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山葡萄北冰红冷适应蛋白COR413-I2基因分离及特征分析 被引量:1
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作者 王学娟 《江苏农业科学》 2018年第19期17-20,共4页
温度是植物种子萌发及生长发育的关键环境因素之一。冷适应蛋白作为植物冷调节的基因,在植物生命周期中起着重要的作用。以耐寒品种北冰红葡萄叶片为材料,设计特异性引物,克隆北冰红冷适应蛋白基因。该基因序列全长609 bp,共编码202个... 温度是植物种子萌发及生长发育的关键环境因素之一。冷适应蛋白作为植物冷调节的基因,在植物生命周期中起着重要的作用。以耐寒品种北冰红葡萄叶片为材料,设计特异性引物,克隆北冰红冷适应蛋白基因。该基因序列全长609 bp,共编码202个氨基酸,将其命名为Vv COR413-I2,该基因编码蛋白的分子量为22. 6 ku,等电点值为9. 88。氨基酸序列同源性对比结果显示,该序列与其他植物的COR413蛋白一致性在78%以上。对该蛋白的结构分析显示,它具有WCOR413蛋白功能域,是WCOR413超家族成员,二级结构分析该蛋白含有5个跨膜结构域。 展开更多
关键词 山葡萄北冰红 适应蛋白基因(cor413) 基因克隆 特征分析
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蜡梅Chimonanthus praecox(L.)Link COR413蛋白基因(Cpcor413pm1)的分子特性与表达分析 被引量:13
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作者 秦华 眭顺照 +2 位作者 李名扬 雷兴华 余国武 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期547-552,共6页
为研究蜡梅冬季开花过程的抗寒分子机理,在构建蜡梅花cDNA文库及EST分析的基础上,通过随机克隆测序,克隆了1个蜡梅COR413蛋白的cDNA基因,命名为Cpcor413pm1.Cpcor413pm1cDNA长946bp,推测的编码蛋白CpCOR413PM1包含201个氨基酸.CpCOR413... 为研究蜡梅冬季开花过程的抗寒分子机理,在构建蜡梅花cDNA文库及EST分析的基础上,通过随机克隆测序,克隆了1个蜡梅COR413蛋白的cDNA基因,命名为Cpcor413pm1.Cpcor413pm1cDNA长946bp,推测的编码蛋白CpCOR413PM1包含201个氨基酸.CpCOR413PM1蛋白N端保守性差,没有信号肽,具有5个保守的跨膜区,1个潜在的GPI锚点,具有可能对蛋白结构或活性十分重要的位置保守的7个Pro、1个Cys,1个被富Gly区一分为二的α螺旋区域,以及Tyr、Thr、Ser磷酸化位点各1个.序列比较分析表明,Cpcor413pm1是首次从蜡梅中克隆到的COR413蛋白基因.RT-PCR分析表明,该基因在蜡梅的萌动期、蕾期、露瓣期、初开期、盛开期、衰老期均有表达,但在初开期和盛开期表达丰度更高,推测Cpcor413pm1与蜡梅花的抗冻性有密切关系. 展开更多
关键词 蜡梅 cor413蛋白 Cpcor413pm1基因 抗寒
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核桃JrCOR413基因家族鉴定与表达分析 被引量:3
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作者 刘凯 李瑶玲 +4 位作者 李洋 王红霞 赵书岗 安秀红 张志华 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期14-20,共7页
为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅... 为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅读框为549~804 bp,翻译蛋白范围为182~267个氨基酸,等电点为8.15~9.93,全部为碱性稳定蛋白;含有典型的WCOR413高度保守的结构域。聚类分析发现,该类基因可与拟南芥高度同源,并分为2个亚组。在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrCOR5在2个核桃品种中显著升高,并且在花器官和嫩茎转录表达较高;结合qPCR分析,JrCOR5在冷胁迫48 h显著升高,达到90倍以上。因此,推测JrCOR5可能在核桃响应冷胁迫过程中起到重要作用。本研究结果将为解析核桃JrCOR413基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制研究奠定基础。 展开更多
关键词 核桃 胁迫 cor413基因家族 表达分析
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山葡萄北冰红VvCOR413-I1基因克隆及生物信息学分析
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作者 王学娟 《安徽农业科学》 CAS 2018年第14期109-112,共4页
[目的]从山葡萄北冰红中克隆耐寒基因COR413,并对其功能进行生物信息学分析。[方法]利用RT-PCR法克隆山葡萄北冰红基因COR413,并利用生物信息学对其进行分析。[结果]它包括630 bp完整的开放阅读框,推测编码210个氨基酸,蛋白的分子量(MW)... [目的]从山葡萄北冰红中克隆耐寒基因COR413,并对其功能进行生物信息学分析。[方法]利用RT-PCR法克隆山葡萄北冰红基因COR413,并利用生物信息学对其进行分析。[结果]它包括630 bp完整的开放阅读框,推测编码210个氨基酸,蛋白的分子量(MW)为59.18 k D,等电点(p I)值为10.74。其蛋白结构以α-螺旋、延伸链为主,其次为无规则卷曲,β-转角所占比例最少,含有4个跨膜结构域。多重序列比对表明VvCOR413-I1与其他植物COR413的氨基酸序列相似性为63.00%~68.33%。[结论]该研究为深入了解VvCOR413-I1功能奠定了基础。 展开更多
关键词 适应蛋白基因(cor413) 山葡萄北冰红 克隆 生物信息学分析
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冷血脊椎动物冷适应研究 被引量:10
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作者 张强 谢锋 +3 位作者 江建平 郑中华 徐俊晓 程贵英 《四川动物》 CSCD 北大核心 2006年第2期433-438,共6页
环境温度是制约冷血脊椎动物分布、生存、繁殖、迁徙等活动最重要的生态因子之一。冷血脊椎动物在多种多样栖息环境中形成多种耐寒策略。本文重点从冷血脊椎动物冷适应行为生态、生理、冷冻诱导基因表达与抗冻物质获得、低温与性别决定... 环境温度是制约冷血脊椎动物分布、生存、繁殖、迁徙等活动最重要的生态因子之一。冷血脊椎动物在多种多样栖息环境中形成多种耐寒策略。本文重点从冷血脊椎动物冷适应行为生态、生理、冷冻诱导基因表达与抗冻物质获得、低温与性别决定等方面对国内外研究进展进行综述,以探讨低温生物学在冷血脊椎动物的发展趋势。 展开更多
关键词 血脊椎动物 适应 抗冻蛋白 抗冻糖蛋白 温度依赖型性别决定 基因抗冻机制
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