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一种高效的多细胞分子动力学算法
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作者 金明灿 胡长军 +2 位作者 李建江 李越 韩载浩 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2013年第4期843-846,共4页
多细胞分子动力学算法是分子动力学模拟中普遍使用的并行算法.因为利用不同作用路径的多细胞分子动力学算法的消息传递次数彼此不同,利用作用路径能够优化消息传递次数.优化消息传递次数是一种设计高效并行算法的方法.因此,本文研究十... 多细胞分子动力学算法是分子动力学模拟中普遍使用的并行算法.因为利用不同作用路径的多细胞分子动力学算法的消息传递次数彼此不同,利用作用路径能够优化消息传递次数.优化消息传递次数是一种设计高效并行算法的方法.因此,本文研究十六个不同的作用路径,推导出十六个表示消息传递次数的数学模型,并在高性能通信和负载平衡方面决定十六个模型中最好的.实验结果表明模型的平均正确率是99.1391%,它的一个时间步骤的并行效率比HS算法平均提高了5.16%,处理器数的增加和截断半径的优化提高其并行效率. 展开更多
关键词 并行计算 多细胞分子动力学算法 作用路径 消息传递次数
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基于改进细胞链表算法的分子动力学模拟性能优化模型
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作者 金明灿 胡长军 +1 位作者 李建江 苗庆松 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2013年第2期12-15,共4页
在改进的细胞链表算法中,细胞大小的减少会降低该算法的通信量和粒子之间距离计算的次数,同时会增加邻居细胞的数量。多细胞分子动力学算法是分子动力学模拟中普遍使用的并行算法。将改进细胞链表算法的基本思想应用到多细胞分子动力学... 在改进的细胞链表算法中,细胞大小的减少会降低该算法的通信量和粒子之间距离计算的次数,同时会增加邻居细胞的数量。多细胞分子动力学算法是分子动力学模拟中普遍使用的并行算法。将改进细胞链表算法的基本思想应用到多细胞分子动力学算法中,推导出了一个分子动力学模拟性能评价模型,并据此提出一个优化模型来加速分子动力学模拟。实验结果表明,根据该优化模型确定的细胞大小可以提高分子动力学模拟程序的性能。 展开更多
关键词 并行计算 细胞链表算法 多细胞分子动力学算法 性能评价 细胞大小的优化
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复合固体推进剂颗粒填充模型及其统计特性分析 被引量:5
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作者 颜小婷 夏智勋 +1 位作者 那旭东 沙本尚 《国防科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第5期61-71,共11页
复合固体推进剂属于高填充比颗粒类复合材料,氧化剂和金属颗粒在基体中的随机分布使其在细观尺度具有非均质的特点。从细观尺度研究固体推进剂燃烧及力学性能时,必须考虑颗粒级配、空间分布和种类等因素的影响。采用分子动力学方法,以... 复合固体推进剂属于高填充比颗粒类复合材料,氧化剂和金属颗粒在基体中的随机分布使其在细观尺度具有非均质的特点。从细观尺度研究固体推进剂燃烧及力学性能时,必须考虑颗粒级配、空间分布和种类等因素的影响。采用分子动力学方法,以硝酸酯增塑聚醚高能复合固体推进剂为研究对象,将固体颗粒模型化为球形,生成其在基体内随机分布的颗粒填充模型。利用Monte-Carlo算法模拟计算颗粒填充模型细观结构的两点概率函数,并研究了颗粒填充体积分数、尺寸与级配等参数对其的影响规律。从统计意义上给出具有各态历经性、统计均匀性和各向同性特点的颗粒填充构型最小周期性代表体元尺寸,可有效减小后续研究的计算量,节约计算成本。所构建的推进剂细观几何构型及对最小周期性代表体元尺寸的计算为后续开展复合固体推进剂细观尺度燃烧、燃面处铝团聚及力学性能数值研究奠定了基础。 展开更多
关键词 硝酸酯增塑聚醚 固体推进剂 细观结构 分子动力学算法 两点相关函数 MONTE-CARLO方法
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Optimal multilevel thresholding based on molecular kinetic theory optimization algorithm and line intercept histogram 被引量:3
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作者 范朝冬 任柯 +1 位作者 张英杰 易灵芝 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS CSCD 2016年第4期880-890,共11页
Among all segmentation techniques, Otsu thresholding method is widely used. Line intercept histogram based Otsu thresholding method(LIH Otsu method) can be more resistant to Gaussian noise, highly efficient in computi... Among all segmentation techniques, Otsu thresholding method is widely used. Line intercept histogram based Otsu thresholding method(LIH Otsu method) can be more resistant to Gaussian noise, highly efficient in computing time, and can be easily extended to multilevel thresholding. But when images contain salt-and-pepper noise, LIH Otsu method performs poorly. An improved LIH Otsu method(ILIH Otsu method) is presented, which can be more resistant to Gaussian noise and salt-and-pepper noise. Moreover, it can be easily extended to multilevel thresholding. In order to improve the efficiency, the optimization algorithm based on the kinetic-molecular theory(KMTOA) is used to determine the optimal thresholds. The experimental results show that ILIH Otsu method has stronger anti-noise ability than two-dimensional Otsu thresholding method(2-D Otsu method), LIH Otsu method, K-means clustering algorithm and fuzzy clustering algorithm. 展开更多
关键词 image segmentation multilevel thresholding Otsu thresholding method kinetic-molecular theory (KMTOA) line intercept histogram
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