为了探究不同内共生菌感染品系对土耳其斯坦叶螨生殖的调控效果,通过系统发育分析沃尔巴克氏体(Wolbachia)、Cardinium所属群组,用RNA-Seq对分别感染Wolbachia、Cardinium及共同感染Wolbachia、Cardinium的雌成螨进行转录组学分析,并用...为了探究不同内共生菌感染品系对土耳其斯坦叶螨生殖的调控效果,通过系统发育分析沃尔巴克氏体(Wolbachia)、Cardinium所属群组,用RNA-Seq对分别感染Wolbachia、Cardinium及共同感染Wolbachia、Cardinium的雌成螨进行转录组学分析,并用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与生殖调控相关的基因。结果表明,Wolbachia属于B群,Cardinium归属于A群。不同内共生菌感染对土耳其斯坦叶螨转录水平产生了显著影响,其中A-WC-F vs A-F的差异基因最多,而A-W-F vs A-F的差异基因最少。基因本体(GO)功能富集结果显示,A-W-F vs A-F、A-C-F vs A-F均富集在蛋白质去泛素化、泛素蛋白转移酶活性等条目,A-WC-F vs A-F富集到蛋白水解、脂质转运体活性等条目。KEGG通路富集结果显示,3个比较组合均富集到FoxO信号通路、Wnt信号通路,A-W-F vs A-F、A-C-F vs A-F还富集到泛素介导的蛋白水解。对生殖调控相关的差异表达基因进行分析,结果显示,大部分基因与泛素化相关,如编码Fizzled、CK1、E1、E2和E3等的基因。进一步通过WGCNA进行分析,鉴定出2个模块与内共生菌感染高度相关,并筛选出调控生殖相关的关键基因,这些基因可能在生殖调控中发挥重要作用。研究结果可为深入探讨内共生菌对宿主生殖调控机制提供参考。展开更多
文摘为了探究不同内共生菌感染品系对土耳其斯坦叶螨生殖的调控效果,通过系统发育分析沃尔巴克氏体(Wolbachia)、Cardinium所属群组,用RNA-Seq对分别感染Wolbachia、Cardinium及共同感染Wolbachia、Cardinium的雌成螨进行转录组学分析,并用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与生殖调控相关的基因。结果表明,Wolbachia属于B群,Cardinium归属于A群。不同内共生菌感染对土耳其斯坦叶螨转录水平产生了显著影响,其中A-WC-F vs A-F的差异基因最多,而A-W-F vs A-F的差异基因最少。基因本体(GO)功能富集结果显示,A-W-F vs A-F、A-C-F vs A-F均富集在蛋白质去泛素化、泛素蛋白转移酶活性等条目,A-WC-F vs A-F富集到蛋白水解、脂质转运体活性等条目。KEGG通路富集结果显示,3个比较组合均富集到FoxO信号通路、Wnt信号通路,A-W-F vs A-F、A-C-F vs A-F还富集到泛素介导的蛋白水解。对生殖调控相关的差异表达基因进行分析,结果显示,大部分基因与泛素化相关,如编码Fizzled、CK1、E1、E2和E3等的基因。进一步通过WGCNA进行分析,鉴定出2个模块与内共生菌感染高度相关,并筛选出调控生殖相关的关键基因,这些基因可能在生殖调控中发挥重要作用。研究结果可为深入探讨内共生菌对宿主生殖调控机制提供参考。
基金国家重点研发计划项目(2021YFD160014101-02)湖北省重点研发计划项目(2020BBB061)资助+1 种基金supported by the National Key Research and Development Program of China(2021YFD160014101-02)the National Key Research and Development Program of Hubei Province(2020BBB061)。
基金supported by the Natural Science Foundation of Hunan Province(2020JJ5404,2022JJ30871)the Hunan Health Commission Research Grant(202108011054)the Clinical Medical Boot Technology Innovation Project of Hunan Province(2021SK53602),China.
