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淡色库蚊rDNA-ITS2基因的克隆分析
被引量:
7
1
作者
耿艺介
高世同
+3 位作者
黄达娜
庾蕾
宋红改
张仁利
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第9期887-890,共4页
目的克隆并鉴定淡色库蚊核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因并应用于现场孽生蚊媒的种属鉴定,从而为孽生现场的蚊媒预警提供分子生物学依据。方法设计淡色库蚊诊断性引物分别对淡色库蚊实验室标准株及从现场采集的蚊虫的rDNA-ITS...
目的克隆并鉴定淡色库蚊核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因并应用于现场孽生蚊媒的种属鉴定,从而为孽生现场的蚊媒预警提供分子生物学依据。方法设计淡色库蚊诊断性引物分别对淡色库蚊实验室标准株及从现场采集的蚊虫的rDNA-ITS2序列进行PCR扩增,PCR产物纯化后连接到pGEM-Teasy载体上并转化到DH5α菌中,然后对其进行DNA序列测定及分析。结果成功克隆了淡色库蚊的rDNA-ITS2基因。序列分析结果表明,实验中所克隆到的淡色库蚊的rDNA-ITS2序列与GenBank所登录的淡色库蚊的rDNA-ITS2序列同源性均为98%以上,同时发现孽生现场存在淡色库蚊。结论rDNA-ITS2序列在淡色库蚊中具有种属特异性,可为孽生现场的蚊媒预警提供分子生物学依据。
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关键词
淡色库蚊
核糖体DNA
内转录第二间隔区
聚合酶链反应
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职称材料
黑龙江与广州颚口线虫幼虫分离株的形态学观察及其分子鉴定
被引量:
8
2
作者
李雯雯
李树清
+4 位作者
张子群
李健
陈志飞
王艳
黄维义
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期104-107,共4页
本研究从来自黑龙江及广州地区的泥鳅中分离到10条颚口线虫幼虫,采用光学显微镜观察幼虫的形态特征,并对虫体的ITS2与CO1基因进行扩增测序、系统发育分析以鉴定虫种。结果显示10条颚口线虫幼虫头球均有3环小钩,其形态学特征与日本颚口线...
本研究从来自黑龙江及广州地区的泥鳅中分离到10条颚口线虫幼虫,采用光学显微镜观察幼虫的形态特征,并对虫体的ITS2与CO1基因进行扩增测序、系统发育分析以鉴定虫种。结果显示10条颚口线虫幼虫头球均有3环小钩,其形态学特征与日本颚口线虫(Gnathostoma nipponicum)第3期幼虫相符。序列分析结果显示与GenBank中登录的日本颚口线虫ITS2和CO1基因的同源性分别为100%和99%。邻位连接法构建的50%一致树也均与日本颚口线虫处于同一分支。表明从黑龙江及广州地区泥鳅中分离的颚口线虫幼虫为日本颚口线虫幼虫,首次证明了中国存在日本颚口线虫。
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关键词
日本颚口线虫
泥鳅
核糖体
第二
内转录
间隔
区
线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基
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职称材料
基于ITS2序列的藁本与常见混伪品的分子鉴定
被引量:
14
3
作者
高婷
姚辉
陈士林
《世界科学技术-中医药现代化》
2011年第2期418-423,共6页
本文对药材藁本及其常见混伪品的rDNA ITS2进行了PCR扩增、测序,并运用MEGA软件对该区进行序列分析,比较了ITS2碱基序列的差异及其规律,同时为药材藁本及混伪品的指纹图谱鉴别提供分子标记。结果显示辽藁本的种内差异较小,而与其主...
本文对药材藁本及其常见混伪品的rDNA ITS2进行了PCR扩增、测序,并运用MEGA软件对该区进行序列分析,比较了ITS2碱基序列的差异及其规律,同时为药材藁本及混伪品的指纹图谱鉴别提供分子标记。结果显示辽藁本的种内差异较小,而与其主要混伪品间存在较大的变异,差异性范围为5.7%~35.3%。根据ITS2序列特征构建的系统树,药材藁本的样品紧密的聚在一起,和其混伪品可以明确区分,支持率为100%。此外,ITS2的二级结构可作为鉴定药材藁本及混伪品种的一个方法,具有一定的系统学及分类学意义。本研究表明rDNA ITS2序列分析可作为药材藁本与混伪品的一种有效的分子鉴定方法,具有重要的应用价值。
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关键词
藁本
混伪品
核糖体DNA
第二
内转录
间隔
区
(rDNA
ITS2)
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职称材料
藻类rDNA特异性片段长度多态性在溺死鉴定中的应用
被引量:
4
4
作者
袁文勇
汤晓蕙
+1 位作者
周顺平
俞卫东
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2018年第5期516-519,共4页
目的通过检验水体和人体器官中硅藻核糖体DNA(rDNA) 5.8S部分序列、第二内转录间隔区(second internal transcribed spacer,ITS2)序列(5.8S+ITS2)的长度多态性差异,判断溺水死亡案件中受害人的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被...
目的通过检验水体和人体器官中硅藻核糖体DNA(rDNA) 5.8S部分序列、第二内转录间隔区(second internal transcribed spacer,ITS2)序列(5.8S+ITS2)的长度多态性差异,判断溺水死亡案件中受害人的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被抛尸入水。方法以南京市公安局法医中心受理的2例硅藻检验鉴定案例为对象,利用5.8S+ITS2分子标记的长度多态性,分析藻类生物在水体、人体组织中种群结构的差异。结果案例1中,在受害人肺、肝组织和水体样本中均检出种类相近的硅藻,利用5.8S+ITS2分子标记在死者肺组织和水体样本中均检出330 bp和376 bp两种DNA片段,确定受害人系生前溺水。案例2中,在死者肺、肝组织中均未检出硅藻,利用5.8S+ITS2分子标记在死者肺组织中仅获得1条DNA片段,长度为331 bp,相对荧光单位值非常低,确定受害人系死后抛尸入水。结论本方法检验两案例的实验结果符合实际案情和硅藻镜检的结论,利用5.8S+ITS2分子标记研究水体和人体组织中特定微生物的种群结构差异,从而判断溺水死亡的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被抛尸入水等问题具有可行性。
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关键词
法医病理学
法医遗传学
硅藻类
DNA
核糖体
第二
内转录
间隔
区
扩增片段长度多态性分析
溺死
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职称材料
题名
淡色库蚊rDNA-ITS2基因的克隆分析
被引量:
7
1
作者
耿艺介
高世同
黄达娜
庾蕾
宋红改
张仁利
机构
深圳市疾病预防控制中心分子生物学实验室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第9期887-890,共4页
文摘
目的克隆并鉴定淡色库蚊核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因并应用于现场孽生蚊媒的种属鉴定,从而为孽生现场的蚊媒预警提供分子生物学依据。方法设计淡色库蚊诊断性引物分别对淡色库蚊实验室标准株及从现场采集的蚊虫的rDNA-ITS2序列进行PCR扩增,PCR产物纯化后连接到pGEM-Teasy载体上并转化到DH5α菌中,然后对其进行DNA序列测定及分析。结果成功克隆了淡色库蚊的rDNA-ITS2基因。序列分析结果表明,实验中所克隆到的淡色库蚊的rDNA-ITS2序列与GenBank所登录的淡色库蚊的rDNA-ITS2序列同源性均为98%以上,同时发现孽生现场存在淡色库蚊。结论rDNA-ITS2序列在淡色库蚊中具有种属特异性,可为孽生现场的蚊媒预警提供分子生物学依据。
关键词
淡色库蚊
核糖体DNA
内转录第二间隔区
聚合酶链反应
Keywords
Culex. pipiens pallens
rDNA
ITS2
PCR
分类号
R383.2 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
黑龙江与广州颚口线虫幼虫分离株的形态学观察及其分子鉴定
被引量:
8
2
作者
李雯雯
李树清
张子群
李健
陈志飞
王艳
黄维义
机构
广西大学动物科学技术学院
上海出入境检验检疫局
黑龙江出入境检验检疫局
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期104-107,共4页
基金
国家质检总局科技专项(2010IK013)
上海市科委标准专项(11dz0503100)
文摘
本研究从来自黑龙江及广州地区的泥鳅中分离到10条颚口线虫幼虫,采用光学显微镜观察幼虫的形态特征,并对虫体的ITS2与CO1基因进行扩增测序、系统发育分析以鉴定虫种。结果显示10条颚口线虫幼虫头球均有3环小钩,其形态学特征与日本颚口线虫(Gnathostoma nipponicum)第3期幼虫相符。序列分析结果显示与GenBank中登录的日本颚口线虫ITS2和CO1基因的同源性分别为100%和99%。邻位连接法构建的50%一致树也均与日本颚口线虫处于同一分支。表明从黑龙江及广州地区泥鳅中分离的颚口线虫幼虫为日本颚口线虫幼虫,首次证明了中国存在日本颚口线虫。
关键词
日本颚口线虫
泥鳅
核糖体
第二
内转录
间隔
区
线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基
Keywords
Gnathostoma nipponicum
loach (Misgurnus anguillicaudatus)
internal transcribed spacer region 2 (ITS2)
cytochrome coxidase subunit 1 (CO1)
分类号
S852.7 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
基于ITS2序列的藁本与常见混伪品的分子鉴定
被引量:
14
3
作者
高婷
姚辉
陈士林
机构
青岛农业大学生命科学学院
中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
2011年第2期418-423,共6页
基金
卫生部卫生行业科研专项(200802043):药用植物DNA barcoding(条形码)鉴定研究
负责人:陈士林
文摘
本文对药材藁本及其常见混伪品的rDNA ITS2进行了PCR扩增、测序,并运用MEGA软件对该区进行序列分析,比较了ITS2碱基序列的差异及其规律,同时为药材藁本及混伪品的指纹图谱鉴别提供分子标记。结果显示辽藁本的种内差异较小,而与其主要混伪品间存在较大的变异,差异性范围为5.7%~35.3%。根据ITS2序列特征构建的系统树,药材藁本的样品紧密的聚在一起,和其混伪品可以明确区分,支持率为100%。此外,ITS2的二级结构可作为鉴定药材藁本及混伪品种的一个方法,具有一定的系统学及分类学意义。本研究表明rDNA ITS2序列分析可作为药材藁本与混伪品的一种有效的分子鉴定方法,具有重要的应用价值。
关键词
藁本
混伪品
核糖体DNA
第二
内转录
间隔
区
(rDNA
ITS2)
Keywords
Ligustici Rhizoma et Radix, adulterant, second internal transcribed spacer of ribosomal DNA (rDNA ITS2)
分类号
R384.1 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
藻类rDNA特异性片段长度多态性在溺死鉴定中的应用
被引量:
4
4
作者
袁文勇
汤晓蕙
周顺平
俞卫东
机构
南京市公安局刑事科学技术研究所
出处
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2018年第5期516-519,共4页
基金
南京市公安局科研资助项目(K2013016)
文摘
目的通过检验水体和人体器官中硅藻核糖体DNA(rDNA) 5.8S部分序列、第二内转录间隔区(second internal transcribed spacer,ITS2)序列(5.8S+ITS2)的长度多态性差异,判断溺水死亡案件中受害人的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被抛尸入水。方法以南京市公安局法医中心受理的2例硅藻检验鉴定案例为对象,利用5.8S+ITS2分子标记的长度多态性,分析藻类生物在水体、人体组织中种群结构的差异。结果案例1中,在受害人肺、肝组织和水体样本中均检出种类相近的硅藻,利用5.8S+ITS2分子标记在死者肺组织和水体样本中均检出330 bp和376 bp两种DNA片段,确定受害人系生前溺水。案例2中,在死者肺、肝组织中均未检出硅藻,利用5.8S+ITS2分子标记在死者肺组织中仅获得1条DNA片段,长度为331 bp,相对荧光单位值非常低,确定受害人系死后抛尸入水。结论本方法检验两案例的实验结果符合实际案情和硅藻镜检的结论,利用5.8S+ITS2分子标记研究水体和人体组织中特定微生物的种群结构差异,从而判断溺水死亡的落水地点以及受害人系生前落水还是死后被抛尸入水等问题具有可行性。
关键词
法医病理学
法医遗传学
硅藻类
DNA
核糖体
第二
内转录
间隔
区
扩增片段长度多态性分析
溺死
Keywords
forensic pathology
forensic genetics
diatoms
DNA,ribosomal
second internal transcribed spacer
amplified fragment length polymorphism analysis
death from drowning
分类号
DF795.1 [医药卫生—法医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
淡色库蚊rDNA-ITS2基因的克隆分析
耿艺介
高世同
黄达娜
庾蕾
宋红改
张仁利
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
7
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
黑龙江与广州颚口线虫幼虫分离株的形态学观察及其分子鉴定
李雯雯
李树清
张子群
李健
陈志飞
王艳
黄维义
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于ITS2序列的藁本与常见混伪品的分子鉴定
高婷
姚辉
陈士林
《世界科学技术-中医药现代化》
2011
14
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
藻类rDNA特异性片段长度多态性在溺死鉴定中的应用
袁文勇
汤晓蕙
周顺平
俞卫东
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2018
4
在线阅读
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职称材料
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