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条斑紫菜(Pyropia yezoensis)10个选育系的ISSR分析 被引量:4
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作者 陈淑吟 陆勤勤 +2 位作者 张美如 胡传明 许广平 《天津农业科学》 CAS 2012年第5期19-23,共5页
利用ISSR分子标记进行条斑紫菜(Pyropia yezoensis)10个选育品系的种质鉴定研究。结果表明,具条带特异性且表达稳定清晰的ISSR引物共14个,其扩增多态性片段约占97.1%,这些引物可用作区分这些品系的分子标记,同时利用引物826扩增的特异... 利用ISSR分子标记进行条斑紫菜(Pyropia yezoensis)10个选育品系的种质鉴定研究。结果表明,具条带特异性且表达稳定清晰的ISSR引物共14个,其扩增多态性片段约占97.1%,这些引物可用作区分这些品系的分子标记,同时利用引物826扩增的特异性位点建立了这些选育品系的ISSR遗传识别码。 展开更多
关键词 条斑紫菜 内部简单序列重复 种质鉴定
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福建不同水域水葫芦遗传多态性的ISSR分析 被引量:6
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作者 林瑞余 孙红艳 +4 位作者 赵瑞宗 陈祥旭 苗利国 黄磊 林文雄 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2008年第2期175-179,共5页
在建立内部简单重复序列(ISSR)分析方法的基础上,以采自福建省主要河流和福州内河的12份水葫芦样本为材料,筛选出20个可扩增出清晰且具多态性片段的ISSR随机引物,通过PCR扩增,探讨其遗传多态性和亲缘关系.ISSR分析结果表明,从12份水葫... 在建立内部简单重复序列(ISSR)分析方法的基础上,以采自福建省主要河流和福州内河的12份水葫芦样本为材料,筛选出20个可扩增出清晰且具多态性片段的ISSR随机引物,通过PCR扩增,探讨其遗传多态性和亲缘关系.ISSR分析结果表明,从12份水葫芦样本中获得了150个DNA片段,其中75个片段呈现多态性,占总扩增片段的50.0%;Shannon信息指数均值(0.2739)和Nei′s基因多样性指数均值(0.1894)相对较小,但种群内的遗传多样性仍有一定的差异.聚类分析表明,当遗传距离为0.40时,供试的12份水葫芦样本分为3大类,第Ⅰ大类来自福建农林大学校内池塘,第Ⅱ类来自福州金山社区内河,而闽江、九龙江、木兰溪和晋江流域的聚为一类. 展开更多
关键词 水葫芦 内部简单重复序列(ISSR) 遗传多态性
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皱边石杉内生真菌ISSR-PCR反应条件的优化 被引量:3
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作者 史云峰 禹利君 +3 位作者 刘仲华 黄璜 胥锦桦 朱楠楠 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期398-403,共6页
以从皱边石杉中分离纯化出的99株内生真菌DNA为材料,优选出10条ISSR引物(UBC842、UBC848、UBC850、UBC856、UBC861、UBC864、UBC868、UBC873、UBC880、UBC887)的最适退火温度,并对其进行ISSR–PCR反应体系单因素试验及正交试验优化,建... 以从皱边石杉中分离纯化出的99株内生真菌DNA为材料,优选出10条ISSR引物(UBC842、UBC848、UBC850、UBC856、UBC861、UBC864、UBC868、UBC873、UBC880、UBC887)的最适退火温度,并对其进行ISSR–PCR反应体系单因素试验及正交试验优化,建立皱边石杉内生真菌ISSR–PCR的优化反应体系,即25μL反应体系中,10×PCR Buffer(Mg2+浓度为2.0 mmol/L)2.5μL,dNTPs(10 mmol/L)0.6μL,引物(10 pmol/μL)2.0μL,Taq E(1 U/μL)1.5μL,DNA模板(10 ng/μL)3μL,无菌ddH2O 15.4μL。以UBC873引物对99株内生真菌基因组DNA进行PCR扩增,初步获知皱边石杉内生真菌资源的遗传多样性非常丰富。 展开更多
关键词 皱边石杉 内生真菌 内部简单重复序列 正交试验
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黑木耳总DNA提取及PCR-ISSR引物筛选 被引量:4
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作者 曾晓丽 汪思迪 程水明 《湖北农业科学》 北大核心 2009年第12期2926-2928,共3页
以14个黑木耳[Auricularia auricula(L.ex Hook)Underw]菌株为试材,对黑木耳总DNA提取方法和ISSR-PCR扩增反应条件及引物进行了筛选。结果表明,改进的SDS抽提法可以在较短时间内提取到高纯度的DNA产物;并筛选出了可产生遗传多样性的15... 以14个黑木耳[Auricularia auricula(L.ex Hook)Underw]菌株为试材,对黑木耳总DNA提取方法和ISSR-PCR扩增反应条件及引物进行了筛选。结果表明,改进的SDS抽提法可以在较短时间内提取到高纯度的DNA产物;并筛选出了可产生遗传多样性的15条引物,其中引物ISSR11、ISSR12、ISSR14扩增结果的稳定性好、多态性强。经凝胶电泳比较,引物ISSR14可作为黑木耳PCR–ISSR反应的适宜引物。 展开更多
关键词 黑木耳 内部简单重复序列分子标记 DNA提取 引物筛选
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ISSR标记技术辅助形态学的红曲菌株分类鉴定 被引量:6
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作者 朱丽萍 陈福生 +2 位作者 杨强 陈申习 邵彦春 《中国酿造》 CAS 北大核心 2020年第8期175-181,共7页
以市售红曲产品中分离的17株红曲菌株和8株标准菌株为主要材料,根据它们的菌落形态和显微形态特征进行分类,25株菌株归为6类。同时,运用内部简单重复序列(ISSR)标记分类法进行聚类分析,在相似性水平为0.9时,25株菌株聚为5类。综合形态... 以市售红曲产品中分离的17株红曲菌株和8株标准菌株为主要材料,根据它们的菌落形态和显微形态特征进行分类,25株菌株归为6类。同时,运用内部简单重复序列(ISSR)标记分类法进行聚类分析,在相似性水平为0.9时,25株菌株聚为5类。综合形态学分类鉴定法和ISSR标记分类法结果,25株红曲菌株被聚为3大类,分别是红色红曲菌(Monascus ruber)、紫色红曲菌(Monascus purpureus)和血红红曲菌(Monascus sanguineus)。结果表明,传统形态学分类方法结合ISSR标记分类法能为红曲菌株的分类鉴定提供综合参考信息。也可为了解市售红曲相关发酵产品生产菌株的分类与特征、进一步发掘和保护红曲菌株资源提供参考。 展开更多
关键词 红曲菌 形态 内部简单重复序列 分类鉴定
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黑木耳栽培菌株亲缘关系的ISSR分析 被引量:12
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作者 任广明 李滇华 +1 位作者 郭兴 高云虹 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期99-101,共3页
采用ISSR分析标记技术对黑龙江省伊春地区23个黑木耳主栽品种进行DNA指纹图谱分析,在选用的10个引物中,有6个引物扩增得到较清晰、稳定、多态性强的指纹图谱。运用NTSYS软件进行聚类分析,相似水平为0.70时,可将23个黑木耳菌株分为3个组... 采用ISSR分析标记技术对黑龙江省伊春地区23个黑木耳主栽品种进行DNA指纹图谱分析,在选用的10个引物中,有6个引物扩增得到较清晰、稳定、多态性强的指纹图谱。运用NTSYS软件进行聚类分析,相似水平为0.70时,可将23个黑木耳菌株分为3个组群。结果表明,伊春地区黑木耳栽培菌株遗传背景差异不大,存在同物异名现象,ISSR标记可用于黑木耳栽培菌株鉴定、遗传作图、遗传多样性等研究。 展开更多
关键词 内部简单重复序列 黑木耳 聚类分析
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