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O^6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶基因表达与胃癌发生的关系 被引量:4
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作者 曾桃英 孙幼芳 +3 位作者 段家华 周祖良 王君 刘俐敏 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期84-86,共3页
目的研究人胃癌组织O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)基因的表达特点及其与胃癌发生的关系。方法应用加强型原位杂交方法及寡核苷酸探针高效标记技术对76例胃癌组织、73例癌旁组织、20例正常胃组织进行MGMT基因标记检测,同时应用自... 目的研究人胃癌组织O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)基因的表达特点及其与胃癌发生的关系。方法应用加强型原位杂交方法及寡核苷酸探针高效标记技术对76例胃癌组织、73例癌旁组织、20例正常胃组织进行MGMT基因标记检测,同时应用自动图像分析系统进行定量分析。结果胃癌组织MGMT基因阳性表达率为40.8%(31/76),低于正常胃组织的60.0%(12/20),MGMT表达强阳性率为32.3%(10/31),也明显低于正常组织的83.3%(10/12),差异均有显著性意义(P<0.01或P<0.05);癌旁组织MGMT基因阳性表达率为46.6%(34/73),MG-MT表达强阳性率为41.1%(14/34),与胃癌组织差异无显著性意义。定量分析示,胃癌组织MGMT阳性表达的积分吸光度、阳性单位值明显低于正常组织(P<0.05)。胃癌组织与癌旁组织、早期胃癌与进展期胃癌组织、癌旁不同程度不典型增生之间MGMT表达无明显差异。结论人体胃组织存在高度表达的MGMT基因,胃癌发生与MGMT基因表达水平降低有关,MGMT基因异常表达是胃癌形态学改变出现之前的早期行为。 展开更多
关键词 O^6-甲基鸟嘌呤-dna-甲基转移 基因表达 胃癌
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MRI影像组学术前预测较低级别胶质瘤IDH突变合并MGMT启动子甲基化亚型的价值 被引量:9
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作者 沙永建 王效春 +2 位作者 谭艳 张辉 杨国强 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期6-11,共6页
目的探讨使用MRI影像组学的方法,建立一个用于预测较低级别胶质瘤(lower grade gliomas,LGGs)异柠檬酸脱氢酶突变(isocitrate dehydrogenase mutation,IDH mut)合并氧6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶启动子甲基化(O^(6)-methylguanine-DNA me... 目的探讨使用MRI影像组学的方法,建立一个用于预测较低级别胶质瘤(lower grade gliomas,LGGs)异柠檬酸脱氢酶突变(isocitrate dehydrogenase mutation,IDH mut)合并氧6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶启动子甲基化(O^(6)-methylguanine-DNA methyltransferase promoter methylation,MGMT meth)亚型的影像组学模型。材料与方法回顾性分析来自山西医科大学第一医院、山西省人民医院和TCGA/TCIA(The Cancer Genome Atlas和The Cancer Imaging Archive)公共数据库的158例患者的术前MRI图像、临床和基因信息。将上述三处数据合并,对所有图像进行重采样和强度归一化处理后,以7∶3的比例随机分为训练集和测试集。从术前MRI图像上提取对比增强后T1加权序列(post-contrast enhanced T1-weighted,CE-T1)和T2加权流体衰减反转恢复序列(T2-weighted fluid attenuation inversion recovery,T2-FLAIR)的1702个影像组学特征。通过单因素逻辑回归(logistic regression,LR)、最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)进行有效特征筛选,使用合成少数过采样技术(synthetic minority over-sampling technique,SMOTE)对训练集少数类样本进行数据平衡。最后,使用多因素LR进行建模。通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线和校准曲线评价模型诊断效能和拟合优度,并建立列线图进行可视化风险预测。结果在训练集和测试集两个亚型的不同临床特征的组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。影像组学模型在训练集和测试集的AUC(area under the curve,AUC)分别为0.842和0.935,F-Measure分别为0.965和0.942,训练集校准曲线经Hosmer-Lemeshow检验的P值为0.1393。结论术前MRI影像组学模型可以预测LGGs患者IDH mut合并MGMT meth亚型,从而为LGGs患者的分子分型的精确诊断、替莫唑胺(temozolomide,TMZ)使用的决策、生存期预测提供重要的临床辅助价值。 展开更多
关键词 较低级别胶质瘤 影像组学 磁共振成像 异柠檬酸脱氢 6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移 分子分型
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动态对比增强及平均表观传播子磁共振成像在预测高级别胶质瘤MGMT启动子甲基化状态中的应用价值 被引量:4
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作者 袁鹏翾 高阳 +2 位作者 吴琼 张华鹏 王少彧 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期85-91,共7页
目的 探讨应用平均表观传播子MRI(mean apparent propagator-magnetic resonance imaging, MAP-MRI)及动态对比增强MRI(dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging, DCE-MRI)预测3、4级胶质瘤患者O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转... 目的 探讨应用平均表观传播子MRI(mean apparent propagator-magnetic resonance imaging, MAP-MRI)及动态对比增强MRI(dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging, DCE-MRI)预测3、4级胶质瘤患者O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyhransferase, MGMT)启动子甲基化状态的可行性。材料与方法 前瞻性纳入本院自2018年6月至2022年1月经病理证实的14例MGMT启动子甲基化和17例MGMT启动子非甲基化胶质瘤患者,进行了术前常规MRI、DCE-MRI及MAP-MRI扫描。通过手动勾画肿瘤实质区域为感兴趣区(region of interest, ROI)并提取ROI定量参数特征,测量DCE-MRI参数及MAP-MRI参数。参数与MGMT甲基化间的相关性采用Pearson相关分析。所有参数均采用两独立样本t检验,比较DCE-MRI和MAP-MRI对预测3、4级胶质瘤MGMT启动子甲基化状态的诊断效能。进一步建立单因素和多因素logistic回归模型,分析构建受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线,以DeLong检验比较DCE-MRI参数、MAP-MRI参数与多参数联合模型预测MGMT甲基化的诊断效果。结果 DCE-MRI参数容积转运常数(volume transfer constant,Ktrans)、血管外细胞外容积分数(fractional volume of the extravascular-extracellular space, Ve)以及MAP-MRI参数非高斯(non-Gaussianity, NG)、非高斯轴向(non-Gaussianity axial, NGAx)、Q空间逆方差(Q-space inverse variance,QIV)、返回原点概率(return to the origin probability, RTOP)、返回轴线概率(return to the axis probability,RTAP)与MGMT启动子甲基化间呈中等相关性,对预测3、4级胶质瘤MGMT启动子甲基化与非甲基化组间差异具有统计学意义(P<0.05);ROC曲线下面积(area under the curve, AUC)分别为0.803、0.815、0.807、0.803、0.765、0.790、0.739。多因素logistic分析显示Ve是预测MGMT启动子甲基化的最佳预测因子,其准确性最高,AUC为0.815(95%CI:0.659~0.971),比值比(odds ratio, OR)为0.891(95%CI:0.815~0.975)。DeLong检验结果表明DCE-MRI和MAP-MRI多参数联合后预测胶质瘤MGMT启动子甲基化状态的诊断效能最高,AUC为0.992。结论 DCE-MRI和MAP-MRI对于预测高级别胶质瘤MGMT启动子甲基化状态具有一定的应用价值,同时应用两者联合诊断将有助于进一步提高诊断的效能。 展开更多
关键词 高级别胶质瘤 磁共振成像 动态对比增强磁共振成像 平均表观传播子磁共振成像 O6-甲基鸟嘌呤-dna-甲基转移 分子分型
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基于多序列MRI的卷积神经网络预测胶质瘤MGMT启动子甲基化状态 被引量:3
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作者 陈晓华 张若弟 +4 位作者 周云舒 刘世莉 王卓 张少茹 陈志强 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期34-39,78,共7页
目的 探讨基于多序列MRI的卷积神经网络模型预测脑胶质瘤O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase, MGMT)启动子甲基化状态的价值。材料与方法 回顾性分析宁夏医科大学总医院2015年11月至2022年6月经手术... 目的 探讨基于多序列MRI的卷积神经网络模型预测脑胶质瘤O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA methyltransferase, MGMT)启动子甲基化状态的价值。材料与方法 回顾性分析宁夏医科大学总医院2015年11月至2022年6月经手术病理证实的161例胶质瘤患者的临床及MRI影像资料,其中MGMT启动子甲基化型80例,未甲基化型81例。收集术前MRI的T2WI、T2液体衰减反转恢复(T2 fluid attenuated inversion recovery, T2-FLAIR)及对比增强T1WI (contrast enhanced T1WI, CE-T1WI)序列,对所有图像预处理后,勾画感兴趣区(region of interest, ROI)。对图像进行标注后按照7∶3随机分为训练集和验证集。使用34层残差神经网络(34-layer-residual convolutional neural network, ResNet34)分别建立基于T2WI、T2-FLAIR、CE-T1WI的单序列模型T2-net、T2f-net、TC-net和多序列融合模型TS-net,预测MGMT启动子甲基化状态。采用受试者工作特征曲线下面积(area under the receiver operating characteristic, AUROC)、精确度-召回率曲线下面积(area under the precision-recall curve, AUPRC)、准确度、特异度和敏感度评估模型效能,通过DeLong检验比较模型间的预测效能。结果 四个预测模型T2-net、T2f-net、TC-net、TS-net均有良好的预测效能,TS-net的AUROC值均高于T2-net、T2f-net、TC-net(训练集:0.930 vs. 0.859、0.877、0.920;验证集:0.910 vs. 0.812、0.840、0.854),TS-net的AUPRC值均高于T2-net、T2f-net、TC-net(训练集:0.912 vs. 0.860、0.864、0.908;验证集:0.896 vs. 0.796、0.826、0.839)。验证集中TS-net的AUROC值均高于T2-net、T2f-net、TC-net,差异均有统计学意义,训练集中与T2-net、T2f-net相比差异有统计学意义(DeLong检验,P<0.05)。结论 基于多序列MRI融合的卷积神经网络模型,可以准确、无创地预测胶质瘤MGMT甲基化状态,优于单一序列模型,为指导临床治疗决策和评估胶质瘤患者预后提供可靠依据。 展开更多
关键词 成人弥漫胶质瘤 磁共振成像 深度学习 卷积神经网络 O6-甲基鸟嘌呤-dna-甲基转移 分子分型
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逆病毒载体介导的双耐药基因在小鼠骨髓细胞的转移 被引量:3
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作者 周鑫莉 王季石 +1 位作者 顾静文 林果为 《复旦学报(医学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第1期1-5,共5页
目的 增强造血细胞对化疗药物的耐受性 ,探讨逆转录病毒介导的基因转移效率及耐药基因导入在造血细胞保护性基因治疗中的作用。方法 应用电穿孔基因转移法将逆转录病毒载体G1Na MGMT IRES MDR1导入病毒包装细胞GP +E86及PA3 17,以VCR... 目的 增强造血细胞对化疗药物的耐受性 ,探讨逆转录病毒介导的基因转移效率及耐药基因导入在造血细胞保护性基因治疗中的作用。方法 应用电穿孔基因转移法将逆转录病毒载体G1Na MGMT IRES MDR1导入病毒包装细胞GP +E86及PA3 17,以VCR加压筛选后的阳性克隆上清感染小鼠骨髓细胞 ,应用PCR、Southernblot及流式细胞仪检测耐药基因MGMT及MDR1在细胞中的转移与表达。结果 加压筛选及乒乓效应使病毒滴度由 ( 0 .2~ 7.6)× 10 4CFU/mL提高到 ( 1.9~ 5 .7)× 10 6 CFU/mL ,从DNA、RNA及蛋白水平上分别证实了双耐药基因在小鼠骨髓细胞中获得了有效转移和表达 ,而转基因后的小鼠骨髓细胞对VCR、高三尖杉酯碱和BCNU的耐药性比未转导细胞分别提高了 5 .7、5 .0和 8.5倍。结论 双耐药基因成功导入小鼠骨髓细胞为肿瘤基因治疗的临床研究提供了实验基础。 展开更多
关键词 逆转录病毒载体 耐药基因 六氧甲基鸟嘌呤-dna-甲基转移酶 多药耐药基因 基因转移 骨髓细胞 小鼠 肿瘤
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DNA修复酶MGMT及Ki-67在星形细胞瘤中的表达及临床意义 被引量:3
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作者 王丽萍 孙逊 +3 位作者 邹亚彬 张俊阁 李波 曹阳 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期549-551,共3页
目的:观察脑星形细胞瘤中DNA修复酶-6氧-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(MGMT)及细胞增殖核抗原(Ki-67)蛋白表达及临床意义。方法:69例样本均来源于神经外科手术切除且临床资料完整、术后病理诊断为星形细胞瘤病例,其中Ⅰ-Ⅱ级34例,Ⅲ... 目的:观察脑星形细胞瘤中DNA修复酶-6氧-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(MGMT)及细胞增殖核抗原(Ki-67)蛋白表达及临床意义。方法:69例样本均来源于神经外科手术切除且临床资料完整、术后病理诊断为星形细胞瘤病例,其中Ⅰ-Ⅱ级34例,Ⅲ级21例,Ⅳ级14例。应用免疫组织化学方法(ABC法)检测样本中MGMT及Ki-67蛋白的表达状况,并进行秩和相关等级检验。结果:星形细胞瘤中MGMT蛋白表达阳性率为60.9%,其中,Ⅰ-Ⅱ级、Ⅲ级和Ⅳ级分别为88.2%、23.5%和50.0%。不同分级之间MGMT蛋白表达比较差异均有显著性(P=0.0031),MGMT阳性表达率与肿瘤分级呈负相关(r=-0.3511,P=0.0031);星形细胞瘤中Ki-67阳性率为62.3%,随肿瘤恶性程度的增加蛋白表达明显增强(P=0.0000),该表达与肿瘤分级呈正相关(r=0.6904,P=0.0000);并且随Ki-67表达强度的增加,MGMT的表达强度明显下降(P=0.0151),Ki-67与MGMT蛋白表达呈负相关(r=-0.2915,P=0.0151)。结论:星形细胞瘤中MGMT及Ki-67表达与肿瘤恶性程度密切相关,提示MGMT和Ki-67可以作为评价星形细胞瘤预后的生物学指标。 展开更多
关键词 星形细胞瘤 6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移 细胞增殖核抗原
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胃癌MGMT基因表达的临床病理意义 被引量:4
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作者 段家华 孙幼芳 +1 位作者 曾桃英 王君 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期807-809,共3页
目的检测胃癌组织O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)基因的表达,探讨MGMT基因表达与胃癌组织学类型、疗效、预后、骨髓抑制的关系。方法应用加强型原位杂交三相寡核苷酸探针高效标记技术检测76例胃癌组织MGMT的表达,同时应用自动图像... 目的检测胃癌组织O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)基因的表达,探讨MGMT基因表达与胃癌组织学类型、疗效、预后、骨髓抑制的关系。方法应用加强型原位杂交三相寡核苷酸探针高效标记技术检测76例胃癌组织MGMT的表达,同时应用自动图像分析系统进行定量分析。结果76例胃癌MGMT基因阳性表达率为40.8%(31/76)。治疗后生存5年以上者胃癌组织MGMT阳性表达率为35.3%(4/17),明显低于生存5年以下组,后者MGMT阳性表达率为65.9%(22/41)(P<0.05)。白细胞计数≥3×109/L组MGMT阳性率为54.8%(23/42),明显高于白细胞计数<3×109/L组[23.5%(8/34)](P<0.01)。早期胃癌与进展期胃癌间MGMT表达差异无显著性意义(P>0.05)。不同组织学类型及淋巴结转移状况组间MGMT基因表达差异无显著性意义(P>0.05)。结论胃癌MGMT基因阳性表达水平与患者生存时间、骨髓抑制有关,提示检测胃癌组织MGMT基因表达水平对抗癌治疗、提高骨髓耐受性和预测预后有重要意义。 展开更多
关键词 O6-甲基鸟嘌呤-dna-甲基转移 胃肿瘤 预后
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食管鳞状细胞癌组织中COX-2和MGMT蛋白的表达 被引量:2
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作者 朱辉 王慧娟 +6 位作者 贺春语 王启鸣 李鹏 闫相涛 张国伟 王生 马智勇 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2011年第1期125-128,共4页
关键词 食管肿瘤 鳞状细胞癌 -2 6--甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移
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