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空间飞行条件下小鼠不同组织中多组学分子互作模式挖掘及关键基因识别
1
作者
张彦
杨青
+2 位作者
杜晓辉
赵磊
孙野青
《空间科学学报》
北大核心
2025年第2期529-555,共27页
为了从系统生物学的角度探究空间生物学效应,本文基于单样本网络(Single-Sample Network,SSN)开发了一种生物信息学分析方法.首先,为来自空间飞行小鼠不同组织的每个样本分别构建了转录组、DNA甲基化、蛋白质组层面的SSN.然后,提取每个...
为了从系统生物学的角度探究空间生物学效应,本文基于单样本网络(Single-Sample Network,SSN)开发了一种生物信息学分析方法.首先,为来自空间飞行小鼠不同组织的每个样本分别构建了转录组、DNA甲基化、蛋白质组层面的SSN.然后,提取每个SSN中所有节点的拓扑特征,并使用T检验识别出不同组学层面的差异互作分子.结果表明,虽然不同组学层面互作模式改变的分子交集有限,但其调控的生物过程和通路具有相似性,主要包括代谢过程、DNA损伤响应、细胞周期、氧化应激、昼夜节律等.本文还分别构建了不同组学层面的共互作网络,并识别了枢纽(Hub)基因.此外,空间飞行改变的分子互作模式可能与一系列疾病发生和病毒重激活有关.
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关键词
空间环境
单样本网络
分子互作模式
多组学
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职称材料
芽胞杆菌生物防治作用机理与应用研究进展
被引量：
76
2
作者
马佳
李颖
+5 位作者
胡栋
彭杰丽
贾楠
张翠绵
王旭
王占武
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2018年第4期639-648,共10页
芽胞杆菌Bacillus spp.是国际上应用非常普遍的生防细菌,一直是当今土壤微生物学和微生态学研究热点之一。目前,国内外已完成多个芽胞杆菌菌株全基因组测序分析工作。本文从芽胞杆菌的次生代谢与抑菌作用、生物膜与竞争作用、植物-芽胞...
芽胞杆菌Bacillus spp.是国际上应用非常普遍的生防细菌,一直是当今土壤微生物学和微生态学研究热点之一。目前,国内外已完成多个芽胞杆菌菌株全基因组测序分析工作。本文从芽胞杆菌的次生代谢与抑菌作用、生物膜与竞争作用、植物-芽胞杆菌-病原菌互作与诱导植物抗性三方面概括性地综述了芽胞杆菌的生防机制。通过芽胞杆菌功能拓展的分子改良,可以提高植物抗病性,并就生防芽胞杆菌剂的商业化生产及在农业上的应用作了探讨。近年来我国学者在芽胞杆菌应用基础研究上取得了丰硕成果,为进一步实现芽胞杆菌的产业化及其应用奠定了坚实的基础。
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关键词
芽胞杆菌
生物防治
植物病害
微生物
互
作
分子
模式
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职称材料
木霉菌生物防治作用机理与应用研究进展
被引量：
129
3
作者
陈捷
朱洁伟
+1 位作者
张婷
王秉丽
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2011年第2期145-151,共7页
木霉菌Trichoderma是国际上应用非常普遍的生防真菌。随着植物免疫的MAMPs(微生物互作分子模式)理论的发展,利用木霉菌防治病害和提高作物抗逆性机理研究进入了一个新阶段,尤其是系统生物学方法的应用,使得人们在"组学"尺度...
木霉菌Trichoderma是国际上应用非常普遍的生防真菌。随着植物免疫的MAMPs(微生物互作分子模式)理论的发展,利用木霉菌防治病害和提高作物抗逆性机理研究进入了一个新阶段,尤其是系统生物学方法的应用,使得人们在"组学"尺度上认识木霉菌与植物和病原菌互作的本质成为可能,这将极大丰富木霉菌生物防治植物病害的理论基础。在我国建立木霉菌多样化应用技术途径是发挥木霉菌在农业可持续发展中作用的重要发展方向。本文重点介绍木霉菌生物防治分子机理研究的新进展。
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关键词
木霉菌
生物防治
植物病害
微生物
互
作
分子
模式
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职称材料
题名
空间飞行条件下小鼠不同组织中多组学分子互作模式挖掘及关键基因识别
1
作者
张彦
杨青
杜晓辉
赵磊
孙野青
机构
大连海事大学环境科学与工程学院环境系统生物学研究所
出处
《空间科学学报》
北大核心
2025年第2期529-555,共27页
基金
空间站工程空间应用系统第二批、第三批科学实验项目(SCP-03-01-02,SCP-03-01-03,YYWT-0801-EXP-17)
国家自然科学基金面上项目(32071244)
中国博士后科学基金面上项目(2020M670720)共同资助。
文摘
为了从系统生物学的角度探究空间生物学效应,本文基于单样本网络(Single-Sample Network,SSN)开发了一种生物信息学分析方法.首先,为来自空间飞行小鼠不同组织的每个样本分别构建了转录组、DNA甲基化、蛋白质组层面的SSN.然后,提取每个SSN中所有节点的拓扑特征,并使用T检验识别出不同组学层面的差异互作分子.结果表明,虽然不同组学层面互作模式改变的分子交集有限,但其调控的生物过程和通路具有相似性,主要包括代谢过程、DNA损伤响应、细胞周期、氧化应激、昼夜节律等.本文还分别构建了不同组学层面的共互作网络,并识别了枢纽(Hub)基因.此外,空间飞行改变的分子互作模式可能与一系列疾病发生和病毒重激活有关.
关键词
空间环境
单样本网络
分子互作模式
多组学
Keywords
Space environment
Single-sample network
Molecular interaction pattern
Multi-omics
分类号
V524 [航空宇航科学与技术—人机与环境工程]
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职称材料
题名
芽胞杆菌生物防治作用机理与应用研究进展
被引量：
76
2
作者
马佳
李颖
胡栋
彭杰丽
贾楠
张翠绵
王旭
王占武
机构
河北省农林科学院遗传生理研究所/河北省植物转基因中心重点实验室/农业部农产品质量安全风险评估实验室
出处
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2018年第4期639-648,共10页
基金
河北省科技支撑计划(15226904D)
河北省高层次人才资助项目(E2015100015)
文摘
芽胞杆菌Bacillus spp.是国际上应用非常普遍的生防细菌,一直是当今土壤微生物学和微生态学研究热点之一。目前,国内外已完成多个芽胞杆菌菌株全基因组测序分析工作。本文从芽胞杆菌的次生代谢与抑菌作用、生物膜与竞争作用、植物-芽胞杆菌-病原菌互作与诱导植物抗性三方面概括性地综述了芽胞杆菌的生防机制。通过芽胞杆菌功能拓展的分子改良,可以提高植物抗病性,并就生防芽胞杆菌剂的商业化生产及在农业上的应用作了探讨。近年来我国学者在芽胞杆菌应用基础研究上取得了丰硕成果,为进一步实现芽胞杆菌的产业化及其应用奠定了坚实的基础。
关键词
芽胞杆菌
生物防治
植物病害
微生物
互
作
分子
模式
Keywords
Bacillus
biocontrol
plant disease
plant-microbe interaction
分类号
S476 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
木霉菌生物防治作用机理与应用研究进展
被引量：
129
3
作者
陈捷
朱洁伟
张婷
王秉丽
机构
上海交通大学农业与生物学院
出处
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2011年第2期145-151,共7页
基金
现代农业产业技术体系专项(CARS-02)
上海市重点项目(09391910900)
上海市农业科技成果转化项目(103919N2100)
文摘
木霉菌Trichoderma是国际上应用非常普遍的生防真菌。随着植物免疫的MAMPs(微生物互作分子模式)理论的发展,利用木霉菌防治病害和提高作物抗逆性机理研究进入了一个新阶段,尤其是系统生物学方法的应用,使得人们在"组学"尺度上认识木霉菌与植物和病原菌互作的本质成为可能,这将极大丰富木霉菌生物防治植物病害的理论基础。在我国建立木霉菌多样化应用技术途径是发挥木霉菌在农业可持续发展中作用的重要发展方向。本文重点介绍木霉菌生物防治分子机理研究的新进展。
关键词
木霉菌
生物防治
植物病害
微生物
互
作
分子
模式
Keywords
Trichoderma
biocontrol
plant disease
MAMPs
分类号
S482.292 [农业科学—农药学]
S476 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
空间飞行条件下小鼠不同组织中多组学分子互作模式挖掘及关键基因识别
张彦
杨青
杜晓辉
赵磊
孙野青
《空间科学学报》
北大核心
2025
0
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职称材料
2
芽胞杆菌生物防治作用机理与应用研究进展
马佳
李颖
胡栋
彭杰丽
贾楠
张翠绵
王旭
王占武
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2018
76
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
木霉菌生物防治作用机理与应用研究进展
陈捷
朱洁伟
张婷
王秉丽
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2011
129
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职称材料
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