立分子标记-表型性状综合评价体系可显著提升恢复系选育效率,为杂交粳稻恢复系新品系的选育及亲本组配提供较好的遗传信息,为培育广适性杂交粳稻新品种提供优良的种质资源。 展开更多
关键词 水稻 恢复系 广亲和基因 恢复基因 分子标记 农艺性状
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基于KASP分子标记的木薯种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
5
作者 丘鸿 王明 +7 位作者 肖鑫辉 李开绵 叶剑秋 应东山 杨延青 孟俊霖 袁爱娟 宁佳慧 《南方农业学报》 北大核心 2026年第1期43-53,F0002,共12页
【目的】基于全基因组重测序数据开发木薯KASP分子标记,利用其对木薯种质进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建,以期为木薯种质鉴定、优异资源挖掘及新品种选育提供分子工具和理论参考。【方法】基于377份木薯种质全基因组重测序数据,... 【目的】基于全基因组重测序数据开发木薯KASP分子标记,利用其对木薯种质进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建,以期为木薯种质鉴定、优异资源挖掘及新品种选育提供分子工具和理论参考。【方法】基于377份木薯种质全基因组重测序数据,以位点完整性、次要等位基因频率、杂合率、多态性信息含量(PIC)、GC含量、序列同源性、连续单碱基重复及位点分布密度等条件,筛选出高多态性KASP分子标记,并对184份木薯种质资源进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建。【结果】从木薯全基因组重测序数据中位于基因组不同位置的52722个SNP位点进行筛选,最终获得了9443个SNP位点。从木薯的18条染色体上分别选择分布相对均匀的20个SNP位点,共计360个位点。利用360对KASP引物对22份木薯种质进行引物初筛,筛选出27个高多态性KASP分子标记。通过27个KASP分子标记对184份木薯种质资源的遗传多样性分析,结果显示,主要等位基因频率(MAF)为0.440~0.842,平均为0.637;基因多样性(GD)为0.270~0.591,平均为0.464,有26个KASP分子标记的GD高于0.300;观测杂合度(Ho)为0.173~0.538,平均为0.344,45.3%KASP分子标记的Ho分布在0.300~0.400;PIC为0.234~0.545,85.18%KASP分子标记的PIC大于0.300,显示出较高的多态性。184份木薯种质被划分为9个类群,群体划分与其地理来源未呈明显相关性,说明木薯种质间存在较高程度的基因交流与混合。将27个KASP分子标记分型结果转为二元编码数据,构建184份木薯种质资源的DNA指纹图谱,有效地揭示不同木薯种质之间的遗传差异。【结论】基于木薯全基因组重测序数据开发出27个KASP分子标记,能有效评估木薯种质遗传多样性,并鉴定种质间的亲缘关系,可用于木薯种质资源鉴定、基因定位及分子标记辅助育种。 展开更多
关键词 木薯 KASP分子标记 遗传多样性分析 DNA指纹图谱 聚类分析
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荔枝LcGAMYB基因家族鉴定及矮化相关分子标记开发
6
作者 符书英 杨明超 +6 位作者 陈丁 何玉坤 邓海达 陈哲 严婷婷 王祥和 胡福初 《热带作物学报》 北大核心 2026年第3期588-602,共15页
矮化是荔枝重要的育种与栽培性状。本研究以矮化相关的候选基因LcGAMYB23为核心,基于前期QTL定位结果,系统评估MYB家族背景及其分子应用潜力。通过全基因组层面的生物信息学鉴定,共获得151个LcMYB家族成员。保守基序与结构域解析表明,... 矮化是荔枝重要的育种与栽培性状。本研究以矮化相关的候选基因LcGAMYB23为核心,基于前期QTL定位结果,系统评估MYB家族背景及其分子应用潜力。通过全基因组层面的生物信息学鉴定,共获得151个LcMYB家族成员。保守基序与结构域解析表明,所有成员均含Myb_DNA-binding结构域,表明该家族在荔枝中序列保守性较高。进一步克隆并比对3个乔化荔枝品种(9918、妃子笑、三月红)和3个矮化荔枝品种(糯米糍、鸭姆笼、紫娘喜)的LcGAMYB23序列,发现两类材料在该基因上存在稳定的序列差异。基于差异单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点设计分子标记,并在70个品种中验证,结果显示,该标记可在cDNA水平有效区分乔化与矮化类型,且在DNA水平判别结果一致。上述结果为荔枝矮化性状的分子分型与分子辅助育种提供了有效工具,并为LcGAMYB23的功能阐释奠定基础。 展开更多
关键词 荔枝 LcGAMYB23 基因家族 生物信息学分析 分子标记
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棉花纤维长度GhCRK26-1931 SNP分子标记的开发及应用
7
作者 李静 庞博 +6 位作者 耿世伟 张茹 陈佳林 宋武 马晶晶 李生梅 高文伟 《江苏农业学报》 北大核心 2026年第3期464-474,共11页
纤维长度作为棉花纤维品质的核心指标,其分子标记的开发对加速育种进程具有重要意义。本研究基于混合分组分析结合全基因组测序(BSA-seq)的定位开发了与棉花纤维长度相关的分子标记GhCRK26-1931 SNP,并系统评价了其应用价值。通过对512... 纤维长度作为棉花纤维品质的核心指标,其分子标记的开发对加速育种进程具有重要意义。本研究基于混合分组分析结合全基因组测序(BSA-seq)的定位开发了与棉花纤维长度相关的分子标记GhCRK26-1931 SNP,并系统评价了其应用价值。通过对512份棉花品种(系)的竞争性等位基因特异性PCR(KASP)基因分型和表型分析发现,供试材料表现出丰富的遗传多样性,海岛棉与陆地棉回交群体纤维极端材料、陆地棉种质材料和海岛棉种质材料纤维长度存在明显表型变异,变异系数范围为3.48%~9.65%,基于纤维长度等表型数据的聚类分析将材料划分为4大类群。验证试验结果显示,GhCRK26-1931 SNP分子标记在海岛棉与陆地棉回交群体亲本系9和新海16中的基因分型结果与BSA-Seq数据完全一致:系9为TT基因型,新海16为CC基因型;在60份海岛棉与陆地棉回交群体极端材料中,CC基因型(37份)和TT基因型(23份)的纤维长度存在显著差异(P<0.05),且TT基因型纤维长度均值小于CC基因型;进一步在305份陆地棉(Gossypium hirsutum)和145份海岛棉(Gossypium barbadense)种质材料中均观察到类似规律,TT基因型材料的纤维长度均值小于CC基因型(P<0.05)。综上,GhCRK26-1931 SNP分子标记可有效用于棉花纤维长度的选择育种,其中CC基因型对纤维长度具有正向调控效应。本研究不仅为优质棉花品种的选育开辟了新途径,也为棉花纤维品质的分子标记辅助选择提供了可靠工具。 展开更多
关键词 棉花 纤维长度 CRK26基因 KASP-SNP分子标记
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基于CAPS分子标记构建蒙农S007饲用大豆DNA指纹图谱
8
作者 高佳荷 唐芳 +3 位作者 王勇 索荣臻 王明玖 罗四维 《中国草地学报》 北大核心 2026年第2期19-27,共9页
为提高饲用大豆品种鉴定的准确性与检测效率,本研究以内蒙古农业大学新育成品种蒙农S007饲用大豆(简称S007)为研究对象,以其亲本野大豆和其他饲用大豆品种(品系)为对照,并选取6个国内外广泛应用的栽培大豆品种作为验证材料。基于全基因... 为提高饲用大豆品种鉴定的准确性与检测效率,本研究以内蒙古农业大学新育成品种蒙农S007饲用大豆(简称S007)为研究对象,以其亲本野大豆和其他饲用大豆品种(品系)为对照,并选取6个国内外广泛应用的栽培大豆品种作为验证材料。基于全基因组重测序数据,筛选可被限制性内切酶酶切的SNP位点,开发稳定的酶切扩增多态性序列(Cleaved amplified polymorphic sequences,CAPS)分子标记,验证其稳定性和有效性,并构建可明确区分S007的DNA指纹图谱。研究结果表明,4个CAPS分子标记的SNP位点分别为:大豆6号染色体46861483位置的T-C突变在S006和S007中可被BglⅡ酶切;9号染色体47583653位置的C-A突变在野大豆和S007中不可被BglⅡ酶切;9号染色体50331067位置的T-C突变在S003和S007中不可被BglⅡ酶切;11号染色体8555794位置的C-G突变在S007和黑豆8-4-1中可被BglⅡ酶切。由此构建的蒙农S007饲用大豆的指纹图谱分子标记模式为“+——+(—)”(“+”表示可酶切,“-”表示不可酶切,“(—)”表示杂合),具备高度的品种特异性。基于上述4个CAPS标记构建的指纹图谱,可完全区分包括S007在内的9个参试大豆品种。本研究建立的方法为饲用大豆品种鉴定提供了一种高效、精准且低成本的技术方案,可为新品种审定、推广及其他植物指纹图谱构建提供参考。 展开更多
关键词 饲用大豆 CAPS分子标记 DNA指纹图谱 品种鉴定
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大豆高油高产相关基因分子标记开发及信息数据库建立
9
作者 穆萃 黄婧贻 +5 位作者 魏思明 胡利民 徐畅 刘春燕 齐照明 陈庆山 《大豆科技》 2026年第1期1-10,共10页
提高大豆单产,改良大豆品质是大豆育种重要目标。文章对与大豆油分及产量相关重要性状基因进行筛选获得284个功能位点,开发了16个大豆油分和产量相关KASP标记,并建立信息数据库。结果表明,与688份大豆种质已重测序结果相较,油分相关标... 提高大豆单产,改良大豆品质是大豆育种重要目标。文章对与大豆油分及产量相关重要性状基因进行筛选获得284个功能位点,开发了16个大豆油分和产量相关KASP标记,并建立信息数据库。结果表明,与688份大豆种质已重测序结果相较,油分相关标记中高油标记符合率为53.88%~97.35%;产量标记中高产标记符合率为57.58%~96.48%。通过整合基因型与表型数据建立的信息矩阵数据库为http://202.118.166.101:8000/index/。此研究开发的分子标记有助于大豆分子标记辅助选择及培育高油高产大豆新品种。 展开更多
关键词 大豆 高油高产 分子标记 KASP
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72份水稻种质材料中抗白叶枯病分子标记检测分析
10
作者 何颖 许泽良 +3 位作者 张弘 周鸿凯 莫俊杰 杨善 《广东农业科学》 2026年第1期35-47,共13页
【目的】为应对白叶枯病对水稻生产安全构成的挑战,明确72份水稻种质材料中白叶枯病抗性基因情况。【方法】以广东海洋大学海水稻种质资源库的72份水稻种质材料为试验对象,提取水稻总DNA,通过特异分子标记技术对Xa1、Xa5、Xa7、Xa13、X... 【目的】为应对白叶枯病对水稻生产安全构成的挑战,明确72份水稻种质材料中白叶枯病抗性基因情况。【方法】以广东海洋大学海水稻种质资源库的72份水稻种质材料为试验对象,提取水稻总DNA,通过特异分子标记技术对Xa1、Xa5、Xa7、Xa13、Xa21、Xa23、Xa26、Xa27等8个已知的白叶枯病抗性基因进行聚合酶链反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳检测与分析,并利用软件NTsyspc 2.10e对电泳数据进行聚类分析。【结果】72份水稻种质材料均检测到白叶枯病抗性基因,且每份种质材料均至少同时携带2个抗性基因。其中,R1141和D2两份种质材料同时携带5个抗性基因,分别为Xa1、Xa5、Xa7、Xa23、Xa26;53份种质材料同时携带3个抗性基因,占73.61%。共有51份种质材料携带相同抗性基因组合,均为Xa1、Xa5、Xa26。Xa1、Xa26、Xa5被检测出的频率最高,分别为98.61%、93.06%和91.67%。聚类分析将72份水稻种质材料划分为三大类:第Ⅰ类包含64份材料,均同时携带Xa1、Xa26两个抗性基因;第Ⅱ类包含5份材料,均同时携带Xa1、Xa5两个抗性基因;第Ⅲ类包含3份材料,均同时携带Xa1、Xa7、Xa23、Xa26等4个抗性基因。【结论】水稻种质材料中所含白叶枯病抗性基因同质化严重、多态性较低,同时携带Xa1、Xa5和Xa26的材料占比高达71%。然而,同时携带5个抗性基因的种质材料仅2份,可作为抗病基因的来源亲本,加强创新利用。今后应加强保护水稻野生资源材料和抗白叶枯病的地方水稻种质材料,保护水稻种质材料的多样性,挖掘更多抗白叶枯病新基因,并在杂交育种中广泛利用以拓宽水稻抗白叶枯病血缘,选育更多聚合不同抗病基因组合的新材料。 展开更多
关键词 水稻 白叶枯病 抗性基因 分子标记 抗病育种
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茶树种质资源DNA分子标记研究综述
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作者 熊元元 马伟伟 +2 位作者 李春华 王云 王小萍 《四川农业科技》 2026年第1期147-151,157,共6页
茶树种质资源是茶学科研原始创新的核心载体,既为茶科技突破提供支撑,也是茶产业高质量升级的关键保障。本文梳理了茶树种质资源研究中五类主流分子标记技术的应用现状,包括:随机扩增多态性(RAPD),简单序列重复(SSR)、简单序列重复区间(... 茶树种质资源是茶学科研原始创新的核心载体,既为茶科技突破提供支撑,也是茶产业高质量升级的关键保障。本文梳理了茶树种质资源研究中五类主流分子标记技术的应用现状,包括:随机扩增多态性(RAPD),简单序列重复(SSR)、简单序列重复区间(ISSR)、起始密码子靶向多态性(SCoT、单核苷酸多态性(SNP),各技术在种质鉴定、遗传分析等场景各具优势。为推动茶树种质资源创新利用,本文提出四大研究展望:一是研发新型分子标记技术,突破现有局限;二是加强多组学技术联合应用,揭示性状遗传机制;三是深化重要性状基因挖掘与关联分析,为育种提供靶点;四是加速分子标记辅助育种产业化,缩短育种周期。 展开更多
关键词 茶树 种质资源 DNA分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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山桐子转录组SSR特征分析及其分子标记开发与应用
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作者 顾云映 刘星 +1 位作者 邱祥婷 刘杰 《南方农业学报》 北大核心 2026年第1期256-266,共11页
【目的】基于转录组测序数据从山桐子叶片中挖掘SSR位点并进行分析,评估SSR标记的可用性和多态性,为山桐子种质资源收集与保存及分子标记开发提供理论参考。【方法】以山桐子叶片为材料,利用MISA对转录组测序数据进行SSR位点检索并分析... 【目的】基于转录组测序数据从山桐子叶片中挖掘SSR位点并进行分析,评估SSR标记的可用性和多态性,为山桐子种质资源收集与保存及分子标记开发提供理论参考。【方法】以山桐子叶片为材料,利用MISA对转录组测序数据进行SSR位点检索并分析其特征,使用Primer 5.0设计SSR引物,通过SSR-PCR验证开发其多态性引物。【结果】利用MISA筛选获得的18300条Unigenes共有8182条含SSR位点,占序列总数的44.71%;共有11767个SSR位点,平均分布距离为1.74 kb。完全型SSR位点数量为10721个,占总SSR位点的91.11%。SSR重复类型中以单核苷酸重复数量最多,共6384个,占总SSR位点的54.25%;二核苷酸次之,共2223个,占总SSR位点的18.89%;五核苷酸重复数量最少,仅36个,占总SSR位点的0.31%。共发现257种重复基元,在单核苷酸重复基元中,A/T数量最多,共6222个,占总SSR位点的52.88%;二核苷酸重复基元中,CT/AG数量最多,共701个,占总SSR位点的5.96%,其次为TC/GA,共664个,占总SSR位点的5.64%。在基元重复次数中,重复次数为10的SSR位点数量最多,共2434个,占总SSR位点的20.68%,且以单核苷酸重复数量最多,为2263个,占比为92.97%。10721个SSR位点长度为10~84 bp,平均长度为14.99 bp,位点长度主要集中在10~42 bp,该区间内共有10697个SSR位点,占总SSR位点的90.91%;具有高多态性(SSR长度≥20 bp)的SSR位点共1941个,占总SSR位点的16.50%。基于16份山桐子种质资源对随机选取的70对SSR引物进行验证,共有65对引物可扩增出目标条带,有效扩增率为92.86%,其中16对引物可扩增出多态性条带。利用6对多态性引物对16份山桐子样品进行聚类分析,在遗传相似系数0.78处,16份样品可分为2类。【结论】山桐子叶片转录组中SSR位点类型丰富,共获得16对多态性引物,具有开发出高多态性SSR分子标记的潜力,可用于山桐子遗传多样性分析、分子标记育种和资源保护。 展开更多
关键词 山桐子 转录组 SSR特征分析 分子标记
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宁夏玉米骨干自交系抗茎腐病分子标记鉴定与基因型分析
13
作者 张茜 石磊 +1 位作者 关雅静 李新 《种子科技》 2026年第2期1-4,共4页
对宁夏地区63份玉米骨干自交系进行了茎腐病抗性鉴定与基因型分析,通过田间表型评价与分子标记检测,筛选出SSRZ33、umc2069、IDP2347及bnlg1444与田间抗性表型高度关联的有效标记,为宁夏玉米抗茎腐病分子育种提供了技术依据与材料基础。
关键词 宁夏玉米自交系 茎腐病 分子标记
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小偃麦衍生系抗旱基因功能分子标记检测及效应分析
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作者 常利芳 乔彦玮 +6 位作者 郭慧娟 乔麟轶 张树伟 陈芳 李欣 畅志坚 张晓军 《山西农业科学》 2026年第1期70-80,共11页
为进一步明确小偃麦衍生系抗旱等位基因组成,采用5个小麦抗旱基因TaNRX-B1、TaDreb-B1、TaPYL1-1B、TaBADH-A1和TaDRO-5B的功能分子标记检测了175份小偃麦衍生系,并结合萌发期13个抗旱指标的抗旱系数和综合评价D值,分析了各等位基因的... 为进一步明确小偃麦衍生系抗旱等位基因组成,采用5个小麦抗旱基因TaNRX-B1、TaDreb-B1、TaPYL1-1B、TaBADH-A1和TaDRO-5B的功能分子标记检测了175份小偃麦衍生系,并结合萌发期13个抗旱指标的抗旱系数和综合评价D值,分析了各等位基因的抗旱效应。结果显示,5个抗旱等位基因在小偃麦衍生系中的频率总体偏低,其中,TaDreb-B1a的频率最高,为38.86%;TaDRO-5B基因的Hap-5B-I的频率最低,为5.14%。在117份中等以上抗旱性衍生系中,2份携带4个抗旱等位基因的衍生系CH6310(TaDreb-B1a/TaBADH-A1b/TaPYL1-1B^(In-442)/Hap-5B-I)和CH1539(TaNRX-B1a/TaDreb-B1a/TaBADH-A1b/Hap5B-I)均为强抗旱种质;13份强抗旱衍生系未检测到任何抗旱等位基因,可能存在未知的抗旱相关基因。携带抗旱等位基因TaDreb-Bla、TaPYL1-1B^(In-442)和Hap-5B-I种质的多数指标抗旱系数均值高于携带其干旱敏感等位基因的衍生系,且抗旱等位基因与多个指标抗旱系数呈显著正相关,抗旱效应较高。因此,抗旱基因TaDreb-B1、TaPYL1-1B和TaDRO-5B的功能标记能够有效用于小偃麦衍生系抗旱基因型检测及分子标记辅助选择育种。 展开更多
关键词 小偃麦衍生系 抗旱基因 功能分子标记 等位基因 抗旱系数
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依据表型指标和分子标记的红松种子园遗传多样性分析
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作者 马晓雨 高源 尚福强 《东北林业大学学报》 北大核心 2026年第4期16-24,共9页
为明确红松种子园的遗传背景,以辽宁省森林经营研究所实验林场红松一代无性系种子园24个无性系为材料,通过分析13个表型指标在各红松无性系间差异与多样性,并利用SSR标记技术从分子水平分析红松种子园遗传多样性,进而构建各红松无性系... 为明确红松种子园的遗传背景,以辽宁省森林经营研究所实验林场红松一代无性系种子园24个无性系为材料,通过分析13个表型指标在各红松无性系间差异与多样性,并利用SSR标记技术从分子水平分析红松种子园遗传多样性,进而构建各红松无性系的分子身份证。结果表明:红松种子园在表型和分子水平上均存在较为丰富的遗传多样性。13个表型指标变异系数介于7.48%~91.77%,均值为23.67%,其中,生长性状和种实性状的变异系数均值分别为18.90%、31.30%;Shannon-Weaver多样性指数介于0.928~2.084,均值为1.908,生长性状和种实性状的多样性指数均值分别为1.890、1.938,说明红松种子园不同无性系生长性状数值的高低差异较大,在种实性状上数值分级更为丰富。在分子标记结果中,10对SSR引物在24个红松无性系中共检测出43个等位基因,有效等位基因数、Shannon信息指数、期望杂合度、观测杂合度均值分别为2.207、0.906、0.476、0.421;表型和SSR聚类均将红松种子园内无性系分为3大类群,但类群内系号差异较大,并通过3对高效引物构建了24个红松无性系的分子身份证,分辨率达100%。 展开更多
关键词 红松 表型指标 分子标记 遗传多样性
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利用分子标记辅助选择改良两系不育系33S稻瘟病抗性和米质的研究
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作者 张屹 谢红军 +4 位作者 曾晓珊 肖峰 汤国华 朱明东 余应弘 《中国稻米》 北大核心 2026年第2期113-117,共5页
33S为晚稻专用型两用核不育系,配合力好,所配系列组合表现出生育期短、产量高、抗倒性好等特点,深受市场欢迎。田间鉴定33S感染的叶瘟与穗瘟均为9级,稻米直链淀粉含量达到24.9%,大大限制了该不育系在生产上的配组应用。本研究利用定向... 33S为晚稻专用型两用核不育系,配合力好,所配系列组合表现出生育期短、产量高、抗倒性好等特点,深受市场欢迎。田间鉴定33S感染的叶瘟与穗瘟均为9级,稻米直链淀粉含量达到24.9%,大大限制了该不育系在生产上的配组应用。本研究利用定向回交和分子标记辅助选择相结合的技术,快速聚合稻瘟病抗性基因Pigm和直链淀粉含量调控基因Wxb,获得了2个携带双基因的33S改良株系。经抗性鉴定和稻米品质分析,改良系HS4和HS5的稻瘟病综合抗性指数分别为3.5、2.3,稻米直链淀粉含量分别为11.7%、11.6%。用同一父本分别与改良系和33S配组,所配组合的其他主要农艺性状无显著差异。全基因重测序比较显示,改良系HS4和HS5的背景回复率分别达到96.67%和97.79%。本研究结果表明,聚合Pigm和Wxb基因能显著提高稻瘟病抗性、改善稻米品质,实现对33S抗性和优良食味的定向改良。 展开更多
关键词 水稻 分子标记辅助选择 稻瘟病 直链淀粉含量 定向改良
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速生林木抗逆性分子标记辅助育种技术优化
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作者 张萍 《花卉》 2026年第2期133-135,共3页
针对速生林木抗逆性分子标记辅助育种技术效率低、周期长的技术瓶颈,以山东滨州地区速生杨、速生白蜡为研究对象,开展了基于脱水应答元件结合蛋白(DREB)转录因子家族的分子标记技术优化研究。通过DREB基因挖掘与序列分析,设计开发了简... 针对速生林木抗逆性分子标记辅助育种技术效率低、周期长的技术瓶颈,以山东滨州地区速生杨、速生白蜡为研究对象,开展了基于脱水应答元件结合蛋白(DREB)转录因子家族的分子标记技术优化研究。通过DREB基因挖掘与序列分析,设计开发了简单重复序列-单核苷酸多态性(SSR?鄄SNP)联合分子标记体系,建立了高通量标记检测技术平台。采用盐碱胁迫实验验证了优化技术的应用效果,结果表明优化后的分子标记辅助选择准确率显著提升,育种周期较传统方法缩短一半以上。该技术体系为速生林木抗逆品种快速选育提供了高效技术途径。 展开更多
关键词 速生林木 抗逆性 分子标记 辅助育种 DREB基因
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基于SRAP分子标记分析贵州芝麻种质资源的遗传多样性
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作者 潘金卫 杨航 +4 位作者 袁婷婷 向依 李慧琳 奉斌 于二汝 《贵州农业科学》 2026年第3期34-41,共8页
【目的】探明贵州芝麻种质资源的遗传多样性,为保存和利用芝麻种质资源提供参考依据。【方法】以贵州安顺、毕节、黔东南、黔南、铜仁和遵义的70份芝麻种质为材料,利用SRAP引物对植株叶片进行PCR扩增,分析多态位点、Nei’s基因多样性指... 【目的】探明贵州芝麻种质资源的遗传多样性,为保存和利用芝麻种质资源提供参考依据。【方法】以贵州安顺、毕节、黔东南、黔南、铜仁和遵义的70份芝麻种质为材料,利用SRAP引物对植株叶片进行PCR扩增,分析多态位点、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon信息指数(I)等遗传参数。【结果】16对SRAP引物组合对70份芝麻种质共检测到232个位点,其中多态性位点116个。70份芝麻种质的Nei’s基因多样性指数(H)为0.2881,Shannon信息指数(I)为0.4482;遗传相似系数为0.4224~0.8276,均值0.6364。根据地理来源将贵州70份芝麻种质划分为6个组群,Nei’s基因多样性指数(H)为0.1607~0.2966,Shannon信息指数(I)为0.2346~0.4497,遗传一致度为0.8575~0.9980,遗传距离为0.0020~0.1537。UPGMA遗传聚类可在遗传相似系数为0.63处将70份芝麻种质分为5个类群。【结论】贵州芝麻种质资源遗传多样性较丰富;遵义与黔南芝麻的遗传一致度最高,铜仁与安顺芝麻遗传一致度最低;遗传关系聚类结果与地理来源无必然联系。 展开更多
关键词 芝麻 种质资源 SRAP引物 分子标记 遗传多样性
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分子标记辅助选择技术在玉米遗传改良中的应用与展望
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作者 王业建 王小东 +3 位作者 唐怀君 张磊 高升旗 刘成 《农业工程》 2026年第3期34-39,共6页
分子标记辅助选择(MAS)技术作为现代作物遗传育种的重要组成部分,已发展成为玉米遗传改良的有效手段。系统综述MAS技术在玉米遗传改良中的应用现状与未来前景,重点分析该技术在玉米抗逆性、品质、产量、株型及不育系选育等方面的具体应... 分子标记辅助选择(MAS)技术作为现代作物遗传育种的重要组成部分,已发展成为玉米遗传改良的有效手段。系统综述MAS技术在玉米遗传改良中的应用现状与未来前景,重点分析该技术在玉米抗逆性、品质、产量、株型及不育系选育等方面的具体应用案例。同时,探讨玉米MAS技术应用中存在的问题与挑战,展望MAS技术与全基因组选择、基因编辑等新兴技术融合的发展趋势,以及其在实现玉米精准育种和设计育种中的潜力。 展开更多
关键词 玉米 分子标记辅助选择 基因组编辑 遗传改良 育种技术
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风铃木类植物分子标记的研究进展与展望
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作者 陈欣然 《现代园艺》 2026年第9期61-64,共4页
风铃木(Bignoniaceae)因花色艳丽,花量密集,极具园林观赏价值,在热带、亚热带地区广泛引种,目前已成为风铃木科植物中的佼佼者。然而,目前风铃木类植物存在引种来源复杂、种质资源混乱、形态分类标准不统一以及良种选育滞后等问题。为... 风铃木(Bignoniaceae)因花色艳丽,花量密集,极具园林观赏价值,在热带、亚热带地区广泛引种,目前已成为风铃木科植物中的佼佼者。然而,目前风铃木类植物存在引种来源复杂、种质资源混乱、形态分类标准不统一以及良种选育滞后等问题。为了解决这些问题,研究人员使用多种分子标记技术(如SSR、ISSR、SNP等)在DNA分子层面对风铃木类植物进行分类鉴定和遗传多样性分析。本研究系统综述了风铃木类植物分子标记技术的研究进展,分析不同分子标记技术在风铃木类植物中的应用现状,并探讨其在遗传育种中的潜在价值,以及目前对风铃木类植物分子标记研究的不足,需进一步优化分子标记技术的应用,结合多种标记方法,提高风铃木类植物的分类准确性和遗传多样性分析的可靠性,为品种改良及景观栽培应用奠定了理论基础。通过规范其分类管理,促进其在园林景观中的更好应用。 展开更多
关键词 风铃木 分子标记 遗传多样性
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