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基于大鼠心肌组织mRNA表达谱筛选冠状动脉性猝死相关生物标志物
被引量：
1
1
作者
郭相杰
李昊
+6 位作者
白雅琴
吴鹏
赵春梅
董祎铭
陈念念
贠克明
高彩荣
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2022年第4期443-451,共9页
目的探寻冠状动脉性猝死(sudden coronary death,SCD)大鼠心肌组织信使RNA(messenger RNA,mRNA)的差异表达,为SCD的法医学鉴定提供思路。方法建立SCD大鼠模型,利用二代测序技术进行转录组测序;用R软件limma包筛选SCD大鼠心肌组织中差异...
目的探寻冠状动脉性猝死(sudden coronary death,SCD)大鼠心肌组织信使RNA(messenger RNA,mRNA)的差异表达,为SCD的法医学鉴定提供思路。方法建立SCD大鼠模型,利用二代测序技术进行转录组测序;用R软件limma包筛选SCD大鼠心肌组织中差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),使用STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件对DEG构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并基于cytoHubba插件筛选相关hub基因。用R软件clusterProfiler包对筛选到的DEG进行生物学功能和信号通路富集分析。结果共有177个DEG与SCD相关,主要参与肾素-血管紧张素系统、PI3K-Akt信号通路等。血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)、补体成分4a(C4a)、Fos原癌基因(Fos proto-oncogene,FOS)等基因在SCD的发生发展过程中发挥关键作用。结论AGT、C4a、FOS等基因有望成为鉴定SCD的潜在生物标志物,基于mRNA表达谱的研究可为SCD的法医学鉴定提供参考。
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关键词
法医病理学
冠状动脉性猝死
信使RNA
差异表达基因
生物标志物
心肌缺血
死亡原因
大鼠
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职称材料
题名
基于大鼠心肌组织mRNA表达谱筛选冠状动脉性猝死相关生物标志物
被引量：
1
1
作者
郭相杰
李昊
白雅琴
吴鹏
赵春梅
董祎铭
陈念念
贠克明
高彩荣
机构
山西医科大学法医学院
出处
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2022年第4期443-451,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(81971790)
山西省基础研究计划资助项目(20210302123314)。
文摘
目的探寻冠状动脉性猝死(sudden coronary death,SCD)大鼠心肌组织信使RNA(messenger RNA,mRNA)的差异表达,为SCD的法医学鉴定提供思路。方法建立SCD大鼠模型,利用二代测序技术进行转录组测序;用R软件limma包筛选SCD大鼠心肌组织中差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),使用STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件对DEG构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并基于cytoHubba插件筛选相关hub基因。用R软件clusterProfiler包对筛选到的DEG进行生物学功能和信号通路富集分析。结果共有177个DEG与SCD相关,主要参与肾素-血管紧张素系统、PI3K-Akt信号通路等。血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)、补体成分4a(C4a)、Fos原癌基因(Fos proto-oncogene,FOS)等基因在SCD的发生发展过程中发挥关键作用。结论AGT、C4a、FOS等基因有望成为鉴定SCD的潜在生物标志物,基于mRNA表达谱的研究可为SCD的法医学鉴定提供参考。
关键词
法医病理学
冠状动脉性猝死
信使RNA
差异表达基因
生物标志物
心肌缺血
死亡原因
大鼠
Keywords
forensic pathology
sudden coronary death
messenger RNA(mRNA)
differentially expressed gene
biomarker
myocardial ischemia
cause of death
rats
分类号
DF795.1 [医药卫生—法医学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
基于大鼠心肌组织mRNA表达谱筛选冠状动脉性猝死相关生物标志物
郭相杰
李昊
白雅琴
吴鹏
赵春梅
董祎铭
陈念念
贠克明
高彩荣
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2022
1
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