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表面等离子体共振生物分子相互作用分析的计量溯源方法研究
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作者 李兰英 陶晴 刘刚 《计量学报》 北大核心 2025年第5期748-753,共6页
根据表面等离子体共振(surface plasma resonance, SPR)生物分子相互作用分析核心原理,提出了一种以折射率为理论基础并结合蔗糖标准物质的计量溯源方法。首先制备了蔗糖标准溶液,使用折光仪对其进行定值。然后将折射率值溯源至阿贝折... 根据表面等离子体共振(surface plasma resonance, SPR)生物分子相互作用分析核心原理,提出了一种以折射率为理论基础并结合蔗糖标准物质的计量溯源方法。首先制备了蔗糖标准溶液,使用折光仪对其进行定值。然后将折射率值溯源至阿贝折射仪标准块,从而建立折射率的校准依据,实现折射率重复性检测、折射率标准值1.330~1.400范围内的线性校准,以及分析仪相对基线噪声和相对基线漂移的分析。最后,利用梯度稀释的蔗糖纯度标准物质,完成了检测限的校准。首次建立了全面、科学和有效的SPR生物分子相互作用分析的计量溯源方法,可应用于基础生命科学研究和生物医药研制领域的相关仪器计量校准应用。 展开更多
关键词 生物计量学 生物分子相互作用 表面等离子体共振 折射率 蔗糖标准物质 校准 不确定度
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阴离子-基质分子间作用调控增强PEO基离子凝胶热电性能
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作者 张睿涵 王连军 +1 位作者 江莞 孙婷婷 《东华大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期31-37,共7页
离子热电材料因其毫伏级高热电势,在热电能源转换领域展现出巨大应用前景。基于分子间相互作用,调控实现其热电势的有效增强是离子热电材料的研究热点和难点。以1-乙基-3-甲基咪唑氯(EMImCl)和1-乙基-3-甲基咪唑-双三氟甲基磺酰亚胺(EMI... 离子热电材料因其毫伏级高热电势,在热电能源转换领域展现出巨大应用前景。基于分子间相互作用,调控实现其热电势的有效增强是离子热电材料的研究热点和难点。以1-乙基-3-甲基咪唑氯(EMImCl)和1-乙基-3-甲基咪唑-双三氟甲基磺酰亚胺(EMImTFSI)两类离子液体以及聚环氧乙烷(PEO)为原料制备离子凝胶,研究离子液体与聚合物基质的分子间相互作用差异及其对热电性能的影响,并通过阴离子组分调控,实现热电性能的有效提升。研究结果表明,EMImTFSI通过阴离子TFSI^(-)中的CF_(3)与PEO的—OH和CH_(2)产生氢键作用,EMImCl则通过阴离子Cl^(-)与PEO的—OH产生分子间氢键作用,且Cl^(-)与PEO的—OH之间的分子间氢键作用强于TFSI^(-),使得PEO基底聚合物不定形区域增加,有助于EMImCl在PEO基底获得更高的阴阳离子迁移差。最终,通过上述阴离子与基质分子间相互作用调控,PEO/EMImCl热电势相比PEO/EMImTFSI提高了约38%,其值可达12.51 mV/K,这为制备高性能离子热电材料提供更多可借鉴途径。 展开更多
关键词 离子热电 分子相互作用 热电势 离子液体
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不同元素组成分子筛结构与有机结构导向剂主客体相互作用的高通量计算
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作者 李霖 王晨 +1 位作者 王嘉泽 李莉 《高等学校化学学报》 北大核心 2025年第4期1-7,共7页
分子筛是一种具有规则孔道结构的无机微孔晶体材料,广泛应用于工业吸附分离和催化过程.本文从已知的260余种分子筛拓扑结构中选取了14种能够以纯硅、硅铝和磷酸铝形式合成的拓扑结构,通过高通量计算方法探究了有机结构导向剂(OSDA)对这... 分子筛是一种具有规则孔道结构的无机微孔晶体材料,广泛应用于工业吸附分离和催化过程.本文从已知的260余种分子筛拓扑结构中选取了14种能够以纯硅、硅铝和磷酸铝形式合成的拓扑结构,通过高通量计算方法探究了有机结构导向剂(OSDA)对这些不同元素组成的分子筛骨架的结构导向作用.研究结果表明,不同的OSDA对元素组成结构的导向作用有显著差异,某些OSDA倾向于导向纯硅或硅铝结构,而另一些则更倾向于导向纯磷酸铝结构.本文所得结果不仅有助于加深对OSDA在分子筛合成中作用机制的理解,还可为设计和合成具有特定元素组成的分子筛提供理论依据. 展开更多
关键词 分子 元素组成 有机结构导向剂 主客体相互作用
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淀粉-大分子复合物的制备方法、相互作用和功能特性 被引量:1
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作者 赖海彬 高静 《食品科学》 北大核心 2025年第6期285-294,共10页
淀粉对生物大分子的包埋提高了其稳定性和生物利用度,而生物大分子又有助于改变淀粉自身的功能特性。因此,淀粉与大分子的有效结合在递送体系和功能食品等领域具有广泛的应用前景。然而,由于淀粉种类、大分子性质差异以及制备方式的不同... 淀粉对生物大分子的包埋提高了其稳定性和生物利用度,而生物大分子又有助于改变淀粉自身的功能特性。因此,淀粉与大分子的有效结合在递送体系和功能食品等领域具有广泛的应用前景。然而,由于淀粉种类、大分子性质差异以及制备方式的不同,导致各复合物在相互作用和功效等方面存在显著差异。本文综述淀粉-大分子复合物二元及三元体系的制备方法、相互作用以及功能特性,有助于深入理解新型淀粉基复合物的营养价值、感官特性以及特定功效,旨在拓宽其在功能性食品、生物技术和医药等领域的应用。 展开更多
关键词 淀粉 分子 制备方法 相互作用 功能特性
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基于分子动力学的环氧树脂与固化剂及地层矿物间的作用模拟
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作者 董浩安 李志勇 +3 位作者 张金波 金星宇 岑昊天 徐瑞星 《钻井液与完井液》 北大核心 2025年第3期283-289,共7页
研究环氧树脂材料的固化过程以及其与地层矿物之间的相互作用,对于其在石油领域的应用具有重要的理论意义。然而,以往的研究主要集中于环氧树脂材料自身的性质,忽视了其与地层的相互作用。为了深入探讨环氧树脂材料的固化过程及其与地... 研究环氧树脂材料的固化过程以及其与地层矿物之间的相互作用,对于其在石油领域的应用具有重要的理论意义。然而,以往的研究主要集中于环氧树脂材料自身的性质,忽视了其与地层的相互作用。为了深入探讨环氧树脂材料的固化过程及其与地层矿物之间的相互作用,该研究基于分子模拟方法,以E51环氧树脂分子和不同种固化剂为研究对象,计算了其分子间的静电势、作用能以及固化产物与地层矿物之间的相互作用能。研究结果表明,环氧树脂分子中的环氧基团具有明显的负静电势,数值为-0.060 Hartree/e,而固化剂分子中的活泼氢原子则具有明显的正电势,数值在0.053~0.126Hartree/e之间。此外,环氧树脂与不同固化剂分子间存在相互吸引作用,其相互作用能范围为-0.446~-29.306 kcal/mol;交联后,分子间的相互作用能下降至-80.987~-110.844 kcal/mol之间。最后,环氧树脂交联产物与地层矿物之间也存在显著的相互吸引作用,其中单个树脂分子与方解石矿物的相互作用能在-49.795~-173.187 kcal/mol之间,与白云石矿物的相互作用能在-44.604~-147.307 kcal/mol之间。该研究的结果为环氧树脂在石油天然气工业中的应用提供了理论基础,所采用的研究方法也可用于优化环氧树脂类添加剂的设计。 展开更多
关键词 分子模拟 环氧树脂 地层矿物 静电势 相互作用
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α-O-4型木质素二聚体分子间相互作用机理研究
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作者 崔达 尹鹤霖 +3 位作者 吴爽 刘斌 王琦 王擎 《太阳能学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第9期595-602,共8页
不同于传统单分子分解机制,聚焦双分子反应热解机理,采用密度泛函理论(DFT)的GGA/RPBE方法,选取α—O—4型木质素二聚体模型化合物苄基苯基醚(BPE)为研究对象,确定其中存在的分子间相互作用关系以及关键产物在热解过程中形成的化学途径... 不同于传统单分子分解机制,聚焦双分子反应热解机理,采用密度泛函理论(DFT)的GGA/RPBE方法,选取α—O—4型木质素二聚体模型化合物苄基苯基醚(BPE)为研究对象,确定其中存在的分子间相互作用关系以及关键产物在热解过程中形成的化学途径,并重点研究木质素中取代基对分子间相互作用关系产生的影响。研究结果表明,在单分子反应中,取代基会提高各个键的活性,CH_(3)取代基会促进C—O键的均裂。木质素分子与自由基之间存在强烈的相互作用,但取代基会抑制分子间相互作用关系,且取代基上H自由基参与反应的意向弱于木质素连接键上的H自由基。4种α—O—4型木质素脱氢二聚体自由基主要可能发生均裂的键是O—C_(芳香族)键,而非C_(α)—O键。 展开更多
关键词 生物质能 木质素 热解 密度泛函理论 α—O—4 分子相互作用
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小分子与蛋白质相互作用研究的新方法-PELSA
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作者 唐致恒 刘小云 《质谱学报》 北大核心 2025年第1期1-2,共2页
小分子-蛋白质相互作用在生命活动中发挥着重要作用,广泛参与几乎所有的生物学过程。蛋白质与小分子配体(如药物、代谢物、金属离子和核酸等)的结合能够调控蛋白质的结构、功能及其生物学活性。因此,研究蛋白质-小分子相互作用对于药物... 小分子-蛋白质相互作用在生命活动中发挥着重要作用,广泛参与几乎所有的生物学过程。蛋白质与小分子配体(如药物、代谢物、金属离子和核酸等)的结合能够调控蛋白质的结构、功能及其生物学活性。因此,研究蛋白质-小分子相互作用对于药物开发、生物分子功能解析及疾病机制研究都具有重要意义。然而,与蛋白质-蛋白质互作相比,研究小分子-蛋白质互作的有效工具则明显不足。例如,如何规模化筛选小分子的蛋白靶标并实现其精准鉴定至今仍是一项非常有挑战性的任务。 展开更多
关键词 蛋白质相互作用 蛋白质互作 广泛参与 生物分子 功能解析 分子相互作用 药物开发 有效工具
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分子间作用力对香豆素和乙酸与Cu(Ⅱ)络合能力的影响
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作者 代丹青 邢晶 +2 位作者 董炜 陈全 吴敏 《环境化学》 北大核心 2025年第4期1449-1456,共8页
植物根系分泌物是影响植物对重金属吸收以及对重金属胁迫响应的重要因素.根系分泌物中的小分子有机酸、酚等有机物与重金属具有强结合力,从而影响重金属在根际土壤中的迁移和转化.因此,本研究探究了根系分泌物中小分子有机物香豆素和乙... 植物根系分泌物是影响植物对重金属吸收以及对重金属胁迫响应的重要因素.根系分泌物中的小分子有机酸、酚等有机物与重金属具有强结合力,从而影响重金属在根际土壤中的迁移和转化.因此,本研究探究了根系分泌物中小分子有机物香豆素和乙酸与Cu(Ⅱ)络合的行为,通过Xigo湿式比表面分析仪测定弛豫时间、分子动力学模拟等方法探究了分子间存在的相互作用力.结果表明,随有机物浓度增加,香豆素和乙酸与Cu(Ⅱ)单位络合量及条件稳定常数均降低,这归因于乙酸分子间—O—H与—C=O形成氢键作用力,香豆素分子间—C=O与苯环上—C—H形成静电吸引力,这两种分子间的作用力强于它们与Cu(Ⅱ)结合的作用力.乙酸与Cu(Ⅱ)络合表现出明显的pH依赖性,pH值越低,羧基中H不易解离,氢键作用增强,与Cu(Ⅱ)络合能力降低.而香豆素分子间静电吸引作用力几乎不受pH条件影响.本研究通过解析根系小分子有机物与重金属络合行为,为探究根系分泌物在介导重金属生物有效性和迁移转化中的环境作用提供有效信息. 展开更多
关键词 根系分泌物 络合 氢键作用 静电吸引 分子作用力.
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光谱法联合分子对接研究邻苯二甲酸二乙酯与卵白蛋白的相互作用
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作者 付晨 黄群 《食品与机械》 北大核心 2025年第7期1-8,共8页
[目的]运用多光谱分析和分子对接技术探究邻苯二甲酸二乙酯(DEP)与卵白蛋白(OVA)的相互作用机理。[方法]利用Stern-Volmer方程,研究DEP对OVA的荧光猝灭机理及两者之间的结合常数与结合位点数,并通过热力学参数确定二者相互作用的主要作... [目的]运用多光谱分析和分子对接技术探究邻苯二甲酸二乙酯(DEP)与卵白蛋白(OVA)的相互作用机理。[方法]利用Stern-Volmer方程,研究DEP对OVA的荧光猝灭机理及两者之间的结合常数与结合位点数,并通过热力学参数确定二者相互作用的主要作用力类型,根据F?rster非辐射能量转移理论,得出二者之间的能量转移效率和结合距离。利用分子对接考察了DEP与OVA之间的相互作用力。[结果]DEP可静态猝灭OVA内源荧光。25~45℃时,结合常数(K)由2.631×10^(8) L/mol降至1.072×10^(8) L/mol,DEP与OVA之间有1~2个主要结合位点。热力学分析表明,二者通过静电作用自发结合。荧光共振能量转移参数(J=1.316×10^(-13) cm^(3)·L/mol,R_(0)=3.665 nm,E=0.735,r=3.091 nm)证实其强结合。紫外—可见光谱分析表明,DEP与OVA结合形成基态复合物。分子对接模拟显示,DEP与OVA通过氢键、范德华力及疏水作用结合,形成的复合物结构稳定。[结论]DEP可静态猝灭OVA内源荧光,二者通过静电作用自发形成1~2个结合位点的稳定基态复合物,结合距离为3.091 nm,能量转移效率为0.735。复合物结构稳定性主要由氢键、范德华力及疏水作用维持。 展开更多
关键词 荧光光谱 紫外吸收光谱 邻苯二甲酸二乙酯 卵白蛋白 相互作用 分子对接
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上层大气层气固相互作用的分子动力学研究
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作者 陶瑞灵 王智慧 《力学学报》 北大核心 2025年第1期65-78,共14页
海拔100~300 km的上层大气层内,主要成分之一的原子氧化学活性高,容易在超低轨飞行器表面材料上发生吸附和侵蚀现象,显著改变壁面的物理化学状态和气固相互作用特征,进而影响飞行器的气动性能.由于时空尺度差异和成本限制,目前的地面试... 海拔100~300 km的上层大气层内,主要成分之一的原子氧化学活性高,容易在超低轨飞行器表面材料上发生吸附和侵蚀现象,显著改变壁面的物理化学状态和气固相互作用特征,进而影响飞行器的气动性能.由于时空尺度差异和成本限制,目前的地面试验手段和模拟方法很难复现上层大气层真实空间环境的气固相互作用过程.针对这一难题,文章设计了一种分子动力学等效模拟方案,让气体分子在短时间内高频入射材料表面,来反映真实环境中长时间低频率的气固相互作用过程,从而研究上层大气层不同海拔高度的空间环境中,原子氧在典型航天材料壁面的吸附/侵蚀状态演化过程以及动量适应系数的变化规律.研究表明,在满足一定等效原则时,这种模拟方案能够合理地反映相关的真实物理图像,展示了洁净壁面从少量吸附到大量吸附原子氧,再到原子氧侵蚀壁面表层结构形成松散氧化物的3阶段演化过程,同时也给出了高速入射的气体分子在相应壁面状态下的动量适应特征.另外,本文也研究了上层大气层另一主要组分N_(2)的存在对原子氧吸附、侵蚀和适应过程的影响.这一研究可加深人们对上层大气层气固相互作用过程的认识,并为新一代飞行器的气动设计提供参考. 展开更多
关键词 上层大气层 气固相互作用 分子动力学 适应系数 超低轨 大气阻力
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基于分子光谱法、热动力学分析法和分子对接技术的丁香酸甲酯和人血清白蛋白相互作用机制的研究
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作者 朱鑫麗 张晶晶 +2 位作者 胡童霞 吴帆 李红亮 《理化检验(化学分册)》 北大核心 2025年第8期885-891,共7页
丁香酸甲酯作为特定蜂蜜的特征性标志物,在进入人体后可与人血清白蛋白(HSA)结合并通过血液循环实现全身运输,但目前对二者的相互作用机制尚缺乏系统研究。为此,采用题示方法系统考察了丁香酸甲酯与HSA相互作用的荧光猝灭特性、分子间... 丁香酸甲酯作为特定蜂蜜的特征性标志物,在进入人体后可与人血清白蛋白(HSA)结合并通过血液循环实现全身运输,但目前对二者的相互作用机制尚缺乏系统研究。为此,采用题示方法系统考察了丁香酸甲酯与HSA相互作用的荧光猝灭特性、分子间作用力类型、能量转移机制及特异性结合模式。采用荧光光谱法、紫外-可见吸收光谱法和热动力学分析法分析,结果显示,丁香酸甲酯与HSA以5.82 nm的结合距离通过氢键、范德华力和疏水相互作用力相结合,引发非辐射能量转移,导致HSA发生动态荧光猝灭并伴随最大发射波长红移;同步荧光光谱法分析结果表明,随着丁香酸甲酯浓度的增大,色氨酸(Trp)残基和酪氨酸(Tyr)残基的特征荧光强度逐渐降低,提示HSA微环境疏水性下降,肽链伸展程度增加,蛋白质构象发生改变;分子对接模型显示,丁香酸甲酯可进入HSA结合口袋,与氨基酸残基,如Tyr残基Tyr-138和组氨酸(His)残基His-146等形成氢键,这一特异性结合模式可能是产生上述现象的结构基础。研究阐明了丁香酸甲酯与HSA的动态相互作用机制,可为深入理解蜂蜜特征成分的体内运输过程及其潜在生理功能提供重要的理论基础。 展开更多
关键词 荧光光谱法 热动力学分析法 分子对接技术 紫外-可见吸收光谱法 丁香酸甲酯 人血清白蛋白 相互作用机制
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基于光学检测的分子间相互作用表征技术研究进展 被引量:2
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作者 封加栋 陆峰 《海军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期872-879,共8页
分子间相互作用的表征技术是阐明细胞生物学事件、了解疾病发生机制、辅助药物研发的有力手段。近年来,分子间相互作用的表征技术发展迅速,不断向着高灵敏度、高通量、极短时间、极低检测限的方向发展。本文对表面等离子体共振、生物膜... 分子间相互作用的表征技术是阐明细胞生物学事件、了解疾病发生机制、辅助药物研发的有力手段。近年来,分子间相互作用的表征技术发展迅速,不断向着高灵敏度、高通量、极短时间、极低检测限的方向发展。本文对表面等离子体共振、生物膜干涉、背向散射干涉以及微量热泳动这4种常见的、基于光学检测的分子间相互作用表征技术的原理、特点及最新应用进展进行了综述与比较,为分子间相互作用表征技术的选择提供参考。 展开更多
关键词 分子相互作用 表面等离子体共振 生物膜干涉 背向散射干涉 微量热泳动
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盐酸安非他酮多晶型分子间相互作用分析研究 被引量:1
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作者 张亚安 潘雅典 +3 位作者 林玉婷 朱咏娟 刘媛媛 孙柏旺 《化学研究与应用》 CAS 北大核心 2024年第10期100-108,共9页
以多晶型药物盐酸安非他酮为模型药物,探讨晶体结构和分子间相互作用对稳定性影响。对四种晶型从分子构象、分子间氢键等进行了详细比较;利用CrystalExplorer软件中Hirshfeld表面和能量框架模块,从理论上系统地分析了四种晶型中分子间... 以多晶型药物盐酸安非他酮为模型药物,探讨晶体结构和分子间相互作用对稳定性影响。对四种晶型从分子构象、分子间氢键等进行了详细比较;利用CrystalExplorer软件中Hirshfeld表面和能量框架模块,从理论上系统地分析了四种晶型中分子间作用方式和作用能的大小。结果显示室温下最稳定的晶型KUMCAX01具有更稳定的分子构象,更高的堆积指数,Cl…H、O…H等较强分子间作用力贡献比例更大,与周围离子总相互作用能更高,为深刻理解多晶型药物晶体构造差异对稳定性的影响提供一定理论依据。 展开更多
关键词 盐酸安非他酮 多晶型 晶体结构 Hirshfeld表面分析 分子相互作用
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激发态DNA碱基对分子间相互作用的理论研究
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作者 邵博孝 吴玮 苏培峰 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期24-33,共10页
[目的]利用本课题组发展的定量分析方法研究激发态DNA碱基对分子间相互作用的本质,以及不同类型的电子跃迁对DNA碱基对分子间相互作用的影响.[方法]采用广义Kohn-Sham能量分解分析方法(generalized Kohn-Sham based energy decompositio... [目的]利用本课题组发展的定量分析方法研究激发态DNA碱基对分子间相互作用的本质,以及不同类型的电子跃迁对DNA碱基对分子间相互作用的影响.[方法]采用广义Kohn-Sham能量分解分析方法(generalized Kohn-Sham based energy decomposition analysis,GKS-EDA),对两种Waston-Crick构型和两种stacked构型的DNA碱基对分子间相互作用本质进行理论研究.[结果]对于Waston-Crick构型的碱基对,n→π^(*)跃迁削弱了轨道极化作用但加强了电子相关作用,激发态分子间相互作用由电子相关作用主导,而π→π^(*)跃迁对分子间氢键影响较小;对于stacked构型的碱基对,π→π^(*)跃迁削弱了静电相互作用但增强了电子相关作用.[结论]Waston-Crick构型碱基对分子间相互作用本质受电子激发跃迁影响较大,而电子激发跃迁基本不改变stacked构型碱基对分子间相互作用本质. 展开更多
关键词 激发态 DNA碱基对 分子相互作用 能量分解分析
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基于网络药理学、分子对接和分子动力学探讨犀角地黄汤治疗糖尿病足溃疡的作用机制
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作者 郑炜 马琳 +3 位作者 刘佳 张瑞华 赵杰 魏伟 《天津师范大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第4期14-22,共9页
为了解犀角地黄汤(RHRD)治疗糖尿病足溃疡(DFU)的分子机制,应用网络药理学和分子动力学模拟方法,通过TCMSP数据库、BATMAN-TCM和文献检索搜索犀角地黄汤中药成分的活性成分及其靶点,然后从GeneCards、CTD、OMIM、TTD和DrugBank数据库中... 为了解犀角地黄汤(RHRD)治疗糖尿病足溃疡(DFU)的分子机制,应用网络药理学和分子动力学模拟方法,通过TCMSP数据库、BATMAN-TCM和文献检索搜索犀角地黄汤中药成分的活性成分及其靶点,然后从GeneCards、CTD、OMIM、TTD和DrugBank数据库中检索DFU的疾病靶点.分析药物靶点和疾病靶点的交叉靶点,使用Cytoscape 3.7.1软件构建成分-靶点(CT)网络,在String平台上构建治疗靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络,并对关键基因进行筛选.在DAVID数据库中进行GO和KEGG富集分析.用AutoDock进行分子对接以预测RHRD有效成分与核心靶点的结合,随后用Gromacs进行分子动力学模拟,观察靶蛋白中的相互作用和构象变化.以HaCaT细胞为实验材料,通过MTT实验和细胞划痕实验检测高糖条件下RHRD对HaCaT细胞的保护作用.结果显示:(1)共筛选出32种活性成分、419个药物靶点、14036个疾病靶点和384个治疗靶点;(2)通过CT网络和PPI网络分析获得了核心活性成分(槲皮素、山柰酚、梓醇、黄芩素)和核心靶点(TP53、AKT1、HSP90AA1、STAT3、MAPK1),主要涉及脂质与动脉粥样硬化、Th17细胞分化通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路和MAPK信号通路等;(3)分子对接结果表明,RHRD有效成分与核心靶点之间存在很强的结合亲和力,分子动力学模拟证实了RHRD有效成分与这些靶点的稳定结合;(4)MTT实验结果显示RHRD可以保护HaCaT细胞免受高糖诱导的细胞损伤,细胞划痕实验结果显示RHRD能够显著诱导伤口愈合. 展开更多
关键词 犀角地黄汤 糖尿病足溃疡 网络药理学 分子动力学模拟 蛋白质相互作用
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褐煤与水微观相互作用的分子机制:多尺度分子模拟 被引量:1
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作者 吴玉花 李荣花 +6 位作者 张茜 高红凤 朱美霖 刘彩珠 吴建波 张慧 白红存 《洁净煤技术》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期48-60,共13页
煤与水的表面相互作用是洁净煤技术领域的重要科学问题之一。然而,褐煤与水的相互作用是一个复杂的物理化学过程,其微观机制在原子尺度和电子结构方面仍不明确。尤其缺乏褐煤中不同官能团与水之间相互作用能量、稳定性结构特征、相互作... 煤与水的表面相互作用是洁净煤技术领域的重要科学问题之一。然而,褐煤与水的相互作用是一个复杂的物理化学过程,其微观机制在原子尺度和电子结构方面仍不明确。尤其缺乏褐煤中不同官能团与水之间相互作用能量、稳定性结构特征、相互作用本质的系统考察。基于多尺度分子模拟研究了褐煤与水微观相互作用的分子机制。基于量子化学计算重点考察典型褐煤模型结构中不同官能团与单分子水的相互作用,获得水分子在褐煤不同位点吸附的局域极小构象,以及稳定吸附构象的几何结构特征。基于独立梯度模型的直观绘景阐释了褐煤与水分子之间的相互作用形式主要为范德华作用和氢键。借助能量分解分析方法定量描述并确定了静电作用是稳定煤-水相互作用的最主要因素。此外,还基于分子动力学模拟揭示了不同数量褐煤分子与大量水分子相互作用的组装行为和演化特征,阐明了褐煤分子结构在大量水中的团聚现象。分子动力学模拟结果同样印证了褐煤和水分子主要以静电作用结合。 展开更多
关键词 煤结构 表面相互作用 非共价相互作用 分子模拟 密度泛函理论
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基于光谱法及分子对接技术的猪血红蛋白与儿茶素相互作用研究 被引量:3
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作者 刘丽莉 陈卉 +3 位作者 郭净芳 张潇丹 苏克楠 于影 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1117-1124,共8页
为增强猪血红蛋白(PHb)结构的稳定性,提高其应用价值,将天然抗氧化剂儿茶素(C)与PHb进行互作,以期稳定PHb的结构。采用紫外可见光谱、荧光光谱、傅里叶红外光谱和扫描电镜研究C与PHb的相互作用,并通过分子模拟对接技术表征儿茶素-猪血... 为增强猪血红蛋白(PHb)结构的稳定性,提高其应用价值,将天然抗氧化剂儿茶素(C)与PHb进行互作,以期稳定PHb的结构。采用紫外可见光谱、荧光光谱、傅里叶红外光谱和扫描电镜研究C与PHb的相互作用,并通过分子模拟对接技术表征儿茶素-猪血红蛋白复合物(C-PHb)的形貌和结构。结果表明,添加C前后,PHb的紫外吸收光谱发生明显变化;荧光光谱结果表明,C能有效猝灭PHb内源荧光且为自由发生的静态猝灭,猝灭常数(Kq)为7.5×10^(10)L·mol^(-1)·s^(-1),作用力主要为范德华力、氢键和疏水作用力。同时,相较于PHb,C-PHb的蛋白质二级结构发生改变,表现为β-折叠含量增高,α-螺旋、β-转角和无规卷曲含量降低。此外,分子对接模型进一步验证了C可与PHb进行相互作用。综上,C可与PHb互作以稳定其结构。本研究可为制备具有抗氧化性质的PHb复合物提供理论支持和可行性依据。 展开更多
关键词 猪血红蛋白 儿茶素 相互作用 光谱法 分子对接
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聚氨酯与稀释沥青相互作用的分子动力学模拟
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作者 佘兆宇 刘林林 +2 位作者 晏应 李靖 盛云霓 《化工新型材料》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期181-185,189,共6页
为从分子尺度深入了解聚氨酯与稀释沥青的相互作用,采用Materials Studio软件,分别构建沥青、聚氨酯、聚氨酯-稀释沥青共混模型,并验证模型准确性。基于分子动力学模拟,开展温度和聚氨酯掺量对稀释沥青内聚能密度、溶解度参数、相互作... 为从分子尺度深入了解聚氨酯与稀释沥青的相互作用,采用Materials Studio软件,分别构建沥青、聚氨酯、聚氨酯-稀释沥青共混模型,并验证模型准确性。基于分子动力学模拟,开展温度和聚氨酯掺量对稀释沥青内聚能密度、溶解度参数、相互作用能、力学性能的影响研究。结果表明:建立的沥青和聚氨酯分子模型较合理,能够表征沥青和聚氨酯真实特性;随着温度的升高,稀释沥青和稀释沥青-聚氨酯共混体系的内聚能密度均呈下降趋势;在[-10℃,100℃]范围内,聚氨酯添加物能够降低稀释沥青的内聚能密度,不同温度下降低幅度平均为15%;在60℃时,稀释沥青与聚氨酯的溶解度参数δ差值最小,各总相互作用能和范德华势能最大,体系最稳定;聚氨酯能够提高稀释沥青的力学参数,并且力学参数与聚氨酯的掺量呈正相关关系。研究对树脂改性冷补沥青混合料具有参考价值。 展开更多
关键词 冷补料 聚氨酯 稀释沥青 分子动力学 相互作用
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基于分子动力学模拟的木材细胞壁与水分相互作用研究进展 被引量:2
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作者 徐佳佳 李京予 +1 位作者 张润华 马尔妮 《高分子材料科学与工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第8期165-173,共9页
木材是一种典型的天然高分子材料,在分子尺度上解读水分对木材微纳结构的影响,是木材中水分研究的重难点。文中概述了分子动力学模拟的一般过程,重点介绍了近年来分子动力学模拟在木材-水分的研究领域中,对细胞壁化学组分纤维素、半纤... 木材是一种典型的天然高分子材料,在分子尺度上解读水分对木材微纳结构的影响,是木材中水分研究的重难点。文中概述了分子动力学模拟的一般过程,重点介绍了近年来分子动力学模拟在木材-水分的研究领域中,对细胞壁化学组分纤维素、半纤维素、木质素与水分相互作用以及细胞壁各组分之间的界面与水分相互作用等方面的最新研究进展,最后提出了相关的现存问题,并就未来的发展方向进行展望,以期为深入揭示木材与水分的相互作用提供参考。 展开更多
关键词 木材 细胞壁 水分 相互作用 分子动力学模拟
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基于分子模拟的复合泡沫抑尘剂微观作用机制研究
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作者 赵鑫璐 《中国安全科学学报》 北大核心 2025年第S1期151-157,共7页
为研究复合泡沫抑尘剂在不同复配比例下的微观作用机制及功效,以阴离子型表面活性剂十二烷基硫酸钠(SDS)与非离子型表面活性剂三聚乙二醇单十四醚(C_(14)E_(3))所构建的泡沫液膜模型为研究对象,采用分子动力学的方法,研究SDS/C_(14)E_(3... 为研究复合泡沫抑尘剂在不同复配比例下的微观作用机制及功效,以阴离子型表面活性剂十二烷基硫酸钠(SDS)与非离子型表面活性剂三聚乙二醇单十四醚(C_(14)E_(3))所构建的泡沫液膜模型为研究对象,采用分子动力学的方法,研究SDS/C_(14)E_(3)泡沫抑尘剂在不同复配比例体系下的微观动态演变过程与热力学特性。结果表明:SDS与C_(14)E_(3)复配进一步提升了SDS头基对水分子的束缚,当SDS/C_(14)E_(3)的比例为12∶24时,SDS头基与水分子间的相互作用最强;复合泡沫液膜结合水与SDS头基的扩散系数随复配比例呈先“V”字型变化特征;SDS/C_(14)E_(3)复合时SDS头基束缚结合水的能力明显强于单一表面活性剂的泡沫液膜,且复配比例为12∶24时头基与水的扩散能力最弱;复合泡沫液膜的表面张力随SDS比例的升高,先减小后增大,当SDS/C_(14)E_(3)的比例为12∶24时,泡沫液膜的润湿性最好。 展开更多
关键词 分子动力学 泡沫抑尘剂 复配比例 表面活性剂 相互作用
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