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纽荷尔脐橙叶片和幼果内生细菌群落多样性及其功能预测被引量：1: 1; 作者游婧刘冰 +5 位作者熊桂红蒋军喜宋珏萍雷若琦朱珍谢忠建《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期884-893,共10页; 【目的】柑橘溃疡病是脐橙上的一种重要病害,影响其发生的因素较多。通过了解纽荷尔脐橙内生细菌群落组成和其潜在的生物学功能,探索内生细菌在脐橙感染溃疡病中的作用。【方法】从纽荷尔脐橙树上随机采集未表现任何病害症状的幼果和嫩... 展开更多; 关键词纽荷尔脐橙内生细菌多样性功能预测高通量测序群落结构 Tax4Fun功能预测; 在线阅读下载PDF 职称材料

腾冲红花油茶花梗内生细菌的多样性: 2; 作者黄融吴晓漫 +5 位作者荀利杰孟庆鑫田亚凯董坤龚雪阳董霞《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1997-2004,共8页; 【目的】探究腾冲红花油茶花梗内生细菌群落结构及其多样性,为腾冲红花油茶花梗中有益微生物的筛选和利用提供科学依据。【方法】采集12和60年生树龄的腾冲红花油茶花梗,基于高通量测序技术探究其内生细菌多样性及群落结构差异。【结果... 展开更多; 关键词腾冲红花油茶树龄内生细菌多样性高通量测序; 在线阅读下载PDF 职称材料

火棘不同组织内生细菌群落多样性被引量：3: 3; 作者张丽芳胡海林 +5 位作者桂腾茸高秀徐晴芳朱铃徐启贺蔡建《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1193-1200,共8页; 为了解火棘不同组织内生细菌群落多样性,该研究采用高通量测序技术对火棘内生细菌16S rRNA V5~V7可变区进行测序,分析火棘不同组织部位内生细菌群落多样性。结果表明:(1)从火棘根、茎、叶组织中共获得内生细菌OTU 1818个,其中根部754个... 展开更多; 关键词火棘不同组织内生细菌群落多样性高通量测序技术功能预测; 在线阅读下载PDF 职称材料

植物内生细菌对植物健康的作用被引量：5: 4; 作者张淑婷周利华赵文卓《植物医生》 2020年第1期6-11,共6页; 植物内生菌是一个多样性十分丰富的微生物类群,存在于没有外在感染症状的健康植物组织内,并与宿主植物协同进化.随着研究领域的不断拓宽和研究方法的不断更新,植物内生菌与植物健康的关系以及应用逐渐成为研究热点.本文主要综述了内生... 展开更多; 关键词植物内生细菌内生细菌多样性应用功能; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名纽荷尔脐橙叶片和幼果内生细菌群落多样性及其功能预测被引量：1: 1; 作者游婧刘冰熊桂红蒋军喜宋珏萍雷若琦朱珍谢忠建; 机构江西农业大学农学院; 出处《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期884-893,共10页; 基金国家自然科学基金项目(31460139) 江西省自然科学基金项目(20192BAB214004,20161BAB204184)。; 文摘【目的】柑橘溃疡病是脐橙上的一种重要病害,影响其发生的因素较多。通过了解纽荷尔脐橙内生细菌群落组成和其潜在的生物学功能,探索内生细菌在脐橙感染溃疡病中的作用。【方法】从纽荷尔脐橙树上随机采集未表现任何病害症状的幼果和嫩叶,嫩叶分别在春、夏、秋3个季节进行采样,每个样品设3个重复。对4个样品进行表面消毒后从中提取DNA,PCR在25μL反应体系中进行,扩增产物经20 g/L琼脂糖凝胶电泳检查,选取主条带清晰的400~500 bp片段进行测序。采用基于16S rRNA基因V3-V4可变区的高通量测序技术及Tax4Fun功能预测对纽荷尔脐橙内生细菌菌群及其功能进行了测定和分析。各样本数据在FLASH V1.2.7上进行拼接,利用QIIMEV1.7.0对产生的原始数据进行质控,用Uparse V7.0.10012对有效数据进行聚类,在97%的相似度水平上生成OTU。为每个OTU挑选一个代表序列,并使用SSUrRNA数据库进行物种注释分析使用,获得分类学信息并分别在各个分类水平统计各样本的群落组成,并用MUSCLE(V3.8.31)进行α多样性(样本内)和β多样性(样本间)分析。通过UProC和PAUDA 2种方法将功能信息对应到SILVA数据库中,实现功能注释。【结果】季节和采摘部位对脐橙内生细菌群落组成的多样性和物种丰富度存在一定的差异,脐橙幼果中的内生细菌数量多于叶片,夏季相较于其他季节内生细菌群落丰富度更高;脐橙内生细菌群体在门水平上的组成相似,但丰度占比不同,且厚壁菌门、变形菌门和蓝菌门为主要优势门,各优势细菌纲数目、组成及其丰度随不同脐橙样本而异,芽孢杆菌属为主要优势属;Tax4Fun功能预测显示纽荷尔脐橙内生细菌包含大量关于膜运输、碳水化合物代谢、氨基酸代谢、翻译、复制和修复、能量代谢、辅因子和维生素的代谢等基因信息,其中功能基因丰度较大的为碳水化合物代谢和氨基酸代谢,且脐橙夏天叶片的细胞过程和环境信息处理功能信息高于其他3种样品,幼果的遗传信息处理、新陈代谢、有机系统和人类疾病功能信息高于其他3种样品。【结论】纽荷尔脐橙内生细菌群落多样性丰富,具有大量代谢相关的有益菌,研究结果可为今后探索纽荷尔脐橙内生细菌菌群的利用和柑橘溃疡病的生物防治提供思路。; 关键词纽荷尔脐橙内生细菌多样性功能预测高通量测序群落结构 Tax4Fun功能预测; Keywords Newhall navel orange endophytic bacterial diversity functional prediction high-throughput sequencing community structure Tax4Fun function prediction; 分类号 S436.66 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名腾冲红花油茶花梗内生细菌的多样性: 2; 作者黄融吴晓漫荀利杰孟庆鑫田亚凯董坤龚雪阳董霞; 机构云南农业大学动物科学技术学院/云南农业大学东方蜜蜂研究所/云南省蜜蜂资源可持续利用工程研究中心云南农业大学食品科学技术学院; 出处《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1997-2004,共8页; 基金国家自然科学基金项目(32060241) 国家现代农业产业技术体系(蜂体系)项目(CARS-44-KXJ13)。; 文摘【目的】探究腾冲红花油茶花梗内生细菌群落结构及其多样性,为腾冲红花油茶花梗中有益微生物的筛选和利用提供科学依据。【方法】采集12和60年生树龄的腾冲红花油茶花梗,基于高通量测序技术探究其内生细菌多样性及群落结构差异。【结果】分类操作单元(OTU)和α多样性分析表明,2种树龄腾冲红花油茶花梗内生细菌丰富度和物种种类存在差异。在2种树龄腾冲红花油茶花梗中均检测出4个细菌门,其中变形菌门(Proteobacteria)相对丰度最高,在2组样品中占比均达60%以上。60年生样品检测到的特有细菌属包括游动放线菌属(Actinoplanes)、小单孢菌科未分类属(unclassified_f_Micromonosporaceae)和甲基球菌科未分类属(unclassified_f_Methylopilaceae),优势细菌属为鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、甲基杆菌—原单胞菌属(Methylobacterium-Methylorubrum)、1174-901-12、羊膜杆菌属(Amnibacterium)和Kineosporia;12年生样品的优势细菌属为1174-901-12、鞘氨醇单胞菌属、甲烷氧化细菌属(Methylocella)、酸杆菌属(Terriglobus)和甲基杆菌—原单胞菌属。2组样品中部分内生细菌在门和属水平的相对丰度呈显著差异(P<0.05,下同)。腾冲红花油茶花梗内生细菌的基因功能主要涉及碳水化合物代谢、氨基酸代谢、能量代谢等。【结论】腾冲红花油茶花梗含有丰富的内生细菌,树龄大的腾冲红花油茶花梗中内生细菌多样性和丰富度显著增多,且优势细菌种类和相对丰度也发生改变。挖掘和利用腾冲红花油茶功能菌株时需充分考虑树龄因素。; 关键词腾冲红花油茶树龄内生细菌多样性高通量测序; Keywords Camellia reticulate Lindl tree age diversity of endophytic bacteria high-throughput sequencing; 分类号 S794.4 [农业科学—林木遗传育种]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名火棘不同组织内生细菌群落多样性被引量：3: 3; 作者张丽芳胡海林桂腾茸高秀徐晴芳朱铃徐启贺蔡建; 机构曲靖师范学院云南省高校特色果酒技术创新与应用工程研究中心曲靖师范学院数学与统计学院曲靖师范学院经济与管理学院; 出处《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1193-1200,共8页; 基金云南省教育厅科学研究基金(2022J0808)。; 文摘为了解火棘不同组织内生细菌群落多样性,该研究采用高通量测序技术对火棘内生细菌16S rRNA V5~V7可变区进行测序,分析火棘不同组织部位内生细菌群落多样性。结果表明:(1)从火棘根、茎、叶组织中共获得内生细菌OTU 1818个,其中根部754个,茎部308个,叶部756个,三者共有OTU 152个。(2)物种分类显示,不同火棘组织内生细菌具有丰富的群落多样性,火棘根部内生细菌种类隶属于23门53纲137目216科373属557种,其中异样根瘤菌属(Allorhizobium-Neorhizobium-Pararhizobium-Rhizobium)和链霉菌属(Streptomyces)为优势属,其相对丰度分别为10.57%和8.00%;茎部内生细菌种类隶属于21门32纲76目126科204属270种,其中马赛菌属(Massilia)和未知分类的丛毛单胞菌科属(unclassified_f_Comamonadaceae)为优势属,其相对丰度分别为31.10%和12.82%;叶部内生细菌种类隶属于21门52纲130目210科380属581种,其中土芽孢杆菌属(Geobacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas)为优势属,其相对丰度分别为12.31%和9.84%。(3)PICRUSt功能预测表明,根部内生细菌物种最丰富,参与各种代谢调控的细菌丰度最高。该研究结果为进一步探讨植物内生细菌功能,挖掘新的有益微生物资源提供了参考。; 关键词火棘不同组织内生细菌群落多样性高通量测序技术功能预测; Keywords Pyracantha fortuneana different tissues diversity of endophytic bacterial community high-throughput sequencing technology function prediction; 分类号 Q939 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名植物内生细菌对植物健康的作用被引量：5: 4; 作者张淑婷周利华赵文卓; 机构西南大学植物保护学院; 出处《植物医生》 2020年第1期6-11,共6页; 基金国家烟草专卖局绿色防控重大专项(110201601025 LS-05).; 文摘植物内生菌是一个多样性十分丰富的微生物类群,存在于没有外在感染症状的健康植物组织内,并与宿主植物协同进化.随着研究领域的不断拓宽和研究方法的不断更新,植物内生菌与植物健康的关系以及应用逐渐成为研究热点.本文主要综述了内生细菌的多样性、进入植物组织内的机制以及内生细菌的主要功能及应用,提出了现阶段内生菌研究存在的问题,并展望了内生菌研究的前景.; 关键词植物内生细菌内生细菌多样性应用功能; Keywords endophytic bacteria in plants endophytic bacteria diversity infection mechanism; 分类号 Q939.1 [生物学—微生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	纽荷尔脐橙叶片和幼果内生细菌群落多样性及其功能预测	游婧刘冰熊桂红蒋军喜宋珏萍雷若琦朱珍谢忠建	《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心	2023	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	腾冲红花油茶花梗内生细菌的多样性	黄融吴晓漫荀利杰孟庆鑫田亚凯董坤龚雪阳董霞	《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	火棘不同组织内生细菌群落多样性	张丽芳胡海林桂腾茸高秀徐晴芳朱铃徐启贺蔡建	《广西植物》 CAS CSCD 北大核心	2023	3	在线阅读下载PDF 职称材料
4	植物内生细菌对植物健康的作用	张淑婷周利华赵文卓	《植物医生》	2020	5	在线阅读下载PDF 职称材料