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巴斯德杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立与初步应用
1
作者
邢进
冯育芳
+3 位作者
岳秉飞
贺争鸣
孙晓梅
代解杰
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2017年第1期85-90,共6页
目的建立巴斯德杆菌的CODEHOP PCR快速检测方法,为实验动物的呼吸道细菌的控制提供参考。方法应用CODEHOP在线简并引物设计工具,比对Genbank中13株巴斯德杆菌的RNA聚合酶β亚基(rpo B)氨基酸序列设计简并引物。对建立CODEHOP PCR方法用2...
目的建立巴斯德杆菌的CODEHOP PCR快速检测方法,为实验动物的呼吸道细菌的控制提供参考。方法应用CODEHOP在线简并引物设计工具,比对Genbank中13株巴斯德杆菌的RNA聚合酶β亚基(rpo B)氨基酸序列设计简并引物。对建立CODEHOP PCR方法用21株参考菌株进行特异性和敏感性评价,并应用于实验动物中的巴斯德杆菌检测。结果简并引物Past F6/PastR5扩增标准菌株的目的片段为200 bp左右。能够区分受试的巴斯德杆菌和主要的实验动物呼吸道病原菌。敏感性为0.2 pg/μL^2 pg/μL。在受试的609只实验动物中呼吸道样品中检测出巴斯德杆菌阳性率为19.1%。样品阳性片段经测序验证,准确率为100%。结论所建立的方法具有良好的特异性和敏感性,可用于动物样品中巴斯德杆菌的检测。
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关键词
巴斯德杆菌
共有序列简并杂合寡核苷酸引物
PCR检测
实验动物
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题名
巴斯德杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立与初步应用
1
作者
邢进
冯育芳
岳秉飞
贺争鸣
孙晓梅
代解杰
机构
中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所
中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心
出处
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2017年第1期85-90,共6页
基金
国家科技支撑计划项目(2014BAI01B01)
文摘
目的建立巴斯德杆菌的CODEHOP PCR快速检测方法,为实验动物的呼吸道细菌的控制提供参考。方法应用CODEHOP在线简并引物设计工具,比对Genbank中13株巴斯德杆菌的RNA聚合酶β亚基(rpo B)氨基酸序列设计简并引物。对建立CODEHOP PCR方法用21株参考菌株进行特异性和敏感性评价,并应用于实验动物中的巴斯德杆菌检测。结果简并引物Past F6/PastR5扩增标准菌株的目的片段为200 bp左右。能够区分受试的巴斯德杆菌和主要的实验动物呼吸道病原菌。敏感性为0.2 pg/μL^2 pg/μL。在受试的609只实验动物中呼吸道样品中检测出巴斯德杆菌阳性率为19.1%。样品阳性片段经测序验证,准确率为100%。结论所建立的方法具有良好的特异性和敏感性,可用于动物样品中巴斯德杆菌的检测。
关键词
巴斯德杆菌
共有序列简并杂合寡核苷酸引物
PCR检测
实验动物
Keywords
Pasteurella spp.
CODEHOP
PCR detection
Laboratory animals
分类号
R-332 [医药卫生]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
巴斯德杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立与初步应用
邢进
冯育芳
岳秉飞
贺争鸣
孙晓梅
代解杰
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2017
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