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云南省猪戊型肝炎病毒全基因组扩增及进化分析
被引量：
1
1
作者
杨臣臣
龙飞燕
+5 位作者
毕艳红
李云龙
王珏
禹文海
井申荣
黄芬
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期547-551,共5页
目的对猪戊型肝炎病毒全长基因组进行扩增,分析其进化关系,为HEV的感染性克隆研究奠定基础。方法利用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-nPCR)和RACE技术对猪粪便中HEV样品进行全基因组扩增,利用DNAStar和MEGA4.0软件进行同源性比较和进化树分...
目的对猪戊型肝炎病毒全长基因组进行扩增,分析其进化关系,为HEV的感染性克隆研究奠定基础。方法利用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-nPCR)和RACE技术对猪粪便中HEV样品进行全基因组扩增,利用DNAStar和MEGA4.0软件进行同源性比较和进化树分析。结果 RT-nPCR方法扩增出HEV的5段目的基因序列和RACE技术扩增出HEV的5′和3′端,序列比对结果正确,HEV全长扩增成功。同源性分析显示其与新疆株(GU119961)同源性较高(96.1%)。系统进化树显示该病毒属于基因4型h亚型猪HEV。结论 HEV全基因组序列扩增成功,为深入研究HEV奠定基础。
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关键词
猪戊型肝炎病毒
巢式逆转录PCR
全长基因组分析
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职称材料
题名
云南省猪戊型肝炎病毒全基因组扩增及进化分析
被引量：
1
1
作者
杨臣臣
龙飞燕
毕艳红
李云龙
王珏
禹文海
井申荣
黄芬
机构
昆明理工大学医学院
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期547-551,共5页
基金
国家自然科学基金资助(No.31360619)
云南省自然科学基金(No.2013FB032
+2 种基金
2011FZ068)
中国博士后科学基金(No.2014M562672)资助
杨臣臣和龙飞燕同等贡献~~
文摘
目的对猪戊型肝炎病毒全长基因组进行扩增,分析其进化关系,为HEV的感染性克隆研究奠定基础。方法利用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-nPCR)和RACE技术对猪粪便中HEV样品进行全基因组扩增,利用DNAStar和MEGA4.0软件进行同源性比较和进化树分析。结果 RT-nPCR方法扩增出HEV的5段目的基因序列和RACE技术扩增出HEV的5′和3′端,序列比对结果正确,HEV全长扩增成功。同源性分析显示其与新疆株(GU119961)同源性较高(96.1%)。系统进化树显示该病毒属于基因4型h亚型猪HEV。结论 HEV全基因组序列扩增成功,为深入研究HEV奠定基础。
关键词
猪戊型肝炎病毒
巢式逆转录PCR
全长基因组分析
Keywords
swine hepatitis E virus
RT-nPCR
complete genome sequences analysis
分类号
R373.2 [医药卫生—病原生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
云南省猪戊型肝炎病毒全基因组扩增及进化分析
杨臣臣
龙飞燕
毕艳红
李云龙
王珏
禹文海
井申荣
黄芬
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
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